La recherche en agriculture a un rôle important à jouer pour la population mondiale si on la considère comme un domaine stratégique pouvant fournir des connaissances ainsi qu´une base technologique à la production agricole. Ce secteur génère des extrants, des résultats ayant des impacts spécifiques dans les zones rurales, les filières agricoles, l'économie, la société et l'environnement. La recherche et l'innovation agricoles représentent un élément clé pour permettre d´atteindre les objectifs du développement durable imposés par les Nations Unies (ODD), en particulier les ODD 2 et 12 – c´est-à-dire réduire les inégalités sociales, éliminer la faim et accroître durablement la production alimentaire. Ainsi, l'évaluation de l'impact dans le domaine économique, politique, social et environnemental des recherches et des innovations devient fondamentale dans un objectif de recherche croissante de la durabilité des pays et de la planète. Les bailleurs de fonds, les institutions supérieures de contrôle, le parlement, le gouvernement, les producteurs, les filières agricoles, les consommateurs et toute la société civile ont besoin de transparence, d'efficacité et d'efficience de la part des organismes publics : ils doivent démontrer un retour sur investissement public, un impact positif sur l'économie et la société, tout en minimisant les impacts négatifs sur l'environnement. L'objectif principal de cette thèse est donc de répertorier les approches théoriques et pratiques déjà réalisées pour l'évaluation d'impact, en particulier en se penchant sur les expériences de quatre organismes de recherche, et de développer un modèle conceptuel du système de gestion de l'évaluation d'impact de l'innovation, en particulier un modèle qui sera applicable aux organismes de recherche agricole. Nous adoptons une méthodologie basée sur la revue de littérature, quatre cas d'étude comparative d'organismes de recherche agricole (le Cirad et l´Inra en France, l´Embrapa au Brésil, et le CSIRO en Australie). Les contributions innovantes de cette thèse sont : I. La construction d'un modèle conceptuel d'un système de gestion de l'évaluation d'impact basé sur le processus d'innovation ; II. Le modèle du système de l'évaluation d'impact d'innovation considèrant une vision transversale de durabilité, intégrant les dimensions environnementale, sociale, politique et économique ; III. Le système d'analyse d'impact de l'innovation reposera sur un processus unique de gestion, notamment concernant les étapes d'évaluation ex ante et ex post selon leur temporalité respective ; IV. La gestion du processus de l'innovation et de l'évaluation d'impact prévoyant l'insertion d'approches comportementales telles que les concepts d'holisme, de constructivisme et de transdisciplinarité. Cette thèse présente donc une approche originale car fournissant un outil de gouvernanceà la recherche, tout en mettantun accent innovant sur la gestion de l'impact ex-ante et ex-post. Elle aide les organisations de recherche et d'innovation à fournir chaque fois plus de solutions durables dans le cadre de leurs missions institutionnelles, et contribuant ainsi à participer aux objectifs de développement durable de l'ONU pour aller vers une agriculture plus productive et plus durable. / Agricultural research has an important role for the world population by considering it as a strategic area for providing knowledge and technological base for agricultural production. This sector generates outputs, outcomes with respective impacts to rural zones, supply chains, economy, society and environment. The agricultural research & innovation represents a key piece for reaching the United Nations sustainable development goals (SDG), especially to SDG 2 and 12 – to promote sustainable agricultural to eliminate hunger and improving nutrition, as well as to promote sustainable consumption and production, respectively. In order to check whether agricultural research organizations generate sustainable impacts, it is necessary to assess the impacts of their innovations. Funders, supreme auditing institutions, parliament, government, producers, supply chains, consumers and all society require transparency, efficacity, and effectivity of public organizations: they must highlight return of public investment as well as generate positive impact to the economy and society, and minimize negative impacts to the environment. Many public research organizations around the world have developed impact assessment processes. There is no flawed theories and practices approaches to impact assessment context. Therefore, this research seeks to fill gaps or to supplement the existing approaches. The main thesis objective is to summarize theoretical and practical studied approaches on impact assessment, including the experiences of four research organizations, and to develop a conceptual model of innovation impact assessment management system, especially applicable to agricultural research organizations. It adopts a methodology based on literature review, four cases of a comparative study of agricultural research organizations (Cirad and Inra from France, Embrapa from Brazil, and CSIRO from Australia), and benchmarking these experiences studied. The innovative contributions of this thesis are I. construction of a conceptual model of an impact assessment management system based on the open innovation process; II. the model of innovation impact assessment management system considers a cross-cut view of sustainability, integrating the environmental, social, political and economic dimensions; III. the innovation impact assessment system will be based on a unique managerial process that regards ex-ante and ex-post assessment stages according to its respective temporality; IV. the management of the innovation and impact assessment processes foresees the insertion of behavioral approaches such as concepts of holism, constructivism, transdisciplinarity and agile management practices as essential requirements for the effective engagement of the internal and external actors and the effectiveness of the evaluation process. This thesis has an original approach by bringing a research governance tool with an innovative focus on ex-ante and ex-post impact management, helping research and innovation organizations to become increasingly sustainable in their institutional missions, thus contributing to the achievement of the UN's sustainable development goals towards more productive and sustainable agriculture.