Submitted by Ana Damasceno (ana.damasceno@unipampa.edu.br) on 2016-09-12T20:02:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Relação Da Nutrição Apícola Com A Microbiota Do Pólen E Do Sistema Digestório De Abelhas Melíferas Verificada Por Sequenciamento De Nova Geração.pdf: 2887795 bytes, checksum: 12218b912a445c8eb21706a94911e90f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-12T20:02:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Relação Da Nutrição Apícola Com A Microbiota Do Pólen E Do Sistema Digestório De Abelhas Melíferas Verificada Por Sequenciamento De Nova Geração.pdf: 2887795 bytes, checksum: 12218b912a445c8eb21706a94911e90f (MD5) Previous issue date: 2015-03-16 / A microbiota e os genes funcionais ativamente envolvidos no processo de decomposição e utilização de grãos de pólen em pão de mel e no trato digestório de abelha ainda não são completamente compreendidos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura e diversidade da comunidade de bactérias e Archaeas em amostrasde pão de mel e sistema digestório de abelhas africanizadas, bem como para prever os genes envolvido na bioprocessamento microbiano do pólen, usando a tecnologia de seqüenciamento de nova geração. Um total de 11 filos bacterianos foram encontrados dentro do sistema de digestório de abelhas e 10 filos bacterianos foram encontrado dentro pão de mel. Embora a comparação a nível de filo mostre mais filos em comum, a análise filogenética mais profunda mostrou maior variação de composição taxonômica. A família Enterobacteriaceae, Ricketsiaceae, Spiroplasmataceae e Bacillaceae, foram os principais grupos responsáveis por a especificidade do intestino de abelhas, enquanto as principais famílias responsáveis pela especificidade do pão de mel foram Neisseriaceae, Flavobacteriaceae, Acetobacteraceae e Lactobacillaceae. Em termos da estrutura da comunidade microbiana, a análise mostrou que as comunidades dos dois ambientes foram bastante diferentes umas das outras, com apenas 7% dos táxons a nível de espécies compartilhados entre o sitema digestório de abelhas e o pão de mel. Os resultados indicaram a presença de um elevado nível de especialização e uma microbiota intestinal bem adaptada dentro de cada abelha e do pão de mel.A comunidade associada ao pão de mel, apresentou maior abundância relativa de genes relacionados com a degradação de aminoácidos, carboidratos, e o metabolismo lipídico, sugerindo que biodegradação do pólen ocorre predominantemente pela microbiota associada ao pão de mel. Estes resultados sugerem uma complexa e importante relação entre nutrição de abelhas e suas comunidades microbianas. / The microbiota and the functional genes actively involved in the process of breakdown and utilization of pollen grains in beebread and beeguts are not yet understood. The aim of this work was to assess the diversity and community structure of bacteria and archaea in Africanized honeybee guts and beebread as well as to predict the genes involved in the microbial bioprocessing of pollen using state of the art ‘post-light’ based sequencing technology. A total of 11 bacterial phyla were found within bee guts and 10 bacterial phyla were found within beebread. Although the phylum level comparison shows most phyla in common, a deeper phylogenetic analysis showed greater variation of taxonomic composition. The families Enterobacteriaceae, Ricketsiaceae, Spiroplasmataceae and Bacillaceae, were the main groups responsible for the specificity of the bee gut while the main families responsible for the specificity of the beebread were Neisseriaceae, Flavobacteriaceae, Acetobacteraceae and Lactobacillaceae. In terms of microbial community structure, the analysis showed that the communities from the two environments were quite different from each other with only 7 % of species-level taxa shared between beegut and beebread. The results indicated the presence of a highly specialized and well-adapted microbiota within each bee gut and beebread. The beebread community included a greater relative abundance of genes related to amino acid, carbohydrate, and lipid metabolism, suggesting that pollen biodegradation predominantly occurs in the beebread. These results suggests a complex and important relationship between honeybee nutrition and their microbial communities.

