Made available in DSpace on 2016-06-15T17:47:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 sadia_ali_ioc_mest_2012.pdf: 2556754 bytes, checksum: 4021afcde5f4b6bf66a9b56032439b23 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Made available in DSpace on 2016-07-05T23:52:49Z (GMT). No. of bitstreams: 3 sadia_ali_ioc_mest_2012.pdf.txt: 336057 bytes, checksum: f697a3227b778cfb3d4acd605c43b9c9 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) sadia_ali_ioc_mest_2012.pdf: 2556754 bytes, checksum: 4021afcde5f4b6bf66a9b56032439b23 (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O sarampo é uma doença exantemática viral, altamente infecciosa, causada por um vírus da família Paramyxoviridae, gênero Morbillivirus que, apesar de estar disponível uma vacina, segura e eficaz contra a doença, esta ainda constitui uma importante causa de morbidade e mortalidade infantil em muitos países em desenvolvimento. Embora exista apenas um tipo antigênico do vírus do sarampo, estudos de caracterização genética dos vírus de tipo selvagem permitiram a identificação oito subtipos (A-H) e 24 genótipos. O Brasil eliminou a transmissão autóctone do vírus do sarampo a partir do ano 2000. A partir de então foram confirmados vários casos de sarampo importados ou relacionados a importações, principalmente do genótipo D4. A epidemiologia molecular dos vírus do sarampo baseada nas análises da região C-terminal da nucleoproteína tem demonstrado uma diversidade limitada entre as cepas circulantes, dificultando dessa forma a determinação da origem dos vírus usando apenas essa região. O objetivo deste trabalho foi caracterizar geneticamente os genótipos D4 dos vírus do sarampo detectados no Brasil no período de 2003 a 2012, e para tal, as sequências da proteína H completa e do gene Nparcial foram analisadas Os casos positivos para o genótipo D4 foram previamente identificados pela amplificação dos 450nt da região C-terminal da proteína N por RT-PCR, as sequências completas do gene H destas amostras foram diretamente amplificadas por RT-PCR a partir das amostras clínicas e posteriormente sequenciado. As análises filogenéticas da sequência de nucleotídeos do gene N e do gene H completo mostraram que os vírus do sarampo genótipo D4 detectados no Brasil podem ser resultado de várias importações de diferentes variantes do mesmo genótipo que circulam na Europa. Foram identificadas mutações nas sequências de aminoácidos tanto do gene N parcial como do gene H completo dos genótipos D4 dos vírus do sarampo detectados no Brasil. Estas mutações parecem não alterar as propriedades antigênicas e imunológicas do vírus / Measles is a highly infectious viral exanthem of the family Paramyxoviridae, genus Morbillivirus. Despite the availability of a safe and effective vaccine, measles infection continues to be an important cause of infantile morbidity and mortality in developing countries. Although there is only one antigenic type of the measles virus, genetic characterisation of the wild-type virus identified 8 subtypes (A-H), with a total of 24 genotypes being recognised. From 2000, the indigenous transmission of the measles virus has been eliminated in Brazil. Since then, several cases of imported measles, or cases associated with importations, were confirmed, principally of genotype D4. The molecular epidemiology of the measles virus based on analyses of the C-terminal region of the nucleoprotein has demonstrated a limited diversity between circulating strains, making it difficult to determine the origin of the virus by this genomic region alone. The objective of this study was to genetically characterise the D4 genotype of measles viruses detected in Brazil from 2003 to 2012 by analysing sequences from the complete H gene and partial N gene of the virus Cases positive for measles genotype D4 were previously identified by the amplification of a 450nt of the C-terminal region of the N protein by RT-PCR. The complete H gene from these samples was amplified by RT-PCR directly from clinical samples and subsequently sequenced. Phylogenetic analysis of the nucleotide sequences of the N gene and the complete H gene demonstrated that the measles D4 genotype detected in Brazil may have been a result of several importations of different variants of the same genotype circulating in Europe. Mutations were identified in the amino acid sequences of the N gene and complete H gene but they do not appear to change the immunological and antigenic properties of the virus