Thesis (Ph.D.)--Industrial and Systems Engineering, Georgia Institute of Technology, 2009. / Committee Chair: Stasko, John; Committee Member: Abowd, Gregory; Committee Member: Cross, Stephen; Committee Member: Czerwinski, Mary; Committee Member: Vidakovic, Brani

Thesis (doctoral)--Swiss Federal Institute for Environmental Science and Technology, 2005. / Title from PDF file (viewed on Jan. 18, 2007). "DISS ETH No. 15918." Includes bibliographical references.

Thesis (Ph. D.)--Computing, Georgia Institute of Technology, 2006. / Stasko, John, Committee Member ; Owen, Henry, Committee Member ; Merkle, Ralph, Committee Member ; Lee, Wenke, Committee Member ; Ahamad, Mustaque, Committee Chair.

Thesis (M.F.A.)--Rochester Institute of Technology, 2006. / Typescript. Includes bibliographical references.

Em 2008, o IRTF lançou a RFC “SNMP Traffic Measurements and Trace Exchange Formats”, que apresenta uma metodologia para coleta e análise de tráfego SNMP, com o objetivo de identificar características e padrões de uso desse protocolo nas redes em produção. Uma das limitações desta metodologia é a não especificação de um processo de visualização dos dados gerados, o que dificulta o estudo dos resultados obtidos através da aplicação da mesma. Existem alguns trabalhos no âmbito de redes de computadores que investigam a aplicação de técnicas de visualização de informação no estudo de tráfegos. No entanto, tais trabalhos disponibilizam apenas visualizações estáticas, com pouca ou nenhuma possibilidade de interação com o usuário, i.e., elas não permitem que o mesmo explore e retrabalhe a maneira que os dados são visualizados. Esta dissertação de mestrado descreve e avalia técnicas de visualização de informação interativas adaptadas para o estudo de tráfegos gerados pelo SNMP, levando em conta as características peculiares do protocolo. Quatro protótipos de visualização de tráfegos SNMP foram implementos, integrados à ferramenta Management Traffic Analyzer e validados com base em um modelo aninhado para o projeto e análise de visualizações. / In 2008 IRTF released RFC “SNMP Traffic Measurements and Trace Exchange Formats”, which proposes a methodology for capturing and analysis of SNMP traffic traces, in order to identify the behavior and usage patterns of the protocol in production networks. One of the limitations of such methodology is the lack of a process definition to visualize the results of the gathered data, which makes the understanding of its results more difficult. There is some work in the computer network area dealing with the applicantion of information visualization techniques in the study of network traces. Nevertheless, such work only provide static visualization techniques, with little or none user interaction possibilities. That is, they do not allow the user to explore and rebuild the way data is visualized. This masters dissertation presents and evaluates interactive information visualization techniques, adapted for the study of SNMP traces and its unique features. Four visualization prototypes were implemented, integrated in the tool Management Traffic Analyzer, and validated following a nested model for the project and evaluation of visualization techniques.

Com a ampliação da quantidade de informação disponível, gerada pelas diversas atividades humanas, surgiu a necessidade de sistemas computacionais capazes de indexar e analisar estas informações. A manipulação de dados, a derivação de novas informações e a extração de características desses dados propiciam descoberta de padrões e geração de conhecimento, tornando tais sistemas uma importante ferramenta científica. Sistemas com essas funcionalidades são criados com as mais variadas finalidades. No presente trabalho, focamos os sistemas para gerenciamento de informações na área da Biologia, mais especificamente, nos estudos da evolução de mamíferos. Tais sistemas podem ser enquadrados nos chamados sistemas de informação de biodiversidade. Tem-se verificado um número crescente de iniciativas direcionadas para o compartilhamento de informações de biodiversidade através da web. Tais sistemas visam disponibilizar, através da rede mundial de computadores, informações sobre espécimes catalogados em coleções nos mais variados locais, tais como museus de ciências naturais e instituições de pesquisa. Este trabalho descreve os componentes principais de um sistema de informações de biodiversidade, cujo objetivo é integrar recursos de visualização e de análise de dados e funções convencionais de gerenciamento encontradas em bancos de dados. O sistema, denominado TaxonomyBrowser, visa auxiliar os biólogos no gerenciamento de informações a respeito de espécimes por eles coletados, assim como exemplares já catalogados em coleções de museus. A integração com visualização de mapas através da API do Google Maps e a utilização de ferramentas de análise de dados através do Google Charts e do sistema R amplia a aplicabilidade do sistema, bem como, facilita a interação com os usuários. A validação, assim como todo projeto do sistema, foi realizada com a ajuda de biólogos da UFRGS, responsáveis pela coleta e catalogação de espécimes de mamíferos. / The increasing amount of information available due to the several, different human activities leads to the need for computing systems able to index and analyze these large data volume. Data manipulation, derivation of new data from the available ones and the extraction of characteristics from these data allow finding patterns and generating knowledge, turning such computing systems important scientific tools. Thus, systems with these features are created with a variety of purposes. In this work we focus on systems for the management of biological data, more specifically on those supporting the study of mammals’ evolution. Such systems are classified as biodiversity information systems. It has been verified an increasing number of approaches to share biodiversity information through the web. Such systems aim at providing, through theWorldWideWeb, information about catalogued specimens in collections at various locations, like natural sciences museums and research institutions. This work describes the main components of a biodiversity information system developed to integrate visualization and data analysis tools and conventional data management functions provided by relational databases. The system, named TaxonomyBrowser, aims at helping biologists to manage the information about the specimens they collect in fieldwork, as well as specimens that have already been catalogued in museums’ collections. The integration of map visualization through the Google Maps API and the application of Google Charts and R System as data analysis tools improve the system applicability, as well as facilitate user interaction. All phases of the system design were performed together with UFRGS biologists, in a participatory design experience, and currently they are carrying on a thorough validation of the system.

