Diss. (sammanfattning) Stockholm : Univ., 2005. / Härtill 3 uppsatser.

Diss. (sammanfattning) Uppsala : Uppsala universitet, 2007. / Härtill 4 uppsatser.

Thesis (Ph.D. in Molecular Biology) -- University of Colorado Denver, 2007. / Typescript. Includes bibliographical references (leaves 225-248). Free to UCD affiliates. Online version available via ProQuest Digital Dissertations;

Made available in DSpace on 2015-11-11T12:13:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 caroline_passaes_ioc_dout_2012.pdf: 6197462 bytes, checksum: 60b931e8b71d31d134ea1576e4b43737 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-05-21 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A integrase (IN) é uma enzima chave para o ciclo de replicação do HIV, sendo responsável por catalisar a integração do genoma do HIV no cromossomo hospedeiro. Devido ao papel essencial desta enzima para a patogênese da infecção pelo HIV, a recente introdução dos inibidores de IN (INI) na prática clínica e em vista da escassez de informação sobre a diversidade genética da IN do HIV no Brasil, o presente estudo tem como objetivos a) investigar a diversidade genética da IN e os níveis de resistência primária nos subtipos B, C e F do HIV que são prevalentes no Brasil; b) acompanhar pacientes sob terapia antirretroviral em esquemas contendo raltegravir (RAL) a fim de monitorar a emergência de mutações de resistência aos INI; c) desenvolver um método de genotipagem da IN do HIV para ser usado na pratica clínica no Brasil; e d) investigar o envolvimento do processo de integração no controle da replicação do HIV. Não foram detectadas mutações principais associadas aos INI entre os indivíduos virgens de tratamento infectados com diferentes subtipos de HIV-1 O nível de mutações acessórias observadas foi bem baixo, e algumas posições foram polimórficas nas amostras brasileiras dos subtipos B, C e F. Esses resultados encorajam o uso de INI no Brasil. Analisando as coortes de pacientes que trocaram a enfuvirtida por RAL ou sob terapia de resgate com RAL, nós observamos um aumento nas contagens de células T CD4+ e uma rápida diminuição da carga viral no grupo sob terapia de resgate. Três pacientes não atingiram supressão virológica e as mutações Q148H+G140S foram detectadas em dois deles. A fim de monitorar o crescente número de pacientes sob terapia com RAL no Brasil, nós desenvolvemos um método de genotipagem in-house que está atualmente em teste pela rede de Genotipagem do Ministério da Saúde do Brasil para futura incorporação no monitoramento de pacientes falhando INI. Sobre o papel da IN no controle da infecção pelo HIV, não observamos mutações nos resíduos importantes para a atividade catalítica nas sequências de IN obtidas de pacientes controladores da infecção pelo HIV, nem acúmulo de DNA 2-LTR, sugerindo que não há um mecanismo bloqueando a integração nestes pacientes. Juntos, os resultados apresentados trazem informações importantes sobre a diversidade genética da IN, resistência aos INI e sobre o papel da IN na patogênese da infecção pelo HIV / I ntegrase ( IN) is a key enzyme for the HIV - 1 replication cycle, being responsible for catalyz ing the integration of HIV genome into the host chromat in. Due to the essential role of this enzyme for HIV pathogenesis , the recent introduction of IN inhibitors in the clinical practice and in view of the paucity of information about the genetic diversity of HIV IN in Brazil, the present study aims to a) inv estigate the genetic diversity of IN and the levels of primary resistance in HIV subtypes B, C and F that are prevalent in Brazil; b) follow - up patients under antirretroviral therapy schemes containing raltegravir (RAL) in order to monitor the emergence of resistance mutations to IN inhibitor (INI) ; c) develop a method to genotype HIV IN to be used in c linical practice in Brazil; and d) investigate the involvement of the integration process in the control of HIV replication. No major resistance mutations as sociated to IN I w ere detected among drug - naïve individuals infected with distinct HIV - 1 subtypes . The level of accessory mutations was very low, and some positions were polymorphic in Brazilian samples of HIV subtypes B, C and F. These results encourage th e use of IN I in Brazil. By a nalyzing cohorts of patients that switched from enfuvirtide to RAL or under salvage therapy with RAL we observed an increase in T CD4+ cell counts and a rapid decay of viral load in this salvage therapy group. For three patients , virological suppression was not achieved and the mutations Q148H+G140S were detected for two of them . In order to monitor the increasing number of patients under therapy with RAL in Brazil, we developed a n in - house genotyping method that is currently und er test by the Brazilian Ministry of Health Genotyping N etwork for further incorporation for the management of HIV patients failing INI . Concerning the role of the IN in the control of HIV infection, we did not observe mutations at residues important for c atalytic activity in the integrase sequences obtaine d from HIV controller patients or an accumulation of 2 - LTR DNA, suggesting that there is not a mechanism blocking HIV integration in these patients. Taken together, the results here presented bring import ant insights about HIV IN diversity, resistance to INI and the role of IN in HIV pathogenesis

Diss. (sammanfattning) Umeå : Univ., 2008. / Härtill 3 uppsatser.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2004. / Vita. Includes bibliographical references.