Orientador: Jane Megid / Resumo: Coxiella burnetii é uma bactéria intracelular obrigatória responsável por causar a febre Q em humanos, mas também é conhecida como coxielose em animais. No Brasil, pouco é sabido a respeito da epidemiologia da enfermidade. O presente estudo objetiva estabelecer a prevalência do patógeno em bovinos abatidos no estado de São Paulo, além da detecção molecular em soro e fetos de bovinos. A sorologia de 1515 amostras de bovinos coletadas em frigoríficos foi realizada por reação de imunofluorescência indireta (RIFI) para anticorpos anti-C. burnetii. Reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) visando detectar o gene IS1111, foi utilizada para o diagnóstico molecular de C. burnetii em amostras de soro e fetos de bovinos. A prevalência aparente para anticorpos anti-C. burnetii em bovinos foi de 23,8% [IC95%=21,7% – 25,9%] (n=360), e a prevalência real de 20,0% [IC95%=17,8 – 22,3%]. A qPCR foi realizada nas 360 amostras soropositivas e apresentou resultado positivo em 92 amostras (25,6% [IC95%=20,1% – 28,8%]), demonstrando a presença do micro-organismo na corrente sanguínea dos bovinos amostrados. Entre as 28 amostras de fetos bovinos analisados, 10,7% (n=3) foram positivas na qPCR, confirmado por sequenciamento. A análise por qPCR quantitativo das amostras de abortamentos indicaram concentração entre 500 – 104 células por grama de tecido. Análise de multilocus de repetições em tandem de número variável (MLVA) e Multispacer Sequence Typing (MST) das amostras de fetos e do cont... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Coxiella burnetii is an obligate intracellular bacterium responsible for causing Q fever in humans but is also known as coxiellosis in animals. In Brazil, little is known about the epidemiology of the disease. The present study aims to establish the prevalence of the pathogen in cattle slaughtered in the state of São Paulo, in addition to molecular detection in bovine serum and fetuses. The serology of 1515 bovine samples collected in slaughterhouses was performed by indirect immunofluorescence reaction (IFA) for anti-C. burnetii antibodies. Real-time polymerase chain reaction (qPCR) to detect the IS1111 gene was used for the molecular diagnosis of C. burnetii in bovine serum and fetal samples. The apparent prevalence of anti-C. burnetii antibodies in cattle was 23.8% [95% CI = 21.7% - 25.9%] (n = 360) and the true prevalence was 20.0% [95% = 17.8 - 22.3%]. The qPCR was performed in the 360 seropositive samples and presented a positive result in 92 samples (25.6% [95% CI = 20.1% - 28.8%]), demonstrating the presence of the microorganism in the blood stream of the sampled cattle. Among the 28 samples of bovine fetuses analyzed, 10.7% (n = 3) were positive in qPCR, confirmed by sequencing. Quantitative qPCR analysis of the abortion samples indicated concentration between 500-104 cells per gram of tissue. Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis (MLVA) and Multispacer Sequence Typing (MST) from fetal samples and positive control revealed new strains of C. burnetii c... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2016-04-07T13:25:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 maria_guia_ioc_dout_2015.pdf: 33668716 bytes, checksum: 116b84e24b72cbb6e3a9a67cb4657da1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Febre Q é uma zoonose cosmopolita causada por Coxiella burnetii, uma bactéria intracelular obrigatória gram-negativa da ordem Legionellales. A doença, que ocorre como pequenos surtos ou casos isolados, tem amplo espectro clínico, desde doença febril limitada, pneumonia, hepatite à endocardite e meningoencefalite. Pequenos roedores silvestres são importantes reservatórios, mas a infecção humana está principalmente relacionada a ovelhas, cabras e gado bovino, embora gatos, cães e coelhos estejam implicados em surtos urbanos. Na população humana a transmissão ocorre por aerossóis provenientes de líquido amniótico, placenta e lã, além da urina, fezes, leite e outras secreções animais contendo o agente. No Brasil, a primeira descrição de febre Q ocorreu em 1953. Embora casos esporádicos confirmados por teste sorológico e estudos sorológicos tenham