Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-29Bitstream added on 2014-06-13T21:03:51Z : No. of bitstreams: 1 silva_dcg_dr_jabo.pdf: 913437 bytes, checksum: aa269781e66dfd6e36870d5868db52c3 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A ferrugem asiática da soja é causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi. Quatro genes de resistência à ferrugem da soja distintos, Rpp1 a 4, foram descritos. O objetivo deste trabalho foi mapear geneticamente os genes de resistência Rpp2 e Rpp4 e identificar genes induzidos pela resposta de defesa mediada pelo gene Rpp2. Duas populações F2:3 derivadas dos cruzamentos entre as linhagens resistentes PI 230970 (Rpp2) e PI 459025 (Rpp4) com a cultivar suscetível BRS 184, e marcadores SSR, foram utilizados neste estudo. Os locos Rpp2 e Rpp4 foram mapeados nos grupos de ligação J e G da soja, respectivamente, e os marcadores associados terão grande valor no processo de seleção assistida por marcadores para este caráter. Quatro bibliotecas de cDNA, derivadas de folhas do genótipo resistente PI 230970 (Rpp2) e do genótipo suscetível Embrapa 48, obtidas às 24 e 192 horas após a inoculação com esporos de P. pachyrhizi, foram geradas utilizando a metodologia SSH e tiveram seu padrão de expressão avaliado por análise de microarranjos de cDNA. Foram produzidas 3.807 sequências viáveis, das quais 670 foram sequências únicas, sendo 149 destas (22,2%) novas sequências da soja. A categoria funcional mais representativa para as quatro bibliotecas foi proteção celular, defesa e virulência. Apenas 65 trnascritos foram diferencialmente expressos, estando eles envolvidos na geração de espécies reativas de oxigênio, fitoalexinas e proteínas antimicrobianas, morte celular e senescência, modificação, estabilização e degradação protéica, controle da expressão gênica e reforço de parede celular. Este trabalho permitiu a identificação de novas seqüências da soja e contribuiu para a elucidação da estratégia de defesa mediada pelo gene Rpp2. / Asian soybean rust is caused by the fungus Phakopsora pachyrhizi. Four resistance genes to this disease, Rpp1 to 4, were previously identified. The aim of this work was to identify SSR markers linked to Rpp2 and Rpp4, and to characterize genes up-regulated under soybean-Asian rust interaction. Two F2:3 populations derived from the crosses PI 230970 (Rpp2) x BRS 184 and PI 459025 (Rpp4) x BRS 184, and SSR markers were used for mapping. Rpp2 and Rpp4 loci were mapped on the soybean linkage groups J and G, respectively, and the associated markers will be highly valuable to assist the introduction of these genes into soybean cultivars. Four cDNA libraries derived from leaf samples of the resistant genotype PI 230970 and the susceptible genotype Embrapa 48, obtained at 24 and 192 hours after inoculation, were generated using SSH and evaluated by cDNA microarray analysis. A total of 3,807 reliable ESTs were obtained, 670 from them were unique. The most representative functional category in all libraries was “cell rescue, defense and virulence”. Only 65 transcripts were differentially expressed among treatments, and were involved in the generation of reactive oxygen species, phytoalexins and antimicrobial proteins; cell death and senescence; protein fate; gene expression control; and reinforcement of cell wall. This work produced novel soybean sequences and contributed to the comprehension of the soybean mechanism of resistance to Asian rust mediated by Rpp2.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-03-18Bitstream added on 2014-06-13T19:44:35Z : No. of bitstreams: 1 marchiorato_ia_dr_jabo.pdf: 517282 bytes, checksum: f2d40c2e6db9d7a211f668d69642bc62 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O conhecimento da distribuição espacial dos nematóides nas lavouras é imprescindível para adoção de práticas de manejo. Nas grandes fazendas do Mato Grosso, pelo fato de não se ter uma informação precisa sobre as áreas infestadas dentro dos talhões, os produtores preferem não adotar nenhuma medida de manejo, já que, em função do custo e do ponto de vista operacional, seria inviável fazê-lo em toda a área. Com os mapas de variabilidade do potencial de produtividade dos talhões ou partes deles, cujo potencial de produtividade está abaixo da expectativa, em função do nível da tecnologia de produção adotado, o produtor pode, na safra atual, certificar-se se os nematóides, problemas de fertilidade, combinações desses ou outras causas estão sendo os fatores limitantes à realização do potencial de produtividade do talhão. O presente estudo foi conduzido numa parceria entre o Laboratório de Nematologia da UNESP/FCAV, Câmpus de Jaboticabal-SP e a Empresa Globalsat Monitoramento Agrícola com sede em Rondonópolis-MT, com