Cloud-native is a new computing paradigm that takes advantage of key characteristics of cloud computing, where applications are packaged as containers. The lifecycle of containerized applications is typically managed by container orchestration tools such as Kubernetes, the most popular container orchestration system that automates the containers’ deployment, maintenance, and scaling. Kubernetes has become the de facto standard for container orchestrators in the cloud-native era. Meanwhile, with the increasing demand for High-Performance Computing (HPC) over the past years, containerization is being adopted by the HPC community and various processors and special-purpose hardware are utilized to accelerate HPC applications. The architecture of cloud systems has been gradually shifting from homogeneous to heterogeneous with different processors and hardware accelerators, which raises a new challenge: how to exploit different computing resources efficiently? Much effort has been devoted to improving the use efficiency of computing resources in heterogeneous systems from the perspective of task scheduling, which aims to match different types of tasks to optimal computing devices for execution. Existing proposals do not take into account the variation in I/O performance between heterogeneous nodes when scheduling tasks. However, I/O performance is an important but often overlooked factor that can be a potential performance bottleneck for HPC tasks. This thesis proposes an I/O-aware scheduler named cmio-scheduler for containerized data-intensive HPC tasks in Kubernetes-based heterogeneous clusters, which is aware of the I/O throughput of compute nodes when making task placement decisions. In principle, cmio-scheduler assigns data-intensive HPC tasks to the node that fulfills the tasks’ requirements for CPU, memory, and GPU and has the highest I/O throughput. The experimental results demonstrate that cmio-scheduler reduces the execution time by 19.32% for the overall workflow and 15.125% for parallelizable tasks on average. / Cloud-native är ett nytt dataparadigm som drar nytta av de viktigaste egenskaperna hos molntjänster, där applikationer paketeras som behållare. Livscykeln för applikationer i containrar hanteras vanligtvis av verktyg för containerorkestrering, t.ex. Kubernetes, det mest populära systemet för containerorkestrering, som automatiserar installation, underhåll och skalning av containrar. Kubernetes har blivit de facto-standard för containerorkestrar i den molnnativa eran. Med den ökande efterfrågan på högpresterande beräkningar (HPC) under de senaste åren har containerisering antagits av HPC-samhället och olika processorer och specialhårdvara används för att påskynda HPC-tillämpningar. Arkitekturen för molnsystem har gradvis skiftat från homogen till heterogen med olika processorer och hårdvaruacceleratorer, vilket ger upphov till en ny utmaning: hur kan man utnyttja olika datorresurser på ett effektivt sätt? Mycket arbete har ägnats åt att förbättra utnyttjandet av datorresurser i heterogena system ur perspektivet för uppgiftsfördelning, som syftar till att matcha olika typer av uppgifter till optimala datorutrustning för utförande. Befintliga förslag tar inte hänsyn till variationen i I/O-prestanda mellan heterogena noder vid schemaläggning av uppgifter. I/O-prestanda är dock en viktig men ofta förbisedd faktor som kan vara en potentiell flaskhals för HPC-uppgifter. I den här avhandlingen föreslås en I/O-medveten schemaläggare vid namn cmio-scheduler för containeriserade dataintensiva HPC-uppdrag i Kubernetes-baserade heterogena kluster, som är medveten om beräkningsnodernas I/O-genomströmning när den fattar beslut om placering av uppdrag. I princip tilldelar cmio-scheduler dataintensiva HPC-uppgifter till den nod som uppfyller uppgifternas krav på CPU, minne och GPU och som har den högsta I/O-genomströmningen. De experimentella resultaten visar att cmio-scheduler i genomsnitt minskar exekveringstiden med 19,32 % för det totala arbetsflödet och med 15,125 % för parallelliserbara uppgifter.