Orientador: Maria Inês de Moura Campos Pardini / Resumo: Este trabalho visou a comparação de 5 diferentes métodos de extração de DNA, a partir de amostras de materiais de arquivo (tecido incluído em parafina, lâmina de hemograma corada e não corada com Leishman, lâmina de mielograma, gotas de sangue em Guthrie card) e fontes escassas (células bucais, 1 e 3 bulbos capilares, 2 mL de urina), para avaliar a facilidade de aplicação dos mesmos e possibilidade de amplificação desse DNA pela técnica de PCR. Os métodos incluíram digestão por proteinase K, seguida e não seguida por purificação com fenol/clorofórmio, utilização de Chelex 100 Ò, utilização de InstaGeneÒ e fervura em água estéril. O DNA obtido, foi testado por PCR, para a amplificação de três fragmentos gênicos: de Brainderived neutrophic factor (764 pb), de Fator V Leiden (220 pb) e de Abelson (106 pb), sendo que, a amplificação para o primeiro, eliminava a necessidade dos demais. Conforme o tamanho do fragmento gênico estudado, a fonte potencial de DNA e o método de extração utilizado, os resultados caracterizaram o melhor caminho para padronização dos procedimentos técnicos a serem incluídos e apresentados no manual de Procedimentos Operacionais Padrão do Laboratório de Biologia Molecular do Hemocentro - HC - UNESP - Botucatu. / Abstract: The present work aimed to compare five different methods of DNA extraction of archieved materials samples (paraffin-embedded tissues, periferic blood smear - stained or non-stained with Leshman, aspired bone marrow smears and blood guts in Guthrie card) and rare sources (oral cells, 1 and 3 capilar bulbs, 2 mL urine), to avaliate the aplication facility and the amplification possibility one for PCR. The methods included proteinase K digestion - followed or non by phenol/chloroform purification, Chelex 100Ò (BioRad), InstaGeneÒ (BioRad) and boilling in sterile water. The DNA obteined, was tested for amplification of 3 genic fragments: from Brainderived neutrophic factor gene (764 bp), Factor V Leiden gene (220 bp) and Abelson gene (106 bp). According to the genic fragment lenght studed, the DNA potential source and the extraction method used, the results characterized better guidelines for padronization of the techniques procedures for to Good Manufacturing Practices from Molecular Biology Laboratory from Blood Center - Medicine School - UNESP - Botucatu . / Mestre

Orientador: Osmar Aparecido Cuoghi / Banca: Luiz Gonzaga Gandini Júnior / Banca: Eduardo César Almada Santos / Resumo: Objetivou-se avaliar o efeito da retração dentária sobre o ponto A nos sentidos ântero-posterior e vertical, bem como a correlação e a previsibilidade dos comportamentos dessas estruturas. Utilizou-se 60 telerradiogafias em norma lateral, tomadas no início e no final do tratamento ortodôntico corretivo de 30 pacientes (22 femininos e 8 masculinos) entre 10 e 17 anos, com má oclusão de Classe II, divisão 1 e de Classe I, com extração dos primeiros pré-molares superiores. Além das grandezas 1.NA, 1-NA, 1.PP e 1-A, distâncias lineares horizontais e verticais foram mensuradas utilizando como referência uma linha horizontal 7o abaixo do plano SN e a sua perpendicular. Sendo normalmente distribuídos, todos os dados foram mensurados duas vezes, cujos valores médios foram submetidos ao teste t emparelhado, testes de correlação e de regressão linear. Em média, o ponto A retraiu 0,71 mm e deslocou para baixo 2,38 mm, acompanhando uma retração do ápice radicular de 1,03 mm e da borda incisal de 4,13 mm e uma extrusão dentária de 2,35 mm. Houve correlação positiva entre a retração do ponto A e do ápice radicular (r=0,75; a<0,0001) e da borda incisal (r=0,70; a<0,0001), demonstrando um padrão previsível no comportamento ântero-posterior. Concluiu-se que o ponto A retraiu e deslocou para baixo acompanhando o dente, demonstrando padrão previsível no sentido ântero-posterior. / Abstract: It was aimed to evaluate the effect of retraction of anterior teeth on the point A antero-posteriorly and vertically, as well as the correlation and the predictability of the behavior of these structures. Sixty telerradiographs in lateral norm were taken, at the beginning and the end of corrective orthodontic treatment, from thirty patient (22 female and 8 male) aging from 10 to 17 years, with Class II, division 1 and Class I malocclusion and underwent maxillary first premolars extractions. Besides the variables 1.NA, 1-NA, U1/PP and U1?Avert, horizontal and vertical linear measurements were made in relation to a horizontal reference line constructed from the S-N plane minus 7o and its perpendicular. As distributed normally, all the data were measured twice, and the mean values were submitted to paired t test, linear correlation and regression tests. In average, point A retracted 0,71 mm and moved 2,38 mm downwardly, following 1,03 mm of root apex and 4,13 mm of incisal edge retraction, and 2,35 mm of tooth extrusion. The retraction of point A was positively correlated with root apex (r=0,75; p<0,0001) and with incisal edge retraction (r=0,70; p<0,0001), showing a predictable antero-posterior behavior. It was concluded that point A retracted and moved downwardly following the tooth, and the retraction of point A in relation to the anterior tooth showed predictable pattern. / Mestre