Em 2008, o IRTF lançou a RFC “SNMP Traffic Measurements and Trace Exchange Formats”, que apresenta uma metodologia para coleta e análise de tráfego SNMP, com o objetivo de identificar características e padrões de uso desse protocolo nas redes em produção. Uma das limitações desta metodologia é a não especificação de um processo de visualização dos dados gerados, o que dificulta o estudo dos resultados obtidos através da aplicação da mesma. Existem alguns trabalhos no âmbito de redes de computadores que investigam a aplicação de técnicas de visualização de informação no estudo de tráfegos. No entanto, tais trabalhos disponibilizam apenas visualizações estáticas, com pouca ou nenhuma possibilidade de interação com o usuário, i.e., elas não permitem que o mesmo explore e retrabalhe a maneira que os dados são visualizados. Esta dissertação de mestrado descreve e avalia técnicas de visualização de informação interativas adaptadas para o estudo de tráfegos gerados pelo SNMP, levando em conta as características peculiares do protocolo. Quatro protótipos de visualização de tráfegos SNMP foram implementos, integrados à ferramenta Management Traffic Analyzer e validados com base em um modelo aninhado para o projeto e análise de visualizações. / In 2008 IRTF released RFC “SNMP Traffic Measurements and Trace Exchange Formats”, which proposes a methodology for capturing and analysis of SNMP traffic traces, in order to identify the behavior and usage patterns of the protocol in production networks. One of the limitations of such methodology is the lack of a process definition to visualize the results of the gathered data, which makes the understanding of its results more difficult. There is some work in the computer network area dealing with the applicantion of information visualization techniques in the study of network traces. Nevertheless, such work only provide static visualization techniques, with little or none user interaction possibilities. That is, they do not allow the user to explore and rebuild the way data is visualized. This masters dissertation presents and evaluates interactive information visualization techniques, adapted for the study of SNMP traces and its unique features. Four visualization prototypes were implemented, integrated in the tool Management Traffic Analyzer, and validated following a nested model for the project and evaluation of visualization techniques.

Com a ampliação da quantidade de informação disponível, gerada pelas diversas atividades humanas, surgiu a necessidade de sistemas computacionais capazes de indexar e analisar estas informações. A manipulação de dados, a derivação de novas informações e a extração de características desses dados propiciam descoberta de padrões e geração de conhecimento, tornando tais sistemas uma importante ferramenta científica. Sistemas com essas funcionalidades são criados com as mais variadas finalidades. No presente trabalho, focamos os sistemas para gerenciamento de informações na área da Biologia, mais especificamente, nos estudos da evolução de mamíferos. Tais sistemas podem ser enquadrados nos chamados sistemas de informação de biodiversidade. Tem-se verificado um número crescente de iniciativas direcionadas para o compartilhamento de informações de biodiversidade através da web. Tais sistemas visam disponibilizar, através da rede mundial de computadores, informações sobre espécimes catalogados em coleções nos mais variados locais, tais como museus de ciências naturais e instituições de pesquisa. Este trabalho descreve os componentes principais de um sistema de informações de biodiversidade, cujo objetivo é integrar recursos de visualização e de análise de dados e funções convencionais de gerenciamento encontradas em bancos de dados. O sistema, denominado TaxonomyBrowser, visa auxiliar os biólogos no gerenciamento de informações a respeito de espécimes por eles coletados, assim como exemplares já catalogados em coleções de museus. A integração com visualização de mapas através da API do Google Maps e a utilização de ferramentas de análise de dados através do Google Charts e do sistema R amplia a aplicabilidade do sistema, bem como, facilita a interação com os usuários. A validação, assim como todo projeto do sistema, foi realizada com a ajuda de biólogos da UFRGS, responsáveis pela coleta e catalogação de espécimes de mamíferos. / The increasing amount of information available due to the several, different human activities leads to the need for computing systems able to index and analyze these large data volume. Data manipulation, derivation of new data from the available ones and the extraction of characteristics from these data allow finding patterns and generating knowledge, turning such computing systems important scientific tools. Thus, systems with these features are created with a variety of purposes. In this work we focus on systems for the management of biological data, more specifically on those supporting the study of mammals’ evolution. Such systems are classified as biodiversity information systems. It has been verified an increasing number of approaches to share biodiversity information through the web. Such systems aim at providing, through theWorldWideWeb, information about catalogued specimens in collections at various locations, like natural sciences museums and research institutions. This work describes the main components of a biodiversity information system developed to integrate visualization and data analysis tools and conventional data management functions provided by relational databases. The system, named TaxonomyBrowser, aims at helping biologists to manage the information about the specimens they collect in fieldwork, as well as specimens that have already been catalogued in museums’ collections. The integration of map visualization through the Google Maps API and the application of Google Charts and R System as data analysis tools improve the system applicability, as well as facilitate user interaction. All phases of the system design were performed together with UFRGS biologists, in a participatory design experience, and currently they are carrying on a thorough validation of the system.