objetivo de avaliar a eficácia dos mapas de variabilidade do potencial de produtividade obtido com imagens de satélite como instrumento auxiliar às decisões sobre o manejo de nematóides na cultura da soja. O mapa de variabilidade do potencial de produtividade da Fazenda Aimi, no Município de Rondonópolis, foi utilizado no estudo. As médias do potencial de produtividade nas áreas correspondentes às diferentes classes de potencial foram negativamente correlacionadas com as populações de Pratylenchus. brachyurus obtidas nas amostras de solo e raízes coletadas nessas áreas, confirmando que os mapas em questão são instrumentos auxiliares valiosos para a tomada de decisão sobre o manejo de nematóides. / The knowledge of the spatial distribution of nematodes in crops is essential to adoption of management practices. In big farms of Mato Grosso, because of not have accurate information on infested areas within the plots, producers prefer not adopt any measure of management because, depending on the cost and operational point of view, it would be impracticable make it across the area. With maps of variability of the potential of productivity of the plots or parts of them, whose potential productivity is below the expectations, depending on the level of technology used in production, the producer may, in the current crop, make sure that the nematodes, problems of fertility, or combinations of both or other causes are the limiting factors to the achievement of the potential productivity of the plot. This study was carried out in a partnership between the Laboratorio de Nematologia of UNESP/FCAV, Câmpus de Jaboticabal-SP, and Globalsat Monitoramento Agrícola Company based in Rondonópolis-MT, to evaluate the effectiveness of maps of the potential variability in productivity achieved with satellite imagery as a tool to assist decisions on the management of nematodes on soybean. The map of variability of the potential of productivity from of Fazenda Aimi in the county of Rondonópolis was used in the study. The averages of the potential for productivity in the areas corresponding to different classes of potential were negatively correlated with the population of P. brachyurus obtained in samples of soil and roots collected in those areas, confirming that the maps in question are valuable auxiliary instruments for decision on the management of nematodes.

Resumo: A ferrugem asiática da soja é causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi. Quatro genes de resistência à ferrugem da soja distintos, Rpp1 a 4, foram descritos. O objetivo deste trabalho foi mapear geneticamente os genes de resistência Rpp2 e Rpp4 e identificar genes induzidos pela resposta de defesa mediada pelo gene Rpp2. Duas populações F2:3 derivadas dos cruzamentos entre as linhagens resistentes PI 230970 (Rpp2) e PI 459025 (Rpp4) com a cultivar suscetível BRS 184, e marcadores SSR, foram utilizados neste estudo. Os locos Rpp2 e Rpp4 foram mapeados nos grupos de ligação J e G da soja, respectivamente, e os marcadores associados terão grande valor no processo de seleção assistida por marcadores para este caráter. Quatro bibliotecas de cDNA, derivadas de folhas do genótipo resistente PI 230970 (Rpp2) e do genótipo suscetível Embrapa 48, obtidas às 24 e 192 horas após a inoculação com esporos de P. pachyrhizi, foram geradas utilizando a metodologia SSH e tiveram seu padrão de expressão avaliado por análise de microarranjos de cDNA. Foram produzidas 3.807 sequências viáveis, das quais 670 foram sequências únicas, sendo 149 destas (22,2%) novas sequências da soja. A categoria funcional mais representativa para as quatro bibliotecas foi proteção celular, defesa e virulência. Apenas 65 trnascritos foram diferencialmente expressos, estando eles envolvidos na geração de espécies reativas de oxigênio, fitoalexinas e proteínas antimicrobianas, morte celular e senescência, modificação, estabilização e degradação protéica, controle da expressão gênica e reforço de parede celular. Este trabalho permitiu a identificação de novas seqüências da soja e contribuiu para a elucidação da estratégia de defesa mediada pelo gene Rpp2. / Abstract: Asian soybean rust is caused by the fungus Phakopsora pachyrhizi. Four resistance genes to this disease, Rpp1 to 4, were previously identified. The aim of this work was to identify SSR markers linked to Rpp2 and Rpp4, and to characterize genes up-regulated under soybean-Asian rust interaction. Two F2:3 populations derived from the crosses PI 230970 (Rpp2) x BRS 184 and PI 459025 (Rpp4) x BRS 184, and SSR markers were used for mapping. Rpp2 and Rpp4 loci were mapped on the soybean linkage groups J and G, respectively, and the associated markers will be highly valuable to assist the introduction