• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 24
  • 1
  • Tagged with
  • 25
  • 25
  • 13
  • 12
  • 5
  • 5
  • 4
  • 4
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
11

Isolation of enterococos and fecais coliformes of oysters (Crassostrea rhizophorae) sold in the beach of the Futuro, Fortaleza, CearÃ. / Isolamento de enterococos e coliformes fecais de ostras (Crassostrea rhizophorae) comercializadas na praia do futuro, Fortaleza, CearÃ.

Ana MÃrcia de Faria Morelli 17 February 2003 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / The Most Probable Numbers (NMPs) of enterococci and thermotolerant coliforms were estimated in 60 oyster samples (crassostrea rhizophorea) sold at two beach restaurantes, A and B, at Praia do Futuro, Fortaleza City, Cearà state, during the period between september 2000 and september 2001. Each sample included 25 individuals, therefore reaching a total of approximately 1,500 tested oyster. The enterococci NMPs in the samples collected at A ranged between <3,0/g and >1,100/g, while those sampled at B were between 3,0/g and >1,100/g. For the thermotolerant coliforms the obtained values were between <3,0/g and 9,300/g for A, and between <3,0/g and >110,000/g for B. Of all the tested samples, 40% of the oyster sampled at A and 43% of those sampled at B showed thermotolerant coliforms NMPs values over the limits established by the National Health Safety Agency ( AgÃncia Nacional de VigilÃncia SanitÃria) for human consumption of raw food (BRASIL, 2001). There was no statistical correlation between the enterococci and thermotolerant coliforms NMPs (p<0.05). 90 strains of E. faecalis (71%), 8 of E. hirae (6%), 2 of E. mundtii (2%) and 1 of E. durans (1%) were isolated at A, while at B 76 strains of E. faecalis (63%), 5 of E. hirae (4%), 2 of E. mundtii (2%) were found. Regarding the thermotolerant coliform group, 56 strains of E. coli (82%), 12 of Enterobacter (17%) and 1 of Citrobacter (1%) were confirmed at A, while 40 strains of E. coli (63%), 19 of Enterobacter (30%), 3 of Citrobacter (5%) and 1 of Klebsiella (2%) were found at B. All the E. coli strains isolated at A were sensitive to the following antimicrobial agents: CIP, CN, CRO, FOX, IMP, NA and SXT. 70% of these strains showed resistence to ampiciline. At B, the higher sensitivies (100%) were observed for the following antimicrobial agents: CIP, CN, CRO, FOX, IMP, NA and NIT. The ampiciline-resistence values were similar to those at A. None of the Enterococcus species showed to be capable to produce growth inhibiting substances (bacteriocins) aganist E. coli. / Foram estimados o NÃmero Mais ProvÃvel (NMP) de enterococos e de coliformes termotolerantes de 60 amostras de ostras (Crassostrea rhizophorae) comercializadas em duas barracas: A e B, na Praia do Futuro em Fortaleza â CE, no perÃodo de setembro de 2000 a setembro de 2001. Cada amostra constava de 25 indivÃduos, totalizando assim a anÃlise de aproximadamente 1.500 ostras. Os NMPs de enterococos para as amostras coletadas na Barraca A variaram de <3,0 a >1100/g , enquanto os estimados nas amostras da Barraca B ficaram entre 3,0 e >1100/g. Para coliformes termotolerantes os valores encontrados nas amostras de ostra foram de <3,0 a 9300,0/g e <3,0 a >110000/g para as Barracas A e B, respectivamente. Do total de amostras analisadas, 40% na Barraca A e 43% na Barraca B mostraram valores de coliformes termotolerantes acima dos padrÃes estabelecidos pela AgÃncia Nacional de VigilÃncia SanitÃria (ANVISA) para espÃcies destinadas a alimentaÃÃo humana e que serÃo ingeridas cruas (BRASIL, 2001). NÃo houve correlaÃÃo estatÃstica entre os NMPs de enterococos e de coliformes termotolerantes ( p< 0,05). Na Barraca A foram confirmadas 90 (71%)cepas de E. faecalis; 8 (6%) de E. hirae; 2(2%) de E. mundtii e 1( 1%) de E. durans, enquanto na B foram confirmadas: 76(63%) cepas de E. faecalis; 5 (4%) de E. hirae e 2(2%) de E. mundtii. Com relaÃÃo aos coliformes termotolerantes, foram confirmadas na Barraca A: 56 (82%)cepas de E. coli; 12 (17%) de Enterobacter e 1 (1%) de Citrobacter e na Barraca B, foram confirmadas 40 (63%) de E. coli; 19 (30%) de Enterobacter; 3 (5%) de Citrobacter e 1 (2%) de Klebsiella. Todas as cepas de E. coli da Barraca A foram sensÃveis ao antimicrobianos: CIP,CN, CRO, FOX, IMP, NA e SXT enquanto, que 70% apresentaram resistÃncia a ampicilina. Na Barraca B, As maiores sensibilidades (100%) foram detectadas aos antimicrobianos CRO, CIP, CN, FOX, F, IMP, NA. e NIT. Com relaÃÃo à resistÃncia a ampicilina, o resultado foi similar ao da Barraca A. Frente a Escherichia coli, nenhuma das cepas, das diferentes espÃcies de Enterococcus, testadas, mostrou capacidade de produzir substÃncias inibidoras (bacteriocinas) de crescimento.
12

Metabólitos secundários bioativos de invertebrados marinhos: isolamento, determinação estrutural e atividades biológicas / Bioactive secondary metabolites from marine invertebrates: isolation, structure determination and biological activities

