Submitted by Rodolfo de Niro Gazola null (rngazola@gmail.com) on 2018-01-17T15:00:48Z No. of bitstreams: 1 gazola_rn_dr_ilha.pdf: 2617484 bytes, checksum: d2a2e8e5c35719fb2f8767697f233618 (MD5) / Approved for entry into archive by Cristina Alexandra de Godoy null (cristina@adm.feis.unesp.br) on 2018-01-17T15:45:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 gazola_rn_dr_ilha.pdf: 2617484 bytes, checksum: d2a2e8e5c35719fb2f8767697f233618 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-17T15:45:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 gazola_rn_dr_ilha.pdf: 2617484 bytes, checksum: d2a2e8e5c35719fb2f8767697f233618 (MD5) Previous issue date: 2017-12-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As áreas de cultivo do eucalipto têm ocupado novas regiões do Brasil, sendo que o estado do Mato Grosso do Sul lidera esta expansão. Nessas novas áreas, a condição edafoclimática é um fator limitante ao desenvolvimento dessa cultura, pois os solos do bioma Cerrado apresentam baixa fertilidade natural, com pouca disponibilidade de fósforo (P) e potássio (K), e baixo teor de matéria orgânica (M.O.), além disso, o clima é caracterizado pela presença de déficit hídrico acentuado e frequente. Portanto, a carência de nutrientes no solo aliado às condições climáticas influenciam no desenvolvimento da cultura. Neste contexto, objetivou-se avaliar a adubação nitrogenada, fosfatada e potássica dado à importância desses nutrientes na cultura do eucalipto, e a suas limitações no solo em estudo. O experimento foi conduzido na Fazenda Renascença, fundo agrícola administrado pela Cargill Agrícola S/A, localizado no município de Três Lagoas/MS, de setembro de 2011 a julho de 2017, em um NEOSSOLO QUARTZARÊNICO Órtico. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados com quatro tratamentos e cinco repetições. Os tratamentos foram constituídos de doses de nitrogênio (N) (0, 70, 105 e 140 kg ha-1), de P (0, 40, 70 e 100 kg ha-1 de P2O5) e de K (0, 90, 135 e 180 kg ha-1 de K2O). Cada parcela foi composta por 56 plantas, distribuídas em sete linhas de oito plantas cada, totalizando 420 m2. Nas linhas de plantio, as mudas do clone I144 (Eucalyptus urophylla) foram espaçadas em 2,5 m e nas entrelinhas em 3,0 m. Foram avaliados: a produtividade de madeira; as concentrações de nutrientes nas folhas; a produtividade de folhedos, as concentrações e a transferência de nutrientes de folhedos; a disponibilidade dos macronutrientes no solo; o balanço dos nutrientes nas folhas e no solo (relação log isométrica); a produção, concentrações de nutrientes e seu acúmulo na biomassa e a eficiência no uso dos nutrientes. A adubação nitrogenada, fosfatada e potássica aumentaram a produção de biomassa, volume de madeira e estoque de nutrientes na biomassa. As doses de N influenciaram nas concentrações de N na folha e no folhedo, nos balanços foliares de [N | P], [K | Ca, Mg] e [Ca | Mg] e na ciclagem de K e não interferiram na produtividade de folhedo, nos teores de P, K, Ca, Mg e S no solo e na eficiência da utilização dos nutrientes. As doses de P influenciaram positivamente na transferência de P e K para solo, no balanço foliares de [N | P], nos teores de P solo e não interferiram na produtividade de folhedo, nos teores de K, Ca, Mg e S no solo e na eficiência da utilização dos nutrientes. As doses de K influenciaram positivamente nas concentrações de K e negativamente nas de Mg na folha e no folhedo, na transferência de K e Mg para o solo, nos balanços foliares de [K | Ca, Mg] e [Ca | Mg] e do solo de [K, Ca, Mg | H+Al] e [K | Ca, Mg], na eficiência da utilização do N e não interferiram na produtividade de folhedo e nos teores de P, Ca, Mg e S no solo. / The areas of eucalyptus cultivation have occupied new regions of Brazil, being that the state of Mato Grosso do Sul leads this expansion. In these new areas, the soil and soil conditions of the Cerrado biome have low natural fertility, with low availability of phosphorus (P) and potassium (K), and low organic matter (OM), in addition, the climate is characterized by the presence of accentuated and frequent water deficit. Therefore, the lack of nutrients in the soil combined with climatic conditions influence the development of the crop. In this context, the objective was to evaluate the nitrogen, phosphate and potassium fertilization given to the importance of these nutrients