Orientador: Edson Luiz Mendes Coutinho / Banca: Mara Cristina Pessoa da Cruz / Banca: Takashi Muraoka / Abstract: A greenhouse experiment was carried out to evaluate the effects in soil, plant and soybean dry matter yield in function of manganese rates and sources. The distribution of manganese in different fractions was evaluated. A completely randomized design in a factorial arrangement 3x6x3 (soil x rate x Mn source) was used. The soils were classified as Typic Quartzipsamment (soil 1), clayey Typic Haplustox (soil 2) and sandy clay loam Typic Haplustox (soil 3). Mn rates were 0, 5, 10, 20, 40 e 60 mg kg-1 using single superphosphate + Mn (micronutrient incorporated in ordinary superphosphate granulation), "Fritted" Mn and manganese sulphate. The available Mn was determined with Mehlich-1 (M-1) and DTPA. The extractants used to evaluate Mn solubility in fertilizers were: water, 20 g L-1 citric acid and neutral ammonium citrate solutions. The agronomic effectiveness of the manganese sources was calculated using manganese sulphate as reference. Using sequential extraction, the soil Mn was partitioned into exchangeable, organic, amorphous Fe and Al oxides, crystalline Fe and Al oxides and residual forms. Mn fertilization increased Mn content in soybean shoot, regardless to soil and source considered. Dry matter yield depended of Mn initial in soils. In soils 1 and 2, which had low Mn content, occured an increase in soybean dry matter yield. The DTPA and M-1 extractants were efficient to evaluate the Mn availability to soybean. The "fritted" Mn source resulted lower agronomic effectiveness in comparison to SS+Mn and MnSO4...(Complete abstract, acess undermentioned eletronic adress) / Mestre

Orientador: Aluir Porfírio Dal Poz / Resumo: É esperado que o operador humano permaneça, por um longo tempo, como parte integrante do sistema de extração de feições. Portanto, as pesquisas que caminham para o desenvolvimento de novos métodos semi-automáticos são ainda de grande importância. Nesta linha, esta pesquisa propõe um método semi-automático para a extração de rodovias em imagens digitais. A metodologia é uma combinação entre técnicas de correlação e estratégia de teste ativo. Os resultados experimentais obtidos da aplicação do método em imagens reais mostram que o método funciona corretamente, demonstrando que pode ser usado em esquemas de captura de dados. / Abstract: The human operator is still expected to remain as part of the feature extraction system for a relative long time. Therefore, researches for the development of new semi-automatic methods is still of great importance. Following this line, this research proposes a semi-automatic method for road extraction from digital images. It is based on a combination between correlation techniques and an active testing strategy. In order to initialize the extraction process, the operator needs to supply two close seed points plus another one at the end of road segment selected to be extracted. Experimental results obtained from the application of the method to real image data show that the method works properly, demonstrating that the developed method can be used in data capturing schemes. / Mestre

Resumo: Este trabalho propõe uma nova metodologia para extração de rodovias utilizando imagens aéreas digitais. A inovação baseia-se no algoritmo de Programação dinâmica (PD), que nesta metodologia realiza o processo de otimização no espaço objeto, e não no espaço imagem como as metodologias tradicionais de extração de rodovias por PD. A feição rodovia é extraída no espaço objeto, o qual implica um rigoroso modelo matemático, que é necessário para estabelecer os pontos entre o espaço imagem e objeto. Necessita-se que o operador forneça alguns pontos sementes no espaço imagem para descrever grosseiramente a rodovia, e estes pontos devem ser transformados para o espaço objeto para inicialização do processo de otimização por PD. Esta metodologia pode operar em diferentes modos (modo mono e estéreo), e com diversos tipos de imagens, incluindo imagens multisensores. Este trabalho apresenta detalhes da metodologia mono e estéreo e também os experimentos realizados e os resultados obtidos. / Abstract: This work proposes a novel road extraction methodology from digital images. The innovation is based on the dynamic programming (DP) algorithm to carry out the optimisation process in the object space, instead of doing it in the image space such as the DP traditional methodologies. Road features are traced in the object space, which implies that a rigorous mathematical model is necessary to be established between image and object space points. It is required that the operator measures a few seed points in the image space to describe sparsely and coarsely the roads, which must be transformed into the object space to make possible the initialisation of the DP optimisation process. Although the methodology can operate in different modes (mono-plotting or stereoplotting), and with several image types, including multisensor images, this work presents details of our single and stereo image methodology, along with the experimental results. / Orientador: João Fernando Custódio da Silva / Coorientador: Aluir Porfírio Dal Poz / Banca: Júlio Kiyoshi Hasegawa / Banca: Messias Meneguette Júnior / Doutor