Kossuga, Miriam Harumi 21 October 2008 (has links)
Ao longo dos últimos 20 anos os organismos marinhos se tornaram uma das fontes mais interessantes para o isolamento de produtos naturais biologicamente ativos. Apesar disso, os organismos marinhos da costa brasileira foram muito pouco explorados como fonte de metabólitos secundários. A presente investigação se insere no âmbito de dois projetos temáticos, o primeiro desenvolvido entre 2002 e 2006 e o segundo em andamento, que têm por objetivo melhor conhecer as potencialidades de organismos marinhos da costa brasileira como fonte de metabólitos secundários biologicamente ativos. Assim, foram investigados extratos bioativos de cinco espécies de invertebrados marinhos: três ascídias, uma esponja e um octocoral, todos oriundos da costa brasileira. O fracionamento dos extratos destes animais resultou no isolamento de 15 compostos, dos quais sete inéditos na literatura. A partir do extrato bruto da ascídia Clavelina oblonga foram isolados dois compostos: a 5-[3,5-dibromo-4([2-oxo-5-oxazonidinil)]metoxifenil]2-oxazolidinona e o (2S,3R)- 2-amino-3-dodecanol. Este último apresentou uma potente atividade antifúngica contra Candida albicans. Do extrato da ascídia Didemnum ligulum foram obtidos dois compostos: a asterubina e a N,N-dimetil-O-metiletanolamina. A investigação química do extrato da ascídia Didemnum sp. resultou no isolamento de quatro dicetopiperazinas modificadas denominadas rodriguesinas A e B, e N-acetil-rodriguesinas A e B. As rodriguesinas A e B foram obtidas na forma de mistura inseparável, e puderam ser identificadas por análises espectroscópicas detalhadas, inclusive por experimentos MS/MS. A mistura contendo as rodriguesinas A e B apresentou moderada atividade antibiótica contra um isolado clínico de Streptococcus mutans, contra S. mutans UA159 e Staphylococcus aureus ATCC6538. A partir do extrato bruto da esponja Plakortis angulospiculatus foram obtidos seis policetídeos: a plakortenona, a plakortina, o plakortídeo P, o 3,6 epoxi, 4,6,8 trietil-2,4,9-dodecatrienoato de metila, a espongosoritina A e o 3,6 epoxi, 4,6,8 trietil-2,4,-dodecadienoato de metila. Os compostos puros obtidos da esponja P.angulospiculatus foram avaliados em testes de atividade antiparasitária contra Leishmania chagasi e Trypanosoma cruzi, antineuroinflamatória e citotóxica frente a quatro diferentes linhagens de células tumorais. O composto plakortídeo P apresentou potente atividade leishmanicida altamente seletiva. Finalmente, a investigação do extrato bruto do octocoral Carijoa riisei resultou no isolamento de um único constituinte, o esteróide 18-acetoxipregna-1,4,20-trien-3-ona, na qual apresentou atividades tripanomicida e leishmanicida. / Throughout the last 20 years, marine organisms have become one of the most interesting sources for the isolation of biological active natural products. However, marine organisms from the Brazilian coastline have been largely underexplored as source of secondary metabolites. The present investigation was developed in the scope of two thematic projects, the first one during 2002 and 2006 the second one, still in progress, aims the discovery of the potentialities of marine organisms of the Brazilian coast as a source of biologically active secondary metabolites. Bioactive extracts of five species of marine invertebrates have been investigated: three ascidians, one sponge and one octocoral. The fractionation of these extracts led to the isolation of 15 compounds, of which seven are unprecedented in the literature. From the crude extract of the ascidian Clavelina oblonga two compounds have been isolated: [3,5-dibromo-4-[(2-oxo-5-oxazolidinyl)]methoxyphenyl]-2- oxazolidinone and (2S,3R)-2-aminododecan-3-ol. The last one displayed potent antifungal activity against Candida albicans. Two compounds have been obtained from the crude extract of the ascidian Didemnum ligulum: asterubine and N,N-dimethyl-O-methylethanolamine. The chemical investigation of the extract of the ascidian Didemnum sp. resulted in the isolation of four modified diketopiperazines: rodriguesines A and B, was well as N-acetil-rodriguesines A and B. Rodriguesines A and B have been obtained as an unseparable mixture, and have been identified by detailed analysis of spectroscopic data including MS/MS experiments. The mixture of the rodriguesines A and B displayed moderate antibiotic activity against a clinical isolate of Streptococcus mutans, against S. aureus mutans UA159 and Staphylococcus aureus ATCC6538. The crude extract of the sponge Plakortis angulospiculatus have been investigated and six polyketides have been isolated: plakortenone, plakortin, plakortide P, methyl 3,6-epoxy-4,6,8-triethyl-2,4,9-dodecatrienoate, spongosoritin A and methyl 3,6-epoxy-4,6,8-triethyldodeca-2,4-dienoate. The polyketides isolated from the sponge P.angulospiculatus have been evaluated in tests of antiparasitic activity against Leishmania chagasi and Trypanosoma cruzi, antineuroinflammatory and cytotoxic against four different human cancer cell lines. Plakortide P exhibited potent and highly selective leishmanicidal activity. Finally, the chemical investigation of the crude extract from the octocoral Carijoa riisei resulted in the isolation of a single constituent, the known steroid 18- acetoxypregna-1,4,20-trien-3-one, which displayed cytotoxic, antitrypanosomal and antileishmanial activity.
13

Relações interespecíficas: diversidade, métodos de ancoragem e hábitos alimentares associados aos tubos de espécies de Ceriantharia (Cnidaria; Anthozoa) / Interspecific relationships: diversity, anchoring methods and feeding habits associated to the tubes of Ceriantharia species (Cnidaria; Anthozoa) / Relaciones interespecíficas: diversidad, métodos de anclaje y hábitos alimentarios asociados a los tubos de especies de Ceriantharia (Cnidaria; Anthozoa)

Ceriello, Hellen 04 June 2018 (has links)
Submitted by Hellen Ceriello (hellenceriello@hotmail.com) on 2018-06-15T23:29:21Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Finalizada - BANCA.pdf: 2330776 bytes, checksum: 3d3e8e2b5b094d5da14941dc13e82cdd (MD5) / Rejected by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: INCLUIR FOLHA DE APROVAÇÕES - obrigatória no exemplar definitivo – folha providenciada pela Pós-graduação Agradecemos a compreensão. on 2018-06-16T00:27:35Z (GMT) / Submitted by Hellen Ceriello (hellenceriello@hotmail.com) on 2018-06-16T19:43:49Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Finalizada - BANCA.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-06-18T21:37:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ceriello_h_me_assis_int.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-18T21:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ceriello_h_me_assis_int.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) Previous issue date: 2018-06-04 / Item withdrawn by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-09-17T19:55:43Z Item was in collections: Dissertações - Biociências - FCLAS (ID: 286) No. of bitstreams: 8 ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf: 1095261 bytes, checksum: 5788ec61fbfc675195f50b22772b393a (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.jpg: 3766 bytes, checksum: 25c8ef4a719513631285960e4bf4aff2 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.txt: 27631 bytes, checksum: 25e016d08098e925710727934c893eab (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) / Item reinstated by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-09-17T19:56:40Z Item was in collections: Dissertações - Biociências - FCLAS (ID: 286) No. of bitstreams: 8 ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf: 1095261 bytes, checksum: 5788ec61fbfc675195f50b22772b393a (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.jpg: 3766 bytes, checksum: 25c8ef4a719513631285960e4bf4aff2 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.txt: 27631 bytes, checksum: 25e016d08098e925710727934c893eab (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O filo Cnidaria é caracterizado por animais em cujos tecidos encontram-se células tóxicas denominadas cnidócitos. Devido à liberação de substâncias tóxicas, os cnidários apresentam poucas associações com outras espécies, entretanto as associações mais conhecidas são frequentemente descritas como obrigatórias ou comensais facultativas. Um dos grupos deste filo, Ceriantharia, é representando por membros genericamente conhecidos por ceriantários ou anêmonas-de-tubo cuja característica mais marcante é a presença de uma secreção celular única (pticocisto) que auxilia na construção de um tubo, sintetizado pelo próprio animal, que fica inserido no substrato e abriga o animal. Embora existam estudos quanto ao histórico, taxonomia e posição sistemática, análises moleculares e morfológicas e ciclo de vida, estudos a respeito de associações interespecíficas ocorrendo em tubos de ceriantários são escassos. Logo, pouco se conhece sobre essas associações bem como os métodos que as espécies utilizam para se ancorarem aos tubos desses animais. Sendo assim, esse estudo elencou espécies que ocorrem em tubos de Ceriantharia, abordando principalmente os métodos de ancoragem e hábitos alimentares envolvidos nas relações observadas. Os tubos de 8 espécies de ceriantários foram analisados, fornecendo dados quanto a associações de Annelida, Crustacea e Mollusca aos tubos. / The phylum Cnidaria is characterized by animals that carry stinging cells named cnidocytes in their tissues. Due to the release of toxic substances, cnidarians have few associations with other species, however mostly known associations are often described as mandatory or optional commensalism. One of the groups in this phylum, Ceriantharia, is represented by members generally known as ceriantharians or tube-dwelling anemones whose most remarkable feature is the presence of a peculiar cell secretion (ptychocyst) that supports the construction of a tube, synthetized by the animal itself, and inserted into the substrate, lodging the animal. Although there are some studies concerning the history, taxonomy and systematic position, molecular and morphological analyzes and life-cycle, studies regarding interspecific associations occurring with ceriantharian tubes are scarce. Thus, little is known about these associations as well as the methods that the species use in order to anchor on these tubes. Thereby, this study listed species occurring in ceriantharian tubes mainly discussing the anchoring methods and feeding habits involved in the associations observed. The tubes of 8 Ceriantharia species were analyzed, yielding data about interactions with Annelida, Crustacea and Mollusca to the tubes. / 2016/00689-7 / 2017/07870-1
14

Filogeografia comparada e história evolutiva da Planície Costeira Sul e Sudeste do Brasil

