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Estudo de frequências alélicas de STRs do cromossomo X na população brasileira de Araraquara-SP /

Martins, Joyce Aparecida. January 2008 (has links)
Orientador: Regina Maria Barretto Cicarelli / Banca: Gilka Jorge Figaro Gattás / Banca: Rogério Nogueira de Oliveira / Resumo: A identificação humana através da análise do ácido desoxirribonucléico (DNA) é realizada pelo estudo de regiões polimórficas do DNA, transferidas dos pais para os filhos pelo mecanismo de herança genética. Os marcadores mais utilizados na rotina forense são regiões microssatélites ou STRs (Short Tandem Repeats) e se classificam em STRs autossômicos (AS STRs), do cromossomo Y (Y-STRs) e do cromossomo X (X-STRs). Estes últimos são de utilização recente nos testes de identificação humana, sendo aplicados com a finalidade de complementar os dados obtidos com os demais marcadores. Tendo em vista a necessidade de ampliação dos dados da população brasileira em relação aos marcadores genéticos, este projeto teve o objetivo de determinar as freqüências alélicas e os parâmetros estatísticos de interesse na prática forense e em testes de paternidade para 5 X-STRs. Para isto foram analisados 120 indivíduos não aparentados, classificados segundo o grupo de cor de pele (30 brancos, 30 pretos, 30 pardos e 30 amarelos) e residentes em Araraquara. Através dos resultados obtidos neste estudo, verificou-se que a população brasileira de Araraquara apresenta particularidades na sua distribuição alélica, havendo diferenças entre esta e demais populações de outros países, sendo que uma maior distância genética foi obtida com a população asiática. Em relação aos marcadores X-STRs analisados, o DXS101 foi o mais polimórfico, seguido por DXS7424, DXS6854, DXS7132 e DXS6808. O poder de discriminação obtido foi de 0,9999928 e 0,9990702 em mulheres e homens, respectivamente, constituindo tal sistema em uma poderosa ferramenta para a prática forense e testes de paternidade. / Abstract:Human identification by examining the desoxirribonucleic acid (DNA) is held by the study of polymorphic regions of the DNA, transferred from the parents to their children by mechanism of genetic inheritance. The more used markers in forensic routine are microsatellites regions or STRs (Short Tandem Repeats) and they can be classified into STRs autosomal (AS STRs), Y chromosome (Y-STRs) and X chromosome (X-STRs). These last two are for use in the recent identification of human testing, being implemented with the aim to complement the data obtained with other markers. Because the needs of expansion of the Brazilian population data in relation to genetic markers, this project aimed to determine the allelic frequencies and the statistical parameters of interest in forensic and paternity tests to 5 X-STRs. To do this were analyzed 120 individuals not related, classified according to its skin color group (30 European Brazilians, 30 Pardo Brazilians, 30 African Brazilians and 30 Oriental Brazilians) and residents in Araraquara. Through the results obtained in this study, it was found that the Brazilian population of Araraquara presents features in its allelic distribution, and there are differences between it and other populations from other countries, and that greater genetic distance was obtained with the Asian population. For X-STRs markers analyzed, DXS101 was the most polymorphic, followed by DXS7424, DXS6854, DXS7132 and DXS6808. The power of discrimination obtained was 0.9999928 and 0.9990702 in women and men, respectively, constituting such a system into a powerful tool for forensic and paternity tests. / Mestre
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Estudo de frequências alélicas de STRs do cromossomo X na população brasileira de Araraquara-SP

Martins, Joyce Aparecida [UNESP] 12 February 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-12Bitstream added on 2014-06-13T18:09:06Z : No. of bitstreams: 1 martins_ja_me_arafcf.pdf: 547030 bytes, checksum: 60f0ef05d3eacc654ece090da98967d0 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A identificação humana através da análise do ácido desoxirribonucléico (DNA) é realizada pelo estudo de regiões polimórficas do DNA, transferidas dos pais para os filhos pelo mecanismo de herança genética. Os marcadores mais utilizados na rotina forense são regiões microssatélites ou STRs (Short Tandem Repeats) e se classificam em STRs autossômicos (AS STRs), do cromossomo Y (Y-STRs) e do cromossomo X (X-STRs). Estes últimos são de utilização recente nos testes de identificação humana, sendo aplicados com a finalidade de complementar os dados obtidos com os demais marcadores. Tendo em vista a necessidade de ampliação dos dados da população brasileira em relação aos marcadores genéticos, este projeto teve o objetivo de determinar as freqüências alélicas e os parâmetros estatísticos de interesse na prática forense e em testes de paternidade para 5 X-STRs. Para isto foram analisados 120 indivíduos não aparentados, classificados segundo o grupo de cor de pele (30 brancos, 30 pretos, 30 pardos e 30 amarelos) e residentes em Araraquara. Através dos resultados obtidos neste estudo, verificou-se que a população brasileira de Araraquara apresenta particularidades na sua distribuição alélica, havendo diferenças entre esta e demais populações de outros países, sendo que uma maior distância genética foi obtida com a população asiática. Em relação