La gastroenteritis ocasionada por rotavirus se encuentra entre las principales causas de morbilidad y mortalidad infantil. En el Perú rotavirus representa el 30% de las muertes por diarrea y 4% del total de defunciones, afectando principalmente a niños menores de 5 años. Desde el año 2009 el Perú implementó la vacuna contra rotavirus en su programa de vacunación universal, sin embargo, debido a la aparición de genotipos emergentes, es importante monitorear la diversidad del virus para evaluar los posibles efectos sobre la eficacia de la vacuna. Pese a esto, existen escasos reportes de la epidemiología de rotavirus en nuestro país. El objetivo del presente estudio es determinar la presencia y los genotipos G y P de Rotavirus en muestras provenientes de niños con gastroenteritis aguda atendidos en un hospital de Lima entre Octubre del 2013 y Octubre del 2014. Como metodología se utilizó el RT-PCR en tiempo real (qRT- PCR) para la detección del rotavirus y el RT PCR convencional para la genotipificación de las muestras positivas, asimismo se secuenciaron algunas muestras para determinar los genotipos finales. De las 448 muestras analizadas en el estudio, 45 (10%) tuvieron resultado positivo para rotavirus. Entre los genotipos identificados, G12 (40.9%), G2 (25%) y P[8] (77.3%) fueron los más frecuentes y la combinación G/P más dominante fue G12P[8] (54.5%). Los resultados evidenciaron una alta prevalencia de G12P[8]entre los casos positivos, genotipo no reportado previamente en el Perú. Se recomienda realizar nuevos estudios para evaluar las variaciones en la diversidad de rotavirus circulantes en el Perú y los posibles efectos ante la presión selectiva de la vacuna.Rotavirus gastroenteritis is one of the leading causes of morbidity and mortality in children. In Peru rotavirus represents 30% of deaths due to diarrhea and is responsible of 4% of the total deaths, affecting mostly children under 5 years. Peru implemented the rotavirus vaccine in its universal vaccination program since 2009. Due to the appearance of emerging genotypes, it is important to evaluate the diversity of the virus in order to determine possible effects on vaccine efficacy. However there are few reports on the molecular epidemiology of rotavirus in our country. The aim of this study was to determine the presence and Rotavirus G and P genotypes in samples from children with acute gastroenteritis attended in a hospital in Lima between October 2013 and October 2014. The method usedfor the detection of rotavirus was real time RT-PCR (qPCR) and conventional RT-PCR to determine the genotype of positive samples. Additionally, sequencing was used to confirm the final genotype of some samples. Of the 448 samples analyzed, 45 (10%) were positive for rotavirus.G12 (40.9%), G2 (25%) and P[8] (77.3%) were the most frequent genotypes and the most prevalent G/P combination was G12P[8] (54.5%). The results showed a high prevalence of G12P[8] among the positive cases. G12P[8] has not been previously reported in Peru. We recommend more in deep studies to identify the diversity of circulating genotypes in Peru.

Propósito: Evaluar el valor del Vesikari Scoring System (VSS) como herramienta diagnóstica en la predicción de patógenos en niños con gastroenteritis aguda. Métodos: En un estudio retrospectivo, se analizó 247 historias clínicas y registros laboratoriales del Hospital de Emergencias Pediátricas (Lima, Perú), utilizando el diagnóstico de CIE-10 A00-A009 (enfermedades intestinales infecciosas). Se dividió según los patógenos detectados: no específico, viral y bacteriana. Se detectaron las bacterianas por coprocultivo y las virales por inmunoanálisis. Los casos no específicos tenían ambos resultados negativos o no hubo pruebas laboratoriales. Se ha calculado la sensibilidad, especificidad, valores predictivos negativos (VPN) y positivos (VPP), índice de probabilidad (LR) y el área bajo la curva (ROC). Resultado: El área bajo la curva ROC del VSS no fue significativo para determinar la etiología bacteriana ni viral. En el punto de corte de 9 en VSS, se analizó VPP (18.29%) y VPN (89.47%). Los leucocitos en heces tuvieron un área bajo la curva ROC de 0.8831(IC95% 0,79-0,96 y p=0.04) para etiología bacteriana, con una sensibilidad de 80.95%, especificidad de 88.24% y LR- de 0.22. Los leucocitos en heces con un punto de corte de ≥20, tuvo una precisión aceptable para diagnosticar gastroenteritis bacteriana. La prueba de moco en heces tuvo una sensibilidad de 83.33%, especificidad de 82.35% y VPP de 95.89%. Conclusión: El VSS no es una herramienta adecuada para determinar etiología de gastroenteritis viral y bacteriana. Sin embargo, se ha determinado que los leucocitos en heces con un punto de corte de ≥20 leucocitos por campo y moco en heces permite identificar la gastroenteritis aguda bacteriana. / Purpose: To evaluate the Vesikari Scoring System (VSS) as a valuable diagnostic tool for predicting pathogens in children with acute gastroenteritis. Methods: In this retrospective study were analyzed 247 clinical and laboratory records of the Pediatric Emergency Hospital (Lima, Peru), with the diagnosis of ICD-10 A00-A009 (Intestinal Infectious diseases). According to the pathogens detected were divided into groups: non-specific, viral, and bacterial. Bacteria were detected by stool culture, viral pathogens by immune analysis. The non-specific group had negative on both tests, or they did not perform. We calculated sensitivity, specificity, negative and positive predictive values, negative and positive likelihood ratios, and receiver operating characteristic curves.  Results: The area under the ROC curve of VSS was not significant for viral and bacterial etiology. The cut-off point of 9 in VSS was calculated by analyzing PPV (18,29%) and NPV (89,47%). The fecal leukocyte had a ROC of 0.8831 (IC95% 0.79-0.96 and p=0.04) for bacterial group, with a sensibility of 80,95%, specificity of 88,24% and LR- of 0,22. At a cut-off point of ≥20 fecal leukocytes was an acceptable diagnostic accuracy for bacterial gastroenteritis. The stool mucus for the bacterial group had a sensibility of 83,33%, a specificity of 82,35%, and a PPV of 95,89%. Conclusion: VSS is not an adequate diagnostic tool to differentiate viral from bacterial etiology. Nevertheless, we determine that a test of fecal leukocytes, with a cut-off point of ≥20 leukocytes per field and mucus in stools, allow us to identify the bacterial etiology of gastroenteritis. / Tesis