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Spectrométrie de masse de biomolécules par photoionisation à pression atmosphérique / Mass spectrometry of biomolecules by atmospheric pressure photoionization

Allegrand, Julie 11 July 2012 (has links)
La photoionisation à pression atmosphérique (APPI) permet d’analyser des biomolécules hydrophobes donc difficilement observables avec les sources d’ions connues comme l’électro-nébulisation (ESI) ou la désorption-ionisation laser assistée par matrice (MALDI). Elle permet d’étudier les interactions d’un faisceau de photons irradiant dans l’ultraviolet grâce à un nébullisat, à pression atmosphérique, contenant un mélange de molécules. Elle génère de nombreuses fragmentations et permet d’obtenir d’emblée sans expérience MS/MS supplémentaire des fragments non observables avec les autres techniques de fragmentation en source. Le but de ce travail a été d’étendre le champ d’application de l’APPI à des biomolécules plus ou moins polaires et d’approfondir l’élucidation des voies de fragmentations par la compréhension des mécanismes réactionnels mis en jeu. Les expériences faites à l’aide de la lampe au krypton ont permis d’obtenir des spectres riches de fragments divers voire même exotiques et caractéristiques d’une longueur d’onde fixée à 10,0 eV et minoritairement à 10,6 eV. L’utilisation du rayonnement synchrotron a donné l’avantage d’ajouter une dimension supplémentaire à ces spectres APPI-MS qui est la variation de longueur d’onde (4-20 eV ou 300-60 nm). Ce nouveau paramètre apporte des informations complémentaires grâce à l’étude de l’évolution des réactions mises en jeu selon les longueurs d’ondes choisies. L’étude des mécanismes APPI a donc mené à la mise en évidence de réactions mettant en jeu des électrons ou menant à des ions fragments radicalaires provenant de réactions jamais observées auparavant avec les sources d’ions connues. L’utilisation combinée de la source APPI et du rayonnement synchrotron est un outil très efficace pour la caractérisation de nouvelles molécules grâce à cette grande variation de longueur d’ondes possible apportant même des informations supplémentaires à celles obtenues avec la lampe au krypton à même longueur d’onde. / Atmospheric Pressure Photionisation (APPI) allows for the analysis of hydrophobic biomolecules which are unobservable with the common ionization techniques as electrospray ionization (ESI) or the matrix assisted laser desorption ionization (MALDI). This allows for the study of the interactions between a photon beam irradiating in the VUV thanks to a nebulisate and a mixture of molecules at atmospheric pressure. It generates numerous fragment ions, many of which are unobservable with the other in-source fragmentation techniques, and immediately provides structural information with no supplementary MS/MS experiment. The goal of this work was to spread the application of APPI to more or even less polar biomolecules and to elucidate their fragmentation pathways through a deepened understanding of reaction mechanisms involved. The experiments utilized a krypton lamp which provided rich mass spectra of various and even exotic fragment ions and characteristics of a wavelength fixed mainly at 10.0 eV and in a smaller proportion at 10.6 eV. The use of synchrotron radiation gave the advantage of adding a supplementary dimension to these APPI-MS spectra which is the wavelength variation (4-20 eV or 300-60 nm). This new parameter brings complementary information coming from the reactions never seen before with the known ion sources. The combined use of APPI source and synchrotron radiation is a very effective tool for the characterization of new molecules thanks to the large possibility of wavelength variation providing supplementary information to that obtained with the krypton lamp at the same wavelength.
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Effets quantitatifs et qualitatifs de la lumière sur la croissance des microalgues en culture dense et sur leur production de molécules d'intérêt : vers l’optimisation des procédés de production de microalgues / Quantitative and qualitative effects of light on the growth of microalgae in dense cultures and on the production of molecules of interest

Combe, Charlotte 09 May 2016 (has links)
Les microalgues constituent une source prometteuse de biocarburants dits de troisième génération. L'intérêt de ces micro-organismes photosynthétiques réside également dans l'étendue de la palette de molécules qu'elles peuvent produire, telles que les protéines, les pigments ou encore les vitamines. Néanmoins, des progrès sont encore nécessaires pour diminuer les coûts économiques et environnementaux des procédés de culture et assurer ainsi la viabilité de la filière. En particulier, mieux comprendre l'effet de la lumière sur la productivité des cultures denses est une étape essentielle pour optimiser ces procédés. L'objectif de cette thèse est d'étudier les effets quantitatifs et qualitatifs de la lumière sur la croissance et les mécanismes d'acclimatation de deux espèces de microalgues à fort intérêt biotechnologique, Dunaliella salina et Tisochrysis lutea. La première partie de cette thèse examine la réponse de Dunaliella salina à des variations rapides de la lumière, reproduisant les fluctuations de l'éclairement typiquement perçues par les cellules microalgales brassées au sein des systèmes de cultures industriels à haute densité de type raceway. Dans la seconde partie, nous avons analysé la réponse de Dunaliella salina et Tisochrysis lutea à différentes compositions du spectre lumineux. L'approche à la fois expérimentale et théorique nous a permis d'identifier les effets d'une lumière colorée sur la productivité et la composition pigmentaire des microalgues. Nos résultats offrent des perspectives encourageantes et des pistes concrètes permettant d'optimiser l'utilisation de la lumière pour produire des microalgues et d'améliorer le bilan énergétique de ces procédés. / Microalgae are a promising source of third generation biofuels. The interest on these photosynthetic microorganisms also lies within the extent of the spectrum of molecules that they can produce, such as proteins, pigments, and vitamins. Nevertheless, further progress is still necessary to reduce the economic and environmental costs of cultivation processes and to ensure the viability of this sector. In particular, better understanding of the effect of light on the productivity of dense cultures is an essential step to optimize these processes. The aim of this thesis is to study the quantitative and qualitative effects of light on growth and acclimation mechanisms of two species of microalgae with high biotechnological interest ; Dunaliella salina and Tisochrysis lutea. The first part of this thesis examines the response of Dunaliella salina to rapid light changes, by reproducing irradiance fluctuations typically experienced by microalgal cells in a highly turbid suspension in raceway ponds. In the second part, we analyzed the response of Dunaliella salina and Tisochrysis lutea to different light spectra. Our experimental and theoretical approach allowed us to identify the effect of colored light on productivity and pigment composition of microalgae. Furthermore, our results offer encouraging prospects for elevate understanding and use of light and improve the energy performance of these processes.
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Le Développement en Série de Peano du Matricant Pour l'Etude de la Propagation des Ondes Elastiques en Milieux à Propriétés Continûment Variables