Silva, Fernanda Britto da January 2008 (has links)
O ambiente costeiro e marinho se caracteriza pela falta de barreiras físicas aparentes, além de ser rico em espécies que possuem fase de desenvolvimento larval livre natante. Devido a esta fase de desenvolvimento larval, as espécies marinhas geralmente apresentam alta capacidade dispersiva, proporcionando alto fluxo gênico e conseqüentemente baixa estruturação populacional. Por outro lado, algumas espécies têm apresentado padrões filogeográficos que não são compatíveis com este cenário clássico. Assim, fatores como tempo de duração da fase larval, predação da larva e o hidrodinamismo podem interferir de maneira significativa na dispersão das espécies. Além disso, fatores ambientais históricos, tais como as grandes mudanças climáticas do Pleistoceno também influenciaram os padrões de diversidade genética das espécies. Neste sentido, estudos comparativos são importantes ferramentas para o entendimento dos diferentes processos que deram origem à atual diversidade. Porém, poucos estudos filogeográficos comparativos foram realizados em espécies marinhas costeiras, em especial nenhum para a costa atlântica da América do Sul. Neste estudo comparamos os padrões de diversidade genética de quatro espécies abundantes de invertebrados que ocorrem ao longo da costa sul-sudeste do Brasil, Uruguai e Argentina, com o objetivo de entender a história evolutiva destas espécies e o que elas podem contar sobre esta região geográfica. Sequenciamos parte do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I do moçambique Donax hanleyanus (n= 247), do marisco branco Mesodesma mactroides (n= 59), da tatuíra Emerita brasiliensis (n= 191) e do caranguejo maria-farinha Ocypode quadrata (n= 135). Análises filogeográficas e populacionais foram utilizadas a fim de elucidar e comparar os padrões evolutivos para estas espécies de invertebrados costeiros. Nossos dados revelaram um padrão de variabilidade genética muito baixa para todas as espécies, apesar de apresentarem ampla distribuição geográfica e populações censitárias gigantescas, demonstrando a grande influência das flutuações populacionais históricas na formação da variabilidade genética atual. Apenas E. brasiliensis apresentou uma maior variabilidade ao norte da sua distribuição o que é compatível com expansão populacional recente a partir de algum refúgio de baixa latitude, neste caso, ao norte. Além disto, foi a única espécie a apresentar indicação de isolamento por distância. As histórias demográficas destas espécies, apesar de apresentarem algumas diferenças, parecem estar intimamente ligadas às flutuações de temperatura durante o último grande ciclo glacial, pois três delas apresentaram ancestral comum mais recente (time to most recent commom ancestor – TMRCA) dentro dos 100 mil últimos anos, com exceção de O. quadrata, que apresentou TMRCA há cerca de 500 mil anos. Para todas as espécies constatamos a ocorrência de um longo período de estabilidade demográfica (população reduzida) com expansão populacional mais recente, com exceção de M. mactroides, que apresentou TMRCA e expansão populacional praticamente simultâneos. Emerita brasiliensis foi a espécie com a história demográfica mais recente, apresentando expansão populacional após o último máximo glacial (21 mil anos atrás), e coalescência há cerca de 60 mil anos. As demais espécies apresentaram expansão populacional entre 70 e 100 mil anos, entretanto não podemos descartar a hipótese de expansão simultânea para estas três espécies, já que os intervalos de confiança destas análises se sobrepõem, o que sugere a forte influência de um fator ambiental comum. Ocypode quadrata, além de ter apresentado a história demográfica mais antiga, apresentou a maior diversidade genética, sendo também a espécie com a maior distribuição geográfica, sendo pancontinental, o que sugere ser a espécie mais resistente às mudanças ambientais. As espécies D. hanleyanus e O. quadrata, apresentaram baixa estruturação filogeográfica, o que sugere não haver barreiras biogeográficas efetivas para elas, e corrobora a hipótese de que larvas livres natantes são fator importante para o fluxo gênico elevado. Por outro lado sugerem uma estruturação populacional para M. mactroides (com uma possível barreira biogeográfica no sul de SP) e E. brasiliensis (barreira em Copacabana, RJ). De maneira geral estes dados reforçam a idéia de que só a capacidade dispersiva larval não é suficiente para predizer fluxo gênico e estruturação populacional em populações marinhas costeiras, mas sim uma combinação de fatores ecológicos intrínsecos de cada espécie, assim como os fatores geológicos históricos, como os ocorridos no Pleistoceno. / Coastal and marine environments are usually characterized by lack of evident physical barriers and having many species that show a free-swimming larval stage. Due to this larval stage, marine species commonly show high dispersion rates resulting in high gene flow and low geographical structure. Some species however present phylogeographical patterns that differ from this standard scenario. Factors such as duration of the larval phase, its predation level, and the hydrodinamism of the dispersion can significantly impact species dispersion. Moreover, historical environmental factors, such as the great climatic changes in the Pleistocene are also important elements to shape pattern of genetic diversity of the species. In this sense, comparative analyses are important tools for understanding the different processes that gave rise to the current diversity. Unfortunately, few comparative phylogeographical studies were carried out in sea coastal species, in special none for the Atlantic coast of the South America. In this study we compare the patterns of genetic diversity of four abundant invertebrate species that occur along the beaches of the Brazilian south and southeastern coast, Uruguay and Argentina, to better understand their evolutionary histories as well as what they could tell about the history of this geographical region. For this aim we partially sequenced the mitochondrial Cytochrome Oxidase I gene of the moçambique Donax hanleyanus (n=247), yellow clam Mesodesma mactroides (n=59), mole crab Emerita brasiliensis (n=191) and of the ghost crab Ocypode quadrata (n = 135) and analyzed them using several phylogeographical and populational genetic methods. Our results revealed a pattern of very low genetic diversity for all four species, in spite of their large geographical distribution and the huge population size, evidencing the great influence of the population historical fluctuations in the current genetic variability. Only E. brasiliensis showed a relatively higher variability to the north of its distribution what is compatible with a recent populational expansion from a refugium in low latitudes. Besides it was the only species that presented evidence for isolation by distance. The demographic histories of these species, in spite of presenting some differences, seems to be closely connected with the climatic fluctuations during the last glacial cycle, since three of them presented TMRCAs in the last 100 kyr ago, with the exception of O. quadrata, which presented TMRCA about 500 kyr ago. All species presented a long period of demographic stability with relatively reduced population followed by a more recent population expansion. The exception to this picture is M. mactroides, which presented TMRCA and population expansion nearly simultaneous. Emerita brasiliensis depicted the most recent demographic history, presenting a strong population expansion after the last glacial maximum (21 kyr ago), with TMRCA around 60 kyr ago. The other species presented population expansions between around 70 and 100 kyr ago, however we can not to reject the hypothesis of a simultaneous expansion for these three species, since to the confidence intervals of these analyses overlapped, which would indicate a strong influence of a common environmental feature. Ocypode quadrata presented the most ancient demographic history, the highest genetic diversity, and the largest geographical distribution (it is a pancontinental species). This may indicate that it could the most tolerant to the environmental changes. D. hanleyanus and O. quadrata presented low phylogeographical structure, which can mean the existence of no effective biogeographical barriers to these species, corroborating the hypothesis that a free-swimming larval stage is an important factor for an elevated gene flow. On the other hand, our results suggest a reasonable population structure for M. mactroides (with a possible biogeographical barrier in the south of São Paulo) and E. brasiliensis (barrier around Copacabana, Rio de Janeiro), In conclusion, our results support the proposal that the existence of a freeswimming larval stage is not sufficient to predict high gene flow and population structure in sea coastal species, being this pattern likely a combination of intrinsic ecological factors of each species, as well as biogeographical historical factors.
15

Filogeografia comparada e história evolutiva da Planície Costeira Sul e Sudeste do Brasil