aos marcadores X-STRs analisados, o DXS101 foi o mais polimórfico, seguido por DXS7424, DXS6854, DXS7132 e DXS6808. O poder de discriminação obtido foi de 0,9999928 e 0,9990702 em mulheres e homens, respectivamente, constituindo tal sistema em uma poderosa ferramenta para a prática forense e testes de paternidade. / Human identification by examining the desoxirribonucleic acid (DNA) is held by the study of polymorphic regions of the DNA, transferred from the parents to their children by mechanism of genetic inheritance. The more used markers in forensic routine are microsatellites regions or STRs (Short Tandem Repeats) and they can be classified into STRs autosomal (AS STRs), Y chromosome (Y-STRs) and X chromosome (X-STRs). These last two are for use in the recent identification of human testing, being implemented with the aim to complement the data obtained with other markers. Because the needs of expansion of the Brazilian population data in relation to genetic markers, this project aimed to determine the allelic frequencies and the statistical parameters of interest in forensic and paternity tests to 5 X-STRs. To do this were analyzed 120 individuals not related, classified according to its skin color group (30 European Brazilians, 30 Pardo Brazilians, 30 African Brazilians and 30 Oriental Brazilians) and residents in Araraquara. Through the results obtained in this study, it was found that the Brazilian population of Araraquara presents features in its allelic distribution, and there are differences between it and other populations from other countries, and that greater genetic distance was obtained with the Asian population. For X-STRs markers analyzed, DXS101 was the most polymorphic, followed by DXS7424, DXS6854, DXS7132 and DXS6808. The power of discrimination obtained was 0.9999928 and 0.9990702 in women and men, respectively, constituting such a system into a powerful tool for forensic and paternity tests.
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Distribuição da frequência alélica de STRs preconizados pelo sistema CODIS na capital e no Departamento Central do Paraguai / Distribution of the allelic frequency of STRs recommended by the CODIS system in the capital and in the Central Department of Paraguay

Recalde, Tamara Soledad Frontanilla 10 December 2018 (has links)
Um dos maiores desafios na área forense é, sem dúvida, a identificação humana. O DNA tem sido o responsável por uma verdadeira revolução das técnicas de identificação nas últimas décadas a partir do estudo e da identificação de polimorfismos entre determinados marcadores moleculares existentes nos indivíduos. Os marcadores recomendados para a obtenção de perfis genéticos são loci de regiões microssatélite do DNA, também designados de Short Tandem Repeats (STR). O número de repetições dos marcadores STR é variável entre os indivíduos, criando polimorfismo e tornando-os, desta forma, ótimos marcadores para identificação humana. O objetivo desse trabalho foi estabelecer a distribuição da frequência alélica de 16 STRs preconizados no sistema CODIS, na capital e no Departamento Central de Paraguai. Foram estudadas 300 amostras de saliva coletadas com NUCLEIC-CARD(TM) Collection Device System, de indivíduos paraguaios dentre 20 e 70 anos de idade, morando em uma das 20 cidades estudadas. Para o processamento foi utilizado o kit AmpFLSTR Identifiler Direct PCR Amplification® seguindo as fases de genotipagem, amplificação e eletroforese capilar. Foi possível estabelecer o perfil genético de 259 amostras bem como os parâmetros forenses e, assim, calcular os loci mais polimórficos os quais foram FGA e D18S51 utilizando os softwares GenAlEx 6.5, Arlequin 3.5 e R 2.5. A distribuição das frequências alélicas de cada loci analisado permitiu estabelecer a caracterização genética da população estudada. Foi possível confirmar que a população do Paraguai se encontra em equilíbrio Hardy-Weinberg, com uma diversidade genética intrapopulacional de 0.794915 +/- 0.398307 e interpopulacional determinada pelo índice de fixação (FST) de 0.01112. A partir desse estudo, foi possível determinar as frequências alélicas de 15 STRs utilizados no sistema CODIS nacapital e no Departamento Central do Paraguai bem como a caracterização genética e os parâmetros forenses da população estudada. Todos os loci estudados na população paraguaia foram considerados muito informativos e úteis para a solução de problemas relacionados com identificação humana na amostra analisada / One of the biggest challenges in Forensic Sciences is undoubtedly human identification. DNA has been responsible for a true revolution in identification techniques in the last decades from the study and identification of polymorphisms between certain molecular markers in individuals. The recommended markers for obtaining genetic profiles are loci of DNA microsatellite regions, also called Short Tandem Repeats (STR). The number of repetitions of STR markers is variable among individuals, creating polymorphism and thus making them excellent markers for human identification. The aim of this study was to establish the distribution of the allelic frequency of 16 STRs recommended in the CODIS system, in the capital and in the Central Department of Paraguay. We studied 300 saliva samples collected from NUCLEIC-CARD (TM) Collection Device System of Paraguayan individuals between 20 and 70 years-old, living in one of the 20 cities studied. For the