Les patrons de structuration des espèces animales à fine et à large échelles peuvent être façonnés par des facteurs environnementaux et des traits comportementaux individuels. Les objectifs de cette thèse combinant des approches sociales, génétiques, isotopiques et morphométriques sont de décrire et comprendre i) les structures sociale, écologique et génétique de la population de grands dauphins du golfe Normand-Breton (NB) et ii) la structure de population de l'espèce à l'échelle de l'Atlantique Nord-Est (ANE). Les grands dauphins du golfe NB forment une unique population génétique qui est composée de trois ensembles sociaux et écologiques distincts. Les associations entre individus semblent être influencées par l'écologie et non par les liens de parenté. La structure génétique du grand dauphin à l'échelle de l'ANE est hiérarchique, avec deux écotypes, l'un côtier et l'autre pélagique, qui sont chacun divisé en deux populations. Les populations côtières sont issues d'une population pélagique et auraient colonisé les habitats côtiers libérés lors de la dernière déglaciation, ce qui a permis la diversification de l'espèce. Cette structure semble maintenue par les spécialisations écologiques et le comportement social des individus. Par ailleurs, l'origine pélagique des grands dauphins du golfe NB pourrait expliquer certains de leurs traits sociaux. Pour conclure, les patrons de structuration à fine et à large échelles de ce prédateur supérieur semblent influencés par les comportements sociaux et écologiques, les conditions environnementales présentes et passées ainsi que par son histoire évolutive. L'absence de différences morphologiques marquées entre les deux écotypes pourrait s'expliquer par leur divergence relativement récente ou par un faible contraste entre les habitats pélagiques et côtiers dans l'ANE. Ce travail souligne l'intérêt de combiner de multiples approches à différentes échelles temporelles et spatiales pour comprendre la structure sociale et la structure de population d'espèces mobiles et cryptiques. Ces résultats ont également des implications majeures pour la conservation, en particulier pour la définition d'unités de gestion. / Complex interactions between environmental factors and behavioral traits may shape the fine and large scale structuring patterns of animal species. The objectives of this dissertation were to describe and understand i) the fine-scale social, ecological and genetic structures of bottlenose dolphins in the Normano-Breton (NB) gulf and ii) the population structure of the species at the scale of the North-East Atlantic (NEA) by combining social, genetic, stable isotope and morphometric approaches. Coastal bottlenose dolphins in the NB gulf form a single genetic population subdivided in three social and ecological clusters. Ecology but not kinship may influence association patterns. In the NEA, bottlenose dolphin genetic structure is hierarchical. They form two ecotypes, i.e. coastal and pelagic, each of them being further divided in two populations. This genetic structure was likely triggered by past changes in the environment (i.e. deglaciation) that created ecological opportunities for diversification. Ecological specializations and social behavior may maintain genetic divergence. In turn, the pelagic origin of bottlenose dolphins in the NB gulf may explain some of their social structure traits. Thus, an interaction between social and ecological behaviors, current and past environmental conditions, and evolutionary history may drive the fine and large scale structuring patterns of this top predator. The absence of strong differences in morphology between the two ecotypes may be explained by their relatively recent divergence or by low contrasts between the pelagic and coastal habitats in the NEA. This work highlights the power of combining approaches at different temporal and spatial scales for assessing the social and population structures of highly mobile and difficult to access species. The results have also major conservation implications especially for the designation of management units.