Orientador: Ariovaldo de Oliveira Florentino / Banca: Cristiane Barbieri Rodella / Banca: José Pedro Serra Valente / Resumo: As águas residuárias dos processos de extração vegetal para fins farmacêuticos apresentam elevada DQO (Demanda Química de Oxigênio) e orgânicos persistentes que não são eliminados pelos tratamentos de resíduos líquidos convencionais. Atualmente, a fotocatálise heterogênea vêm se destacando como processo de oxidação avançado (POA) capaz de mineralizar compostos persistentes responsáveis pela poluição do meio ambiente aquático. Este trabalho tem o propósito de descontaminar o efluente semi-tratado de um indústria de extração vegetal, situada na região de Botucatu, São Paulo, Brasil; para seu posterior reuso, a fotocatálise (TiO2 em suspensão) foi aplicada. Foram realizados testes com variação do pH da amostra em que se obteve maior eficiência de fotodegradação em pH 4,0. Foi testado a adição de persulfato de potássio em várias concentrações, constatando que a adição 0,1 g L-1 favorece a degradação dos poluentes mais persistentes remanescentes do efluente semi-tratado. Finalmente, com o objetivo de remover o TiO2 da suspensão foram realizados testes de coagulação-floculação, na presença de sulfato de alumínio e pH 4,0. O tempo de decantação do material em suspensão foi de 30 minutos, DQO final de 2,5 mg O2 L-1 e a turbidez final de 2 NTU. A fotocatálise contribuiu para a remoção de tóxicos persistentes, redução da DQO, eliminação de odores e redução da turbidez do efluente. / Abstract: The wastewater of vegetable extraction process (for pharmaceutical use) present increased DQO (Qhemistry Demand of Oxigen) and bio-recalcitrant organic contaminant that are not eliminated by convencional wastewater treatments. Presently, the heterogen photocatalysis is been outstanding as advanced oxidation process (AOP) capable of decaying of recalcitrant compounds, responsible for the pollution of the aquatic environment. This paper have to purpose of descontaminate the pretreated wastewater by vegetable extraction industry, located in Botucatu region, São Paulo, Brazil; the photocatalysis (TiO2 suspension) was applicated, for it is future reuse. Experiments were carried out with various pH samples with efficient results of photodegradation in pH 4,0. Experiments with the peroxydisulphat addition have done in various concentrations, concluding that it is minimum addition (0,1 g L-1) favours the degradation speed of the moust recalcitrants polluants of the pretreated wastewater. Eventually, experiments of coagulation-floculation have been done to remove the TiO2 (0,5 g L-1) from the suspension, in presence of aluminium sulphate (0,2 g L-1) and pH 4,0. The time of decantation of the suspension material was 30 minutes, the final turbidity 2 NTU and final DQO 2,5 mg O2 L-1. The photocatalysis contributed to remove recalcitrant organic compounds, to reduce the DQO, eliminated the smell and to redecue the wastewater turbidity. / Mestre

