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Algoritmos de agrupamento aplicados a dados de express?o g?nica de c?ncer: um estudo comparativo

Ara?jo, Daniel Sabino Amorim de 11 November 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:47:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DanielSAA.pdf: 691771 bytes, checksum: c2a3333a69e8d426409687ac8cfac27f (MD5) Previous issue date: 2008-11-11 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The use of clustering methods for the discovery of cancer subtypes has drawn a great deal of attention in the scientific community. While bioinformaticians have proposed new clustering methods that take advantage of characteristics of the gene expression data, the medical community has a preference for using classic clustering methods. There have been no studies thus far performing a large-scale evaluation of different clustering methods in this context. This work presents the first large-scale analysis of seven different clustering methods and four proximity measures for the analysis of 35 cancer gene expression data sets. Results reveal that the finite mixture of Gaussians, followed closely by k-means, exhibited the best performance in terms of recovering the true structure of the data sets. These methods also exhibited, on average, the smallest difference between the actual number of classes in the data sets and the best number of clusters as indicated by our validation criteria. Furthermore, hierarchical methods, which have been widely used by the medical community, exhibited a poorer recovery performance than that of the other methods evaluated. Moreover, as a stable basis for the assessment and comparison of different clustering methods for cancer gene expression data, this study provides a common group of data sets (benchmark data sets) to be shared among researchers and used for comparisons with new methods / O uso de t?cnicas de agrupamento na descoberta de subtipos de c?ncer tem atra?do grande aten??o da comunidade cient?fica. Enquanto bioinformatas prop?em novas t?cnicas de agrupamento que levam em considera??o caracter?sticas dos dados de express?o g?nica, a comunidade m?dica prefere utilizar as t?cnicas cl?ssicas de agrupamento. De fato, n?o existem trabalhos na literatura que realizam uma avalia??o em grande escala de t?cnicas de agrupamento nesse contexto. Diante disso, este trabalho apresenta o primeiro estudo em grande escala de sete t?cnicas de agrupamento e quatro medidas de proximidade para a an?lise de 35 conjuntos de dados de express?o g?nica. Mais especificamente, os resultados mostram que a t?cnica mistura finita de gaussianas, seguida pelo k-means, apresentam os melhores resultados em termos de recupera??o da estrutura natural dos dados. Esses m?todos tamb?m apresentam a menor diferen?a entre o n?mero real de classes e o n?mero de grupos presente na melhor parti??o. Al?m disso, os m?todos de agrupamento hier?rquico, que v?m sendo bastante utilizados pela comunidade m?dica, apresentaram os piores resultados quando comparados com os outros m?todos investigados. Este trabalho tamb?m apresenta, como uma refer?ncia est?vel para a avalia??o e compara??o de diferentes algoritmos de agrupamento para dados de express?o g?nica de c?ncer, um conjunto de bases de dados (benchmark data sets) que pode ser compartilhado entre pesquisadores e usado na compara??o de novos m?todos
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Avalia??o de arquitetura de agentes emocionais : uma abordagem baseada em m?trica de qualidade e na influ?ncia das emo??es sobre usu?rios