processing, the AmpFLSTR Identifiler Direct PCR Amplification® kit was used following the phases of genotyping, amplification and capillary electrophoresis. It was possible to establish the genetic profile of 259 samples as well as the forensic parameters and thus to calculate the most polymorphic loci which were FGA and D18S51 using the software GenAlEx 6.5, Arlequin 3.5 and R 2.5. The distribution of the allelic frequencies of each analyzed loci allowed establishing the genetic characterization of the studied population. It was possible to confirm that the population of Paraguay is in Hardy-Weinberg equilibrium, with an intrapopulational genetic diversity of 0.8046 +/- 0.0120 and interpopulational determined by the fixation index (FST) of 0.01112. From this study, it was possible to determine the allelic frequencies of 15 STRs used in the CODIS system in the capital and in the Central Department of Paraguay, as well as the genetic characterization and forensic parameters of the studied population. All the loci studied in the Paraguayan population were considered veryinformative and useful for the solution of problems related to human identification in the analyzed sample
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\"Análise da qualidade de prontuários odontológicos para fins de identificação humana através da auto-avaliação\" / Quality analysis of dental charts, for human identification purpose, through professionals´self-assessment

Meo, Ilka Corrêa de 18 October 2006 (has links)
A qualidade de um prontuário odontológico tem relação direta com sua capacidade em suprir determinadas necessidades dentro da prática profissional. Entre as características desta documentação encontramos a sua capacidade de funcionar como evidência de grande valor em casos de identificação humana, principalmente em casos onde há destruição dos corpos encontrados (carbonização, putrefação avançada, afogamentos e mutilações), onde fica dificultada a realização da identificação através da dactiloscopia ou o reconhecimento pelos familiares. Com a queda no número de tomadas radiográficas realizadas durante o tratamento odontológico e a diminuição da incidência de cárie na população em geral, o detalhamento da documentação escrita elaborada pelo cirurgião-dentista torna-se imprescindível para possibilitar a sua comparação com dados postmortem por ocasião de uma perícia de identificação humana. Dessa forma, este trabalho teve como proposta realizar uma avaliação da qualidade dos prontuários elaborados por cirurgiões-dentistas. Além disso, foi também realizada uma comparação entre a qualidade da documentação elaborada por profissionais recém-formados e profissionais formados há mais de 5 anos, como uma tentativa de estabelecer o tempo de formação do profissional como um fator relevante na elaboração do prontuário. Para tanto, foi realizado um questionário com perguntas referentes à rotina de elaboração da documentação odontológica a uma amostra não probabilística de 132 profissionais, tendo sido utilizada para sua análise a observação quantitativa das tendências das respostas. Observou-se que há grande deficiência no conhecimento dos profissionais quanto ao preenchimento desta documentação, além do desconhecimento da relevância que esta pode apresentar em casos de identificação humana. Quando da comparação levando em consideração o tempo de formado, de modo geral, o desempenho dos dois grupos apresentou-se bastante semelhante, não se refletindo assim, na qualidade final da documentação elaborada, o tempo de formação do indivíduo. / The quality of a dental chart has direct relation with its capacity in supplying definitive necessities of the professional practice. Among the characteristics of this documentation we find its capacity to function as evidence of great value in cases of human identification, especially in cases presenting massive destruction of the bodies (carbonization, advanced decomposition, drowning and mutilation), making it difficult to accomplish the identification through dactyloscopy or even the recognition by the family members. With the decrease in the number of radiographic takes carried out through the dental treatment and the reduction of the incidence of caries in the population in general, the detailing of written documentation elaborated by the dentist becomes essential to make possible its comparison with postmortem data in a forensic identification. Thus, our goal was to evaluate the quality of the dental charts made by graduated dentists. Moreover, we made also a comparison between the quality of the documentation elaborated by newly graduated professionals and professionals graduated for more than 5 years, as an attempt to establish the time of graduation as a relevant factor in the elaboration of the written documentation. For that, a non probabilistic sample of 132 professionals was submitted to a questionnaire with questions referring to the routine elaboration of the dental documentation, having been used for its analysis the quantitative observation of the trends of the answers. It was noticed that there is a great deficiency in the professionals´ knowledge in producing this documentation, and also of its importance in cases of human identification. Regarding the time of graduation, generally, the performance of the two groups presented very similarly, what led us to the conclusion that it does not reflect in the final quality of the documentation.
