Thesis (Ph. D.)--University of Texas at Austin, 2003. / Vita. Includes bibliographical references. Available also from UMI Company.

Thesis (Ph. D.)--University of Missouri-Columbia, 2005. / The entire dissertation/thesis text is included in the research.pdf file; the official abstract appears in the short.pdf file (which also appears in the research.pdf); a non-technical general description, or public abstract, appears in the public.pdf file. Title from title screen of research.pdf file viewed on (July 18, 2006) Vita. Includes bibliographical references.

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Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T04:46:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_LiviaSartorattoRodriguesTeixeira_M.pdf: 2334745 bytes, checksum: a9acefe033f1368290ff1d80292a3ebd (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O gênero Dendropsophus (Anura: Hylidae) é composto por 94 espécies neotropicais, das quais somente 31 foram estudadas citogeneticamente. Embora as espécies desse gênero apresentem o mesmo número cromossômico (2n=30), diferem quanto ao número fundamental e em relação à localização de NORs. Entretanto, a escassez de marcadores citogenéticos e o alto número de espécies com cariótipos ainda não descritos impedem inferências acerca dos possíveis eventos envolvidos na diferenciação cariotípica nesse gênero. Com o intuito de fornecer novos dados para a análise evolutiva cariotípica em Dendropsophus, no presente trabalho foram descritos os cariótipos de duas espécies do grupo de D. marmoratus, D. seniculus e D. soaresi, ampliada a caracterização dos cariótipos de D. decipiens, D. meridianus e descrito o de D. werneri, três espécies do grupo de D. microcephalus. Para a localização cromossômica do gene ribossomal 5S foram utilizadas sequências isoladas de D. soaresi. Também foram utilizadas sondas para verificar a localização cromossômica de sequências teloméricas em todas as espécies estudadas. Por fim, na tentativa de gerar sondas cromossômicas para futuros estudos dos cromossomos telocêntricos encontrados em Dendropsophus, experimentos de pintura cromossômica foram conduzidos com D. nanus e D. walfordi. Dendropsophus seniculus e D. soaresi apresentaram cariótipos muito semelhantes, com a NOR localizada no braço longo dos cromossomos do par 9. Tais cariótipos se assemelham também àqueles das outras três espécies já cariotipadas do grupo de D. marmoratus (D. marmoratus, D. melanargyreus e D. nahdereri), embora o cariótipo de D. nahdereri difira dos demais por apresentar a NOR no braço curto dos cromossomos do par 1. Dois tipos de sequências de DNAr 5S foram isolados de D. soaresi. A sequência identificada como do tipo I é composta por 512 pb, dos quais 390 pb pertencem à região não-transcritora (NTS); já a sequência do tipo II apresenta NTS com apenas 249 pb. A sequência nucleotídica do DNAr 5S do tipo I é idêntica a uma sequência encontrada no hilídeo Gastrotheca riobambae. Quando utilizado como sonda, esse segmento de DNAr 5S foi mapeado no braço longo dos cromossomos do par 2 de D. seniculus e D. soaresi. Sondas compostas por sequências teloméricas detectaram exclusivamente as regiões cromossômicas terminais de D. seniculus, assim como previamente observado em D. marmoratus e D. melanargyreus. Já em D. soaresi, as sondas teloméricas também resultaram em marcações centroméricas e pericentroméricas, exceto nos pares telocêntricos identificados como 5 e 6. Dentre as três espécies do grupo D. microcephalus aqui viii analisadas, D. decipiens, D. meridianus e D. werneri, algumas diferenças puderam ser notadas. Enquanto D. meridianus e D. werneri apresentaram apenas um par de cromossomos telocêntricos de tamanho mediano, no cariótipo de D. decipiens três pares de cromossomos telocêntricos de tamanho mediano puderam ser observados. D. berthalutzae, espécie considerada do mesmo clado de D. decipiens, também apresenta cariótipo com três pares de telocêntricos de tamanho mediano. Em relação à localização da NOR, os cariótipos de D. decipiens, D. meridianus e D. werneri se assemelham, já que em todos a NOR foi localizada na região terminal do braço longo de cromossomos telocêntricos/subtelocêntricos identificados como 12. A partir de cromossomos telocêntricos microdissecados de D. nanus foi construída uma sonda capaz de identificar o par de cromossomos 15 dessa espécie. A sonda obtida, quando hibridada em