Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biociências, Departamento de Fitopatologia, 2012. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-05-29T14:28:50Z No. of bitstreams: 1 2012_MarianaMartinsSeveroAlmeida_Parcial.pdf: 945374 bytes, checksum: f043ad10704b6537a7c84b10ae738f0a (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-05-30T13:41:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_MarianaMartinsSeveroAlmeida_Parcial.pdf: 945374 bytes, checksum: f043ad10704b6537a7c84b10ae738f0a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-30T13:41:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_MarianaMartinsSeveroAlmeida_Parcial.pdf: 945374 bytes, checksum: f043ad10704b6537a7c84b10ae738f0a (MD5) / No Brasil, plantas pertencentes à família Malvaceae estão amplamente distribuídas em todo país, como plantas cultivadas, ornamentais, daninhas ou espécies selvagens. É comum observar claros sintomas de mosaico em plantas daninhas da família Malvaceae e, invariavelmente, elas são infectadas por begomovírus, no entanto, é raro observar sintomas semelhantes de vírus em plantas malváceas ornamentais e cultivadas. Neste trabalho foi realizado um estudo sobre a presença de infecção por begomovírus bipartidos em três espécies da família Malvaceae: malva-preta (Sidastrum micranthum), algodão (Gossypium hirsutum) e chapéu-de-turco ou hibisco-colibri (Malvaviscus arboreus). Nove plantas de algodoeiro apresentando sintoma de mosaico amarelo foram coletadas em casa de vegetação da Embrapa Algodão em Campina Grande, Paraíba, seis plantas de hibisco-colibri foram coletadas em um jardim no centro da cidade do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, com forte sintoma de clorose nas folhas e apenas uma amostra de malva-preta foi coletada no Jardim Zoológico Sgt. Sílvio Delmar Hollemback, Brasília, Distrito Federal, com sintoma de mosaico dourado típico de begomovirose. As sequências dos genomas destes begomovírus foi determinada (DNA-A e DNA-B, 2629 2711 nucleotídeos de comprimento) após clonagem dos produtos amplificados via círculo rolante de cada amostra de DNA. As sequências nucleotídicas dos clones de DNA-A dos isolados tiveram identidade de 62% entre si e para os clones de DNA-B dos isolados as sequências nucleotídicas foram 62% a 70% idênticas entre si, sugerindo que distintos begomovírus estavam presentes nessas amostras. Não foi encontrado o componente de DNA-A na amostra de malva-preta e a sequência do componente de DNA-B compartilhou 69% de identidade nucleotídica com Sida micrantha mosaic virus (SiMMV) sugerindo a presença de uma nova espécie de begomovírus. Das amostras de algodão, a sequência de DNA-A apresentou identidade máxima de 78% com Tomato common mosaic virus (ToCMV) e o DNA-B compartilhou 64% de identidade genômica com Cabbage leaf curl virus (CabLCV) e Rhyncosia rugose golden mosaic virus (RhRGMV). Finalmente, da planta ornamental hibisco-colibri foi isolado uma sequência de DNA-A com 78% de identidade com Abutilon mosaic Bolivia virus (AbMBoV) e uma sequência de DNA-B com 74% de identidade também com Abutilon mosaic Bolivia virus (AbMBoV). Ficou claro que novas espécies de begomovírus estão ocorrendo em plantas daninhas, cultivadas e ornamentais da família Malvaceae no Brasil, podendo causar epidemias futuras no país e em países vizinhos. Uma análise detalhada foi realizada com estas sequências, algumas das quais não possuem características tipicamente encontradas nos geminivírus, tais como o motivo nonanucleotídeo conservado TAATATTAC. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / In Brazil, malvaceous plants are widely spread throughout the country, as cultivated plants, ornamental plants and weeds or wild species. It is common to see clear mosaic symptoms on weeds in the Malvaceae family and invariably they are infected by begomoviruses, however, it is rare to observe virus-like symptoms on cultivated and ornamental malvaceous plants. In this work was made a study on the presence of bipartide begomovirus infection in three malvaceous species: dainty sand mellow (Sidastrum micranthum), cotton (Gossypium hirsutum) and turkcap (Malvaviscus arboreus). Nine cotton plants showing yellow mosaic symptoms were collected in a greenhouse at Embrapa Cotton in Campina Grande, Paraíba, six turkcap plants were collected in a garden in the center of Rio de Janeiro city, Rio de Janeiro, with strong symptoms of chlorosis in the leaves and only one sample of dainty sand mellow was collected at the Zoo Sgt. Sílvio Delmar Hollemback, Brasília, Distrito Federal, with golden mosaic symptoms typical of begomoviruses. The genome sequence of these begomovirus was determined (DNA-A and DNA-B, 2629 to 2711 nucleotide-long) after cloning of rolling circle amplified products of each DNA sample. The nucleotide sequence of clones of the DNA-A isolates had 62% identity to each other and to the clones of DNA-B isolates the nucleotide sequence were 62% to 70% identical to each other, suggesting that distinct begomovirus were present on these samples. From dainty sand mellow plant, a DNA-A component was not found and a DNA-B component sequence with 69% nucleotide identity to Sida micrantha mosaic virus (SiMMV) was found, suggesting the presence of a new begomovirus species. From cotton plants, a DNA-A sequence sharing the maximum nucleotide identity of 78% with Tomato common mosaic virus (ToCMV) and a DNA-B sequence sharing 64% identity with Cabbage leaf curl virus (CabLCV) and Rhyncosia rugose golden mosaic virus (RhRGMV) were found. Finally, from ornamental plant turkcap, the DNA-A sequence was 78% identical to Abutilon mosaic Bolivia virus (AbMBoV) and the DNA-B 74% to Abutilon mosaic Bolivia virus (AbMBoV). It was clear that new begomovirus species are occurring on weed, cultivated and ornamental malvaceous plants in Brazil, and may cause future epidemics in the country and surrounding countries. A detailed analysis was carried on with these sequences, some of them lacking some particular characteristics commonly found on geminiviruses, such as the conserved nonanucleotide motif TAATATTAC.