Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Estatística, 2016. / Submitted by Nayara Silva (nayarasilva@bce.unb.br) on 2016-06-24T14:50:41Z No. of bitstreams: 1 2016_ThuanydeAguiarSantos.pdf: 928072 bytes, checksum: 2cab3bf37f2544536607e2306efff0f0 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-07-07T21:55:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_ThuanydeAguiarSantos.pdf: 928072 bytes, checksum: 2cab3bf37f2544536607e2306efff0f0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-07T21:55:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_ThuanydeAguiarSantos.pdf: 928072 bytes, checksum: 2cab3bf37f2544536607e2306efff0f0 (MD5) / Em um problema de amostragem sem reposição com probabilidades desiguais de seleção, Horvitz e Thompson (1952) propuseram um estimador não viesado capaz de estimar o total, a média de uma variável de interesse ou o tamanho populacional. Além dos estimadores pontuais, pode-se estimar intervalos de possíveis estimativas do parâmetro estudado por meio de estimadores intervalares. Portanto, este trabalho visa apresentar uma revisão da metodologia utilizada para calcular os Intervalos de Confiança (IC) baseados no estimador de Horvitz-Thompson. Verificou-se que o intervalo de confiança clássico, baseado na distribuição normal, é o mais utilizado na literatura. Este IC necessita da variância populacional para ser calculado, por isso, utilizou-se também o IC baseado na distribuição t-student, devido a variância ser estimada e comparou-se o desempenho de diferentes estimadores da variância apresentados na literatura com relação ao tamanho amostral. Verificou-se que nem sempre os IC baseados na distribuição normal atingiram a cobertura nominal e que os estimadores da variância, que independem da probabilidade de seleção conjunta, tiveram desempenho parecido ao estimador proposto por Yates e Grundy (1953) e Sem (1953), em populações pequenas. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In a problem of sampling without replacement with unequal probability of selection, Horvitz e Thompson (1952) have given an estimator without bias capable of estimates the total, the mean of a variable or the population size. Besides the point estimators, it is possible to estimate the ranges of possibles estimates of the parameter analyzed, by the intervals estimators. Therefore, this research has the main purpose to show an overview about the methodologies used to compute the con dence interval based on the Horviz-Thompson estimator. It was found that the classic con dence interval, based on the normal distribution, it is the most used in the literature. This interval needs that the population variance must be calculated, that is why, it was also used the con dence interval based on the t-student distribution, because the variance is estimated and then it was compared the performance of the di erent estimators of variance showed in the literature with relation to the sample size. It was concluded that not always the con dence interval based on the normal distribution reached the nominal cover and that the estimators of variance that are independent of the joint probability of selection had similar performance to the estimator given by Yates e Grundy (1953) and Sen (1953) in small populations.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9494_1.pdf: 666309 bytes, checksum: 4faa8c71261be077a2ec6d10fce3028a (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A presente dissertação aborda estimação pontual e estimação intervalar dos parâmetros que indexam a distribuição Lomax. No que tange à estimação pontual, consideramos esquemas analíticos e numéricos (bootstrap) de correção de viés, que são comparados através de simulação de Monte Carlo. Também analisamos via simulação diferentes estratégias (inclusive algumas baseadas em reamostragem de bootstrap) de estimação intervalar

Submitted by Etelvina Domingos (etelvina.domingos@ufpe.br) on 2015-03-05T17:13:08Z No. of bitstreams: 2 DLFA.pdf: 666309 bytes, checksum: 4faa8c71261be077a2ec6d10fce3028a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-05T17:13:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DLFA.pdf: 666309 bytes, checksum: 4faa8c71261be077a2ec6d10fce3028a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / CAPES / A presente dissertação aborda estimação pontual e estimação intervalar dos parâmetros que indexam a distribuição Lomax. No que tange à estimação pontual, consideramos esquemas analíticos e numéricos (bootstrap) de correção de viés, que são comparados através de simulação de Monte Carlo. Também analisamos via simulação diferentes estratégias (inclusive algumas baseadas em reamostragem de bootstrap) de estimação intervalar.