Submitted by Ana Damasceno (ana.damasceno@unipampa.edu.br) on 2016-10-31T16:19:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Sequenciamento por Ion Torrent revela padrões de interação e distribuição de comunidades microbianas em um perfil de solo ornitogênico da Ilha Seymour, Península Antártica.pdf: 907768 bytes, checksum: 05c430f88f8f32e041e763c1d453d54a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-31T16:19:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Sequenciamento por Ion Torrent revela padrões de interação e distribuição de comunidades microbianas em um perfil de solo ornitogênico da Ilha Seymour, Península Antártica.pdf: 907768 bytes, checksum: 05c430f88f8f32e041e763c1d453d54a (MD5) Previous issue date: 2014 / Neste estudo, foram analisadas e comparadas comunidades bacterianas do solo de uma pinguineira da Ilha Seymour (Península Antártica) em termos de abundância, estrutura, diversidade e rede de interações, a fim de se identificar padrões de interação entre os vários grupos de bactérias presentes em solos ornitogênicos em diferentes profundidades (camadas). A análise das sequências revelou a presença de oito filos distribuídos em diferentes proporções entre as Camadas 1 (0-8 cm), 2 (20-25 cm) e 3 (35-40 cm). De acordo com os índices de diversidade, a Camada 3 apresentou os maiores valores de riqueza, diversidade e uniformidade quando comparado com as Camadas 1 e 2. Em termos de estrutura da comunidade microbiana, a análise UniFrac mostrou que as comunidades microbianas das três camadas foram muito diferentes umas das outras. A análise de redes revelou a existência de um padrão único de interações no qual a rede microbiana formou uma topologia de agrupamento, mas não estruturado em módulos, como de costume em comunidades biológicas. Da mesma forma, através da utilização de análise de redes, foi possível identificar táxons específicos como sendo potencialmente importantes para a estruturação e funcionamento da comunidade microbiana. Além disso, as análises de simulação indicaram que a perda de grupos importantes de microorganismos pode alterar significativamente os padrões de interação dentro da comunidade microbiana. Estes resultados fornecem novos insights sobre as interações bacterianas e ecologia microbiana desse importante, mas ameaçado ambiente. / In this study, we analyzed and compared the soil bacterial communities from a penguin rookery site at Seymour Island (Antarctic Peninsula) in terms of abundance, structure, diversity and interaction network in order to identify interaction patterns among the various groups of bacteria presented in an ornithogenic site at three depths (layers). The analysis of the sequences revealed the presence of 8 phyla distributed in different proportions among the Layers 1 (0-8 cm), 2 (20-25 cm) and 3 (35-40 cm). According to the diversity indexes, Layer 3 presented the highest values of richness, diversity and evenness when compared to Layers 1 and 2. In terms of bacterial community structure, the unweighted and weighted UniFrac analysis showed that the soil bacterial communities from the three layers were quite different from each other. Network analysis revealed the existence of a unique pattern of interactions in which the soil microbial network formed a clustered topology, but not structured in modules, as usual in biological communities. In addition, through the use of network analysis, it was possible to identify specific taxa as potentially important for the structuring and functioning of the microbial community. Furthermore, simulation analyzes indicated that the loss of potential keystone groups of microorganisms may significantly alter the patterns of interactions within the microbial communityThese findings provide new insights into the bacterial interactions and microbial ecology of this important, but threatened environment.