Baron, Cécile 07 October 2005 (has links) (PDF)
Les milieux à propriétés continûment variables selon une direction particulière de l'espace intéressent les géophysiciens depuis plus de cinquante ans. La croûte terrestre, les océans, l'atmosphère sont des milieux naturels continûment hétérogènes. Mais on rencontre également ce type de configuration, variation continue des propriétés caractéristiques de matériaux, pour de nombreux produits industriels. Le contrôle et l'évaluation de ces matériaux représentent donc un enjeu important.<br />Le schéma classique de résolution des équations d'ondes en milieux à hétérogénéité unidirectionnelle repose sur un modèle multicouche, la stratification du milieu étudié pouvant être naturelle, les propriétés sont des fonctions constantes par morceaux, ou artificielle, les propriétés sont des fonctions continues que l'on discrétise. Cette approche est alors connue sous le nom de méthode de Thomson-Haskell. Dans le cas des milieux continûment variables, on calcule une solution exacte à un problème approché ce qui suscite de nombreuses interrogations quant à la précision et à la validité des solutions obtenues.<br />Dans ce travail, le problème est abordé sous un angle différent offrant ainsi de nouvelles perspectives d'approche des milieux hétérogènes. Afin de conserver l'authenticité du problème, nous proposons d'utiliser une méthode basée sur le développement en série de Peano du matricant, forme explicite de la solution analytique exacte des équations d'onde mises sous la forme d'un système différentiel ordinaire du premier ordre à coefficients non constants, pour des profils quelconques de propriétés. Les développements asymptotiques et numériques de cette écriture appliquée à des problèmes de conditions aux limites ont fourni une méthode robuste pour l'analyse des phénomènes acoustiques (courbes de dispersion, spectre fréquentiel du coefficient de réflexion etc.). Des résultats prometteurs quant à la détection du caractère hétérogène et à la quantification de certains paramètres caractéristiques de l'hétérogénéité ont été obtenus.
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Algorithmique et optimisation dans les réseaux de télécommunications

Coudert, David 05 March 2010 (has links) (PDF)
Le contexte général de mes travaux se situe dans les réseaux orientés connexions, que ce soit des réseaux optiques à multiplexage en longueur d'onde (WDM), des réseaux MPLS (multi-protocol label switching), ou encore des réseaux à faisceaux hertziens (wireless backhaul networks). Dans ces réseaux, je m'intéresse à router les flux d'information, à agréger des flux d'information bas débits dans des flux de plus hauts débits, à faire évoluer le routage en cas de variations dans la quantité de trafic à transporter ou dans la topologie du réseau, et à assurer la continuité du trafic en cas de panne simple ou multiple. Pour aborder ces questions, j'utilise des outils variés de l'algorithmique, de la théorie des graphes et de l'optimisation combinatoire.<br /> L'ensemble des résultats présentés dans ce document est le fruit de travaux collaboratifs avec les membres de l'équipe-projet MASCOTTE, des collègues d'autres universités, française ou étrangères, et des collègues de France Télécom, Alcatel-Lucent et 3Roam. L'introduction de ce manuscrit résume nos travaux sur le routage, le groupage de trafic, la tolérance aux pannes et la reconfiguration, ainsi que des travaux plus récents sur la minimisation du nombre d'étiquettes dans les réseaux MPLS, le dimensionnement de réseaux de collecte IP sans fil, et sur le routage disjoints d'ensembles particuliers de requêtes. Ensuite, je détaille nos travaux sur le groupage de trafic au travers d'un état de l'art dans le chapitre 3, nos contributions sur la notion de groupes de ressources partageant un risque dans le chapitre 4, et sur la reconfiguration de routages dans le chapitre 5. Le chapitre 6 conclut ce manuscrit en présentant avec quelques directions de recherches.

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