cariótipos de outras linhagens de D. nanus e no cariótipo de D. walfordi, também detectou cromossomos telocêntricos de tamanho pequeno, sugerindo a homeologia entre eles. Este é o primeiro estudo que utiliza a técnica de pintura cromossômica para analisar os cromossomos telocêntricos de Dendropsophus e os resultados preliminares aqui apresentados sugerem que essa pode vir a ser uma interessante ferramenta na investigação da evolução cromossômica no gênero / Abstract: The genus Dendropsophus (Anura: Hylidae) comprises 94 neotropical species, from which only 31 were studied cytogenetically. The species of this genus have the same chromosome number (2n=30) but differ on fundamental number and NORs location. Cytogenetic markers, however, are scarce for this genus and a large number of species has not been karyotyped yet. Therefore, it is still not possible to infer about the possible events involved in the karyological divergence in this genus. In order to provide new data for evolutionary karyotype analysis in Dendropsophus, we described cytogenetically two species of D. marmoratus group, D. seniculus and D. soaresi, and one species of D. microcephalus group, D. werneri; we also detailed the karyotypes of two other species of D. microcephalus group, D. decipiens and D. meridianus. Sequences isolated from D. soaresi genome were used for chromosomal localization of the 5S rDNA gene. Probes were also used to observe the chromosomal localization of telomeric sequences in all the species in study. Finally, in an attempt to generate chromosomal probes for future studies of the telocentric chromosomes found in Dendropsophus, chromosome painting experiments were conducted with D. nanus and D. walfordi. Dendropsophus seniculus and D. soaresi had very similar karyotypes, with the NOR located on the long arm of chromosome pair 9. These karyotypes are similar to those of the other three species of D. marmoratus group already karyotyped (D. marmoratus, D. nahdereri and D. melanargyreus), although the karyotype of D. nahdereri differs from the others by presenting the NOR in the short arm of chromosome pair 1. Two types of 5S rDNA sequences were found in D. soaresi. While type I 5S rDNA sequence consists of 512 bp and includes a NTS composed of 390 bp, the NTS of type II 5S rDNA has only 249 bp. Type I 5S rDNA nucleotide sequence is identical to the 5S RNA gene found in Gastrotheca riobambae. When used as a probe, the type I 5S rDNA of D. soaresi was mapped in the long arm of chromosome pair 2 of D. seniculus and D. soaresi. Telomeric sequences used as probes detected chromosomal ends in D. seniculus, as previously observed in D. marmoratus and D. melanargyreus. However, the telomeric probes also resulted in centromeric and pericentromeric signals in the chromosomes of D. soaresi, except the telocentric pairs identified as 5 and 6. Among the three species of the D. microcephalus group analyzed herein, D. decipiens, D. meridianus and D. werneri, some differences could be noted. While D. meridianus and D. werneri had only one pair of telocentric chromosomes of medium size, D. decipiens karyotype had three telocentric pairs. The x species D. berthalutzae, which is included in the same clade of D. decipiens, has also three telocentric pairs of a medium size. The karyotypes of D. decipiens, D. meridianus and D. werneri are also similar with regards to the NOR, which was located terminally in the long arm of a telocentric/subtelocentric chromosome identified as 12. The smallest telocentric chromosomes of D. nanus were microdissected and used to construct a probe, which was able to detect chromosome pair 15 of this species. When this probe was hybridized to the karyotype of different lineages of D. nanus and D. walfordi, a small telocentric chromosome pair was also detected, which suggests their homeology. This is the first work that includes chromosome painting to study the telocentric chromosomes in Dendropsophus and preliminary results presented here suggest that this may be an interesting tool to assess the chromosomal evolution in this genus / Mestrado / Biologia Celular / Mestra em Biologia Celular e Estrutural

Thesis (Ph. D.)--Florida State University, 2004. / Advisor: Dr. Joseph Travis, Florida State University, College of Arts and Sciences, Dept. of Biological Science. Title and description from dissertation home page (Jan. 18, 2005). Includes bibliographical references.