Submitted by CHERLYNN DANIELA DA SILVA ARCE null (cdprado@outlook.com) on 2018-04-03T20:24:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Cherlynn_Daniela_da_Silva_Arce.pdf: 1179630 bytes, checksum: c8a13228e501d97cb1dd118aca364265 (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandra Maria Donadon Lusser Segali null (alexmar@fcav.unesp.br) on 2018-04-04T13:21:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 arce_cds_me_jabo.pdf: 1179630 bytes, checksum: c8a13228e501d97cb1dd118aca364265 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-04T13:21:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arce_cds_me_jabo.pdf: 1179630 bytes, checksum: c8a13228e501d97cb1dd118aca364265 (MD5) Previous issue date: 2018-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Com o avanço dos estudos em genética e da tecnologia aplicada à genotipagem de marcadores moleculares, a identificação de polimorfismos associados às características de interesse econômico se tornou mais acessível, possibilitando a sua utilização aumentar a acurácia de modelos de predição do mérito genético dos animais. Esse avanço também possibilitou aumentar a acurácia dos estudos para identificação de QTLs para características de interesse econômico. Entretanto, os marcadores comumente utilizados para tal fim são os SNPs, que por serem bi-alélicos podem não ser muito eficientes na identificação dos QTLs. Os haplótipos, multi-alélicos, apresentam maior possibilidade de estarem em desequilíbrios de ligação (DL) com os QTLs. Dessa forma, objetivou-se no presente trabalho identificar o melhor método de construção de haplótipos para utilização em estudos de detecção de QTLs, a partir da comparação dos três métodos mais comumente utilizados para este fim. Foram utilizadas três populações simuladas representando características com três diferentes valores de herdabilidade, para as quais foram armazenados os dados fenotípicos, genotípicos e de pedigree dos 6.000 animais da população mais recente: Pop1 com herdabilidade baixa (0,10); Pop2 com herdabilidade moderada (0,25); e, Pop3 com herdabilidade alta (0,35). Os genomas simulados consistiram de 750.000 marcadores do tipo SNP, e 750 QTLs, com dois a quatro alelos, dispostos aleatoriamente em 29 cromossomos com tamanho total de 2.333 centimorgans (cM). A partir da simulação foram eliminados os SNPs cuja frequência do menor alelo foi menor que 0,1, restando 576.027, 577.189 e 576.675 marcadores para as populações Pop1, Pop2 e Pop3, respectivamente. A variação fenotípica foi de 1,0 e a variação dos QTLs foi de 50% das herdabilidades, para cada população. As médias dos DL para cada cromossomo, medidas pela estatística D', variaram de 0,20 até 0,30 para todas as populações, na última geração. Foram construídos haplótipos utilizando três métodos: Intervalo de Confiança (IC), Regra de Quatro Gametas (RQG) e Janelas Sobrepostas (JS). Para Pop1, no cromossomo 15, os métodos IC, RQG e JS identificaram cinco, oito e sete QTLs, respectivamente. Somente um QTL foi identificado nos cromossomos 19 e 29. Para a característica de herdabilidade alta, foi identificado um QTL no cromossomo 11. Em relação às análises de associação utilizando SNPs individuais, foram identificados quatro QTLs no cromossomo 15. Para a característica de herdabilidade moderada, não foram encontrados haplótipos ou SNPs isolados significativos. A metodologia de formação de haplótipos baseado na RQG foi considerada a mais eficiente para detecção de QTLs em relação aos métodos IC e JS, bem como ao uso dos SNPs isolados. / With the advancement of genetic studies and the technology applied to the genotyping of molecular markers, the identification of polymorphisms associated with the characteristics of economic interest became more accessible, allowing its use to increase the accuracy of prediction models of the genetic merit of the animals. This advance also made it possible to increase the accuracy of studies to identify QTLs for characteristics of economic interest. However, the commonly used markers for this purpose are SNPs, which because they are bi-allelic may not be very efficient in identifying QTLs. The haplotypes, multi-allelic, are more likely to be in linkage disequilibrium (LD) with QTLs. Thus, the objective of this work was to identify the best haplotype construction method for use in QTLs detection studies, by comparing the three methods most commonly used for this purpose. Three simulated populations representing characteristics with three different heritability values were used for which the phenotypic, genotypic and pedigree data of the 6,000 animals were stored: Pop1 with low heritability (0.10); Pop2 with moderate heritability (0.25); and, Pop3 with high heritability (0.35). The simulated genomes consisted of 750,000 SNP-type markers, and 750 QTLs, with two to four alleles, arranged randomly on 29 chromosomes with a total size of 2,333 centimorgans (cM). From the simulation the SNPs whose frequency of the lowest allele was less than 0.1 were eliminated, leaving 576,027, 577,189 and 576,675 markers for Pop1, Pop2 and Pop3 populations, respectively. The phenotypic variation was 1.0 and the variation of QTLs was 50% of the heritabilities, for each population. The mean LD for each chromosome, measured by the D' statistic, ranged from 0.20 to 0.30 for all populations in the last generation. Haplotypes were constructed using three methods: Confidence Interval (CI), Four Gametes Rule (FGR) and Sliding-Window (SW). For Pop1, on chromosome 15, CI, FGR and SW methods identified five, eight and seven QTLs, respectively. Only one QTL was identified on chromosomes 19 and 29. For the high heritability characteristic, a QTL was identified on chromosome 11. Regarding the association analyzes using individual SNPs, four QTLs were identified on chromosome 15. For the moderate heritability characteristic, no significant isolated haplotypes or SNPs were found. The methodology of haplotype formation based on the FGR was considered the most efficient for the detection of QTLs in relation to CI and SW methods, as well as to the use of isolated SNPs.