Silva, Fernanda Britto da January 2008 (has links)
O ambiente costeiro e marinho se caracteriza pela falta de barreiras físicas aparentes, além de ser rico em espécies que possuem fase de desenvolvimento larval livre natante. Devido a esta fase de desenvolvimento larval, as espécies marinhas geralmente apresentam alta capacidade dispersiva, proporcionando alto fluxo gênico e conseqüentemente baixa estruturação populacional. Por outro lado, algumas espécies têm apresentado padrões filogeográficos que não são compatíveis com este cenário clássico. Assim, fatores como tempo de duração da fase larval, predação da larva e o hidrodinamismo podem interferir de maneira significativa na dispersão das espécies. Além disso, fatores ambientais históricos, tais como as grandes mudanças climáticas do Pleistoceno também influenciaram os padrões de diversidade genética das espécies. Neste sentido, estudos comparativos são importantes ferramentas para o entendimento dos diferentes processos que deram origem à atual diversidade. Porém, poucos estudos filogeográficos comparativos foram realizados em espécies marinhas costeiras, em especial nenhum para a costa atlântica da América do Sul. Neste estudo comparamos os padrões de diversidade genética de quatro espécies abundantes de invertebrados que ocorrem ao longo da costa sul-sudeste do Brasil, Uruguai e Argentina, com o objetivo de entender a história evolutiva destas espécies e o que elas podem contar sobre esta região geográfica. Sequenciamos parte do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I do moçambique Donax hanleyanus (n= 247), do marisco branco Mesodesma mactroides (n= 59), da tatuíra Emerita brasiliensis (n= 191) e do caranguejo maria-farinha Ocypode quadrata (n= 135). Análises filogeográficas e populacionais foram utilizadas a fim de elucidar e comparar os padrões evolutivos para estas espécies de invertebrados costeiros. Nossos dados revelaram um padrão de variabilidade genética muito baixa para todas as espécies, apesar de apresentarem ampla distribuição geográfica e populações censitárias gigantescas, demonstrando a grande influência das flutuações populacionais históricas na formação da variabilidade genética atual. Apenas E. brasiliensis apresentou uma maior variabilidade ao norte da sua distribuição o que é compatível com expansão populacional recente a partir de algum refúgio de baixa latitude, neste caso, ao norte. Além disto, foi a única espécie a apresentar indicação de isolamento por distância. As histórias demográficas destas espécies, apesar de apresentarem algumas diferenças, parecem estar intimamente ligadas às flutuações de temperatura durante o último grande ciclo glacial, pois três delas apresentaram ancestral comum mais recente (time to most recent commom ancestor – TMRCA) dentro dos 100 mil últimos anos, com exceção de O. quadrata, que apresentou TMRCA há cerca de 500 mil anos. Para todas as espécies constatamos a ocorrência de um longo período de estabilidade demográfica (população reduzida) com expansão populacional mais recente, com exceção de M. mactroides, que apresentou TMRCA e expansão populacional praticamente simultâneos. Emerita brasiliensis foi a espécie com a história demográfica mais recente, apresentando expansão populacional após o último máximo glacial (21 mil anos atrás), e coalescência há cerca de 60 mil anos. As demais espécies apresentaram expansão populacional entre 70 e 100 mil anos, entretanto não podemos descartar a hipótese de expansão simultânea para estas três espécies, já que os intervalos de confiança destas análises se sobrepõem, o que sugere a forte influência de um fator ambiental comum. Ocypode quadrata, além de ter apresentado a história demográfica mais antiga, apresentou a maior diversidade genética, sendo também a espécie com a maior distribuição geográfica, sendo pancontinental, o que sugere ser a espécie mais resistente às mudanças ambientais. As espécies D. hanleyanus e O. quadrata, apresentaram baixa estruturação filogeográfica, o que sugere não haver barreiras biogeográficas efetivas para elas, e corrobora a hipótese de que larvas livres natantes são fator importante para o fluxo gênico elevado. Por outro lado sugerem uma estruturação populacional para M. mactroides (com uma possível barreira biogeográfica no sul de SP) e E. brasiliensis (barreira em Copacabana, RJ). De maneira geral estes dados reforçam a idéia de que só a capacidade dispersiva larval não é suficiente para predizer fluxo gênico e estruturação populacional em populações marinhas costeiras, mas sim uma combinação de fatores ecológicos intrínsecos de cada espécie, assim como os fatores geológicos históricos, como os ocorridos no Pleistoceno. / Coastal and marine environments are usually characterized by lack of evident physical barriers and having many species that show a free-swimming larval stage. Due to this larval stage, marine species commonly show high dispersion rates resulting in high gene flow and low geographical structure. Some species however present phylogeographical patterns that differ from this standard scenario. Factors such as duration of the larval phase, its predation level, and the hydrodinamism of the dispersion can significantly impact species dispersion. Moreover, historical environmental factors, such as the great climatic changes in the Pleistocene are also important elements to shape pattern of genetic diversity of the species. In this sense, comparative analyses are important tools for understanding the different processes that gave rise to the current diversity. Unfortunately, few comparative phylogeographical studies were carried out in sea coastal species, in special none for the Atlantic coast of the South America. In this study we compare the patterns of genetic diversity of four abundant invertebrate species that occur along the beaches of the Brazilian south and southeastern coast, Uruguay and Argentina, to better understand their evolutionary histories as well as what they could tell about the history of this geographical region. For this aim we partially sequenced the mitochondrial Cytochrome Oxidase I gene of the moçambique Donax hanleyanus (n=247), yellow clam Mesodesma mactroides (n=59), mole crab Emerita brasiliensis (n=191) and of the ghost crab Ocypode quadrata (n = 135) and analyzed them using several phylogeographical and populational genetic methods. Our results revealed a pattern of very low genetic diversity for all four species, in spite of their large geographical distribution and the huge population size, evidencing the great influence of the population historical fluctuations in the current genetic variability. Only E. brasiliensis showed a relatively higher variability to the north of its distribution what is compatible with a recent populational expansion from a refugium in low latitudes. Besides it was the only species that presented evidence for isolation by distance. The demographic histories of these species, in spite of presenting some differences, seems to be closely connected with the climatic fluctuations during the last glacial cycle, since three of them presented TMRCAs in the last 100 kyr ago, with the exception of O. quadrata, which presented TMRCA about 500 kyr ago. All species presented a long period of demographic stability with relatively reduced population followed by a more recent population expansion. The exception to this picture is M. mactroides, which presented TMRCA and population expansion nearly simultaneous. Emerita brasiliensis depicted the most recent demographic history, presenting a strong population expansion after the last glacial maximum (21 kyr ago), with TMRCA around 60 kyr ago. The other species presented population expansions between around 70 and 100 kyr ago, however we can not to reject the hypothesis of a simultaneous expansion for these three species, since to the confidence intervals of these analyses overlapped, which would indicate a strong influence of a common environmental feature. Ocypode quadrata presented the most ancient demographic history, the highest genetic diversity, and the largest geographical distribution (it is a pancontinental species). This may indicate that it could the most tolerant to the environmental changes. D. hanleyanus and O. quadrata presented low phylogeographical structure, which can mean the existence of no effective biogeographical barriers to these species, corroborating the hypothesis that a free-swimming larval stage is an important factor for an elevated gene flow. On the other hand, our results suggest a reasonable population structure for M. mactroides (with a possible biogeographical barrier in the south of São Paulo) and E. brasiliensis (barrier around Copacabana, Rio de Janeiro), In conclusion, our results support the proposal that the existence of a freeswimming larval stage is not sufficient to predict high gene flow and population structure in sea coastal species, being this pattern likely a combination of intrinsic ecological factors of each species, as well as biogeographical historical factors.
16

Fauna acompanhante: um universo químico a ser explorado / By-catch: a chemical universe to be explored