Thesis (M.S.)--Missouri University of Science and Technology, 2010. / Vita. The entire thesis text is included in file. Title from title screen of thesis/dissertation PDF file (viewed July, 19, 2010) Includes bibliographical references (p. 53-56).

Orientador: Shirlei Maria Recco-Pimentel / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-05T10:17:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Medeiros_LilianRicco_D.pdf: 1840995 bytes, checksum: 62f07c7258ee38a9d84632b39e51a61c (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: No presente estudo caracterizamos e comparamos citogeneticamente populações de sete espécies de Dendropsophus (Hylinae) proximamente relacionadas e que apresentam morfologia externa semelhante: D. nanus (Botucatu, SP; Bodoquena, MS; Telêmaco Borba, PR; Bacabal, MA), D. walfordi (entre Rio Madeira e Pacaás, RO), D. sanborni (Torres, RS), D. jimi (Uberlândia, MG), D. rubicundulus (Uberlândia, MG), D. elianeae (Botucatu, SP; Nova Itapirema, SP; Bodoquena, MS) e D. minutus (Vitória Brasil, SP; Bodoquena, MG). As metáfases foram obtidas a partir de suspensões de células do epitélio intestinal e de testículo. As lâminas foram coradas com solução de Giemsa 10% ou submetidas às técnicas de banda C e de impregnação por prata (Ag-NOR) e hibridação in situ fluorescente. Os dados citogenéticos revelaram a presença de 2n=30 cromossomos em todas espécies, exceto em alguns indivíduos de D. nanus, que apresentaram até três cromossomos B pequenos, todos telocêntricos e univalentes na meiose. Todas as espécies apresentaram pequena quantidade de heterocromatina, localizada somente na região centromérica. No entanto, alguns indivíduos de D. nanus de Telêmaco Borba (PR) e de D. rubicundulus de Uberlândia (MG) apresentaram um pequeno bloco de heterocromatina intersticial no par 3 e no par 12, respectivamente, caracterizando uma variação intrapopulacional. A região organizadora do nucléolo (NOR) foi detectada em um único par cromossômico nas diferentes espécies. Um indivíduo de D. sanborni apresentou um heteromorfismo no par 12 devido a uma duplicação da NOR em um dos homólogos. As populações de D. nanus provenientes de Telêmaco Borba (PR), Bacabal (MA) e Serra da Bodoquena (MS) e a de D. walfordi coletada entre os rios Madeira e Pacaás (RO) apresentaram cariótipos idênticos, com 2n=30 e NF=52. Um espécime de D. nanus da Serra da Bodoquena, apresentou NF=51 devido a um heteromorfismo no par 6, em que um dos homólogos é metacêntrico e o outro telocêntrico, provavelmente devido a uma inversão do tipo pericêntrica. Em todos os espécimes, a NOR foi localizada no par metacêntrico 13. Dendropsophus sanborni proveniente de Botucatu (SP) e Torres (RS) e D. jimi de Uberlândia (MG) também apresentaram cariótipos idênticos, com 2n=30 e NF=50, diferindo das outras duas espécies pela presença de cinco telocêntricos em vez de quatro, com a NOR localizada no par telocêntrico 12. Não foram observadas diferenças citogenéticas entre as populações de D. nanus e entre as de D. sanborni, e nem destas com as outras populações já descritas na literatura. Os cromossomos B presentes em duas populações de D. nanus não apresentaram heterocromatina e nem genes ribossomais. Dendropsophus elianeae apresentou três pares de telocêntricos e a NOR no par 11, enquanto D. rubicundulus apresentou apenas dois telocêntricos e a NOR no par 5. As duas populações de D. minutus apresentaram o mesmo cariótipo já descrito para outras populações, com ausência de cromossomo do tipo telocêntrico. A NOR nessa espécie foi detectada no par 9. Os dados citogenéticos do presente trabalho não permitiram distinguir D. nanus de D. walfordi, nem D. sanborni de D. jimi, sugerindo que são espécies muito intimamente relacionadas. Dendropsophus elianeae e D. rubicundulus foram até pouco tempo consideradas como uma única espécie e D. rubicundulus foi por muito tempo erroneamente denominada de D. elongata. Essas espécies foram facilmente diferenciadas pelo número de telocêntricos e pela localização da NOR. Diferem também de D. elongata, descrita na literatura, que possui apenas um par de telocêntricos. Nenhuma diferença siginificativa foi detectada entre os cariótipos das três populações de D. elianeae. Portanto, os dados citogenéticos corroboraram o status taxonômico atual de D. elianeae e D. rubicundulus. Rearranjos do tipo inversão e translocação devem ter ocorrido durante a diferenciação das espécies de