in the eucalyptus crop and its limitations in the soil under study. The experiment was conducted at Fazenda Renascença, an agricultural fund managed by Cargill Agrícola S / A, located in the municipality of Três Lagoas / MS, from September 2011 to July 2017, in a Entisols. A randomized block design with four treatments and five replications. The treatments were composed rates of nitrogen (N) (0, 70, 105 and 140 kg ha-1), P (0, 40, 70 and 100 kg ha-1 P2O5) and K (0, 90, 135 and 180 kg ha-1 K2O). Each plot was composed of 56 plants, distributed in seven lines of eight plants each, totaling 420 m2. In the planting lines, the seedlings of clone I144 (Eucalyptus urophylla) were spaced at 2.5 m and in between lines at 3.0 m. The following were evaluated: wood productivity; nutrient concentrations in leaves; foliar productivity, nutrient concentrations and transfer of foliage; the availability of macronutrients in soil; nutrient balance in leaves and soil (isometric log ratio); production, nutrient concentrations and their accumulation in the biomass and the efficiency in the use of the nutrients. Nitrogen, phosphate and potassium fertilization increased biomass production, wood volume and nutrient stock in biomass. N rates influenced leaf and leaf N concentrations in leaf balances of [N | P], [K | Ca, Mg] and [Ca | Mg and K cycling and did not interfere in leaf productivity, P, K, Ca, Mg and S contents in the soil and nutrient utilization efficiency. The P rates influenced positively the transfer of P and K to soil, in the leaf balance of [N | P] levels in soil P and did not interfere with leaf productivity, soil K, Ca, Mg and S contents and nutrient utilization efficiency. The K rates influenced positively K concentrations and negatively Mg concentrations in leaf and leaf, K and Mg transfer to soil, in the leaf swings of [K | Ca, Mg] and [Ca | Mg] and the soil of [K, Ca, Mg | H + Al] and [K | Ca, Mg] in the efficiency of N utilization and did not interfere in leaf productivity and soil P, Ca, Mg and S contents. / FAPESP: 2014/02641-6

Compositional data consist of known vectors such as compositions whose components are positive and defined in the interval (0,1) representing proportions or fractions of a whole, where the sum of these components must be equal to one. Compositional data is present in different areas, such as in geology, ecology, economy, medicine, among many others. Thus, there is great interest in new modeling approaches for compositional data, mainly when there is an influence of covariates in this type of data. In this context, the main objective of this thesis is to address the new approach of regression models applied in compositional data. The main idea consists of developing a marked method by penalized regression, in particular the Lasso (least absolute shrinkage and selection operator), elastic net and Spike-and-Slab Lasso (SSL) for the estimation of parameters of the models. In particular, we envision developing this modeling for compositional data, when the number of explanatory variables exceeds the number of observations in the presence of large databases, and when there are constraints on the dependent variables and covariates. / Dados composicionais consistem em vetores conhecidos como composições cujos componentes são positivos e definidos no intervalo (0,1) representando proporções ou frações de um todo, sendo que a soma desses componentes totalizam um. Tais dados estão presentes em diferentes áreas, como na geologia, ecologia, economia, medicina entre outras. Desta forma, há um grande interesse em ampliar os conhecimentos acerca da modelagem de dados composicionais, principalmente quando há a influência de covariáveis nesse tipo de dado. Nesse contexto, a presente tese tem por objetivo propor uma nova abordagem de modelos de regressão aplicada em dados composicionais. A ideia central consiste no desenvolvimento de um método balizado por regressão penalizada, em particular Lasso, do inglês least absolute shrinkage and selection operator, elastic net e Spike-e-Slab Lasso (SSL) para a estimação dos parâmetros do modelo. Em particular, visionamos o desenvolvimento dessa modelagem para dados composicionais, com o número de variáveis explicativas excedendo o número de observações e na presença de grandes bases de dados, e além disso, quando há restrição na variável resposta e nas covariáveis.

