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Caracterização da resistência genética à mancha-angular e desenvolvimento de marcadores microssatélites para regiões específicas do genoma do feijoeiro / Characterization of the genetic resistance to angular leaf spot and development of microsatellite markers in specific region of common bean genome

Caixeta, Eveline Teixeira 08 April 2002 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-17T14:52:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 520472 bytes, checksum: ca6b49db2464acf17c14f205573ca9f2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-17T14:52:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 520472 bytes, checksum: ca6b49db2464acf17c14f205573ca9f2 (MD5) Previous issue date: 2002-04-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A alta incidência de doenças tem sido considerada um dos principais fatores responsáveis pela baixa produtividade do feijoeiro no Brasil. Dentre as doenças que ocorrem em Minas Gerais, a mancha-angular, tem sido apontada como a mais importante da parte aérea. A grande variabilidade genética do patógeno que causa a mancha-angular (Phaeoisariopsis griseola), motiva o constante desenvolvimento de novos cultivares resistentes. Visando dar subsídios a programas de m elhoramento, foram identificadas cinco fontes de resistência à mancha-angular: México 54, AND 277, MAR-2, Cornell 49-242 e BAT 332. Em trabalhos anteriores, foram conduzidos estudos independentes de caracterização genética das quatro primeiras variedades. No presente trabalho, foi estudada a herança da resistência de BAT 332, tendo sido encontrado um gene dominante responsável por essa característica. Para auxiliar programas de melhoramento, foram identificados dois marcadores moleculares do tipo RAPD, OPAA07 950 e OPAO12 950 , ligados em fase de acoplamento a esse gene a uma distância de 5,10 e 5,83 cM, respectivamente. Posteriormente, foram conduzidos testes de alelismo entre as cinco fontes de resistência com o objetivo de entender a relação entre os genes de resistência presentes nessas fontes. Os dados obtidos sugeriram maior complexidade que a encontrada demonstrado nos que estudos Cornell de 49-242 herança possui realizados apenas um anteriormente. gene Foi dominante, denominado de Phg-3, e México 54 três genes distintos, Phg-2, Phg-5 e Phg-6. Em MAR-2 foram encontrados dois genes, um independente denominado de Phg-4 e outro uma forma alélica de um dos genes de México 54, designado de Phg-5 2 . BAT 332 possui um gene dominante, Phg-6 2 , o qual é uma forma alélica de outro gene de México 54. AND 277 possui um alelo de México 54, Phg-2 2 , um de Cornell 49-242, Phg-3 2 , e um de MAR-2, Phg-4 2 . Esses resultados são de especial importância para programas de melhoramento cujo objetivo é a piramidação de genes de resistência. Conhecendo os genes de resistência presentes nas fontes e entendendo a relação entre eles, o melhorista tem a oportunidade de escolher os genitores de seu programa de forma a obter variedade com o maior número e melhor combinação possível de genes de resistência. A maioria dos marcadores moleculares disponíveis para os programas de melhoramento do feijoeiro é do tipo RAPD. A incorporação de marcadores que revelem um maior nível de polimorfismo permite que genótipos relacionados possam ser distinguidos, cruzamentos entre indivíduos aparentados possam ser analisados e marcadores mais próximos do gene de interesse sejam identificados. Os marcadores microssatélites apresentam esse alto polimorfismo e a facilidade típica de marcadores baseados em PCR, no entanto, não têm sido utilizados em feijão pela inexistência de primers microssatélites desenvolvidos para essa espécie. Propôs-se, portanto, na terceira parte deste trabalho, o desenvolvimento desses marcadores para o feijoeiro. Foram obtidos 21 pares de primers que amplificaram bandas únicas e bem definidas, sendo que 15 apresentaram bandas polimórficas e 7 monomórficas. O número de alelos por loco variou de um a seis. A disponibilidade de marcadores moleculares co-dominantes, altamente informativos e de fácil obtenção como os microssatélites será de grande utilidade para os melhoristas e geneticistas que se dedicam ao feijoeiro. / Diseases are among the major problems responsible for the low yield of common bean in Brazil. Angular leaf spot, caused by the fungus Phaeoisariopsis griseola, has been regarded as the most important disease in Brazil, especially in the State of Minas Gerais. The extensive pathogenic variability of this fungus requires the continuous development of new resistant cultivars. To assist breeding programs, five resistance sources for angular leaf spot were identified, México 54, AND 277, MAR-2, Cornell 49-242 and BAT 332. Genetic characterization of four of these sources was previously done. In the present work, the resistance inheritance of the fifth source, BAT 332, was carried out. The results demonstrate that a single dominant gene is responsible for angular leaf spot resistance in this genotype. Two RAPD markers, OPAA07 950 and OPAO12 950 , linked in coupling phase with this gene at 5.10 and 5.83 cM of distance, respectively, were identified. Alellism studies among the five resistance sources were conducted aiming to understand the relationship among these genes involved. Our data suggested a higher complexity than previously found by other authors. It was demonstrated that Cornell 49-242 has just one dominant gene, Phg-3, and Mexico 54 possesses three distinct genes, Phg-2, Phg-5 e Phg-6. For MAR-2, two genes were found, one was independent, Phg-4, and the other was allelic to one of the genes present in México 54, Phg-5 2 . The allele of the Mexico 54 gene was found in BAT 332, Phg-6 2 . AND 277 has one allele of México 54, Phg-2 2 , one of Cornell 49-242, Phg-3 2 , and another of MAR-2, Phg-4 2 . These results are especially important for breeding programs aiming at piramiding resistance genes. With the knowledge of the resistance genes present in the resistance sources and the understanding of the relationship among these genes, the breeder has opportunity to choose the parent for programs aiming to develop varieties with the largest number and the best combination of resistance genes. Most molecular markers developed to be used in bean breeding programs are RAPD markers. The incorporation of maker that shows a higher polymorphisms allows the distinction of closely related genotypes, the analysis of related plants crosses and the identification of molecular marker closer to the interested gene. Microsatellite markers have both high polymorphism and the easy to perform of PCR markers, however, they were not used in common beans due to the lack of primers for this species. In the third and last part of this study, it was to developed microsatellites for common beans. It was identify 21 primers that amplify single discrete band. From these primers, 15 amplified polymorphic bands and 7 monorphic bands. The number of alleles per locus varied from one to six. The existence of codominant, highly informative and easy to work molecular markers may facilitate the use of this tool for common bean breeders and geneticists.