Tangerina, Marcelo Marucci Pereira [UNESP] 27 June 2016 (has links)
Submitted by MARCELO MARUCCI PEREIRA TANGERINA null (marcelomptang@hotmail.com) on 2016-07-09T22:03:34Z No. of bitstreams: 1 Tese ABNT Marcelo Tangerina Wagner Vilegas CD.pdf: 3984472 bytes, checksum: 993744f837a77327c951b1988896f63c (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-12T17:19:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 tangerina_mmp_dr_araiq.pdf: 3984472 bytes, checksum: 993744f837a77327c951b1988896f63c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T17:19:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tangerina_mmp_dr_araiq.pdf: 3984472 bytes, checksum: 993744f837a77327c951b1988896f63c (MD5) Previous issue date: 2016-06-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A fauna acompanhante da pesca do camarão inclui uma série de invertebrados marinhos que são descartados por não ter valor comercial. A fim de tentar acrescentar algum valor a este material, foi analisada a composição química da estrela-do-mar Luidia senegalensis coletada na costa brasileira como consequência da aplicação da pesca de arrasto. A fim de avaliar sua composição química, foi utilizada uma combinação de extração em fase sólida (SPE) seguida de cromatografia líquida de ultra eficiência acoplada a espectrômetro de massas equipado com fonte de ionização por eletrosptray e analisador ion-trap linear (UPLCESI- IT-MSn). Luidia senegalensis contém asterosaponinas, que são esteroides glicosilados sulfatados contendo cinco e seis unidades de açúcar, além de poliidroxiesteroides. Este estudo mostrou a presença de compostos importantes e potencialmente bioativos em invertebrados associados à fauna acompanhante da pesca do camarão, usando um método rápido e eficiente. Normalmente descartada, a fauna acompanhante contém muitos invertebrados que podem hospedar uma grande variedade de gêneros de bactérias, algumas das quais com potencial de produzir produtos naturais bioativos com aplicações biotecnológicas. Assim, para utilizar um material normalmente descartado, foi explorado o potencial biotecnológico de bactérias cultiváveis de duas espécies de invertebrados abundantes na fauna acompanhante, o gastrópode Olivancillaria urceus e a estrela-do-mar Luidia senegalensis. Uma amostra de sedimento da mesma área de coleta também foi investigado. Utilizando múltiplas abordagens de isolamento 134 isolados foram obtidos a partir dos invertebrados e do sedimento. Sequenciamento parcial da subunidade de rRNA (16S) revelou que os isolados pertenciam aos filos Proteobacteria, Firmicutes e Actinobacteria, distribuídos em 28 gêneros. Vários gêneros conhecidos pela sua capacidade de produzir produtos naturais bioativos (Micromonospora, Streptomyces, Serinicoccus e Verrucosispora) foram obtidos a partir das amostras estudadas. Para avaliar as bactérias isoladas quanto à sua capacidade para produzir metabólitos bioativos todas as cepas foram fermentadas e os extratos de fermentação analisados por LC-HRMS e testados em ensaio de atividade antimicrobiana. Quatro cepas apresentaram atividade antimicrobiana contra Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e Staphylococcus warneri. A produção de metabólitos secundários por bactérias isoladas da fauna acompanhante também foi avaliada por uma abordagem metabolômica utilizando LC-HRMS, onde foi avaliado como as diferenças na composição dos meios de cultura podem alterar a produção de substâncias. Utilizou-se a metabolômica como uma ferramenta para investigar a produção de abyssomicinas, um agente anticâncer, e outros metabólitos secundários em três cepas do actinomiceto raro Verrucosispora maris, isoladas a partir de uma amostra de sedimento e associadas à estrela-do-mar Luidia senegalensis de Ubatuba - SP, Brasil. Nove composições diferentes de meios de cultura foram avaliadas e verificou-se que, dentre todas as cepas, somente RKMT_111 foi capaz de produzir abyssomicinas. O estudo da composição do meio de cultura revelou que a produção de abyssomicinas só foi possível em BFM-11m. Embora as três cepas pertençam à mesma espécie e são provenientes da mesma localização, é notável que cada isolado apresentou diferente capacidade de produção de metabólitos secundários. Os produtos de fermentação de Erythrobacter vulgaris foram avaliados utilizando técnicas de HPLC preparativo, LC-HRMS e RMN. A cepa foi isolada pelo método dry-stamp de uma amostra de sedimento marinho da costa de Ubatuba-SP, Brasil. Depois de sequenciamento completo do rRNA (16S) e identificação, o isolado foi fermentado em larga escala, seu caldo de fermentação extraído por solvente e os compostos purificados por HPLCMS. Análise de LC-HRMS e RMN dos compostos isolados levou à identificação de dois novos derivados do ácido cólico, ácido 3-acetil-glicocólico e o ácido 3-acetilglicodesoxicólico. As substâncias obtidas podem ter sido produzidas por biotransformação do ácido glicocólico e ácido desoxicólico, respectivamente, já presentes no meio de cultivo. Este é o primeiro relato de tais compostos e também a primeira observação de uma acilação realizada por um isolado marinho de Erythrobacter vulgaris. / The by-catch fauna of the shrimp fishery includes a number of marine invertebrates that are discarded because they do not have commercial value. In order to try to add some value to these materials, we analyzed the chemical composition of the starfish Luidia senegalensis collected in the Brazilian coast as a consequence of the trawling fishery method. In order to access their chemical composition, we used a combination of solid phase extraction (SPE) followed by ultra performance liquid chromatography coupled to electrospray ionization ion trap tandem mass spectrometry (UPLC-ESI-IT-MSn). Luidia senegalensis contains asterosaponins, which are sulphated glycosilated steroids, containing five and six sugar moieties, in addition to polyhydroxysteroids. This study helped us to support the presence of important and potentially bioactive compounds in invertebrates associated to the by-catch fauna of the shrimp fishery, using a fast and efficient method. Typically discarded, by-catch contains many invertebrates that may host a great variety of bacterial genera, some of which may produce bioactive natural products with biotechnological applications. Therefore, to utilize by-catch that is usually discarded we explored the biotechnological potential of culturable bacteria of two abundant by-catch invertebrate species, the snail Olivancillaria urceus and the sea star Luidia senegalensis. Sediment from the collection area was also investigated. Utilizing multiple isolation approaches 134 isolates were obtained from the invertebrates and sediment. Small subunit rRNA (16S) gene sequencing revealed that the isolates belonged to Proteobacteria, Firmicutes and Actinobacteria phyla and were distributed among 28 genera. Several genera known for their capacity to produce bioactive natural products (Micromonospora, Streptomyces, Serinicoccus and Verrucosispora) were retrieved from the invertebrate samples. To query the bacterial isolates for their ability to produce bioactive metabolites all strains were fermented and fermentation extracts profiled by LC-HRMS and tested for antimicrobial activity. Four strains exhibited antimicrobial activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Staphylococcus warneri. The production of secondary metabolites was assessed using a LC-HRMS-based metabolomics approach, where it was evaluated how differences in media composition can alter the production of chemical compounds. We used metabolomics as a tool to investigate the production of abyssomicins, an anticancer agent, and other secondary metabolites in three strains of the rare actinomycete Verrucosispora maris, all marine isolates from a sediment sample and associated to a starfish from the species Luidia senegalensis of Ubatuba – SP, Brazil. Nine different media compositions were evaluated and it was found that, among all strains, only RKMT_111 was capable of producing abyssomicins. The media composition study revealed that the production of abyssomicins was only achievable in BFM-11m. Although the three strains belong to the same species and the same location, it is worthwhile noticing that each isolate showed different capability for production of secondary metabolites. The products of fermentation of Erythrobacter vulgaris were evaluated using preparative HPLC, LC-HRMS and NMR techniques. Bacterial strain was isolated by drystamp method from a marine sediment sample from the coast of Ubatuba-SP, Brazil. After fully 16S rDNA sequence and identification, the marine isolate was fermented in large-scale, extracted and the compounds purified through HPLC-MS. Analysis of LC-HRMS and NMR of the isolated compounds led to the identification of two new cholic acid derivatives, 3- acetyl-glycocholic acid and 3-acetyl-glycodeoxycholic acid. Both new compounds may have been produced by the biotransformation of glycocholic acid and deoxycholic acid, respectively, already present in the cultivation medium. This is the first report of such compounds and also the first time an acylation has been observed for an Erythrobacter vulgaris marine isolate. / FAPESP: 2011/23159-0
17

Influência da complexidade do habitat e da sazonalidade sobre a fauna associada a macroalgas de um manguezal hipersalino