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Distribuição da frequência alélica de STRs preconizados pelo sistema CODIS na capital e no Departamento Central do Paraguai / Distribution of the allelic frequency of STRs recommended by the CODIS system in the capital and in the Central Department of Paraguay

Tamara Soledad Frontanilla Recalde 10 December 2018 (has links)
Um dos maiores desafios na área forense é, sem dúvida, a identificação humana. O DNA tem sido o responsável por uma verdadeira revolução das técnicas de identificação nas últimas décadas a partir do estudo e da identificação de polimorfismos entre determinados marcadores moleculares existentes nos indivíduos. Os marcadores recomendados para a obtenção de perfis genéticos são loci de regiões microssatélite do DNA, também designados de Short Tandem Repeats (STR). O número de repetições dos marcadores STR é variável entre os indivíduos, criando polimorfismo e tornando-os, desta forma, ótimos marcadores para identificação humana. O objetivo desse trabalho foi estabelecer a distribuição da frequência alélica de 16 STRs preconizados no sistema CODIS, na capital e no Departamento Central de Paraguai. Foram estudadas 300 amostras de saliva coletadas com NUCLEIC-CARD(TM) Collection Device System, de indivíduos paraguaios dentre 20 e 70 anos de idade, morando em uma das 20 cidades estudadas. Para o processamento foi utilizado o kit AmpFLSTR Identifiler Direct PCR Amplification® seguindo as fases de genotipagem, amplificação e eletroforese capilar. Foi possível estabelecer o perfil genético de 259 amostras bem como os parâmetros forenses e, assim, calcular os loci mais polimórficos os quais foram FGA e D18S51 utilizando os softwares GenAlEx 6.5, Arlequin 3.5 e R 2.5. A distribuição das frequências alélicas de cada loci analisado permitiu estabelecer a caracterização genética da população estudada. Foi possível confirmar que a população do Paraguai se encontra em equilíbrio Hardy-Weinberg, com uma diversidade genética intrapopulacional de 0.794915 +/- 0.398307 e interpopulacional determinada pelo índice de fixação (FST) de 0.01112. A partir desse estudo, foi possível determinar as frequências alélicas de 15 STRs utilizados no sistema CODIS nacapital e no Departamento Central do Paraguai bem como a caracterização genética e os parâmetros forenses da população estudada. Todos os loci estudados na população paraguaia foram considerados muito informativos e úteis para a solução de problemas relacionados com identificação humana na amostra analisada / One of the biggest challenges in Forensic Sciences is undoubtedly human identification. DNA has been responsible for a true revolution in identification techniques in the last decades from the study and identification of polymorphisms between certain molecular markers in individuals. The recommended markers for obtaining genetic profiles are loci of DNA microsatellite regions, also called Short Tandem Repeats (STR). The number of repetitions of STR markers is variable among individuals, creating polymorphism and thus making them excellent markers for human identification. The aim of this study was to establish the distribution of the allelic frequency of 16 STRs recommended in the CODIS system, in the capital and in the Central Department of Paraguay. We studied 300 saliva samples collected from NUCLEIC-CARD (TM) Collection Device System of Paraguayan individuals between 20 and 70 years-old, living in one of the 20 cities studied. For the processing, the AmpFLSTR Identifiler Direct PCR Amplification® kit was used following the phases of genotyping, amplification and capillary electrophoresis. It was possible to establish the genetic profile of 259 samples as well as the forensic parameters and thus to calculate the most polymorphic loci which were FGA and D18S51 using the software GenAlEx 6.5, Arlequin 3.5 and R 2.5. The distribution of the allelic frequencies of each analyzed loci allowed establishing the genetic characterization of the studied population. It was possible to confirm that the population of Paraguay is in Hardy-Weinberg equilibrium, with an intrapopulational genetic diversity of 0.8046 +/- 0.0120 and interpopulational determined by the fixation index (FST) of 0.01112. From this study, it was possible to determine the allelic frequencies of 15 STRs used in the CODIS system in the capital and in the Central Department of Paraguay, as well as the genetic characterization and forensic parameters of the studied population. All the loci studied in the Paraguayan population were considered veryinformative and useful for the solution of problems related to human identification in the analyzed sample
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Indicadores Morfológicos de Dimorfismo Sexual em Crânios Humanos / Morphological Traits of the Sexual Dimorphism in Human Skulls