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Estudo genético de populações de soja com fonte de resistência à Heterodera glycines (raça 3) oriundas de topocruzamentos tipo alimento x tipo grão / Genetic study of soybean crossings with source of resistance of Heterodera glycines (race 3) in feed type x grain type topocrosses

Teixeira, Lilian Cristina Andrade de Araújo 29 January 2016 (has links)
Submitted by LILIAN CRISTINA ANDRADE DE ARAUJO TEIXEIRA null (lili_crist@hotmail.com) on 2016-03-03T00:05:52Z No. of bitstreams: 1 Tese_Lilian_Cristina_Andrade_de_Araújo_Teixeira.pdf: 1549316 bytes, checksum: 8c099514dd713d5bf0160216b03c05b0 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-04T14:26:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 teixeira_lcaa_dr_jabo.pdf: 1549316 bytes, checksum: 8c099514dd713d5bf0160216b03c05b0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-04T14:26:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 teixeira_lcaa_dr_jabo.pdf: 1549316 bytes, checksum: 8c099514dd713d5bf0160216b03c05b0 (MD5) Previous issue date: 2016-01-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A soja [Glycine max (L.) Merrill] é uma leguminosa de ciclo anual que apresenta distintas finalidades, dentre elas, uma crescente vertente relaciona-se ao uso na alimentação humana. Há demanda de cultivares de soja com esta destinação com resistência a patógenos e pragas. Em especial destaca-se o nematoide de cisto da soja (Heterodera glycines) que causa expressiva perda na produtividade. Em virtude do exposto, utilizando topocruzamentos de soja tipo alimento x tipo grão, o objetivo do presente trabalho é: a. Determinar a herança da cor do tegumento, da cor do hilo e da expressão do caráter derramamento de hilo em populações F2:3; b. Determinação do estudo da herança da resistência ao nematoide de cisto da soja (NCS), bem como estimativa do número e modo de ação dos genes envolvidos a fim de contribuir no delineamento de cruzamentos, que envolvem os genitores em estudo, com maior possibilidade de acumular genes que conferem resistência à raça 3 do NCS e; c. Verificar com uma abordagem quantitativa, a adequação das populações a um modelo aditivo-dominante, assim como estimar parâmetros genéticos nos cruzamentos gerados. Utilizaram-se genitores contrastantes, um resistente ao NCS raça 3 (‘BRSMG 810C’) e dois suscetíveis, porém aptos para utilização na alimentação humana (‘BRSMG 790A’ e ‘BRSMG 800A’). Obtiveram-se as gerações F1, RCr, RCs e F2 que foram utilizadas para o estudo da herança da resistência, por meio da segregação do caráter. As avaliações de nematoide foram realizadas utilizando-se como estimador o Índice de Fêmeas (IF) e analisadas pelo teste de Qui-Quadrado (χ2) para testar o ajuste ao modelo proposto para a herança. As sementes F3 provenientes de plantas F2 foram caracterizadas para elucidar a herança para caracteres morfológicos de interesse (cor de tegumento, cor e aspecto de hilo). Para os caracteres morfológicos dos grãos avaliados, os resultados observados se ajustam à proporção esperada considerando a existência de quatro genes (R/I/W/T) controlando a expressão da cor do tegumento e cor do hilo para ambos os cruzamentos. Para o cruzamento ‘BRSMG 810C’ x ‘BRSMG 800A’ genótipos ii impediram a expressão dos genes W e T na pigmentação da semente. Ocorreu variação na expressividade do caráter hilo derramado, com herança monogênica e dominância completa para o fenótipo ausência de derramamento de hilo. Há ligação do locus que confere derramamento do hilo com o genótipo T_ (pubescência marrom). O processo de hibridação foi eficiente na geração de variabilidade. Quanto à avaliação nematológica, as plantas F2 apresentaram dois padrões de segregação aceitos (resistente: suscetível): 1:15 (dois genes recessivos complementares) e 3:61 (um gene dominante e dois recessivos complementares). A herança foi confirmada utilizando-se as plantas do RCr, que segregaram na proporção de 1:7, padrão esperado para herança condicionada por três genes. A hipótese de segregação 1:3 (dois genes) foi rejeitada em RCr. A falta de um dos genes recessivos proporcionou resistência moderada ao NCS raça 3 aceitando-se a hipótese de moderadamente resistente: suscetível na proporção de 3:13 (um gene dominante e um gene recessivo). Assim, nestes cruzamentos, a resistência moderada ao NCS raça 3 é condicionada por dois genes epistáticos (um dominante e um recessivo) e o acúmulo de um terceiro gene recessivo confere resistência completa em relação ao fitonematoide em estudo. Os resultados evidenciam que ambos os cruzamentos apresentam acentuada variabilidade genética