Orientador: Salatiér Buzetti / Resumo: As áreas de cultivo do eucalipto têm ocupado novas regiões do Brasil, sendo que o estado do Mato Grosso do Sul lidera esta expansão. Nessas novas áreas, a condição edafoclimática é um fator limitante ao desenvolvimento dessa cultura, pois os solos do bioma Cerrado apresentam baixa fertilidade natural, com pouca disponibilidade de fósforo (P) e potássio (K), e baixo teor de matéria orgânica (M.O.), além disso, o clima é caracterizado pela presença de déficit hídrico acentuado e frequente. Portanto, a carência de nutrientes no solo aliado às condições climáticas influenciam no desenvolvimento da cultura. Neste contexto, objetivou-se avaliar a adubação nitrogenada, fosfatada e potássica dado à importância desses nutrientes na cultura do eucalipto, e a suas limitações no solo em estudo. O experimento foi conduzido na Fazenda Renascença, fundo agrícola administrado pela Cargill Agrícola S/A, localizado no município de Três Lagoas/MS, de setembro de 2011 a julho de 2017, em um NEOSSOLO QUARTZARÊNICO Órtico. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados com quatro tratamentos e cinco repetições. Os tratamentos foram constituídos de doses de nitrogênio (N) (0, 70, 105 e 140 kg ha-1), de P (0, 40, 70 e 100 kg ha-1 de P2O5) e de K (0, 90, 135 e 180 kg ha-1 de K2O). Cada parcela foi composta por 56 plantas, distribuídas em sete linhas de oito plantas cada, totalizando 420 m2. Nas linhas de plantio, as mudas do clone I144 (Eucalyptus urophylla) foram espaçadas em 2,5 m e nas entrelin... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The areas of eucalyptus cultivation have occupied new regions of Brazil, being that the state of Mato Grosso do Sul leads this expansion. In these new areas, the soil and soil conditions of the Cerrado biome have low natural fertility, with low availability of phosphorus (P) and potassium (K), and low organic matter (OM), in addition, the climate is characterized by the presence of accentuated and frequent water deficit. Therefore, the lack of nutrients in the soil combined with climatic conditions influence the development of the crop. In this context, the objective was to evaluate the nitrogen, phosphate and potassium fertilization given to the importance of these nutrients in the eucalyptus crop and its limitations in the soil under study. The experiment was conducted at Fazenda Renascença, an agricultural fund managed by Cargill Agrícola S / A, located in the municipality of Três Lagoas / MS, from September 2011 to July 2017, in a Entisols. A randomized block design with four treatments and five replications. The treatments were composed rates of nitrogen (N) (0, 70, 105 and 140 kg ha-1), P (0, 40, 70 and 100 kg ha-1 P2O5) and K (0, 90, 135 and 180 kg ha-1 K2O). Each plot was composed of 56 plants, distributed in seven lines of eight plants each, totaling 420 m2. In the planting lines, the seedlings of clone I144 (Eucalyptus urophylla) were spaced at 2.5 m and in between lines at 3.0 m. The following were evaluated: wood productivity; nutrient concentrations in leaves; fo... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Arthur Bernardes Cecílio Filho / Resumo: O manejo eficiente de nutrientes é crucial para atingir alta produtividade de frutos. Resultados da análise do tecido são comumente interpretados usando faixas críticas de concentração de nutrientes (CNCR) e Sistema Integrado de Diagnose e Recomendação (DRIS) em culturas de laranja. No entanto, ambos os métodos ignoram as propriedades inerentes à classe dos dados composicionais, não considerando adequadamente as interações de nutrientes e a influência varietal na composição nutricional da planta. Portanto, ferramentas eficazes de modelagem são necessárias para corrigir vieses e incorporar efeitos genéticos na avaliação do estado nutricional. O objetivo deste estudo foi