apontado para a presença de C. burnetii no Brasil, somente em 2008 o agente foi identificado por análise molecular em paciente no município de Itaboraí/RJ. Com a consequente caracterização da infecção também nos animais domésticos de propriedade do paciente, durante o período de 2010-2011, o presente estudo foi proposto com o objetivo de: (i) realizar a vigilância de febre Q em pacientes com suspeita de dengue internados no Hospital Municipal Desembargador Leal Júnior, em Itaboraí, durante o período de 24 meses; (ii) verificar a presença de infecção nos familiares dos casos de febre Q; (iii) analisar os animais de propriedade dos casos de febre Q; (iv) investigar a presença de C. burnetii em animais silvestres capturados nas áreas de onde procederam os casos de febre Q e (v) pesquisar C. burnetii nos artrópodes coletados nos animais Neste estudo foram utilizados o teste de imunofluorescência indireta e a análise molecular (PCR) visando os elementos IS1111 transposase no genoma de C. burnetii. Dos 272 pacientes atendidos no período de 2013 a 2014, 26 (10%) apresentaram anticorpos anti-C. burnetii e nove (3,3%) foram PCR positivos. Um dos pacientes apresentou também infecção por dengue. A análise das sequências genômicas obtidas demonstrou a elevada similaridade entre si (99-100%) e com as sequências de C. burnetii depositadas no GenBank. Dos 35 animais domésticos estudados, seis foram sororreativos: 1/13 cães, 3/13 gatos, 2/9 ovelhas. A análise molecular foi positiva em swab anal de um filhote de gato e em amostra de tecido do úbere da ovelha sororreativa com história de aborto. Todos os 59 animais silvestres dos gêneros Didelphis, Philander, Micoureus, Akodon, Oligoryzomys e Nectomys foram negativos na análise molecular. Dos 283 artrópodes analisados, DNA de C. burnetii foi amplificado em oito dos 266 exemplares de Rhipicephalus sanguineus e em um exemplar de oito Amblyomma sculptum e nenhum dos sete Dermacentor nitens e duas pulgas Ctenocephalides canis identificados. Os resultados comprovam a presença de C burnetii em Itaboraí, confirmam a necessidade da inclusão da febre Q no diagnóstico diferencial da dengue e alertam para a necessidade da sensibilização dos profissionais de saúde sobre a ocorrência desta zoonose no Brasil / Q fever is a worldwide zoonosis disease caused by Coxiella burnetii, a gram-negative obligate intracellular bacterium of the legionellales order. The disease, which occurs as individual cases or small outbreaks have broad-spectrum clinical manifestation from limited febrile disease, pneumonia, endocarditis, hepatitis and meningoencephalitis. Small wild rodents are important reservoirs, but human infection is mainly related to sheep, goats and cattle, although cats, dogs and rabbits are involved in urban outbreaks. In human population, transmission occurs by aerosol from amniotic fluid, placenta and wool, as well as urine, feces, milk and other animal secretions, containing the agent. In Brazil, the first Q fever description occurred in 1953. Although sporadic cases confirmed by serological testing and sero-epidemiological studies have pointed to the presence of C. burnetii in Brazil, only in 2008 it was possible identify the agent in a patient's municipality of Itaboraí/RJ by molecular assay. With the consequent characterization of the infection also in domestic animals owned by the patient during the period 2010-2011, this study was proposed with the aim of: (i) conduct surveillance of Q fever in hospitalized patients with suspected dengue in Itaboraí at the Hospital Municipal Desembargador Leal Junior, during the period of 24 months; (ii) to verify the presence of Q fever infection in family cases ; (iii) analyzing, animals the property Q fever cases; (iv) investigate the presence of C. burnetii in wild animals captured in areas from which proceeded cases of Q fever and (v) search C burnetii in arthropods collected from animals. This study used the indirect immunofluorescence assay and molecular analysis (PCR) targeting the IS1111 transposase elements in the genome of C. burnetii. Of the 272 patients assisted from 2013 to 2014, 26 (10%) had anti-C. burnetii antibodies, and nine (3.3%) were PCR positive. One of