Dendropsophus, levando a modificação na morfologia dos cromossomos e à migração da NOR no genoma, sem alterar o número de cromossomos / Abstract: In the present study we characterized and compared cytogenetically populations of seven closely related Dendropsophus (Hylinae), a group of 30 chromosomes species, that show similar external morphology: D. nanus (Botucatu, SP; Bodoquena, MS; Telêmaco Borba, PR; Bacabal, MA), D. walfordi (between Rio Madeira and Pacaás, RO), D. sanborni (Torres, RS), D. jimi (Uberlândia, MG), D. rubicundulus (Uberlândia, MG), D. elianeae (Botucatu, SP; Nova Itapirema, SP; Bodoquena, MS) e D. minutus (Vitória Brasil, SP; Bodoquena, MG). The metaphases were obtained from intestinal epithelium and testis cell suspensions. The slides were stained with 10% Giemsa solution or submitted to the C-band (King, 1980), silver staining (Ag-NOR) and in situ fluorescence hybridization techniques. All species had 2n=30 chromosomes, except some individuals of D. nanus, which showed up to three little B-chromosomes, all telocentrics. These chromosomes were univalent in meiosis. All the species presented a little amount of heterochromatin, located only in the centromeric region. However, some individuals of D. nanus from Telêmaco Borba (PR) and of D. rubicundulus from Uberlândia (MG) had a little block of interstitial heterochromatin in the pair 3 (D. nanus) and in the pair 12 (D. rubicundulus), characterizing an intra-populational variation. The nucleolar organizing region (NOR) was detected in only one chromosomal pair in all species. An individual of D. sanborni had one heteromorphism due to a duplication of the NOR in one of the homologues of the pair 12. Dendropsophus nanus from Telêmaco Borba (PR), Bacabal (MA) and Serra da Bodoquena (MS) and of D. walfordi collected between the Madeira and Pacaás rivers (RO) showed identical karyotypes, with 2n=30 and NF=52. A specimen of D. nanus from Serra da Bodoquena presented NF=51 due to an heteromorphism in the pair 6, in which one of the homologues is metacentric and the other is telocentric, probably because of a pericentric inversion. In all the specimens, the NOR was located in the metacentric pair 13. Dendropsophus sanborni from Botucatu (SP) and Torres (RS), and D. jimi from Uberlândia (MG) also had identical karyotypes, with 2n=30 e NF=50, differing from the other two species by the presence of five telocentrics instead of four, with the NOR located in the telocentric pair 12. We did not observe citogenetic differences between the populations of D. nanus and of D. sanborni, neither differences among these populations and others already described in the literature. The B-chromosomes found in two populations of D. nanus did not showed heterochromatin neither ribosomal genes. Dendropsophus elianeae had three pairs of telocentric and the NOR in the pair 11. In contrast, D. rubicundulus presented only two telocentrics and the NOR in the pair 5. The two populations of D. minutus had the same karyotype already described for other populations, with absence of telocentric chromosome. The NOR was detected in the pair 9. The cytogenetic data presented here did not permit to distinguish D. nanus from D. walfordi, neither D. sanborni from D. jimi, suggesting that these species are very closely related. Dendropsophus elianeae and D. rubicundulus were until recently considered as a unique species, and for a long time D. rubicundulus was erroneously denominated as D. elongata. These species were easily distinguished from each other by the number of telocentrics and location of the NOR. They also differ from the D. elongata, described in the literature, which has only one pair of telocentric. No significant difference was detected among the karyotypes of the three populations of D. elianeae. Hence, the cytogenetic data confirm the current taxonomic status of D. elianeae and of D. rubicundulus. Rearrangements, such as inversion and translocation, should have occurred during the differentiation of these species, driving the changes in the chromosome morphology and the migration of the NOR in the genome, without modifying the chromosomal number / Doutorado / Biologia Celular / Doutora em Biologia Celular e Estrutural

Thesis (M.S.)--Marshall University, 2002. / Title from document title page. Document formatted into pages; contains ix, 115 p. with maps and illustrations. Includes vita. Includes bibliographical references (p. 34-40).