Galdames, Iván Claudio Suazo [UNIFESP] 25 March 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-03-25. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-11T03:25:33Z : No. of bitstreams: 1 Publico-014.pdf: 1786018 bytes, checksum: 86d1a8947bfcaa7a3aecf928e6fcec4b (MD5) / Objetivo: O propósito deste estudo é avaliar a qualidade, como prova diagnóstica, dos principais indicadores morfológicos de dimorfismo sexual em crânios humanos secos da Coleção do Museu de Crânios da Universidade Federal de São Paulo, através da antropometria direta e utilizando ferramentas da bioestatística e da epidemiologia clínica. Material e Método: Utilizaram-se 284 crânios de indivíduos adultos, brasileiros, dos quais 187 eram homens e 97 mulheres. Realizou-se um estudo de corte transversal de avaliação da prova diagnóstica. Para isso, realizou-se uma abordagem qualitativa, com base no exame visual de 16 indicadores morfológicos tradicionais de dimorfismo sexual, determinando-se para cada um deles o nível de exatidão, de sensibilidade, valores prognósticos, likelihood ratios e odds ratios. Resultados e Conclusões: Todos os indicadores estudados apresentaram altos níveis de exatidão (84.75-72.89%). Os melhores indicadores em termos de exatidão geral, erro intraobservador e valores odds ratios encontraram-se em traços cuja formação se relaciona com a inserção e ação de importantes grupos musculares. A menor exatidão de todos os indicadores morfológicos utilizados como provas diagnósticas neste estudo foi obtida com aqueles baseados na observação da forma. Em 14 dos 16 indicadores o erro intraobservador foi <10%. Os melhores indicadores morfológicos de dimorfismo sexual com base no ranking combinado de exatidão geral, confiabilidade e odds ratios foram: o processo mastóide, o osso zigomático, a mandíbula e as rugosidades do osso occipital. Os indicadores com menor rendimento geral foram: a forma do palato, do mento e da órbita. As ferramentas de estatística epidemiológica contribuíram para complementar e tornar mais consistentes as análises, especialmente ao se analisar em conjunto a sensibilidade dos indicadores e os valores de likelihood ratios. Concluiu-se que os indicadores morfológicos de dimorfismo apresentam um adequado rendimento como provas diagnósticas, mas os valores de exatidão e sensibilidade devem ser complementados com indicadores mais consistentes, que sejam independentes da distribuição da amostra e que incorporem os erros diagnósticos (falsos positivos e negativos), como os valores likelihood ratios, odds ratios e valores prognósticos positivos. / Objetive: The purpose of this study is to assess the quality, as a diagnostic test, of the main indicators of morphological sexual dimorphism in dry human skulls from the skull Museum Collection of the Universidade Federal de São Paulo, through direct anthropometry and using biostatistics tools and clinical epidemiology. Methodology: We used 284 skulls of adult Brazilians, of whom 187 were male and 97 female. A study of cross-evaluation of diagnostic test, for it was a qualitative approach based on visual examination of 16 traditional indicators of morphological sexual dimorphism, determined for each level of accuracy, sensitivity, predictive values, likelihood ratios and Odds ratios. Results and Conclusions: All indicators studied had high levels of accuracy (84.75- 72.89%). The best indicators in terms of overall accuracy, intraobserver error and odds ratios values were found in traits whose formation is related to insertion and action of major muscle groups. The lower accuracy of all the morphological indicators assumed as diagnostic tests in this study was obtained in those based on the observation of the way. In 14 of the 16 indicators intraobserver error was <10%. The best indicators of morphological sexual dimorphism based on the combined ranking of the general accuracy, reliability, and Odds Ratios were: the mastoid process, the zygomatic bone, the mandible and the roughness of the occipital bone. The indicators with the lowest overall performance were the shape of the palate, chin and orbit. The tools of statistical epidemiological contributed to complement and make more robust analysis, especially when considering the overall sensitivity of the indicators and values of likelihood ratios. We concluded that morphological dimorphism indicators presents an adequate performance as diagnostic tests, but the values of accuracy and sensitivity must be matched with more robust indicators that are independent of the distribution of the sample and integrate the diagnostic errors (false positives and negatives ) as the likelihood ratios, odds ratios and positive predictive values. / TEDE
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\"Análise da qualidade de prontuários odontológicos para fins de identificação humana através da auto-avaliação\" / Quality analysis of dental charts, for human identification purpose, through professionals´self-assessment

Ilka Corrêa de Meo 18 October 2006 (has links)
A qualidade de um prontuário odontológico tem relação direta com sua capacidade em suprir determinadas necessidades dentro da prática profissional. Entre as características desta documentação encontramos a sua capacidade de funcionar como evidência de grande valor em casos de identificação humana, principalmente em casos onde há destruição dos corpos encontrados (carbonização, putrefação avançada, afogamentos e mutilações), onde fica dificultada a realização da identificação através da dactiloscopia ou o reconhecimento pelos familiares. Com a queda no número de tomadas radiográficas realizadas durante o tratamento odontológico e a diminuição da incidência de cárie na população em geral, o detalhamento da documentação escrita elaborada pelo cirurgião-dentista torna-se imprescindível para possibilitar a sua comparação com dados postmortem por ocasião de uma perícia de identificação humana. Dessa forma, este trabalho teve como proposta realizar uma avaliação da qualidade dos prontuários elaborados por cirurgiões-dentistas. Além disso, foi também realizada uma comparação entre a qualidade da documentação elaborada por profissionais recém-formados e profissionais formados há mais de 5 anos, como uma tentativa de estabelecer o tempo de formação do profissional como um fator relevante na elaboração do prontuário. Para tanto, foi realizado um questionário com perguntas