Técnicas de visualização de informaçoes têm sido usadas para a representação de ontologias visando permitir a compreensão de conceitos e propriedades em domínios específicos. A visualização de ontologias deve ser baseada em representaccões gráficas efetivas e téquinas de interação que auxiliem tarefas de usuários relacionadas a diferentes entidades e aspectos. Ontologias podem ser complexas devido tanto à grande quantidade de níveis da hierarquia de classes como também aos diferentes atributos. Neste trabalho, propo˜e-se uma abordagem baseada no uso de múltiplas e coordenadas visualizações para explorar ambos os níceis intensional e extensional de uma ontologia. Para tanto, são empregadas estruturas visuais baseadas em árvores que capturam a característica hierárquiva de partes da ontologia enquanto preservam as diferentes categorias de classes. Além desta contribuição, propõe-se um inovador emprego do conceito "Degree of Interest" de modo a reduzir a complexidade da representação da ontologia ao mesmo tempo que procura direcionar a atenção do usuádio para os principais conceitos de uma determinada tarefa. Através da análise automáfica dos diferentes aspectos da ontologia, o principal conceito é colocado em foco, distinguindo-o, assim, da informação desnecessária e facilitando a análise e o entendimento de dados correlatos. De modo a sincronizar as visualizações propostas, que se adaptam facilmente às tarefas de usuários, e implementar esta nova proposta de c´calculo baseado em "Degree of Interest", foi desenvolvida uma ferramenta de visualização de ontologias interativa chamada OntoViewer, cujo desenvolvimento seguiu um ciclo interativo baseado na coleta de requisitos e avaliações junto a usuários em potencial. Por fim, uma última contribuição deste trabalho é a proposta de um conjunto de "guidelines"visando auxiliar no projeto e na avaliação de téncimas de visualização para os níceis intensional e extensional de ontologias. / Visualization techniques have been used for the representation of ontologies to allow the comprehension of concepts and properties in specific domains. Techniques for visualizing ontologies should be based on effective graphical representations and interaction techniques that support users tasks related to different entities and aspects. Ontologies can be very large and complex due to many levels of classes’ hierarchy as well as diverse attributes. In this work we propose a multiple, coordinated views approach for exploring the intensional and extensional levels of an ontology. We use linked tree structures that capture the hierarchical feature of parts of the ontology while preserving the different categories of classes. We also present a novel use of the Degree of Interest notion in order to reduce the complexity of the representation itself while drawing the user attention to the main concepts for a given task. Through an automatic analysis of ontology aspects, we place the main concept in focus, distinguishing it from the unnecessary information and facilitating the analysis and understanding of correlated data. In order to synchronize the proposed views, which can be easily adapted to different user tasks, and implement this new Degree of Interest calculation, we developed an interactive ontology visualization tool called OntoViewer. OntoViewer was developed following an iterative cycle of refining designs and getting user feedback, and the final version was again evaluated by ten experts. As another contribution, we devised a set of guidelines to help the design and evaluation of visualization techniques for both the intensional and extensional levels of ontologies.

This paper focus on the development of a tool for Ship and Weather Information Monitoring (SWIM) visualizing weather data combined with data from ship voyages. The project was done in close collaboration with the Swedish Meteorological and Hydrological Institute (SMHI) who also evaluated the result. The goal was to implement a tool which will help shipping companies to monitor their feet and the weather development along planned routes and provide support for decisions regarding route choice and to evade hazard. A qualitative usability study was performed to gather insight about usability issues and to aid future development. Overall the result of the study was positive and the users felt that the tool would aid them in the daily work.