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Identificação molecular dos peixes da bacia do alto rio Paraná /

Pereira, Luiz Henrique Garcia. January 2011 (has links)
Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Cristina Yumi Miyaki / Banca: Francisco Langeani Neto / Banca: Anderson Luís Alves / Banca: Mateus Pepinelli / Resumo: A identificação da diversidade biológica é um desafio nos dias atuais frente aos 10 a 15 milhões de espécies estimadas. Neste sentido, o uso de ferramentas moleculares para a identificação e caracterização de espécies tem-se mostrado promissor. Há mais de 40 anos o uso dessas ferramentas tem auxiliado na identificação de espécies, principalmente para os grupos em que ainda faltam estudos taxonômicos, são muitos especiosos e/ou se caracterizam por possuir espécies morfologicamente muito semelhantes. Recentemente foi feita uma proposta para a identificação molecular das espécies, denominada DNA barcode, com o objetivo de criar um sistema padronizado, rápido e eficaz de identificação de espécies para toda vida eucariótica. O método utiliza um fragmento de 655 pb do gene mitocondrial COI que funciona como um código de barras de DNA. A metodologia se fundamenta na premissa de que a variação nucleotídica intra-específica é sempre menor que a variação nucleotídica encontrada entre espécies, permitindo assim separá-las com uma taxa de erro insignificante. A metodologia já se mostrou bastante eficaz com resolução maior que 90% para diversos grupos animais. A bacia do Alto rio Paraná drena uma área de aproximadamente 890 mil km2 e está inserida numa das regiões mais exploradas e impactadas do Brasil. É considerada a região mais bem estuda do ponto de vista ictiofaunístico da América do Sul, apresentando uma diversidade de aproximadamente 350 espécies. No entanto, esse número ainda é incerto, frente ao elevado número de espécies já reconhecidas e não descritas e à existência de regiões ainda pouco exploradas na bacia. Assim, o uso da metodologia de identificação por DNA barcode se mostra bastante promissor para o estudo e caracterização dessa importante fauna.Diante do exposto, os objetivos do presente trabalho foram: verificar... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The identification of biological diversity is a challenge due the estimated species numbers of 10 to 15 million. Thus, the use of molecular tools for identification and characterization of species has shown promising. These tools has been used for more than 40 years to aid in the species identification, mainly in groups with few taxonomic studies, with high number of species and with morphologically similar species. Recently, a new proposal to species identification was presented, called DNA barcode. The main objective is the creation of a standardized, fast and efficient methodology to identification of all eukaryotic life. The method uses a fragment of 655 bp from mitochondrial COI gene. The basis of successes of this methodology is the fact of the intraspecific nucleotide variation is lower than the interspecific variation, allowing the separation of species with insignificant error rate. The DNA barcode has proven effective, showing a resolution greater than 90% for many animal groups. The Paraná River Basin drains an area of approximately 890,000 km2 and is located in the most exploited and impacted region of Brazil. It is considered the best studied basin from South America with 350 species of fishes recognized. However, the number of species is still uncertain due the high number of species recognized but not yet described and the occurrence of regions unexplored. Thus, the DNA barcode configure a useful tool to the study and characterization of this important fauna. The objectives of this study were: assessing the efficacy of the DNA barcode methodology to identify the species from this basin; analyzing carefully the cases of possible cryptic species and; to deposit in the BOLD system the sequences obtained to contribute with barcode database. We analyzed 1360 specimens belonging to 214 nominal species and 42 species identified to the genus level. The barcode sequences were... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Identificação genética de espécies de tubarões e monitoramento da pesca no litoral de Sâo Paulo /

Silvério, Juliana. January 2010 (has links)