Duarte, Rafaela Cristina de Souza 26 February 2014 (has links)
Submitted by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-03-21T19:32:20Z No. of bitstreams: 1 PDF - Rafaela Cristina de Souza Duarte.pdf: 17178678 bytes, checksum: bd68b4b71283d326a8bc5494f62f32d1 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-03-21T19:33:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Rafaela Cristina de Souza Duarte.pdf: 17178678 bytes, checksum: bd68b4b71283d326a8bc5494f62f32d1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T19:33:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Rafaela Cristina de Souza Duarte.pdf: 17178678 bytes, checksum: bd68b4b71283d326a8bc5494f62f32d1 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Mangroves have a mosaic of different habitats and microhabitats, each with their specific levels of complexity and occupied by different kinds of organisms. In this context, the present study aimed to assess the effect of habitat complexity and seasonality in the composition and structure of the invertebrate macrofauna associated with macroalgal species with different morphological characteristics. The research was conducted in the hypersaline mangrove of Tubarão River (5 o 04'34.87"S, 36 o 27'32.36"W), municipality of Macau, northern coast of the state of Rio Grande do Norte, Northeastern Brazil. Aiming to analyze the effect of habitat complexity on a local microhabitat scale and considering that the studied mangrove, due to their peculiar hipersalinity characteristics may harbor a rich fauna and flora, the following questions guide this research: a) Does the different macroalgae studied have different degree of habitat complexity? b) Macroalgae with different morphological characteristics supports invertebrate communities significantly different? c) Is there a relationship between habitat complexity and the composition, abundance and diversity of the invertebrate community of their phytal? and d) Is there difference between the pattern of abundance and composition of invertebrates found in macroalgal species between the dry and rainy seasons? A total of 1,750 individuals classified into five taxa were collected: Echinodermata, Amphipoda, Mollusca, Isopoda and Polychaeta, with 723 individuals found in the rainy season (associated with Gracilaria sp.) and 1,028 in the dry season (430 in Dictyota sp. and 598 in Solieria filiformes). Macroalgae of the dry period were morphologically distinct, however, the invertebrate fauna were not significantly different (p=0.1037), thus reinforcing that seasonality may have influenced the abundance and composition of macroinvertebrate taxa. The different macroalgae showed distinct morphological patterns and different degrees of habitat complexity, where more complex algae harbored a richer, abundant and diverse mollusc fauna. Specifically in the case of molluscs, species composition was typically marine, higher than other mangrove environments. Furthermore, the malacofauna was predominantly composed by micromolluscs, as adults whose sizes do not exceed 10 mm, and young individuals of species that reach a larger size. It is suggested that both habitat complexity as well as seasonality affect the richness, diversity and abundance of associated communities. In general, the marine macroalgae provides support for a variety of marine taxa, and may play an important role in increasing the structural underwater habitat complexity of mangrove systems. / Os manguezais apresentam um mosaico composto por diversos habitats e microhabitats, cada um deles com seus níveis de complexidade específicos e ocupados por diferentes tipos de organismos. Nesse contexto, o presente estudo tem por objetivo avaliar o efeito da complexidade do habitat e da sazonalidade na composição e estrutura da macrofauna associada a diferentes espécies de macroalgas com características morfológicas distintas. A pesquisa foi desenvolvida no manguezal hipersalino do Rio Tubarão (5º04 34,87 S; 36º27 32,36 O), município de Macau, litoral setentrional do estado do Rio Grande do Norte, Nordeste do Brasil. No intuito de analisar o efeito da complexidade do habitat em uma escala local de microhabitat e considerando que o manguezal estudado, devido à suas características peculiares de hipersalinidade podem abrigar uma rica fauna e flora, as seguintes perguntas nortearam esta pesquisa: a) As diferentes espécies de algas apresentam graus de complexidade de habitat distintos? b) Algas com características morfológicas diferenciadas suportam comunidades de invertebrados significativamente diferentes? c) Existe uma relação entre a complexidade do habitat oferecido pelas macroalgas e a composição, abundância, riqueza e diversidade de invertebrados participantes de seu fital? d) Existem diferenças entre o padrão de abundância e composição de invertebrados encontrados nas espécies de macroalgas entre os períodos seco e chuvoso? Foram coletados 1.750 indivíduos classificados em cinco taxa: Echinodermata, Amphipoda, Mollusca, Isopoda e Polychaeta, sendo 723 indivíduos encontrados no período chuvoso (associados à Gracilaria sp.) e 1.028 no período seco (430 em Dictyota sp. e 598 em S. filiformes). macroalgas apesar de serem morfologicamente distintas não apresentaram uma fauna de invertebrados significativamente diferente (p=0,1037), reforçando assim, que a sazonalidade pode ter influenciado a abundância e composição dos táxons de macroinvertebrados. As diferentes macroalgas apresentaram padrões morfológicos distintos e diferentes graus de complexidade de habitat, onde algas mais complexas abrigaram uma fauna de moluscos mais rica, abundante e diversa. Especificamente no caso dos moluscos, a composição de espécies foi tipicamente marinha, cuja riqueza pode ser considerada alta com relação a outros ambientes de manguezal. Além disso, a malacofauna foi composta predominantemente por micromoluscos, cujos tamanhos quando adultos não ultrapassam os 10 mm, e por indivíduos jovens de espécies que atingem um porte maior. Sugere-se que tanto a complexidade do habitat quanto a sazonalidade afetam a riqueza, diversidade e abundância das comunidades associadas. De um modo geral, as macroalgas marinhas oferecem suporte para uma diversidade de táxons marinhos, sendo habitats fundamentais para o aumento da complexidade estrutural subaquática do ecossistema manguezal.
18

Filogeografia comparada e história evolutiva da Planície Costeira Sul e Sudeste do Brasil