these patients had also dengue infection. The analysis of the genomic sequences obtained showed high similarity to each other (99-100%) and the sequences of C. burnetii in GenBank. Of the 35 domestic animals studied, six were seroreactive: 1/13 dogs, cats 3/13, 2/9 sheep. Molecular analysis was positive in anal swab of a young kitten and tissue sample from the udder of sororreativa sheep with abortion history. All 59 wild animals Didelphis, Philander, Micoureus, Akodon, Oligoryzomys and Nectomys were negative by molecular analysis. Of the 283 arthropods analyzed, C. burnetii DNA was amplified in eight of 266 Rhipicephalus sanguineus and a specimen of 8 Amblyomma sculptum and none of 7 Dermacentor nitens and 2 fleas Ctenocephalides canis identified. The results show the presence of C. burnetii in Itaboraí, confirm the need for inclusion of Q fever in dengue differential diagnosis and point to the need of awareness among health professionals about the occurrence of this zoonosis in Brazil.

Orientador: Marcos Rogério André / Coorientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Karina Paes Bürger / Banca: Ana Patrícia Yatsuda Natsui / Resumo: Coxiella burnetii é uma bactéria Gram-negativa intracelular obrigatória, que além de considerado agente zoonótico causador da Febre Q em vários países do mundo, foi classificado como um potencial agente de bioterrorismo. Bovinos, ovinos e caprinos representam as fontes de infecção mais frequentemente associadas à ocorrência da enfermidade em humanos, entretanto animais selvagens também podem atuar como importantes fontes de infecção. Desta forma, o presente estudo tem como objetivo investigar a ocorrência de Coxiella burnetii em ruminantes domésticos e selvagens no Brasil. Para tal, 188 amostras de sangue de cervídeos (143 Blastocerus dichotomus, 11 Ozotocerus bezoarticus, 27 Mazama gouazobira, 4 M. bororo e 3 M. americanum), capturados nos estados de MS, SP e MG, foram submetidas à extração de DNA e, subsequentemente, à nested (n)PCR para C. burnetii baseada no elemento de inserção repetitivo IS1111 do gene heat shock protein (htpAB). Além disso, 169 amostras de soro de cervídeos foram submetidas à Reação de Imunofluorescência para detecção de anticorpos IgG anti-C. burnetii. Amostras de soros de bovinos apresentando desordens reprodutivas foram submetidas às Reações de Vírus Neutralização para BoHV-1 e BVD, Soroaglutinação Microscópica para Leptospira spp., Reação de Imunofluorescência Indireta for C. burnetii e Toxoplasma gondii, e Ensaio de Imunoabsorção Enzimática Indireto para Neospora caninum e Trypanosoma vivax. Todas as amostras de sangue mostraram-se negativas na nP... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Coxiella burnetii is an obligate intracellular Gram-negative bacterium, which, in addition to being considered a zoonotic agent that causes Q fever in several countries of the world, has been classified as a potential bioterrorism agent. Cattle, sheep and goats represent the most frequent sources of infection associated with the occurrence of the disease in humans, however, wild animals can also act as important sources of infection. In this way, the present study aims to investigate the occurrence of Coxiella burnetii in domestic and wild ruminants in Brazil. To this end, 188 cervus blood samples (143 Blastocerus dichotomus, 11 Ozotocerus bezoarticus, 27 Mazama gouazobira, 4 M. bororo and 3 M. americanum), captured in the states of MS, SP and MG, were subjected to DNA extraction and, subsequently to the nested (n) PCR for C. burnetii based on the heat shock protein (htpAB) gene IS1111 insertion element. In addition, 169 cervical serum samples were submitted to Immunofluorescence Reaction for the detection of anti-C. burnetii IgG antibodies. Adicionaly, samples of bovine sera presenting reproductive disorders were submitted to the Virus Reaction Neutralization for BoHV-1 and BVD, Microscopic Soroagglutination for Leptospira spp., Indirect Immunofluorescence Reaction for C. burnetii and T. gondii, and Indirect Enzyme Immunoabsorption Assay for N caninum and T. vivax. All blood samples were negative in nPCR, evidencing absence of circulating DNA of C. burnetii in the sampled c... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Michele Mologni (mologni@unoeste.br) on 2019-02-06T17:06:34Z No. of bitstreams: 1 Maykon Ramos Brasileiro.pdf: 195879 bytes, checksum: 8506daf0073cf47f0b9ce3020a93c843 (MD5) / Made available in DSpace on 2019-02-06T17:06:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maykon Ramos Brasileiro.pdf: 195879 bytes, checksum: 8506daf0073cf47f0b9ce3020a93c843 (MD5) Previous issue date: 2018-10-31 / . / A coxielose é uma zoonose associada à bactéria intracelular Coxiella burnetii sendo uma infecção comum em ruminantes e humanos de países asiáticos e europeus. No Brasil estudos epidemiológicos sobre a enfermidade são escassos. O presente estudo avaliou a presença de anticorpos anti-Coxiella (fase II) em 231 amostras de soro bovino provenientes de doze fazendas de leite e corte da região Oeste do estado de São Paulo, colhidas entre os anos de 2012-2018, que estavam mantidas em estoque sob congelamento a -25oC, utilizadas em outras rotinas diagnósticas. As amostras foram testadas pelo método ELISA, utilizando kit comercial importado (Bio-X - Diagnostics®). Do total avaliado, 176 (76,2%) animais foram sorologicamente positivos. Onze (91,6%) das 12 propriedades apresentaram ao menos um animal positivo, com prevalências variando entre 20 e 100%. Os resultados denotam alta prevalência da coxielose em bovinos de leite e corte na região Oeste Paulista, sugerindo que a enfermidade deve ser avaliada com relação aos potencias impactos na reprodução dos animais, incluindo diagnóstico diferencial com patógenos abortivos. Considerando-se o risco de transmissão zoonótica e o desconhecimento acerca da doença, as autoridades de saúde locais devem estar atentas a possíveis casos humanos subdiagnosticados ou confundidos com outras enfermidades similares.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-12-26T15:22:16Z No. of bitstreams: 1 Tese Monica Lemos Ammon Fernandez.pdf: 8355019 bytes, checksum: dfee6b67fb0314370a761d01a0ee90d4 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-12-26T15:22:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Monica Lemos Ammon Fernandez.pdf: 8355019 bytes, checksum: dfee6b67fb0314370a761d01a0ee90d4 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Febre Q é uma zoonose cosmopolita causada por Coxiella burnetii, pequena bactéria intracelular obrigatória gram-negativa e pleomórfica da ordem Legionellales. A doença, que ocorre como pequenos surtos ou como casos isolados, tem amplo espectro de manifestações clínicas, desde uma doença febril limitada, pneumonia, hepatite a endocardite e meningoencefalite. Carrapatos, animais de fazenda, domésticos e selvagens são reservatórios da infecção. A transmissão para o homem ocorre por inalação de aerossóis provenientes de urina, fezes, leite e produtos de abortamento ou menos comumente pela ingestão de leite cru de animais infectados. No Brasil, desde a primeira descrição de febre Q em 1953, em São Paulo, todos os casos têm sido identificados com base em teste sorológico e os poucos estudos soroepidemiológicos em população de risco apontam para a circulação de C. burnetii. Em 2008 foi possível confirmar um caso de febre Q em um paciente, a partir de análise sorológica e molecular. Com o objetivo de rastrear um foco de infecção por C. burnetii, um estudo epidemiológico descritivo foi desenvolvido na área de ocorrência do primeiro caso no Brasil de febre Q confirmado, em 2008, por análise molecular, no Município de Itaboraí, Rio de Janeiro. Análises sorológicas e moleculares foram realizadas em amostras biológicas de familiares e de cães, gatos, cabras e equinos existentes na área estudada, em 2009. Amostras de soro foram submetidas ao teste comercial de imunofluorescência indireta (PANBIOTM), título de corte de 64, para a pesquisa de anticorpo anti-C. burnetii, fases I e II. Amostras de sangue dos familiares e dos animais, assim como de leite, fezes e de secreção nasal, vaginal, além dos artrópodes, coletados nos animais, foram submetidas à PCR (reação em cadeia da polimerase) para a presença da bactéria, utilizando oligonucleotídeos para o gene alvo htpAB. Reatividade foi identificada em amostras de soro da esposa, de 