referentes à rotina de elaboração da documentação odontológica a uma amostra não probabilística de 132 profissionais, tendo sido utilizada para sua análise a observação quantitativa das tendências das respostas. Observou-se que há grande deficiência no conhecimento dos profissionais quanto ao preenchimento desta documentação, além do desconhecimento da relevância que esta pode apresentar em casos de identificação humana. Quando da comparação levando em consideração o tempo de formado, de modo geral, o desempenho dos dois grupos apresentou-se bastante semelhante, não se refletindo assim, na qualidade final da documentação elaborada, o tempo de formação do indivíduo. / The quality of a dental chart has direct relation with its capacity in supplying definitive necessities of the professional practice. Among the characteristics of this documentation we find its capacity to function as evidence of great value in cases of human identification, especially in cases presenting massive destruction of the bodies (carbonization, advanced decomposition, drowning and mutilation), making it difficult to accomplish the identification through dactyloscopy or even the recognition by the family members. With the decrease in the number of radiographic takes carried out through the dental treatment and the reduction of the incidence of caries in the population in general, the detailing of written documentation elaborated by the dentist becomes essential to make possible its comparison with postmortem data in a forensic identification. Thus, our goal was to evaluate the quality of the dental charts made by graduated dentists. Moreover, we made also a comparison between the quality of the documentation elaborated by newly graduated professionals and professionals graduated for more than 5 years, as an attempt to establish the time of graduation as a relevant factor in the elaboration of the written documentation. For that, a non probabilistic sample of 132 professionals was submitted to a questionnaire with questions referring to the routine elaboration of the dental documentation, having been used for its analysis the quantitative observation of the trends of the answers. It was noticed that there is a great deficiency in the professionals´ knowledge in producing this documentation, and also of its importance in cases of human identification. Regarding the time of graduation, generally, the performance of the two groups presented very similarly, what led us to the conclusion that it does not reflect in the final quality of the documentation.
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"Avaliação de três métodos de extração de DNA de dentes humanos submetidos ao calor" / DNA extraction of human teeth submitted to high temperatures: evaluation of three methods .

Remualdo, Vanessa Rosalia 16 December 2004 (has links)
Nos casos de carbonização humana usualmente há uma limitação do emprego dos remanescentes biológicos para estudo. Nestes casos, têm-se usado por eleição dentes para análises forenses, já que sua constituição anatômica proporciona proteção ao material genético. No presente estudo avaliou-se a amplificação por PCR do DNA obtido de dentes submetidos ao calor (200°C, 400°C, 500°C e 600°C) durante 60 minutos testando-se três métodos de extração (orgânico, acetato de amônia/isopropanol e sílica). Foram utilizados 8 pares de dentes de indivíduos diferentes, sendo que um foi mantido in natura (gold standart) e o outro submetido à queima. Para amplificação do DNA empregaram-se iniciadores de DNA genômico (STR-F13A01) e DNA mitocondrial (MPSs). Para o DNA genômico, a análise em gel de poliacrilamida permitiu verificar que com o método orgânico 50% das amostras foram amplificadas, 38% com o acetato de amônia/isopropanol, e 0% com a sílica. Para os MPSs, o seqüenciamento das amostras mostrou que o método orgânico confirmou 100% dos resultados em 200ºC, 50% em 400ºC e 0% em 500ºC e 600ºC. Para o método acetato de amônia/isopropanol em 100% das temperaturas foi possível a análise do mtDNA. Para o método da sílica, obtivemos resultados de 50% em 400°C e 500°C, e 0% em 200°C e 600°C. Nossos resultados permitem concluir que o método acetato de 8 amônia/isopropanol é o mais indicado para obtenção de DNA amplificável por PCR de amostras carbonizadas nas temperaturas utilizadas neste trabalho. / Biological remains of carbonized human bodies are usually not possible to use in forensic analysis. In these cases, teeth are usually selected since enamel, dentin and cement provides protection to the genetic material. The present study evaluates DNA extracted using three methods (organic, isopropilic alcohol and silica) of teeth submitted to different temperatures (200°C, 400°C, 500°C and 600°C). The method of evaluation was amplification by PCR. Two third molars of eight different individuals were used; one was kept in natura (gold standart) and the other submitted to burning. For amplification primers for genomic (STR-F13A01) and mitochondrial (MPSs) DNA were used. For genomic DNA, polyacrylamide gel analysis showed that 50% of the samples extracted with organic method were amplified, 38% with isopropilic alcohol, and 0% with the silica method. For mitochondrial DNA, amplicons sequencing showed that 100% of the samples extracted with isopropilic alcohol method were confirmed in all temperatures; 100% with the organic method in 200°C, 50% in 400°C, and 0% in 500°C and 600°C. For silica method, 50% in 400°C and 500°C and 0% in 200°C and 600°C. Our results show that the isopropilic alcohol method is the best method to extract DNA from burned teeth of all used temperatures.