Meira, Marcilio de Oliveira 05 September 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:47:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarcilioOM_DISSERT.pdf: 2842138 bytes, checksum: a048e635c669d6652fa350ab1d82eadc (MD5) Previous issue date: 2012-09-05 / There is a need for multi-agent system designers in determining the quality of systems in the earliest phases of the development process. The architectures of the agents are also part of the design of these systems, and therefore also need to have their quality evaluated. Motivated by the important role that emotions play in our daily lives, embodied agents researchers have aimed to create agents capable of producing affective and natural interaction with users that produces a beneficial or desirable result. For this, several studies proposing architectures of agents with emotions arose without the accompaniment of appropriate methods for the assessment of these architectures. The objective of this study is to propose a methodology for evaluating architectures emotional agents, which evaluates the quality attributes of the design of architectures, in addition to evaluation of human-computer interaction, the effects on the subjective experience of users of applications that implement it. The methodology is based on a model of well-defined metrics. In assessing the quality of architectural design, the attributes assessed are: extensibility, modularity and complexity. In assessing the effects on users' subjective experience, which involves the implementation of the architecture in an application and we suggest to be the domain of computer games, the metrics are: enjoyment, felt support, warm, caring, trust, cooperation, intelligence, interestingness, naturalness of emotional reactions, believabiliy, reducing of frustration and likeability, and the average time and average attempts. We experimented with this approach and evaluate five architectures emotional agents: BDIE, DETT, Camurra-Coglio, EBDI, Emotional-BDI. Two of the architectures, BDIE and EBDI, were implemented in a version of the game Minesweeper and evaluated for human-computer interaction. In the results, DETT stood out with the best architectural design. Users who have played the version of the game with emotional agents performed better than those who played without agents. In assessing the subjective experience of users, the differences between the architectures were insignificant / H? uma necessidade dos projetistas de sistemas multiagentes em determinar a qualidade dos sistemas logo nas fases iniciais do processo de desenvolvimento. As arquiteturas dos agentes tamb?m fazem parte do projeto desses sistemas, e por isso tamb?m precisam ter sua qualidade avaliada. Motivados pelo importante papel que as emo??es desempenham em nossas vidas di?rias, pesquisadores de agentes incorporados t?m buscado criar agentes capazes de ter intera??o afetiva e natural com usu?rios, de forma que produza algum resultado ben?fico ou desej?vel. Para isso, v?rios estudos propondo arquiteturas de agentes com emo??es foram surgindo sem o acompanhamento dos devidos m?todos necess?rios para avalia??o dessas arquiteturas. Assim, o objetivo principal deste trabalho ? propor uma metodologia de avalia??o de arquiteturas de agentes emocionais, que avalia os atributos de qualidade do projeto das arquiteturas, al?m da avalia??o da intera??o humano computador, sobre os efeitos na experi?ncia subjetiva dos usu?rios de aplica??es que as implementam. A metodologia ? baseada em um modelo de m?tricas bem definido. Na avalia??o da qualidade do projeto arquitetural, os atributos avaliados s?o: extensibilidade, modularidade e complexidade. Na avalia??o dos efeitos na experi?ncia subjetiva dos usu?rios, que envolve a implementa??o das arquiteturas em uma aplica??o e que sugerimos ser no dom?nio de jogos de computador, as m?tricas s?o: agradabilidade, ajuda percebida, anima??o, carinho percebido, confian?a, coopera??o, intelig?ncia, interesse, naturalidade nas rea??es emocionais, realidade do comportamento, redu??o de frustra??o e simpatia, al?m do tempo m?dio e m?dia de tentativas. Realizamos experimentos com esta metodologia e avaliamos cinco arquiteturas de agentes emocionais: BDIE, DETT, Camurri-Coglio, EBDI, Emotional- BDI. Duas das arquiteturas, BDIE e EBDI, foram implementadas numa vers?o do jogo Campo Minado e avaliadas quanto ? intera??o humano computador. Nos resultados, a DETT se destacou com o melhor projeto arquitetural. Os usu?rios que jogaram a vers?o do jogo com agentes emocionais tiveram um melhor desempenho do que os que jogaram sem agentes. Na avalia??o da experi?ncia subjetiva dos usu?rios, as diferen?as entre as arquiteturas foram pouco relevantes.
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Especifica??o de um bloco funcional implementando rede neural para redes industriais foundations fieldbus

Besch, G?udio Vin?cius Lopes 03 December 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:55:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GaudioVLB_Capa_ate_pag17.pdf: 9585869 bytes, checksum: 2c08182891dcc8649365bc6bb452f431 (MD5) Previous issue date: 2004-12-03 / This work proposes the specification of a new function block according to Foundation Fieldbus standards. The new block implements an artificial neural network, which may be useful in process control applications. The specification includes the definition of a main algorithm, that implements a neural network, as well as the description of some accessory functions, which provide safety characteristics to the block operation. Besides, it also describes the block attributes emphasizing its parameters, which constitute the block interfaces. Some experimental results, obtained from an artificial neural network implementation using actual standard functional blocks on a laboratorial FF network, are also shown, in order to demonstrate the possibility and also the convenience of integrating a neural network to Fieldbus devices / Esta disserta??o apresenta a especifica??o de um novo Bloco Funcional de acordo com o padr?o Foundation Fieldbus, implementando uma Rede Neural Artificial ?til em diversas aplica??es de controle de processos. Essa especifica??o inclui a defini??o do algoritmo central do bloco, que implementa uma RN, e das fun??es acess?rias de forma a prover seguran?a de opera??o, al?m da descri??o dos atributos do bloco, com ?nfase nos par?metros, que formam as interfaces do objeto. Apresentam-se tamb?m os experimentos que foram realizados a partir de uma rede FF de laborat?rio, em que se empregaram apenas blocos padronizados j? existentes, a fim de se verificar a possibilidade e a conveni?ncia de integra??o de algoritmos de RN em dispositivos de campo FF
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An?lise de um controlador baseado no Jacobiano estimado da planta atrav?s de uma rede neural