Orientador: Fábio Porto Foresti / Banca: Cláudio de Oliveira / Banca: Daniela Ferreira / Resumo: Dados estatísticos do IBAMA/MMA (Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis) sobre a exploração pesqueira de elasmobrânquios no Brasil registraram no ano de 2007 a captura de 17.900 toneladas, sendo 12.578 toneladas somente de tubarões, um aumento de 11,35% em relação a 2006. Contudo, as dificuldades na identificação morfológica de muitas espécies de tubarões exploradas pela pesca, associada à prática bastante usual de remoção da cabeça e das nadadeiras dos animais, na maioria das vezes antes mesmo do desembarque, tem resultado em uma escassez global de informações sobre captura e comercialização, tornando quase impossível a avaliação de seus efeitos. De acordo com os relatórios a respeito da produção pesqueira apresentados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas 22% de todos os tubarões capturados no Brasil recebem algum tipo de classificação, ainda assim, relacionando apenas um nome popular que em muitos casos refere-se a mais de uma espécie. Por outro lado, dados referente a identificação molecular do tipo PCR-multiplex, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento espécie-específico possibilitando, a identificação simultânea de diversas amostras. Com isso, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a captura e comercialização de tubarões na região Norte do Litoral Paulista. Os resultados apresentados a partir da utilização da técnica da PCR-multiplex a partir do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I em 1000 amostras coletadas em desembarques do litoral do estado de São Paulo, possibilitou, a identificação de 837 amostras. A partir desses dados foram observadas as freqüências relativas por espécie para avaliação de captura e comercialização de tubarões nos municípios de Cananéia, Santos e Ubatuba... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Statistics IBAMA/MMA (Brazilian Institute of Environment and Renewable Natural Resources) on fisheries exploitation of elasmobranchs in Brazil report in 2007 catching 17 900 tonnes, with only 12 578 tonnes of sharks, an increase of 11.35 % compared to 2006. However, difficulties in morphological identification of many shark species exploited by fisheries, coupled with the rather usual practice of removing the head and fins of the animals, most often even before the landing, has resulted in an overall shortage of information on catch and marketing, making it nearly impossible to evaluate their effects. According to the reports about the fish production presented by IBAMA in recent years, only 22% of all sharks caught in Brazil receive some type of classification, yet only linking a popular name in many cases refers to more of a species. Considering the increasing fisheries exploitation technique was used in multiplex PCR-based gene miticindrial Cytochrome oxidase subunit I in 1000 samples collected from landings of the coastal state of Sao Paulo, which enabled the identification of 837 samples were observed by the relative frequencies species for evaluation of capture and trade of sharks in the municipalities of Cananéia, Santos and Ubatuba. For the city of Santos was possible to identify five different species: P. glauca, A. vulpinus, S. Lewin, R. Lalandii and R. porosus, in Ubatuba was recorded the occurrence of four different species in the landings: P. glauca, I. oxyrinchus, R. lalandii and S. lewini and the municipality of Cananea were found three different species: R. lalandii, R. porosus and S. Lewin, product demand elasmobranch was larger in the city of Santos, which shows that this town deserves greater attention in relation to conservation and management of the most exploited species, and Multiplex-PCR technique proved feasible for identification of samples... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Identificação de funções de transferência utilizando como entrada um degrau /

Silva, Dárcio dos Santos. January 2008 (has links)
Resumo: O objetivo do trabalho consiste em estudar e implementar um método de identificação de modelos de funções de transferência que utiliza como entrada de teste um degrau e que foi proposto inicialmente em Kosaka (2005) e compreende duas fases: obtenção de dados referentes à saída do sistema após a aplicação da entrada degrau e a composição de um sistema matricial formado por uma matriz de Toeplitz a partir desses dados. Na solução deste sistema matricial, estima-se os parâmetros da função de transferência do sistema. Neste estudo é proposta uma generalização do método de identificação, descrito em Kosaka, para funções de transferências instáveis. Esse novo método tem como base a multiplicação, no domínio do tempo, da saída da planta y(t) por uma função exponencial do tipo e-at, sendo a um número real positivo. A constante "a" deve ser suficientemente grande, de modo que y(t)e-at ->0 quando t ->infinito. Com esse procedimento o método identifica uma função de transferência estável (G(s+a)) e então é identificada a função de transferência da planta (G(s)). Os resultados da avaliação mostram que o método generalizado e