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Avaliação da acuracidade da reconstrução facial 3D por meio de fotografias antemortem de indivíduos previamente identificados / Evaluation of the accuracy of 3D facial reconstruction through ante-mortem photographs of previously identified individuals

Zeilmann, Patrícia Pereira 17 December 2013 (has links)
Este trabalho teve como objetivo avaliar, por meio de comparação com fotografias ante-mortem, a acuracidade da reconstrução facial forense manual e computadorizada de brasileiros adultos utilizando-se o método de Manchester. Foram reconstruídos os rostos a partir de 08 crânios, 04 femininos e 04 masculinos que foram exumados no Cemitério Municipal Necrópole do Campo Santo-Guarulhos/São Paulo. Esse estudo se justificou para possibilitar a utilização do método de Manchester considerando-se as profundidades de tecidos moles estabelecidas para brasileiros. Oito réplicas de gesso para a reconstrução manual, e oito modelos virtuais em 3D, obtidos por meio de tomografia para a computadorizada foram levados para o Centro de Anatomia e Identificação Humana da Universidade de Dundee/Escócia/Reino Unido. Utilizou-se argila para a manual e a tecnologia Sensable por meio do programa de computador FreeForm Modelling Plus, e do dispositivo tátil Phantom Haptic Desktop para a computadorizada. Avaliou-se a acuracidade das 16 reconstruções resultantes por meio de dois métodos: fotografias das reconstruções produzidas foram mostradas para 100 voluntários, que foram convidados a escolher o sujeito da fotografia em vivo quando incluído com outros cinco sujeitos aleatoriamente selecionados; e por meio de teste de semelhança, que comparou a fotografia da reconstrução com a do sujeito alvo lado a lado, o que foi feito também com dois sujeitos controle. Embora em ambos os testes os sujeitos alvo tiveram o melhor desempenho no número de acertos e no grau de semelhança, as reconstruções manuais obtiveram um melhor desempenho e o maior nível de acerto foi de 90% em um caso no teste de reconhecimento, enquanto na computadorizada foi de 81%. Este estudo demonstrou que o método de manchester em brasileiros, assim como o FreeForm Modelling Plus são ferramentas úteis e adequadas para o uso em reconstrução facial com níveis de sucesso muito significativos. / The aim of this study was to evaluate, by comparison with antemortem photographs, the accuracy of manual and computerized forensic facial reconstruction of adult Brazilians using the Manchester method. The faces were reconstructed from 08 skulls, 04 female and 04 male that were exhumed at the Municipal Cemitery Necropolis of Campo Santo-Guarulhos/Sao Paulo. This study is justified to allow the use of the Manchester method considering the soft tissue depths from Brazilian people. Eight plaster replicas made for manual reconstructions and eight 3D virtual models, obtained by tomography for computerized were taken to the Centre for Anatomy and Human Identification at the University of Dundee/Scotland/UK. Clay was used for the manual and the SensAble technology through the FreeForm Modeling Plus software and the tactil device Phantom Haptic Desktop for the computerized. The accuracy of 16 reconstructions resulting was evaluated by two methods: images of the reconstructions were produced and shown to 100 volunteers who were asked to choose the subject of photography in vivo when included with other five subjects randomly selected; and by the resemblance test, comparing the photograph of the reconstruction with the subject\'s target side by side, which was also done with two control subjects. Although in both tests the 08 subjects achieved the best results in the number of correct answers and in the degree of resemblance, the manual reconstruction achieved a better performance and the higher level of accuracy in one case was 90% in recognition test, while the computerized was 81%. This study showed that the Manchester method in Brazilians, as well as the FreeForm Modeling Plus are usefull and adequate tools for use in facial reconstruction with very significant levels of success.