desenvolver uma abordagem diagnóstica precisa para avaliar o estado nutricional de variedades de copa de laranjeira (Citrus sinensis), usando a análise composicional dos dados e algoritmos de inteligência artificial. Foram coletadas 716 amostras foliares de ramos frutíferos em pomares comerciais de laranjeiras não irrigadas (“Valência”, “Hamlin”, “Pera”, “Natal”, “Valencia Americana” e “Westin”) distribuídos pelo estado de São Paulo (Brasil), analisadas as concentrações de N, S, P, K, Ca, Mg, B, Cu, Zn, Mn e Fe, e avaliadas as produções de frutos. Balanços de nutrientes foram computados como relações-log isométricas (ilr). Análises discriminantes dos valores de ilr diferenciaram os perfis de nutrientes das variedades de copa, indicando composições nutricionais específicas. A acurácia diagnóstica dos balanços de... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Efficient nutrient management is crucial to attain high fruit productivity. Results of tissue analysis are commonly interpreted using critical nutrient concentration ranges (CNCR) and Diagnosis and Recommendation Integrated System (DRIS) on orange crops. Nevertheless, both methods ignore the inherent properties of compositional data class, not accounting adequately for nutrient interactions and varietal influence on plant ionome. Therefore, effective modeling tools are needed to rectify biases and incorporate genetic effects on nutrient composition. The objective of this study was to develop an accurate diagnostic approach to evaluate the nutritional status across orange (Citrus sinensis) canopy varieties using compositional data analysis and machine learning algorithms. We collected 716 foliar samples from fruit-bearing shoots in plots of non-irrigated commercial orange orchards (“Valencia”, “Hamlin”, “Pera”, “Natal”, “Valencia Americana” and “Westin”) distributed across São Paulo state (Brazil), analyzed N, S, P, K, Ca, Mg, B, Cu, Zn, Mn and Fe, and measured fruit yields. Sound nutrient balances were computed as isometric log-ratios (ilr). Discriminant analysis of ilr values differentiated the nutrient profiles of canopy varieties, indicating plant-specific ionomes. Diagnostic accuracy of nutrient balances reached 88% about cutoff yield of 60 Mg ha-1 using ilrs and a k-nearest neighbors classification, allowing the development of reliable nutritional standards at high fruit... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Danilo Ricardo Yamane (danilo_yamane@yahoo.com.br) on 2019-01-28T17:15:40Z No. of bitstreams: 1 Tese Yamane (2018).pdf: 2814108 bytes, checksum: f2e102e5809427e8d3d26d0a59971542 (MD5) / Approved for entry into archive by Tatiana Camila Gricio (tatiana.gricio@unesp.br) on 2019-01-28T17:32:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 yamane_dr_dr_jabo.pdf: 2814108 bytes, checksum: f2e102e5809427e8d3d26d0a59971542 (MD5) / Made available in DSpace on 2019-01-28T17:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 yamane_dr_dr_jabo.pdf: 2814108 bytes, checksum: f2e102e5809427e8d3d26d0a59971542 (MD5) Previous issue date: 2018-11-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O manejo eficiente de nutrientes é crucial para atingir alta produtividade de frutos. Resultados da análise do tecido são comumente interpretados usando faixas críticas de concentração de nutrientes (CNCR) e Sistema Integrado de Diagnose e Recomendação (DRIS) em culturas de laranja. No entanto, ambos os métodos ignoram as propriedades inerentes à classe dos dados composicionais, não considerando adequadamente as interações de nutrientes e a influência varietal na composição nutricional da planta. Portanto, ferramentas eficazes de modelagem são necessárias para corrigir vieses e incorporar efeitos genéticos na avaliação do estado nutricional. O objetivo deste estudo foi desenvolver uma abordagem diagnóstica precisa para avaliar o estado nutricional