of these genes into soybean cultivars. Four cDNA libraries derived from leaf samples of the resistant genotype PI 230970 and the susceptible genotype Embrapa 48, obtained at 24 and 192 hours after inoculation, were generated using SSH and evaluated by cDNA microarray analysis. A total of 3,807 reliable ESTs were obtained, 670 from them were unique. The most representative functional category in all libraries was "cell rescue, defense and virulence". Only 65 transcripts were differentially expressed among treatments, and were involved in the generation of reactive oxygen species, phytoalexins and antimicrobial proteins; cell death and senescence; protein fate; gene expression control; and reinforcement of cell wall. This work produced novel soybean sequences and contributed to the comprehension of the soybean mechanism of resistance to Asian rust mediated by Rpp2. / Orientador: Antonio Orlando Di Mauro / Coorientador: Ricardo Vilela Abdelnoor / Coorientador: Alexandre Lima Nepomuceno / Banca: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Rinaldo César de Paula / Banca: José Baldin Pinheiro / Banca: Francismar Corrêa Marcelino / Doutor

Orientador: Jaime Maia dos Santos / Banca: Arlindo Leal Boiças Júnior / Banca: Clélia Aparecida Iunes Lapera / Banca: Maria Amélia dos Santos / Banca: Júlio Cesar Galli / Resumo: O conhecimento da distribuição espacial dos nematóides nas lavouras é imprescindível para adoção de práticas de manejo. Nas grandes fazendas do Mato Grosso, pelo fato de não se ter uma informação precisa sobre as áreas infestadas dentro dos talhões, os produtores preferem não adotar nenhuma medida de manejo, já que, em função do custo e do ponto de vista operacional, seria inviável fazê-lo em toda a área. Com os mapas de variabilidade do potencial de produtividade dos talhões ou partes deles, cujo potencial de produtividade está abaixo da expectativa, em função do nível da tecnologia de produção adotado, o produtor pode, na safra atual, certificar-se se os nematóides, problemas de fertilidade, combinações desses ou outras causas estão sendo os fatores limitantes à realização do potencial de produtividade do talhão. O presente estudo foi conduzido numa parceria entre o Laboratório de Nematologia da UNESP/FCAV, Câmpus de Jaboticabal-SP e a Empresa Globalsat Monitoramento Agrícola com sede em Rondonópolis-MT, com objetivo de avaliar a eficácia dos mapas de variabilidade do potencial de produtividade obtido com imagens de satélite como instrumento auxiliar às decisões sobre o manejo de nematóides na cultura da soja. O mapa de variabilidade do potencial de produtividade da Fazenda Aimi, no Município de Rondonópolis, foi utilizado no estudo. As médias do potencial de produtividade nas áreas correspondentes às diferentes classes de potencial foram negativamente correlacionadas com as populações de Pratylenchus. brachyurus obtidas nas amostras de solo e raízes coletadas nessas áreas, confirmando que os mapas em questão são instrumentos auxiliares valiosos para a tomada de decisão sobre o manejo de nematóides. / Abstract: The knowledge of the spatial distribution of nematodes in crops is essential to adoption of management practices. In big farms of Mato Grosso, because of not have accurate information on infested areas within the plots, producers prefer not adopt any measure of management because, depending on the cost and operational point of view, it would be impracticable make it across the area. With maps of variability of the potential of productivity of the plots or parts of them, whose potential productivity is below the expectations, depending on the level of technology used in production, the producer may, in the current crop, make sure that the nematodes, problems of fertility, or combinations of both or other causes are the limiting factors to the achievement of the potential productivity of the plot. This study was carried out in a partnership between the Laboratorio de Nematologia of UNESP/FCAV, Câmpus de Jaboticabal-SP, and Globalsat Monitoramento Agrícola Company based in Rondonópolis-MT, to evaluate the effectiveness of maps of the potential variability in productivity achieved with satellite imagery as a tool to assist decisions on the management of nematodes on soybean. The map of variability of the potential of productivity from of Fazenda Aimi in the county of Rondonópolis was used in the study. The averages of the potential for productivity in the areas corresponding to different classes of potential were negatively correlated with the population of P. brachyurus obtained in samples of soil and roots collected in those areas, confirming that the maps in question are valuable auxiliary instruments for decision on the management of nematodes. / Doutor