Silva, Fernanda Britto da January 2008 (has links)
O ambiente costeiro e marinho se caracteriza pela falta de barreiras físicas aparentes, além de ser rico em espécies que possuem fase de desenvolvimento larval livre natante. Devido a esta fase de desenvolvimento larval, as espécies marinhas geralmente apresentam alta capacidade dispersiva, proporcionando alto fluxo gênico e conseqüentemente baixa estruturação populacional. Por outro lado, algumas espécies têm apresentado padrões filogeográficos que não são compatíveis com este cenário clássico. Assim, fatores como tempo de duração da fase larval, predação da larva e o hidrodinamismo podem interferir de maneira significativa na dispersão das espécies. Além disso, fatores ambientais históricos, tais como as grandes mudanças climáticas do Pleistoceno também influenciaram os padrões de diversidade genética das espécies. Neste sentido, estudos comparativos são importantes ferramentas para o entendimento dos diferentes processos que deram origem à atual diversidade. Porém, poucos estudos filogeográficos comparativos foram realizados em espécies marinhas costeiras, em especial nenhum para a costa atlântica da América do Sul. Neste estudo comparamos os padrões de diversidade genética de quatro espécies abundantes de invertebrados que ocorrem ao longo da costa sul-sudeste do Brasil, Uruguai e Argentina, com o objetivo de entender a história evolutiva destas espécies e o que elas podem contar sobre esta região geográfica. Sequenciamos parte do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I do moçambique Donax hanleyanus (n= 247), do marisco branco Mesodesma mactroides (n= 59), da tatuíra Emerita brasiliensis (n= 191) e do caranguejo maria-farinha Ocypode quadrata (n= 135). Análises filogeográficas e populacionais foram utilizadas a fim de elucidar e comparar os padrões evolutivos para estas espécies de invertebrados costeiros. Nossos dados revelaram um padrão de variabilidade genética muito baixa para todas as espécies, apesar de apresentarem ampla distribuição geográfica e populações censitárias gigantescas, demonstrando a grande influência das flutuações populacionais históricas na formação da variabilidade genética atual. Apenas E. brasiliensis apresentou uma maior variabilidade ao norte da sua distribuição o que é compatível com expansão populacional recente a partir de algum refúgio de baixa latitude, neste caso, ao norte. Além disto, foi a única espécie a apresentar indicação de isolamento por distância. As histórias demográficas destas espécies, apesar de apresentarem algumas diferenças, parecem estar intimamente ligadas às flutuações de temperatura durante o último grande ciclo glacial, pois três delas apresentaram ancestral comum mais recente (time to most recent commom ancestor – TMRCA) dentro dos 100 mil últimos anos, com exceção de O. quadrata, que apresentou TMRCA há cerca de 500 mil anos. Para todas as espécies constatamos a ocorrência de um longo período de estabilidade demográfica (população reduzida) com expansão populacional mais recente, com exceção de M. mactroides, que apresentou TMRCA e expansão populacional praticamente simultâneos. Emerita brasiliensis foi a espécie com a história demográfica mais recente, apresentando expansão populacional após o último máximo glacial (21 mil anos atrás), e coalescência há cerca de 60 mil anos. As demais espécies apresentaram expansão populacional entre 70 e 100 mil anos, entretanto não podemos descartar a hipótese de expansão simultânea para estas três espécies, já que os intervalos de confiança destas análises se sobrepõem, o que sugere a forte influência de um fator ambiental comum. Ocypode quadrata, além de ter apresentado a história demográfica mais antiga, apresentou a maior diversidade genética, sendo também a espécie com a maior distribuição geográfica, sendo pancontinental, o que sugere ser a espécie mais resistente às mudanças ambientais. As espécies D. hanleyanus e O. quadrata, apresentaram baixa estruturação filogeográfica, o que sugere não haver barreiras biogeográficas efetivas para elas, e corrobora a hipótese de que larvas livres natantes são fator importante para o fluxo gênico elevado. Por outro lado sugerem uma estruturação populacional para M. mactroides (com uma possível barreira biogeográfica no sul de SP) e E. brasiliensis (barreira em Copacabana, RJ). De maneira geral estes dados reforçam a idéia de que só a capacidade dispersiva larval não é suficiente para predizer fluxo gênico e estruturação populacional em populações marinhas costeiras, mas sim uma combinação de fatores ecológicos intrínsecos de cada espécie, assim como os fatores geológicos históricos, como os ocorridos no Pleistoceno. / Coastal and marine environments are usually characterized by lack of evident physical barriers and having many species that show a free-swimming larval stage. Due to this larval stage, marine species commonly show high dispersion rates resulting in high gene flow and low geographical structure. Some species however present phylogeographical patterns that differ from this standard scenario. Factors such as duration of the larval phase, its predation level, and the hydrodinamism of the dispersion can significantly impact species dispersion. Moreover, historical environmental factors, such as the great climatic changes in the Pleistocene are also important elements to shape pattern of genetic diversity of the species. In this sense, comparative analyses are important tools for understanding the different processes that gave rise to the current diversity. Unfortunately, few comparative phylogeographical studies were carried out in sea coastal species, in special none for the Atlantic coast of the South America. In this study we compare the patterns of genetic diversity of four abundant invertebrate species that occur along the beaches of the Brazilian south and southeastern coast, Uruguay and Argentina, to better understand their evolutionary histories as well as what they could tell about the history of this geographical region. For this aim we partially sequenced the mitochondrial Cytochrome Oxidase I gene of the moçambique Donax hanleyanus (n=247), yellow clam Mesodesma mactroides (n=59), mole crab Emerita brasiliensis (n=191) and of the ghost crab Ocypode quadrata (n = 135) and analyzed them using several phylogeographical and populational genetic methods. Our results revealed a pattern of very low genetic diversity for all four species, in spite of their large geographical distribution and the huge population size, evidencing the great influence of the population historical fluctuations in the current genetic variability. Only E. brasiliensis showed a relatively higher variability to the north of its distribution what is compatible with a recent populational expansion from a refugium in low latitudes. Besides it was the only species that presented evidence for isolation by distance. The demographic histories of these species, in spite of presenting some differences, seems to be closely connected with the climatic fluctuations during the last glacial cycle, since three of them presented TMRCAs in the last 100 kyr ago, with the exception of O. quadrata, which presented TMRCA about 500 kyr ago. All species presented a long period of demographic stability with relatively reduced population followed by a more recent population expansion. The exception to this picture is M. mactroides, which presented TMRCA and population expansion nearly simultaneous. Emerita brasiliensis depicted the most recent demographic history, presenting a strong population expansion after the last glacial maximum (21 kyr ago), with TMRCA around 60 kyr ago. The other species presented population expansions between around 70 and 100 kyr ago, however we can not to reject the hypothesis of a simultaneous expansion for these three species, since to the confidence intervals of these analyses overlapped, which would indicate a strong influence of a common environmental feature. Ocypode quadrata presented the most ancient demographic history, the highest genetic diversity, and the largest geographical distribution (it is a pancontinental species). This may indicate that it could the most tolerant to the environmental changes. D. hanleyanus and O. quadrata presented low phylogeographical structure, which can mean the existence of no effective biogeographical barriers to these species, corroborating the hypothesis that a free-swimming larval stage is an important factor for an elevated gene flow. On the other hand, our results suggest a reasonable population structure for M. mactroides (with a possible biogeographical barrier in the south of São Paulo) and E. brasiliensis (barrier around Copacabana, Rio de Janeiro), In conclusion, our results support the proposal that the existence of a freeswimming larval stage is not sufficient to predict high gene flow and population structure in sea coastal species, being this pattern likely a combination of intrinsic ecological factors of each species, as well as biogeographical historical factors.
19

Influência da complexidade do habitat e da sazonalidade sobre a fauna associada a macroalgas de um manguezal hipersalino