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-10-26T15:43:00Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jones Gomes Bentes.pdf: 3596865 bytes, checksum: 654b699ea9e7bd81b0c077dc28c81f2c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-10-26T18:38:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jones Gomes Bentes.pdf: 3596865 bytes, checksum: 654b699ea9e7bd81b0c077dc28c81f2c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-10-26T18:41:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jones Gomes Bentes.pdf: 3596865 bytes, checksum: 654b699ea9e7bd81b0c077dc28c81f2c (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-26T18:41:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jones Gomes Bentes.pdf: 3596865 bytes, checksum: 654b699ea9e7bd81b0c077dc28c81f2c (MD5) Previous issue date: 2015-01-28 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Malva (Urena lobata L.) is currently the main species used for natural fiber production in the Amazonas State. However, seed supply remains a strategic and critical issue to the production chain of the fiber. Due to total lack of local production of seeds, Amazonas fiber producers depend on acquisition by the state govern of about 100 tons of seeds produced in other regions, each year. Thus become necessary studies to determine technical recommendations for the implementation of seed production systems adapted to local conditions, for the state to become self-sufficient in the supply of this raw material. This study aimed to evaluate the effect of different spacing on productivity of Malva plants for seed production. The experiment was conducted at the Experimental Farm of Federal University of Amazonas – UFAM, in Manaus. The experimental design was completely randomized with three treatments corresponding to the spacing of (T1) 1.0 x 1.0m, (T2) 1.5 x 0.5m (T3) 1.0 x 0.5 m with 10 repetitions, each repetition corresponding to the average of four plants. The following characteristics were evaluated: plant height, stem diameter, number of branches, number of flowers, number of green fruits and number of ripe fruit, the seed production and dry weight of plants. The results were submitted to analysis of variance by F test at 5% probability. For the phenological parameters, 1,5 x 0,5 was higher in stem diameter, fresh fruits and ripe fruit. The treatments 1,5 x 0,5 was also statistically superior for the variable of production of seed. It was concluded that for the establishment of U. lobata L. seed production systems in Amazonas, it is recommended to use 1.5 x 0.5m spacing, in which can be obtained about 1,700 kg of seed per hectare. / A Malva (Urena lobata L.) é atualmente a principal espécie utilizada para a produção de fibra natural no Estado do Amazonas. No entanto, o fornecimento de sementes continua a ser uma questão estratégica e fundamental para a cadeia de produção da fibra. Devido à falta total de produção local de sementes, produtores de fibras Amazonas dependem aquisição pelo governo estadual de cerca de 100 toneladas de sementes produzidas em outras regiões, a cada ano. Assim, tornam-se necessários estudos para determinar as recomendações técnicas para a implantação de sistemas de produção de sementes adaptadas às condições locais, para que o Estado se torne autossuficiente no abastecimento desse insumo. Este estudo teve como objetivo avaliar o efeito de diferentes espaçamentos na produtividade das plantas de Malva para produção de sementes. O experimento foi realizado na Fazenda Experimental da Universidade Federal do Amazonas - UFAM, em Manaus. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com três tratamentos que correspondem aos espaçamentos de (T1) 1,0 x 1,0 m, (T2) 1,5 x 0,5m (T3) 1,0 x 0,5 m, com 10 repetições, cada repetição correspondendo à média de quatro plantas. As características avaliadas foram: altura da planta, diâmetro do caule, número de ramos, número de flores, número de frutos verdes e número de frutos maduros, a produção de sementes e peso seco das plantas. Os resultados foram submetidos à análise de variância pelo teste F a 5% de probabilidade. Para os parâmetros fenológicos, o tratamento 1,5 x 0,5 se desenvolveu mais em diâmetro do caule, frutas frescas e frutas maduras. O espaçamento 1,5 x 0,5 também foi estatisticamente superior para a variável da produção de sementes. Concluiu-se que, para o estabelecimento de sistemas de produção de sementes de U. lobata L. no Amazonas, recomenda-se a utilização de 1,5 x 0,5 m de espaçamento, em que pode ser obtido cerca de 1.700 kg de sementes por hectare.