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Investigação de sapovírus em amostras de swab nasofaringeano e fezes de crianças hospitalizadas de Goiânia, Goiás / Investigation of sapovirus in nasopharyngeal swab samples and feces of hospitalized children from Goiânia, Goiás

Silva, Thairiny Neres 03 October 2017 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-13T10:36:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thairiny Neres Silva - 2017.pdf: 2022674 bytes, checksum: a9ff46169fe46df4f2909e2719e18791 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-13T10:36:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thairiny Neres Silva - 2017.pdf: 2022674 bytes, checksum: a9ff46169fe46df4f2909e2719e18791 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T10:36:47Z (GMT). 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Samples of faeces and nasopharyngeal swabs from all children were submitted to extraction of the genetic material from a commercial kit and screened for sapovirus by RT-qPCR. The viral load was determined by constructing a standard curve from recombinant plasmid. A faecal sample and a nasopharyngeal swab sample were obtained and 47% of the children were positive for sapovirus in at least one of the samples collected, being 10.7% positive only in faecal samples and 28.4% positive only in the samples of nasopharyngeal swab. Regarding viral load, a median of 7.77 x 108 CG / mL was found for stool samples. Regarding the viral load of the nasopharyngeal swab samples, a median 1.54 x 108 CG / mL was observed and a statistically significant result was observed (13/14 p = 0.01), for the samples with viral load above the median obtained in the rainy season. The median viral load of samples from positive children in both clinical specimens was 2.33 x 108 CG / mL in the faeces and 2.67 x 108 CG / mL in the nasopharyngeal swab. Two of these children presented a considerably higher viral load when compared to the others. It is hoped that the data obtained may contribute to a better understanding of the molecular epidemiology of sapoviruses, as well as to the development of better preventive measures, in order to limit the risk of transmission of sapoviruses, especially in a hospital environment. This is the first study to carry out the research and detection of sapovirus in a respiratory tract sample, which could suggest a possible alternative route of viral transmission. / Sapovírus são importantes agentes causadores de gastroenterite aguda no mundo todo, sendo mais frequentemente detectados em crianças menores de cinco anos. O presente estudo teve como objetivo, avaliar o índice de positividade e carga viral de sapovírus em amostras de fezes e swab nasofaringeano de crianças, em associação com os sintomas apresentados por essas crianças. Participaram do estudo 102 crianças hospitalizadas no Hospital Materno Infantil, apresentando sintomas de gastroenteríte, atendidas entre o período de maio de 2014 a maio de 2015, sendo obtidas uma amostra de fezes e uma amostra de swab nasofaringeano de cada uma delas. As amostras de fezes e de swab nasofaringeano de todas as crianças, foram submetidas a extração do material genético a partir de kit comerciale triadas para sapovírus por RT-qPCR. A carga viral foi determinada através da construção de uma curva padrão, a partir de plasmídeo recombinante. Foram obtidas uma amostra de fezes e uma de amostra de swab nasofaringeano sendo 47% das crianças foram positivas para sapovírus em pelo menos uma das amostras coletadas, sendo 10,7% positivas apenas nas amostras de fezes e 28,4% positivas apenas nas amostras de swab nasofaringeano. Em relação a carga viral constatou-se uma mediana 7,77 x 10 8 CG/mL para as amostras de fezes. Em relação a carga viral das amostras de swab nasofaringeano, foi observada uma mediana 1,54 x 10 8 CG/mL e um resultado estatisticamente significativo foi observado (13/14 p= 0,01), para as amostras com carga viral acima da mediana obtidas no período chuvoso. A mediana da carga viral das amostras proveniente das crianças com positividade em ambos espécimes clínicos foi de 2,33 x 10 8 CG/mL nas fezes e de 2,67 x 10 8 CG/mL nos swab nasofaringeano. Duas dessas crianças apresentaram carga viral consideravelmente mais elevada, quando comparada com as demais. Espera-se que os dados obtidos possam contribuir para um melhor entendimento da epidemiologia molecular dos sapovírus, bem como para que melhores medidas preventivas sejam desenvolvidas, a fim de limitar os riscos de transmissão dos sapovírus, especialmente em ambiente hospitalar. Este é o primeiro estudo a realizar a pesquisa e detecção de sapovírus em amostra do trato respiratório, o que poderia sugerir uma possível rota alternativa de transmissão viral.

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