Duarte, Rafaela Cristina de Souza 26 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-09-25T12:22:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Rafaela Cristina de Souza Duarte.pdf: 17178678 bytes, checksum: bd68b4b71283d326a8bc5494f62f32d1 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Mangroves have a mosaic of different habitats and microhabitats, each with their specific levels of complexity and occupied by different kinds of organisms. In this context, the present study aimed to assess the effect of habitat complexity and seasonality in the composition and structure of the invertebrate macrofauna associated with macroalgal species with different morphological characteristics. The research was conducted in the hypersaline mangrove of Tubarão River (5 o 04'34.87"S, 36 o 27'32.36"W), municipality of Macau, northern coast of the state of Rio Grande do Norte, Northeastern Brazil. Aiming to analyze the effect of habitat complexity on a local microhabitat scale and considering that the studied mangrove, due to their peculiar hipersalinity characteristics may harbor a rich fauna and flora, the following questions guide this research: a) Does the different macroalgae studied have different degree of habitat complexity? b) Macroalgae with different morphological characteristics supports invertebrate communities significantly different? c) Is there a relationship between habitat complexity and the composition, abundance and diversity of the invertebrate community of their phytal? and d) Is there difference between the pattern of abundance and composition of invertebrates found in macroalgal species between the dry and rainy seasons? A total of 1,750 individuals classified into five taxa were collected: Echinodermata, Amphipoda, Mollusca, Isopoda and Polychaeta, with 723 individuals found in the rainy season (associated with Gracilaria sp.) and 1,028 in the dry season (430 in Dictyota sp. and 598 in Solieria filiformes). Macroalgae of the dry period were morphologically distinct, however, the invertebrate fauna were not significantly different (p=0.1037), thus reinforcing that seasonality may have influenced the abundance and composition of macroinvertebrate taxa. The different macroalgae showed distinct morphological patterns and different degrees of habitat complexity, where more complex algae harbored a richer, abundant and diverse mollusc fauna. Specifically in the case of molluscs, species composition was typically marine, higher than other mangrove environments. Furthermore, the malacofauna was predominantly composed by micromolluscs, as adults whose sizes do not exceed 10 mm, and young individuals of species that reach a larger size. It is suggested that both habitat complexity as well as seasonality affect the richness, diversity and abundance of associated communities. In general, the marine macroalgae provides support for a variety of marine taxa, and may play an important role in increasing the structural underwater habitat complexity of mangrove systems. / Os manguezais apresentam um mosaico composto por diversos habitats e microhabitats, cada um deles com seus níveis de complexidade específicos e ocupados por diferentes tipos de organismos. Nesse contexto, o presente estudo tem por objetivo avaliar o efeito da complexidade do habitat e da sazonalidade na composição e estrutura da macrofauna associada a diferentes espécies de macroalgas com características morfológicas distintas. A pesquisa foi desenvolvida no manguezal hipersalino do Rio Tubarão (5º04 34,87 S; 36º27 32,36 O), município de Macau, litoral setentrional do estado do Rio Grande do Norte, Nordeste do Brasil. No intuito de analisar o efeito da complexidade do habitat em uma escala local de microhabitat e considerando que o manguezal estudado, devido à suas características peculiares de hipersalinidade podem abrigar uma rica fauna e flora, as seguintes perguntas nortearam esta pesquisa: a) As diferentes espécies de algas apresentam graus de complexidade de habitat distintos? b) Algas com características morfológicas diferenciadas suportam comunidades de invertebrados significativamente diferentes? c) Existe uma relação entre a complexidade do habitat oferecido pelas macroalgas e a composição, abundância, riqueza e diversidade de invertebrados participantes de seu fital? d) Existem diferenças entre o padrão de abundância e composição de invertebrados encontrados nas espécies de macroalgas entre os períodos seco e chuvoso? Foram coletados 1.750 indivíduos classificados em cinco taxa: Echinodermata, Amphipoda, Mollusca, Isopoda e Polychaeta, sendo 723 indivíduos encontrados no período chuvoso (associados à Gracilaria sp.) e 1.028 no período seco (430 em Dictyota sp. e 598 em S. filiformes). macroalgas apesar de serem morfologicamente distintas não apresentaram uma fauna de invertebrados significativamente diferente (p=0,1037), reforçando assim, que a sazonalidade pode ter influenciado a abundância e composição dos táxons de macroinvertebrados. As diferentes macroalgas apresentaram padrões morfológicos distintos e diferentes graus de complexidade de habitat, onde algas mais complexas abrigaram uma fauna de moluscos mais rica, abundante e diversa. Especificamente no caso dos moluscos, a composição de espécies foi tipicamente marinha, cuja riqueza pode ser considerada alta com relação a outros ambientes de manguezal. Além disso, a malacofauna foi composta predominantemente por micromoluscos, cujos tamanhos quando adultos não ultrapassam os 10 mm, e por indivíduos jovens de espécies que atingem um porte maior. Sugere-se que tanto a complexidade do habitat quanto a sazonalidade afetam a riqueza, diversidade e abundância das comunidades associadas. De um modo geral, as macroalgas marinhas oferecem suporte para uma diversidade de táxons marinhos, sendo habitats fundamentais para o aumento da complexidade estrutural subaquática do ecossistema manguezal.
20

Influência da complexidade do habitat e da sazonalidade sobre a fauna associada a macroalgas de um manguezal hipersalino

Duarte, Rafaela Cristina de Souza 26 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-09-25T12:22:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Rafaela Cristina de Souza Duarte.pdf: 17178678 bytes, checksum: bd68b4b71283d326a8bc5494f62f32d1 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Mangroves have a mosaic of different habitats and microhabitats, each with their specific levels of complexity and occupied by different kinds of organisms. In this context, the present study aimed to assess the effect of habitat complexity and seasonality in the composition and structure of the invertebrate macrofauna associated with macroalgal species with different morphological characteristics. The research was conducted in the hypersaline mangrove of Tubarão River (5 o 04'34.87"S, 36 o 27'32.36"W), municipality of Macau, northern coast of the state of Rio Grande do Norte, Northeastern Brazil. Aiming to analyze the effect of habitat complexity on a local microhabitat scale and considering that the studied mangrove, due to their peculiar hipersalinity characteristics may harbor a rich fauna and flora, the following questions guide this research: a) Does the different macroalgae studied have different degree of habitat complexity? b) Macroalgae with different morphological characteristics supports invertebrate communities significantly different? c) Is there a relationship between habitat complexity and the composition, abundance and diversity of the invertebrate community of their phytal? and d) Is there difference between the pattern of abundance and composition of invertebrates found in macroalgal species between the dry and rainy seasons? A total of 1,750 individuals classified into five taxa were collected: Echinodermata, Amphipoda, Mollusca, Isopoda and Polychaeta, with 723 individuals found in the rainy season (associated with Gracilaria sp.) and 1,028 in the dry season (430 in Dictyota sp. and 598 in Solieria filiformes). Macroalgae of the dry period were morphologically distinct, however, the invertebrate fauna were not significantly different (p=0.1037), thus reinforcing that seasonality may have influenced the abundance and composition of macroinvertebrate taxa. The different macroalgae showed distinct morphological patterns and different degrees of habitat complexity, where more complex algae harbored a richer, abundant and diverse mollusc fauna. Specifically in the case of molluscs, species composition was typically marine, higher than other mangrove environments. Furthermore, the malacofauna was predominantly composed by micromolluscs, as adults whose sizes do not exceed 10 mm, and young individuals of species that reach a larger size. It is suggested that both habitat complexity as well as seasonality affect the richness, diversity and abundance of associated communities. In general, the marine macroalgae provides support for a variety of marine taxa, and may play an important role in increasing the structural underwater habitat complexity of mangrove systems. / Os manguezais apresentam um mosaico composto por diversos habitats e microhabitats, cada um deles com seus níveis de complexidade específicos e ocupados por diferentes tipos de organismos. Nesse contexto, o presente estudo tem por objetivo avaliar o efeito da complexidade do habitat e da sazonalidade na composição e estrutura da macrofauna associada a diferentes espécies de macroalgas com características morfológicas distintas. A pesquisa foi desenvolvida no manguezal hipersalino do Rio Tubarão (5º04 34,87 S; 36º27 32,36 O), município de Macau, litoral setentrional do estado do Rio Grande do Norte, Nordeste do Brasil. No intuito de analisar o efeito da complexidade do habitat em uma escala local de microhabitat e considerando que o manguezal estudado, devido à suas características peculiares de hipersalinidade podem abrigar uma rica fauna e flora, as seguintes perguntas nortearam esta pesquisa: a) As diferentes espécies de algas apresentam graus de complexidade de habitat distintos? b) Algas com características morfológicas diferenciadas suportam comunidades de invertebrados significativamente diferentes? c) Existe uma relação entre a complexidade do habitat oferecido pelas macroalgas e a composição, abundância, riqueza e diversidade de invertebrados participantes de seu fital? d) Existem diferenças entre o padrão de abundância e composição de invertebrados encontrados nas espécies de macroalgas entre os períodos seco e chuvoso? Foram coletados 1.750 indivíduos classificados em cinco taxa: Echinodermata, Amphipoda, Mollusca, Isopoda e Polychaeta, sendo 723 indivíduos encontrados no período chuvoso (associados à Gracilaria sp.) e 1.028 no período seco (430 em Dictyota sp. e 598 em S. filiformes). macroalgas apesar de serem morfologicamente distintas não apresentaram uma fauna de invertebrados significativamente diferente (p=0,1037), reforçando assim, que a sazonalidade pode ter influenciado a abundância e composição dos táxons de macroinvertebrados. As diferentes macroalgas apresentaram padrões morfológicos distintos e diferentes graus de complexidade de habitat, onde algas mais complexas abrigaram uma fauna de moluscos mais rica, abundante e diversa. Especificamente no caso dos moluscos, a composição de espécies foi tipicamente marinha, cuja riqueza pode ser considerada alta com relação a outros ambientes de manguezal. Além disso, a malacofauna foi composta predominantemente por micromoluscos, cujos tamanhos quando adultos não ultrapassam os 10 mm, e por indivíduos jovens de espécies que atingem um porte maior. Sugere-se que tanto a complexidade do habitat quanto a sazonalidade afetam a riqueza, diversidade e abundância das comunidades associadas. De um modo geral, as macroalgas marinhas oferecem suporte para uma diversidade de táxons marinhos, sendo habitats fundamentais para o aumento da complexidade estrutural subaquática do ecossistema manguezal.

Page generated in 0.0988 seconds