proposto para funções de transferência instáveis também pode ser aplicado em funções de transferência estáveis. O método generalizado fornece melhores resultados quando é comparada a resposta ao degrau da função de transferência estimada pelo método generalizado com a resposta ao degrau do método proposto originalmente por Kosaka em relação à resposta ao degrau da função de transferência da planta com ruído branco na saída. / Abstract: The objective of this work is to study and implement a method of identifying models of transfer functions which uses as input one step and that was initially proposed in Kosaka (2005).This method comprises two phases: obtaining data relating to the output of the system after application of the step and the composition of a system matrix composed of by a Toeplitz matrix from these data. With the solution of this matrix system, it is estimated the parameters of the transfer function of the system. In this study is proposed a generalization of the identification method, described in Kosaka, for unstable transfer functions. This new method is based on the multiplication in time domain of the plant's output y (t) by an exponential function of the type and e- at,, where a is a positive real number. The constant "a" must be large enough so that y (t)e- at ->0 when t -> infinite. With this procedure the method identifies a stable transfer function (G (s + a)) and then is identified the transfer function of the plant (G (s)). The results of the evaluation showed that the method widespread and proposed for unstable transfer functions can also be applied to stable transfer functions. The generalized method showed better results when compared with the step response of the transfer functions estimated by the method with the step response of the transfer function estimed by the method originally proposed by Kosaka (2005), regarding the step response of the transfer function of the plant with white noise in the output. / Orientador: Francisco Villarreal Alvarado / Coorientador: Marcelo Carvalho Minhoto Teixeira / Banca: Edvaldo Assunção / Banca: Márcio Roberto Covacic / Mestre
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Identificação dos parâmetros modais utilizando apenas as respostas da estrutura : identificação no domínio do tempo /

Nunes Junior, Odair Antonio. January 2006 (has links)
Orientador: João Antônio Pereira / Banca: Luiz de Paula do Nascimento / Banca: Domingos Alves Rade / Resumo: A Análise Modal envolvendo apenas as respostas da estrutura é ainda um desafio que requer o uso de técnicas de identificação especiais. Este trabalho discute a identificação baseada apenas na resposta utilizando um método de identificação no tempo, mais especificamente, o método Identificação Estocástica de Subespaço. É mostrado que uma estrutura vibrando excitada por forças não conhecidas, pode ser modelada como um modelo de espaço de estado estocástico. A partir da aplicação de técnicas numéricas robustas como fatorização QR e Decomposição em Valores Singulares para a matriz bloco de Hankel semi-infinita, contendo os dados de resposta, é obtida a estimativa dos estados do modelo. Uma vez que os estados são conhecidos, o sistema de matrizes é encontrado através da solução de um problema de mínimos quadrados. Encontrado o modelo matemático da estrutura, os parâmetros modais são estimados diretamente através da decomposição em autovalores. O trabalho apresenta ainda uma metodologia que utiliza a função densidade de probabilidade para identificar possíveis componentes harmônicos contidos nos sinais de respostas. Os sinais são filtrados em uma faixa de freqüência contendo um provável modo e é verificado se este corresponde a um modo natural ou operacional. A metodologia é avaliada com dados simulados e experimentais e os resultados obtidos mostraram-se promissores para identificação dos parâmetros modais de sistemas estocásticos lineares e invariantes no tempo, utilizando apenas as respostas. / Abstract: Modal analysis using output-only measurements is still a challenge in the experimental modal analysis community. It requires the use of special modal identification techniques. This work discusses the concepts involved in the output-only modal analysis and the implementation of the Stochastic Subspace Identification time domain method. It is shown that a vibrating structure excited by an unknown force can be modelled as a stochastic state space model. In this approach, the SSI method estimates the state sequences directly from the response data and the modal parameters are estimated by using the eigenvalues decomposition of the state matrix. The steps of the procedure are implemented using the well-known numerical linear algebra algorithms, Singular Value Decomposition and the QR decomposition. It also includes a methodology based on the Probability Density Function to identify harmonic components of the response signals. The signals are filtering in a range of frequency containing a mode, to verify if it is a natural or operational mode. The approach is evaluated with simulated and experimental data and the results have shown to be promising to identify the modal parameters of stochastic linear time-invariant systems, based only on the output data. / Mestre