2 dos 13 caninos, 05 de 10 caprinos e 02 das 03 ovinos. O genoma foi recuperado em amostra de sangue e/ou leite ou swab anal de 02 cães e 06 cabras. O sequenciamento dos produtos de PCR amplificados, do soro dos cães e do leite das cabras, mostraram identidade de 99% para as sequências depositadas no GenBank. Embora não seja uma doença de notificação, os dados obtidos confirmam a circulação deste agente zoonótico e servem de alerta para a necessidade de vigilância epidemiológica da febre Q, em especial em Itaboraí, devido, entre outros fatores, ao crescente desmatamento com ocupação de vastas áreas e da criação, informal e de caráter familiar, de cabras leiteiras por pequenos proprietários nas diversas áreas do território nacional. / Q fever is a zoonosis caused by Coxiella burnetii, a obligate intracellular and pleomorphic, small gram-negative bacterium of Legionellales order. The disease, which can occur as small outbreaks or isolated cases, has a broad spectrum of clinical manifestations, from a limited febrile illness, pneumonia, hepatitis, endocarditis, and meningoencephalitis. Ticks, farm animals, domestic and wild are reservoirs of infection. Transmission to humans occurs through inhalation of aerosols from urine, feces, milk and products of abortion or less commonly by ingestion of raw milk from infected animals. In Brazil, since the first description of Q fever in 1953, in Sao Paulo, cases have been identified by serological tests and very few seroepidemiological studies in the population at risk have been performed showing the circulation of C. burnetii. In 2008 it was possible to confirm a case of Q fever in a patient, from molecular and serological analysis. Aiming to track the source of infection for C. burnetii, a descriptive epidemiologic study was developed in the area of occurrence of the first case of Q fever in Brazil in 2008, confirmed by molecular analysis in Itaboraí, Rio de Janeiro. Serological and molecular analysis was performed on biological samples from family and dogs, cats, goats and horses in the area of studied in 2009. Serum samples were tested with commercial indirect immunofluorescence (PANBIOTM), a cutoff of 64, for the detection of anti-C. burnetii, phases I and II. Blood samples from family members and animals, like milk, feces and nasal discharge, vaginal, and arthropods collected in animals were subjected to PCR (polymerase chain reaction) for the presence of bacteria, using primers for htpAB the target gene. Reactivity was detected in serum samples from his wife, two of the 13 dogs, 05 of 10 goats and 02 of 03 sheeps. The genome was recovered in a sample of blood and / or milk or anal swabs from 02 dogs and 06 goats. The sequencing of the PCR products amplified from the serum of dogs and goats' milk, showed 99% identity to the sequences deposited in GenBank Although not a notifiable disease, our data confirm the circulation of this zoonotic agent and serve as a reminder of the need for surveillance of Q fever, especially in Itaboraí due, among other factors, the increasing deforestation and occupation of vast areas and the creation of informal and familiar character in dairy goats by smallholders in various areas of the country.

Submitted by Geandra Rodrigues (geandrar@gmail.com) on 2018-01-08T17:55:42Z No. of bitstreams: 1 letíciascafuttodefaria.pdf: 1095599 bytes, checksum: 1c63329ef1875b3086d3531350f36ccc (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-01-23T11:12:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 letíciascafuttodefaria.pdf: 1095599 bytes, checksum: 1c63329ef1875b3086d3531350f36ccc (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-23T11:12:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 letíciascafuttodefaria.pdf: 1095599 bytes, checksum: 1c63329ef1875b3086d3531350f36ccc (MD5) Previous issue date: 2017-08-22 / O objetivo desse trabalho foi estimar a prevalência de Coxiella burnetii em Queijo Minas Artesanal da microrregião do Serro e identificar os fatores associados à presença desse microrganismo nas propriedades estudadas. Foram sorteados aleatoriamente 55 produtores cadastrados no Instituto Mineiro de Agropecuária (IMA) para participar da pesquisa. Os