Submitted by Ana Damasceno (ana.damasceno@unipampa.edu.br) on 2016-07-21T18:21:38Z No. of bitstreams: 1 Relação Da Nutrição Apícola Com A Microbiota Do Pólen E Do Sistema Digestório De Abelhas Melíferas Verificada Por Sequenciamento De Nova Geração.pdf: 2887795 bytes, checksum: 12218b912a445c8eb21706a94911e90f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Damasceno (ana.damasceno@unipampa.edu.br) on 2016-08-23T16:34:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Relação Da Nutrição Apícola Com A Microbiota Do Pólen E Do Sistema Digestório De Abelhas Melíferas Verificada Por Sequenciamento De Nova Geração.pdf: 2887795 bytes, checksum: 12218b912a445c8eb21706a94911e90f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-23T16:34:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Relação Da Nutrição Apícola Com A Microbiota Do Pólen E Do Sistema Digestório De Abelhas Melíferas Verificada Por Sequenciamento De Nova Geração.pdf: 2887795 bytes, checksum: 12218b912a445c8eb21706a94911e90f (MD5) Previous issue date: 2015-03-16 / A microbiota e os genes funcionais ativamente envolvidos no processo de decomposição e utilização de grãos de pólen em pão de mel e no trato digestório de abelha ainda não são completamente compreendidos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura e diversidade da comunidade de bactérias e Archaeas em amostrasde pão de mel e sistema digestório de abelhas africanizadas, bem como para prever os genes envolvido na bioprocessamento microbiano do pólen, usando a tecnologia de seqüenciamento de nova geração. Um total de 11 filos bacterianos foram encontrados dentro do sistema de digestório de abelhas e 10 filos bacterianos foram encontrado dentro pão de mel. Embora a comparação a nível de filo mostre mais filos em comum, a análise filogenética mais profunda mostrou maior variação de composição taxonômica. A família Enterobacteriaceae, Ricketsiaceae, Spiroplasmataceae e Bacillaceae, foram os principais grupos responsáveis por a especificidade do intestino de abelhas, enquanto as principais famílias responsáveis pela especificidade do pão de mel foram Neisseriaceae, Flavobacteriaceae, Acetobacteraceae e Lactobacillaceae. Em termos da estrutura da comunidade microbiana, a análise mostrou que as comunidades dos dois ambientes foram bastante diferentes umas das outras, com apenas 7% dos táxons a nível de espécies compartilhados entre o sitema digestório de abelhas e o pão de mel. Os resultados indicaram a presença de um elevado nível de especialização e uma microbiota intestinal bem adaptada dentro de cada abelha e do pão de mel.A comunidade associada ao pão de mel, apresentou maior abundância relativa de genes relacionados com a degradação de aminoácidos, carboidratos, e o metabolismo lipídico, sugerindo que biodegradação do pólen ocorre predominantemente pela microbiota associada ao pão de mel. Estes resultados sugerem uma complexa e importante relação entre nutrição de abelhas e suas comunidades microbianas. / The microbiota and the functional genes actively involved in the process of breakdown and utilization of pollen grains in beebread and beeguts are not yet understood. The aim of this work was to assess the diversity and community structure of bacteria and archaea in Africanized honeybee guts and beebread as well as to predict the genes involved in the microbial bioprocessing of pollen using state of the art ‘post-light’ based sequencing technology. A total of 11 bacterial phyla were found within bee guts and 10 bacterial phyla were found within beebread. Although the phylum level comparison shows most phyla in common, a deeper phylogenetic analysis showed greater variation of taxonomic composition. The families Enterobacteriaceae, Ricketsiaceae, Spiroplasmataceae and Bacillaceae, were the main groups responsible for the specificity of the bee gut while the main families responsible for the specificity of the beebread were Neisseriaceae, Flavobacteriaceae, Acetobacteraceae and Lactobacillaceae. In terms of microbial community structure, the analysis showed that the communities from the two environments were quite different from each other with only 7 % of species-level taxa shared between beegut and beebread. The results indicated the presence of a highly specialized and well-adapted microbiota within each bee gut and beebread. The beebread community included a greater relative abundance of genes related to amino acid, carbohydrate, and lipid metabolism, suggesting that pollen biodegradation predominantly occurs in the beebread. These results suggests a complex and important relationship between honeybee nutrition and their microbial communities.