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Estimação de rigidezes de mancais de rotores por análise de sensibilidade /

Caldiron, Leonardo. January 2004 (has links)
Orientador: Luiz de Paula do Nascimento / Banca: Katia Lucchesi Cavalca Dedini / Banca: Gilberto Pechoto de Melo / Resumo: Neste trabalho são otimizadas rotinas computacionais de um método de estimação de rigidez de mancais de máquinas através de um processo de ajuste de modelo, utilizando a análise de sensibilidade. Este método consiste em utilizar a análise de sensibilidade dos autovalores com relação à variação da rigidez dos mancais de um rotor. A eficácia e a robustez do método são analisadas através de simulações teóricas, bem como através de dados experimentais obtidos de um rotor de rotação variável e rigidezes dos mancais ajustáveis. O modelo matemático de ajuste do sistema é desenvolvido pelo método dos elementos finitos e o método de ajuste converge empregando-se um processo iterativo. Este método de ajuste baseia-se na minimização da diferença entre autovalores experimentais e autovalores obtidos com o modelo matemático de ajuste a partir de valores de rigidez dos mancais previamente adotados. A análise é feita com o rotor em diversas velocidades de rotação para verificar a influência do efeito giroscópio, e em diversas condições de valores da rigidez dos mancais para analisar o método quando aplicado em rotores flexíveis e em rotores rígidos. O desempenho do método é analisado com resultados teóricos e experimentais. / Abstract: In this work, computational routines of estimation method of stiffness bearing of machine via a model updating process are optimized, using the sensitivity analysis. This method consists of using the eigenvalue sensitivity analysis, relating to the stiffness bearing variation of a rotor. The efficacy and the robustness of the method are analyzed through the theoretical simulations, as well as, based on the experimental data obtained of a test rotor with variable rotating speeds and adjustable bearing stiffness values. The mathematical model system is developed by the finite element method and the method of adjustment should converge employing an iterative process. The method of adjustment is based on the minimization of the difference between experimental eigenvalues and eigenvalues obtained via mathematical model from previously adopted stiffness bearing values. The analysis is made by using the rotor in different rotating speeds in order to check the influence of the gyroscopic effect, and in several conditions of the stiffness bearing values to analyze the method when applied on flexible and rigid rotors. The performance of the method is analyzed through theoretical and experimental results. / Mestre
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Identificação de doenças em folhas vegetais da cultura de algodão /

Bernardes, Alexandre Aparecido. January 2011 (has links)
Orientador: Aledir Silveira Pereira / Banca: Adilson Gonzaga / Banca: Rodrigo Capobianco Guido / Resumo: A manifestação de patógenos nas plantações é a maior causadora de prejuízos nos mais diversos cultivares, podendo ocasionar o aumento dos preços e a perda da qualidade dos produtos cultivados. O quanto antes for identificada a doença, mais cedo é realizado o seu controle através de agrotóxicos, tendendo, dessa forma, a diminuir a sua proliferação e, consequentemente, evitando maiores danos. No entanto, muitas vezes, a inspeção visual dos sintomas apresentados pela ocorrência de patógenos em uma folha de planta, não é considerada o suficiente para avaliar e identificar o tipo de doença que está causando a lesão, sendo necessário, para o diagnóstico da doença, uma análise mais detalhada por um agrônomo ou por meio de um exame laboratorial a partir da amostra da doença. Neste contexto, este trabalho realizou a classificação automática de doenças do algodoeiro, a partir da extração de características dos sintomas foliares apresentados em imagens digitais. Utilizou-se para este processo, a energia da transformada wavelet para extração de características das imagens e para realizar a classificação foi utilizado a Máquina de Vetor de Suporte (MVS). Ao percorrer o sistema final de classificação, uma imagem