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Análise de frequências alélicas de 15 marcadores STR em alunos da Faculdade de Odontologia de Bauru / Not available

Frederico, Paulo Renato de Paula 14 December 2015 (has links)
Entre as muitas aplicações das tecnologias de identificação biológica humana, estão as finalidades forenses. O objetivo desta pesquisa foi verificar frequências alélicas de Short Tandem Repeat (STR) e os parâmetros estatísticos de interesse em genética de populações e forense para desenvolver o primeiro banco de dados populacional de DNA na Faculdade de Odontologia de Bauru, Universidade de São Paulo, (FOB/USP) para futuros usos forenses. Frequências alélicas de 15 locos autossômicos e do marcador de gênero amelogenina foram determinadas utilizando amostras de 200 &#x3BC;L de saliva doados por 296 alunos de graduação da FOB/USP, com idade &#x2265; 18 anos, após aprovação ética. Os testes laboratoriais foram feitos com kits comerciais. Resultados e parâmetros estatísticos foram obtidos por meio de programas clássicos: GeneMapper-ID-X, MS Excel 2002 versão 10.6871.6870, GenAlEx 6.5 e Arlequin 3.5, comparando quatro populações (brasileira, portuguesa, norte-americana e a população deste estudo). Os locos mais polimórficos foram D18S51 (17 alelos) e FGA (15 alelos), seguidos pelo D21S11 (13 alelos) e os menos polimórficos foram D16S539 e TH01 (7 alelos cada). A análise comparativa com amostra da população brasileira proveniente de estudos anteriores (n > 100.000) pelo teste goodness of fit X2 index não mostrou diferenças significativas entre estes grupos (p = 0,9999). Outros parâmetros estatísticos foram calculados comparando as populações: local (deste estudo), portuguesa e norte-americana. A análise de variância molecular (AMOVA) entre as três populações, entre as pessoas da mesma população e para cada pessoa de cada população mostrou que existe uma elevada variância individual (99%), que esta variância é mantida uniformemente entre as pessoas da mesma amostra/região (1%) e entre as três populações estudadas (0%). O estudo confirmou o elevado grau de polimorfismo e a alta heterozigosidade (96,5%) da população. Houve diferença significativa quanto ao gênero (79,7% mulheres) quando comparado à população brasileira em geral (50,4%), explicada pelas características do corpo discente da FOB/USP composto por 80,6% de pessoas do gênero feminino. Interessante foi a observação de uma microvariante alélica no loco D18S51, fora da escada padrão e da escala de abrangência do kit, correspondente ao alelo 29, ainda não definida na base de dados internacional (STRBase, atualizada em 07/08/2015). Esta microvariante deverá ser confirmada por testes familiares e sequenciamento de DNA para verificar a possibilidade de outra ocorrência familiar ou duplicação de nucleotídeos. No futuro, os dados obtidos neste estudo devem ser incorporados ao banco de dados da população brasileira e podem ser considerados como referência genética da população regional, ajudando a elucidar casos forenses. Após a confirmação, a potencial nova microvariante alélica contribuirá para a base de dados internacional STRBase. / There are many ways of applying biological human identification technologies, among these are forensic applications. The objective of this study was to verify allele frequencies for 15 autosomal short tandem repeat (STR) loci and develop the first human DNA population database at the Bauru School of Dentistry, University of São Paulo (FOB/USP), for future forensic uses. Allele frequencies for these STR loci and an amelogenin gender marker were determined using 200 &#x3BC;L samples of saliva donated by 296 undergraduates from FOB/USP who were &#x2265; 18 years old at the time of the sample collect after signing a consent form with ethical approval. For laboratory tests, commercial kits were used. Results and statistical parameters were obtained using the following software: GeneMapper IDX (version 1.5), MS Excel 2002 (version 10.6871.6870), GenAlEx (version 6.5) and Arlequin (version 3.5) to compare four populations (Brazil, Portugal, U.S. and this study population). Results indicated that the most polymorphic loci were D18S51 (17 alleles) and FGA (15 alleles), followed by D21S11 (13 alleles); the least polymorphic loci were D16S539 and TH01 (7 alleles each). Various Brazilian populations (n > 100,000) from other studies were compared with this studys Brazilian population using a goodness-of-fit chi-squared test, and no significant differences in these frequencies were observed between these two population groups (p = 0.9999). Other forensic and population genetic statistical parameters were calculated comparing this studys population with Portugal and U.S. populations. For example, an analysis of molecular variance (AMOVA) among all populations, among people of the same population and for each person for each population, showed that people have high individual variance (99%) and that this variance is maintained evenly between people of the same sample/region (1%) and among the three populations studied (0%). This study reinforced the conclusion of other allele frequency population studies for the 15 autosomal STR loci tested, confirming high polymorphic grade and high heterozygosity (96.5%). There were significantly more women in the study (79.7%) when compared to the general Brazilian population (50.4%) since the student body of FOB/USP is 80.6% female. Interestingly, an off-ladder D18S51 allele micro-variance corresponding to the allele 29, not yet identified, was found which should be confirmed using paternity and sequencing tests to verify the possibility of either familial occurrence or nucleotide duplication. In the future, due to the small differences found, the parameters obtained in this study should be incorporated into the Brazilian population database and be considered for a regional population genetic prototype database potentially aiding forensic cases with comparisons and calculations. After confirmation, the potentially new micro variant allele found could be included in the international STRBase.

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