Lucena, Pedro Berretta de 16 December 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:55:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PedroBL.pdf: 595050 bytes, checksum: f0ab25c9935d2925102dfa8c9a811a4b (MD5) Previous issue date: 2005-12-16 / This work presents an analysis of the control law based on an indirect hybrid scheme using neural network, initially proposed for O. Adetona, S. Sathanathan and L. H. Keel. Implementations of this control law, for a level plant of second order, was resulted an oscillatory behavior, even if the neural identifier has converged. Such results had motivated the investigation of the applicability of that law. Starting from that, had been made stability mathematical analysis and several implementations, with simulated plants and with real plants, for analyze the problem. The analysis has been showed the law was designed being despised some components of dynamic of the plant to be controlled. Thus, for plants that these components have a significant influence in its dynamic, the law tends to fail / Este trabalho apresenta uma an?lise da lei de controle baseada em um esquema h?brido indireto usando rede neural, proposto inicialmente por O. Adetona, S. Sathanathan e L. H. Keel. Implementa??es dessa lei de controle, para uma planta de n?vel de segunda ordem, resultaram em um comportamento oscilat?rio, mesmo com a converg?ncia do identificador neural. Tais resultados motivaram a investiga??o da aplicabilidade dessa lei. A partir disso, foram feitas an?lises matem?ticas de estabilidade e diversas implementa??es, com plantas simuladas e com plantas reais, com a finalidade de se analisar o problema. A an?lise mostrou que a lei foi desenvolvida desprezando-se certos componentes da din?mica da planta a ser controlada. Sendo assim, para plantas onde esses componentes t?m uma influ?ncia significativa em sua din?mica, a lei tende a falhar
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Modelagem autom?tica e din?mica de estilos de aprendizagem em sistemas adaptativos e inteligentes para educa??o a dist?ncia: estudo comparativo entre duas abordagens

Gon?alves, Andr? Vin?cius 18 December 2015 (has links)
Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-01-09T12:21:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) andre_vinicius_gon?alves.pdf: 1266538 bytes, checksum: 42c3fe90b9d66c8cb7b901a10e548f1b (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-01-31T13:56:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) andre_vinicius_gon?alves.pdf: 1266538 bytes, checksum: 42c3fe90b9d66c8cb7b901a10e548f1b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-31T13:56:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) andre_vinicius_gon?alves.pdf: 1266538 bytes, checksum: 42c3fe90b9d66c8cb7b901a10e548f1b (MD5) Previous issue date: 2016-06 / Nos ?ltimos dez anos muitos pesquisadores t?m realizado estudos sobre assist?ncia personalizada e inteligente em Ambientes Educacionais a Dist?ncia, baseada na identifica??o dos Estilos de Aprendizagem. Sabe-se que o aprendizado ? algo extremamente particular, pois cada estudante possui estilos pr?prios e pode sofrer mudan?as diante de situa??es diversas como, por exemplo, objetivo, motiva??o, personalidade, etc. Por isso, o conceito de adaptabilidade do conte?do did?tico tem se tornado de grande import?ncia na personaliza??o do Sistema de Gerenciamento de Aprendizagem (SGA). Diante desse fato, Dor?a (2012) prop?e uma abordagem de Sistema Adaptativo e Inteligente para Educa??o (SAIE), utilizando t?cnicas probabil?sticas e Intelig?ncia Artificial (IA), capaz de detectar e adaptar, de maneira din?mica e autom?tica, os estilos de aprendizagem do estudante, considerando o Modelo de Estilo de Aprendizagem Felder-Silverman?s. Ap?s pesquisa detalhada, foram propostas algumas adapta??es baseadas na abordagem original, alterando o funcionamento de dois componentes espec?ficos: o M?dulo Pedag?gico e o Componente de Modelagem do Estudante. Al?m disso, prop?e-se uma nova estrutura do Modelo Estudante, contemplando o hist?rico de desempenho do aluno nos processos avaliativos. Por conseguinte, realizaram-se testes para avaliar os impactos de tais mudan?as por meio uma compara??o estat?stica utilizando o m?todo T-Pareado. Pelos resultados obtidos, as ideias deste trabalho proporcionaram uma melhora m?dia de 6,07% no desempenho avaliativo do estudante e uma redu??o m?dia de 68,27% nos problemas de aprendizagem, demonstrando efici?ncia e efic?cia da proposta. / Disserta??o (Mestrado Profissional) ? Programa de P?s-Gradua??o em Educa??o, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2015. / Since last decade many researchers have been conducting studies on personalized and intelligent assistance in distance education based on identification of learning styles. It is known that learning is something very particular because each student has their own styles and are subject to change on a variety of situations such as goal, motivation, personality, etc. Therefore, this study discusses the concept of adaptability of educational content as a way to provide customization of Learning Management System (LMS). Through probabilistic techniques and Artificial Intelligence (AI), Dor?a (2012) proposed a approach Adaptive and Intelligent System for Education (AIES) able to dynamically and automatically detect, select and adapt learning objects based on the student?s profile through Felder-Silverman Learning Styles Model (FSLSM). After detailed study, it has been proposed some adaptations based on this approach, thereby altering the operation of two specific components: the Pedagogical Module and the Student Modeling Component. In addition, it is proposed a new structure Model Student, considering learner performance history in the evaluation processes. Therefore, it carried out tests to assess the impacts of such changes through a statistical comparison by T-Paired method. From the results, the ideas in this work provides an average improvement of 6.07% in the performance evaluation of the student and an average reduction of 68.27% in the learning problems, demonstrating proposal of efficiency and effectiveness.

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