pode ser classificada entre cinco tipos de diagnósticos diferentes, como sendo "Sadia" (SA), lesionada com as doenças Ramulária (RA), Mancha Angular (MA) e Mancha de Ascochyta (AS), ou identificada pertencente a nenhuma das classes / Abstract: The expression of pathogens in the plantations is the leading cause of damage in several cultivars, which may cause higher prices and loss of quality of crops. The sooner the disease is identified, the sooner it is done through its control of pesticides, tending thus to reduce their proliferation and thus avoiding further damage. However, often the visual inspection of the symptoms presented by the occurrence of pathogens in a leaf, is not considered enough to assess and identify the type of disease that is causing the lesion, being necessary for the diagnosis of disease, a more detailed analysis by an agronomist or through a laboratory test sample from the disease. In this context, this paper carried the automatic classification of diseases of cotton, from the feature extraction of leaf symptoms presented in digital images. It was used for this process, the energy of wavelet transform to extract features from images and to perform the classification, we used the Support Vector Machine (SVM). By walking through the final system of classification, an image can be classified in five types of different diagnoses, as being "Healthy" (SA), with the injured Ramularia diseases (RA), Bacterial Blight (MA) and Ascochyta Blight (AS) or belonging to any of the identified classes / Mestre
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Desenvolvimento de um sensor virtual para processos não-lineares e variantes no tempo, com aplicação em planta de neutralização de PH /

Lotufo, Francisco Antonio. January 2010 (has links)
Orientador: Samuel Euzédice de Lucena / Banca: Leonardo Mesquita / Banca: Inacio Bianchi / Banca: Germano Lambert -Torres / Banca: Neusa Maria Franco de Oliveira / Resumo: Este trabalho apresenta uma metodologia para desenvolvimento de sensores virtuais capazes de inferir variáveis de processos altamente não lineares e variantes no tempo. A metodologia proposta emprega modelagem nebulosa de sistemas dinâmicos complexos, em que a parte antecedente das regras emprega a técnica de agrupamento (clusterização) de Gustafson-Kessel (product space clustering), e os parâmetros da parte conseqüente das regras são estimados utilizando-se o algoritmo dos mínimos quadrados recursivos, com fator de esquecimento variável. O algoritmo proposto foi avaliado por meio de um modelo virtual implementado em ambiente Matlab®/Simulink® para o processo de neutralização de pH, amplamente utilizado pela literatura técnico-científica para investigação de algoritmos de identificação, controle de processos e simulação de sistemas não lineares e variantes no tempo. O algoritmo de identificação nebulosa proposto e implementado neste trabalho, utilizado como sensor virtual de pH, forneceu resultados muito coerentes, quando comparado com outras técnica de modelagem da literatura, no tocante ao tempo de resposta, erro de predição, capacidade de adaptação e número de amostras necessárias à fase de treinamento / Abstract: The design of a virtual sensor involves the choice of variables to be measured and the choice of a method for obtaining the model. This paper presents a methodology for developing virtual sensors capable of inferring process variables highly nonlinear and time varying. The proposed methodology employs fuzzy modeling of complex dynamic systems in which the antecedent part of rules employs the technique of clustering Gustafson-Kessel (product space clustering), and the parameters of consequent part of rules are estimated using the algorithm of the minimum recursive squares with variable forgetting factor. The algorithm was evaluated through a virtual model implemented in Matlab®/Simulink® for the pH neutralization process, widely used by scientific and technical literature to investigate the identification algorithms, process control and simulation of nonlinear systems and variants in time. The fuzzy identification algorithm proposed and implemented in this work, used as a virtual sensor of pH, provided very interesting results when compared with other modeling technique of the literature regarding the response time, error prediction, adaptive capacity and number of samples necessary for the training phase / Doutor
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Avaliação clínica e laboratorial da estomatite por protese /

D'Avila, Susana January 2006 (has links)
