Cette thèse se propose de retracer l’histoire de la Junta de Philippe II. Encore très méconnue des historiens, la Junta fut porteuse d’un renouveau de la façon de gouverner et d’appréhender le politique en Espagne à la charnière des XVIe et XVIIe siècles. En s’insérant entre les diverses étapes de la consultation et la décision royale, et en situant l’action de ses membres au cœur de la gestion quotidienne des affaires, son influence modifia en profondeur la façon dont la structure conciliaire traditionnelle tâchait de répondre au flux incertain du politique. La confrontation quotidienne des membres de la Junta aux affaires les plus variées offre également à l’historien une perspective d’ensemble sur le gouvernement de la Monarchie. Les multiples processus de négociation, la conduite de projets d’ampleur et les diverses réactions aux contingences révèlent une action politique davantage soumise aux tensions et aux rapports de force des acteurs qu’à la ferme volonté du monarque. La Junta constitue ainsi un observatoire privilégié de la construction du choix politique à la fin du règne de Philippe II. Cherchant à s’émanciper à la fois des études sur les institutions de gouvernement et de l’approche prosopographique, ce travail explore de nouvelles pistes d’interprétation centrées sur les pratiques de gouvernement. Production documentaire, organisation du travail de bureau, élaboration de nouveaux dispositifs de consultation, la Junta permet de mieux comprendre quels étaient les mécanismes de la polysynodie et comment ils évoluèrent à son contact. / This thesis intends to trace the history of the Junta of Philip II. Still little known by historians the Junta brought change into the way of governing and of understanding politics in Spain at the transition from the XVIth to the XVIIth century. Being inserted between the several stages of consultation and the royal decision, and by placing the action of its members at the heart of the daily management of cases, its influence deeply modified the way in which the traditional conciliar structure tried to respond to the uncertain stream of politics.The daily confrontation of the members of the Junta with the most diverse cases also gives the historian an overview of the government of the Monarchy. The multiple negotiation processes, the management of wide projects and the several reactions to contingencies reveal a political action more dependent on tensions and balances of power between the actors than on a firm will of the monarch. The Junta thus constitutes a valuable observatory of the construction of political choice at the end of the reign of Philip II. Aiming at emancipating itself from both the studies on governing institutions and the prosopographical approach, this work explores new paths of interpretation focused on the practices of government. Document production, office work organisation, creation of new tools of consultation: the Junta allows to understand better what the mechanisms of the polysynody were and how they evolved because of it.