produtores responderam a um questionário e foi coletada uma amostra de queijo de cada propriedade para representá-la. Nas amostras de queijo coletadas, foram realizadas as análises de Reação de Cadeia da Polimerase (PCR) para C. burnetii e sequenciamento dos produtos de DNA amplificados. Os dados provenientes das entrevistas e resultados das análises laboratoriais, uma vez sistematizados, formaram a base de dados do trabalho. A presença de DNA de C. burnetii foi considerada a variável dependente e as variáveis explicativas foram divididas em três grupos hierárquicos: distal (socioeconômicas e demográficas), intermediário (produção de queijo) e proximal (características do rebanho, produção de leite e ordenha). Os fatores associados à presença de C. burnetii nos queijos foram identificados por análises de regressão logística univariada e multivariada. Do total de amostras analisadas (n = 53), cinco (9,43%) apresentaram DNA de C. burnetii confirmado por sequenciamento. Os fatores associados com a presença de DNA de C. burnetii nos queijos foram: uso do pingo (soro- fermento) para a fabricação dos queijos (OR= 12,09), tipo de ordenha (OR= (16,45) e número de vacas em lactação (OR= 1,05). As variáveis que permaneceram no modelo final como explicativas para presença de C. burnetii nos queijos foram: número de vacas em lactação, tipo de ordenha e uso do pingo. A presença de DNA de C. burnetii nos queijos artesanais enfatiza, por um lado, a necessidade de medidas de controle mais rigorosas para que essa bactéria não esteja presente nos rebanhos de propriedades produtoras de queijos artesanais. Por outro lado, o conhecimento dos fatores associados à presença de C. burnetii nos queijos artesanais poderá auxiliar no estabelecimento de medidas preventivas e na criação de novas normas e legislação para a produção de queijos artesanais, já que essa lacuna na legislação seria algo para reflexão, dada a importância da febre Q para a saúde pública. / The objective of this study was to estimate the prevalence of Coxiella burnetii in Artisan Minas cheese of region of Serro and identify the factors associated with the presence of this organism in the properties studied. Were drawn at random 55 registered producers in the Instituto Mineiro de Agropecuária (IMA) to participate in the research. The producers responded to a questionnaire and was collected a sample of cheese at a property to represent her. The cheese samples collected, the analysis of reaction of polymerase chain reaction (PCR) to C. burnetii and sequencing of amplified DNA products. Data from the interviews and results of laboratory tests, once organized, form the basis of work data. The presence of DNA of C. burnetii was considered as the dependent variable and the explanatory variables were divided into three groups: hierarchical distal (socioeconomic and demographic), intermediate (cheese production) and proximally (characteristics of the herd, milk production and milk). The factors associated with the presence of C. burnetii in cheeses were identified by analysis of univariate and multivariate logistic regression. Of the total samples analyzed (n = 53), five (9.43%) presented DNA of C. burnetii confirmed by sequencing. The factors associated with the presence of DNA of C. burnetii in cheeses were: use of the pingo (serum- baking) for the manufacture of the cheeses (OR = 12.09), type of milking (OR = (16.45) and number of lactating cows (OR = 1.05). The variables that remained in the final model as explanatory for the presence of C. burnetii in cheeses were: number of lactating cows, milking and type use the pingo. The presence of DNA of C. burnetii in artisanal cheeses emphasizes, on the one hand, the need for more stringent control measures so that this bacteria is not present in flocks of artisanal cheese-producing properties. On the other hand, the knowledge of the factors associated with the presence of C. burnetii in artisanal cheeses may assist in establishing preventive measures and the creation of new standards and legislation for the production of artisanal cheeses, since this gap in the legislation would be something for reflection, given the importance of Q fever to public health.