Resumo: Este estudo avaliou a estomatite por prótese total e as variáveis relacionadas à sua etiologia, considerando as características clínicas do indivíduo, as características micológicas e de adesão das espécies de Candida e o grupo sangüíneo dos indivíduos. Sessenta indivíduos portadores de prótese total superior (grupo teste) e 15 indivíduos não usuários de próteses removíveis (grupo controle) foram avaliados. As amostras micológicas foram coletadas da mucosa do palato, face interna da prótese e dorso da língua, por imprint. A identificação das espécies de Candida foi realizada por métodos clássicos (cultura) e moleculares (RAPD). A avaliação da qualidade das próteses totais foi realizada com base em cinco indicadores (defeitos, material, estabilidade, retenção e oclusão) e a da qualidade da higiene da prótese total, por meio da visualização do biofilme com o uso de evidenciador de placa. Não houve diferença significativa no diagnóstico de EP e na detecção de Candida spp. entre o gêneros, hábito de fumar, presença de doença sistêmica, uso de medicamentos e hábitos de higiene (cavidade bucal e PT). A EP foi correlacionada com detecção de Candida spp. no palato e com indivíduos O Rh+. Entretanto não foi correlacionada com um perfil genotípico de Candida spp. ou uma espécie de Candida, com a quantidade de células aderidas nos corpos de prova de resina, com o estado secretor do indivíduo, com o uso contínuo ou qualidade e higiene da prótese total. A detecção de Candida spp. foi correlacionada com a presença de EP, com doença sistêmica, uso de medicamentos, com a qualidade e higiene das próteses e com indivíduos A Rh+. Com base nos resultados obtidos verificamos que a presença de estomatite por prótese total foi correlacionada com o grupo sangüíneo do indivíduo e com Candida spp., a qual também foi correlacionada com características do hospedeiro e da prótese total. / Abstract: This study evaluated the denture stomatitis (DS) and clinical variables related with its etiology, considering the characteristics of clinical, mycological, adhesion profile and blood group of the subjects. 60 denture wearers (test group) and 15 subjects without removable appliances (control group) were evaluated. The mycological samples were taken from palate, denture and tongue by imprint method. The Candida species were identified by classical (culture) and molecular (RAPD) methods. The evaluation of denture quality was performed on basis of five parameters (defect, material, stability, retention, and occlusion) and the hygiene of the denture by means of plaque observation. Statistical difference was not observed between diagnosis of DS and Candida detection for gender, smoking, systemic diseases, medication, hygiene habits (oral cavity and denture). The DS was correlated with Candida spp. on the palate and with subjects O Rh+. However, there was no significance with genotypic profile with any species of Candida either clinical or molecular features. The detection of Candida was correlated with DS, systemic diseases, medication, quality and hygiene of denture in A Rh+ subjects. Within the limits of this study we conclude that denture stomatitis was correlated with blood group and Candida as well as the characteristics of the host and the denture. / Orientador: Maria Regina Sposto / Coorientador: Maria José Soares Mendes Giannini / Banca: Gelson Luis Adabo / Banca: Antonio Olavo Cardoso Jorge / Banca: Luciene Cristina de Figueiredo / Banca: Jacks Jorge Júnior / Doutor
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Técnica de identificação de parâmetros no domínio do tempo utilizando funções ortogonais /

Santos, Katia Antonia Cardoso dos. January 2004 (has links)
Orientador: Gilberto Pechoto de Melo / Banca: Cleudmar Amaral de Araújo / Banca: Vicente Lopes Júnior / Resumo: Nas técnicas de identificação de parâmetros, procuram-se determinar os valores desconhecidos pela manipulação dos sinais de entrada e saída do sistema. O tratamento e análise de sinais são relativamente recentes na engenharia, sendo que seu desenvolvimento deu-se juntamente com o dos sensores e condicionadores de sinais e mais recentemente, com os sistemas automáticos de aquisição de dados. Vários métodos têm sido propostos para resolver problemas de identificação, embora nenhum deles possa ser considerado como sendo universalmente adequado a todas as situações. Conhecendo-se os parâmetros dos sistemas, pode-se acompanhar através de monitoramento e técnicas de identificação, a evolução de possíveis falhas devido à variação destes parâmetros. Os processos de identificação, a partir de funções ortogonais, começam com a construção de uma matriz operacional, o que permite, através de integrações a conversão de um conjunto de equações diferenciais em um conjunto de equações algébricas e consequentemente a obtenção dos parâmetros desconhecidos. Neste trabalho, apresentam-se as técnicas de Identificação de Parâmetros