de variedades de copa de laranjeira (Citrus sinensis), usando a análise composicional dos dados e algoritmos de inteligência artificial. Foram coletadas 716 amostras foliares de ramos frutíferos em pomares comerciais de laranjeiras não irrigadas (“Valência”, “Hamlin”, “Pera”, “Natal”, “Valencia Americana” e “Westin”) distribuídos pelo estado de São Paulo (Brasil), analisadas as concentrações de N, S, P, K, Ca, Mg, B, Cu, Zn, Mn e Fe, e avaliadas as produções de frutos. Balanços de nutrientes foram computados como relações-log isométricas (ilr). Análises discriminantes dos valores de ilr diferenciaram os perfis de nutrientes das variedades de copa, indicando composições nutricionais específicas. A acurácia diagnóstica dos balanços de nutrientes atingiu 88% com a produtividade de corte correspondente a 60 t ha-1, utilizando-se ilrs e o algoritmo de classificação knn, o que possibilitou o desenvolvimento de padrões nutricionais confiáveis para a obtenção de elevado nível de produtividade de frutos. Os citricultores do estado de São Paulo devem adotar o conceito de balanços de nutrientes, onde grupos de nutrientes estão equilibrados de maneira ideal. Fornecer mais Ca através de calcário ou gesso, reduzir as aplicações de fertilizantes P e K, e aumentar a fertilização de B via solo pode reequilibrar os balanços [Mg | Ca], [Ca, Mg | K], [P | N, S], [K, Ca, Mg | N, S, P] e [B | N, S, P, K, Ca, Mg] em pomares de laranjas com produtividade inferior a 60 t ha-1. O software “CND-Citros” pode auxiliar os citricultores, engenheiros agrônomos e técnicos a diagnosticar o estado nutricional das lavouras de laranja com base no método proposto, utilizando os resultados da análise química das folhas. / Efficient nutrient management is crucial to attain high fruit productivity. Results of tissue analysis are commonly interpreted using critical nutrient concentration ranges (CNCR) and Diagnosis and Recommendation Integrated System (DRIS) on orange crops. Nevertheless, both methods ignore the inherent properties of compositional data class, not accounting adequately for nutrient interactions and varietal influence on plant ionome. Therefore, effective modeling tools are needed to rectify biases and incorporate genetic effects on nutrient composition. The objective of this study was to develop an accurate diagnostic approach to evaluate the nutritional status across orange (Citrus sinensis) canopy varieties using compositional data analysis and machine learning algorithms. We collected 716 foliar samples from fruit-bearing shoots in plots of non-irrigated commercial orange orchards (“Valencia”, “Hamlin”, “Pera”, “Natal”, “Valencia Americana” and “Westin”) distributed across São Paulo state (Brazil), analyzed N, S, P, K, Ca, Mg, B, Cu, Zn, Mn and Fe, and measured fruit yields. Sound nutrient balances were computed as isometric log-ratios (ilr). Discriminant analysis of ilr values differentiated the nutrient profiles of canopy varieties, indicating plant-specific ionomes. Diagnostic accuracy of nutrient balances reached 88% about cutoff yield of 60 Mg ha-1 using ilrs and a k-nearest neighbors classification, allowing the development of reliable nutritional standards at high fruit yield level. Citrus growers from São Paulo state should adopt the concept of yield-limiting nutrient balances, where groups of nutrients are optimally balanced. Supplying more Ca as lime or gypsum materials, reducing the P and K fertilizer applications and enhancing soil B fertilization could re-establish the [Mg | Ca], [Ca, Mg | K], [P | N, S], [K, Ca, Mg | N, S, P] and [B | N, S, P, K, Ca, Mg] balances in orange orchards yielding less than 60 Mg ha-1. The software “CND-Citros” can assist citrus growers, agronomy engineers and technicians to diagnose the nutrient status of orange crops based on the proposed method, using the results of leaf chemical analysis.