Orientador: Aluir Porfírio Dal Poz / Banca: João Fernando Custódio da Silva / Banca: Daniel Rodrigues dos Santos. / Resumo: Nesta pesquisa é proposta uma metodologia para a orientação semi-automática de imagens CBERS usando rodovias como controle de campo. Baseia-se numa estratégia iterativa envolvendo três etapas. Na primeira etapa um operador identifica na imagem as rodovias de controle de campo e fornece alguns pontos sementes, distribuídos grosseira e esparsamente ao longo ou nas imediações das rodovias. Estes pontos sementes são utilizados pelo algoritmo de otimização de programação dinâmica para extrair as rodovias na imagem. Na segunda etapa são estabelecidas correspondências pontuais entre as rodovias de controle e as correspondentes rodovias extraídas na imagem. Na terceira etapa as correspondências pontuais são utilizadas para orientar a imagem usando a DLT (Direct Linear Transformation). As duas últimas etapas do processo são iteradas até que se verifique a estabilização do processo de orientação. Os resultados experimentais possibilitaram verificar que a metodologia proposta foi eficiente com várias imagens teste. Em todos os casos se verificou a convergência do processo de orientação. Além disso, os parâmetros estimados de orientação possibilitaram o registro de rodovias de verificação com acurácia no nível do pixel ou melhor. / Abstract: In this research is proposed a methodology for semiautomatic CBERS image orientation using roads as ground control. It is based on an iterative strategy involving three steps. In the first step, an operator identifies on the image the ground control roads and supplies along them a few distributed seed points, which could be sparsely and coarsely distributed. These seed points are used by the dynamic programming algorithm for extracting the ground control roads from the image. In the second step, it is established the correspondences between points describing the ground control roads and the corresponding ones extracted from the image. In the last step, the corresponding points are used to orient the CBERS image by using the DLT (Direct Linear Transformation). The two last steps are iterated until the convergence of the orientation process is verified. Experimental results showed that the proposed methodology was efficient with several test images. In all cases the orientation process converged. Moreover, the estimated orientation parameters allowed the registration of check roads with pixel accuracy or better. / Mestre

Orientador: Ary dos Santos-Pinto / Banca: Roberto Hideo Shimizu / Banca: Lídia Parsekian Martins / Resumo: A reabsorção radicular apical é um dos mais comuns e indesejáveis efeitos colaterais do tratamento ortodôntico sendo motivo de estudos com finalidade de seu entendimento e elaboração de medidas preventivas. Objetivou-se com o presente estudo determinar e quantificar radiograficamente a ocorrência de reabsorção radicular nos incisivos após a retração anterior, levando-se em consideração o dente estudado e sua relação com a quantidade de movimentação radicular ou modificação na inclinação do incisivo. Foram avaliados incisivos superiores e inferiores de 22 pacientes entre 12 e 25 anos, de ambos os gêneros, submetidos a tratamento ortodôntico com aparelho fixo e extração de pré-molares. A quantificação da reaborção radicular foi realizada pela diferença entre as medidas do comprimento radicular em radiografias periapicais nas fases pré e pós retração de incisivos.O controle da distorção da imagem radiográfica e da alteração na angulação dos incisivos foi realizada utilizando-se o método descrito por Linge & Linge (1983). Foram utilizadas telerradiografias laterais pré e pós retração de incisivos para relacionar a mudança de inclinação dos incisivos e quantidade de movimento vertical, horizontal e total do ápice radicular com a reabsorção radicular. Com base nos dados obtidos conclui-se que há reabsorção radicular significante na fase de retração de incisivos variando de 1,51 mm a 2,37 mm não relacionada com o movimento ou alteração de inclinação do ápice radicular destes dentes através do osso. / Abstract: Apical root resorption is among the most commom and undesirable counterside effects of orthodontic treatment. Thus it has been extensively studied in order to be prevented or minimized. The present research aimed to radiographically determine and quantify root resorption on incisors after retraction of the anterior segment. The root resoption and it's relation to the root movement or incisors tipping were considered. Upper and lower incisors of 12 to 25 years old patients, both gender, orthodontically treated with fixed appliance and premolars extraction were evaluated in the present study. The measurement of root resorption was obtained by the differences between root length on periapical radiographs, before and after incisors retraction. Distortion of the radiographic image and incisors tipping change control were controled using the methodology proposed by Linge & Linge (1983). Pre and post incisor retraction lateral cephalometric radiographs were used to establish the relation between root resorption and the tipping of the incisors and vertical, horizontal and total movement of the root apex. Based on the obtained data it was concluded that there is significant root resorption during incisors retraction movement, varing from 1.51 mm to 2.37 mm, and it is not related to the movement of root apex or to the tipping change of these teeth through the bone. / Mestre