utilizando as funções ortogonais de Fourier e polinomiais de Legendre e Chebyshev. / Abstract: In the parameter identification techniques, it is important to determine the unknown values in the manipulation of input and output signal of the system. The treatment and analysis of signals are relatively recent in the engineering, and its development took place with the sensors and the signal conditioning and recently, with the automatic data acquisition systems. Various methods have been proposed to solve identification problems, although any of them can be regarded universally adequate to all the situations. If the parameters of the systems, is known it can be accompanied, through monitoring and identification techniques, the evolution of possible fault due to the variation of the parameters. The identification process, from these types of functions, start with the construction of an operational matrix for the integration of orthogonal bases vectors, which allow the conversion of a differential equation set to a algebraic equation set, obtaining the unknown parameters. In this work, the parameter identification techniques used, the orthogonal functions of Fourier and polynomial of Legendre and Chebyshev, is presented. / Mestre
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Utlização do DNA mitocondrial no contexto forense brasileiro /

Paneto, Greiciane Gaburro. January 2006 (has links)
Orientador: Regina Maria Barretto Cicarelli / Banca: Rogério Nogueira de Oliveira / Banca: Raquel Mantuaneli Scarel Caminaga / Resumo: A identificação humana através da análise de DNA utiliza o perfil genético de um indivíduo baseado na combinação de diversos marcadores que são herdados de seus progenitores. Esses marcadores são geralmente diferenças nas seqüências de DNA nuclear entre os indivíduos (polimorfismos). Em alguns casos, entretanto, a análise do DNA nuclear não pode ser aplicada. Isso ocorre quando o DNA da amostra apresenta-se degradado ou em casos onde o material biológico não apresenta o DNA nuclear. Nestes casos, a análise do DNA mitocondrial (DNA mt) é o método de escolha. Entretanto, em um mesmo indivíduo podem existir populações de DNA mt diferentes, fenômeno denominado heteroplasmia. Este trabalho teve como objetivo o estudo da freqüência de heteroplasmia no DNA mt extraído de amostras de cabelo, quando comparado ao DNA mt contido no sangue dos mesmos indivíduos; análise da terceira região hipervariável (HV3) do DNA mt em amostras de sangue para estudo do seu poder discriminatório em nossa população; e aplicação da técnica de análise do DNA mt em vestígios biológicos. Para isso foram seqüenciadas as regiões hipervariáveis HV1 e HV2 em amostras de cabelo e sangue de 100 indivíduos, além do sequenciamento da região hipervariável HV3 em amostras de 150 indivíduos, todos residentes na Grande São Paulo. Uma freqüência de 10,5% de heteroplasmia foi encontrada em amostras de cabelo, e uma diversidade haplotípica de 0,8233 e probabilidade de semelhança de 0,1822 na região HV3 do DNA mt em amostras de sangue. Os resultados obtidos estão de acordo com os resultados relatados em outras populações e permitem sua aplicação no contexto forense brasileiro. / Abstract: The human identification by DNA analysis uses the genetic profile of an individual based on the combination of diverse markers that are inherited of its ancestors. These markers are generally differences in sequences of nuclear DNA between individuals (polymorphisms). In some cases, however, the analysis of the nuclear DNA cannot be applied. It occurs when the DNA sample is degraded or in cases which the biological material does not content nuclear DNA. In these cases, the mitocondrial DNA (mtDNA) analysis is the choice method. However, inside one individual can exist different mtDNA populations, phenomenon called heteroplasmy. The objective of this work was to study the frequency of heteroplasmy in extracted mtDNA from hair, when compared with mtDNA contained in the blood of the same individuals; and to analysis the third hypervariable region (HV3) of mtDNA in blood samples to study its discriminatory power in our population. For it, hypervariable regions HV1 and HV2 in hair and blood samples from 100 individuals had been sequenced, beyond the sequencing of hypervariable region HV3 in 150 individuals samples, inhabitants of Grande São Paulo. A heteroplasmic frequency of 10.5% was found in hair samples, and a haplotype diversity of 0.8233 and a random match probability of 0.1822 were found in the HV3 region of mtDNA in blood samples. These results are in agreeing with those obtained from other populations and allow its application in the Brazilian forensic context. / Mestre

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