Thesis (M.S.)--Marshall University, 2002. / Includes bibliographical references (p. 34-40). Online version available in PDF format.

Orientador: Julián Faivovich / Coorientador: Banca: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Hélio Ricardo da Silva / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Délio Baêta / Banca: Marco Rada / Resumo: A tribo Cophomantini inclui espécies de pererecas que dentre outras características, possuem um pré-polex ósseo e avantajado. Atualmente inclui cinco gêneros. Seu maior gênero em riqueza de espécies, e também um dos mais diversos da família Hylidae, o gênero Boana contem atualmente 92 táxons formalmente descritos. No entanto, até o presente aproximadamente 60% de sua diversidade taxonômica foi analisada em filogenias mais inclusivas. O gênero Boana é dividido em sete grupos de espécies. Muitas de suas espécies são associadas a estes grupos através de caracteres fenotípicos. Alguns destes grupos, todavia encontram-se pouco suportados molecularmente, e apesar de várias espécies agruparem-se por fenótipos, os agrupamentos filogenéticos carecem de sinapomorfias fenotípicas. Na presente tese, foram amostradas seqüências de 83 espécies de Boana, bem como de espécimes pertencentes ao gênero, porém de taxonomia indefinida, totalizando 256 terminais para o gênero. Inserimos seqüências de DNA representando fragmentos de até dez genes por terminal do nosso banco de dados. Recuperamos Boana liliae inserida em Myersiohyla, outro gênero de Cophomantini. A análise filogenética das 83 espécies de Boana resultou em uma melhoria para o suporte de muitos dos seus relacionamentos internos, mas curiosamente, apesar da densa amostragem taxonômica, muitos agrupamentos permanecem pouco suportados. Finalmente, fizemos um estudo comparativo do pré-polex na tribo Cophomantini. Investigamos o elemento e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The tribe Cophomantini includes treefrog species which, among other traits, have an osseous and enlarged prepollex. Currently it includes five genera. The genus Boana is the most diverse of the tribe, and also one of the richest genera of Hylidae, including 92 formally described taxa. However, approximately 60% of its taxonomic diversity was analyzed in more inclusive phylogenies. The genus Boana is divided into seven groups of species. Many of its species are assigned to their respective groups through phenotypical characters. Some of those groups are still poorly supported molecularly. Even being many species assigned to their respective groups through phenotypes, many groupings remain without phenotypical synapomorphies. On the present thesis, we sampled sequences of 83 species of Boana, as well specimens of undetermined taxonomy, totalizing 256 terminals for the genus. Each terminal have sequences of up to ten gene fragments. We recovered Boana liliae nested within the genus Myersiohyla, also from the tribe Cophomantini. The phylogenetic analysis of the 83 species of Boana resulted in better supports for many of its internal relationships. Curiously, besides the dense taxonomic sampling, many groupings remain poorly supported. Finally, we made a comparative study of the prepollex within the tribe Cophomantini. We surveyed this element and osteological and myological structures associated, established homology hypothesis, and optimize the resulted characters on the most parsimonious tree previously recovered. The prepollex of species of this tribe have a considerable evolutionary plasticity, and its two basic morphologies evolved many times on the tribe Cophomantini / Doutor