Orientador: Aluir Porfírio Dal Poz / Resumo: Pesquisas em extração de rodovias em imagens digitais não são recentes, sendo as primeiras da década de 70. Os métodos desenvolvidos normalmente são classificados em duas classes: semi-automático e automático. Esta última classe não prevê a intervenção de um operador. Neste contexto, a extração automática de cruzamentos de rodovias é fundamental, embora muito poucos trabalhos são encontrados na literatura sobre extração de rodovias. A razão principal é a grande diversidade de cruzamentos de rodovias, gerando algumas dificuldades para construir um conhecimento a priori sobre cruzamentos. Esta pesquisa propõe uma metodologia automática para resolver este problema, combinando segmentos de rodovias extraídos de uma imagem de alta resolução (pixel < 0,7 m), com linhas extraídas numa imagem de baixa resolução (pixel > 2m), reamostrada da imagem original de alta resolução. A metodologia proposta foi testada em um conjunto de imagens de alta resolução, mostrando-se confiável e eficiente. Desde que as bordas das rodovias sejam satisfatoriamente definidas, o método se mostrou capaz de extrair totalmente os cruzamentos de rodovias. Além disso, gerou uma significante melhora na malha viária (aproximadamente 16%) extraída pela metodologia automática de extração de segmentos de rodovias. / Abstract: Researches on road extraction from digital images are not recent, being the first one from 70's. The methods developed are usually classified into two classes, i.e., semiautomatic and automatic. Concerning this last class, no intervention with the operator is expected. In this context, the road crossing extraction is fundamental, although very few works are found in the relevant literature. The main reason is the great diversity of road crossings, bringing some difficulties to build up a priori knowledge of them. This research proposes a methodology for solving this problem combining road segments extracted from a high - resolution image (pixel < 0.7 m), with lines extracted from a low - resolution image (pixel > 2m) resampled from the original, high - resolution image. The proposed methodology was tested with a set of high - resolution image, showing that it is reliable and efficient. Whenever the road edges were well - defined the method was able to totally extract the road crossings. In addition it provided road networks with completion significantly better (about 16%) than the corresponding ones previously extracted by the automatic road segment extraction method. / Mestre

Resumo: Nas três últimas décadas, a utilização de herbicidas vem aumentando progressivamente no mundo. Com isso, cresce a importância do entendimento do destino final dessas moléculas, ou seja, o estudo do comportamento dos herbicidas no solo. O tebuthiuron é um herbicida residual utilizado no cultivo da cana-de-açúcar, em aplicações de pré-emergência. O objetivo deste trabalho foi avaliar o residual do herbicida tebuthiuron em amostras de solo, coletadas em áreas de cultivo de cana-de-açúcar, utilizando metodologias distintas de extração bem como análises cromatográficas. Foram coletadas amostras de solo (0-10 cm), dos sistemas de cana crua e queimada, em 49 áreas pertencentes ao Grupo Cosan - Unidade Barra, as quais receberam aplicação de tebuthiuron na safra 2005/06 e 2006/07. Foram utilizados dois extratores para a recuperação do produto presente nas amostras: cloreto de cálcio (CaCl2) e solução de solo. A quantificação do herbicida foi realizada por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). Os dados obtidos foram ajustados por modelo logarítmico. Os métodos de extração mostraram-se apropriados para avaliar quantitativamente o herbicida tebuthiuron, verificando-se elevada correlação entre os dados obtidos. A concentração média, inicial e final do produto no sistema de cana crua e queimada foram de 40,76 e 8,44, 56,57 e 5,71 ng g-1, respectivamente. Após um ciclo da cultura constatou-se no sistema de cana crua 20,72% da dose inicial enquanto no sistema de cana queimada apenas 10,09%, mostrando assim maior residual do produto no sistema com palha. / Abstract: The use of herbicides has been increasing progressively in the last three decades around the world. Thereby, it increases the importance of understanding the final destiny of these molecules, it means, the study of herbicide behavior's in the soil. Tebuthiuron is a residual herbicide used in pre-emergence applications at sugarcane crop. Therefore, the aim of this work was to evaluate the residual of tebuthiuron in soil samples, collected in sugarcane crop, using different extraction methods as well as chromatographic analyses. Soil samples were collected (0-10 cm) on raw and burned sugarcane systems, at 49 areas belonging to Cosan Group - Barra Unit, which received tebuthiuron applications at 2005/06 and 2006/07 seasons. Two extractors were used to recovery the herbicide present in the samples: calcium chloride (CaCl2) and soil solution. The herbicide quantification was accomplished by high performance liquid chromatograph (HPLC). The results obtained were adjusted by the logarithmic model. Both extraction methods produced highly correlated results. The initial and final concentration of the herbicide in the areas under two different production systems (sugarcane harvested green and burned sugarcane) were 40,76 and 8,44; 56,57 and 5,71 ng g-1, respectively. After a complete crop cycle (12-18 months from harvest to harvest) it were observed concentrations of tebuthiuron in soil solution equivalent to 20,72% and 10,09% of the initial rate in sugarcane harvested green and burned sugarcane, respectively. / Orientador: Edivaldo Domingues Velini / Coorientador: Eduardo Negrisoli / Banca: Fernando Tadeu de Carvalho / Banca: Sidnei Roberto de Marchi / Mestre