em F2. O modelo aditivo-dominante foi suficiente para explicar o caráter, sendo o efeito genético aditivo o mais importante. A resistência ao NCS raça 3 teve grande influência ambiental. De acordo com os resultados obtidos, existe evidência de ganho com seleção em processo seletivo. A herdabilidade no sentido restrito de baixa magnitude indica provável ponderação na pressão de seleção, fato que prioriza a realização de seleção em fase avançada dos programas de melhoramento, como no teste de progênies, para a obtenção de cultivares especiais para a alimentação humana e homozigota para resistência a este fitonematoide. / Soybean [Glycine max (L.) Merrill] is an annual leguminous that has distinct purposes, among them, a growing amount is related to the human feed. There is a demand of cultivars aiming this destination, which are resistant to pathogens and plagues. A special plague is highlighted, the soybean nematode of cyst (Heterodera glycines) (NCS). It causes expressive loss of productivity. Facing this, using soybean topcrosses feed-like x grain-like this work aims: a. determine the tegument color, hilum color, and hilum spread character heritance in F2 populations; b. determine the NCS resistance heritage, as well the involved genes number and action mode estimative in order to contribute in the crosses design, which involve the parents studied, with a higher possibility of accumulation of genes which provide resistance to the NCS race 3; and c. Verify in a quantitative approach the adequacy population in an additive-dominant model, as well estimate the genetic parameter into the crossings. We used contrasting parents, being resistant to the race 3 (‘BRSMG 810C’) and two susceptible, however suitable to the human feed (‘BRSMG 790A’ and ‘BRSMG 800A’). Thus, the generations F1, RCr, RCs, and F2 were created. They were used to study heritage resistance through the character segregation. The nematode evaluations were done using as estimator the Female Index (IF) and they were analyzed by the chi-square test (χ2) to test the adjustment to the suggested model to the heritage. The F3 seeds from the F2 plants were characterized to elucidate the heritage to interest morphologic traits (seed coat color, hilum color and hilum aspect). For the morphological character of grain, the results observed of descendent were adjusted to the expected proportion, considering that there were four genes (R/I/W/T) controlling the expression coat and hilum color to both crossings. At crossing ‘BRSMG 810C’ x ‘BRSMG 800A’, the allele ii genetic owners hindered the expression of genes W and T at seed pigmentation. There was variation in the expression of spread hilum character, presenting monogenic heritance and full dominance to the characteristic. There are locus binding that gives outpouring of spread hilum with T_ locus (brown pubescence). The hybridization process was efficient to obtain genetic variability. Regarding to the nematologic evaluation, F2 plants presented two segregation patterns accepted: (resistant:susceptible) 1:15 (two complementary recessive genes) and 3:61 (one dominant gene and two complementary recessive genes). The heritability was confirmed using the BCr plants, which segregated at 1:7 proportion. Such proportion is expected in heritance conditioned to three genes. The 1:3 segregation hypothesis (two genes) was rejected in BCr. The lack of one of recessive gene provided moderate resistance to NCS race 3, accepting the hypothesis of moderately resistant: susceptible at 3:13 proportion (one dominant and one recessive). Thus, in these crossings, the moderate resistance to NCS race 3 is conditioned by two epistatic genes (one dominant and one recessive) and the accumulation of a third recessive gene provides full resistance to the phytonematodes evaluated in this article. The results highlight that both crossings have high genetic variability in the F2. The additive-dominant model was enough to explain the character, where the most important genetic effect was the additive. The NCS race 3 resistance had a great environmental influence. According to the obtained results, there is an evidence of gain with selection in the selective process. The heritability in the narrow sense of low magnitude indicates a probable weighting in the selection pressure. This fact prioritizes the selection conduction in a more advanced phase of breeding program, like in the progenies test, to obtain special cultivars to feed humans, and in the homozygote to resist to this phytonematode. / CNPq: 1406592012-9 / FAPESP: 2012/15448-4

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