Los Thraustochytriales o mejor conocidos como thraustochitridos son protistas pertenecientes al Grupo Chromista según los análisis del gen 18S rRNA. Considerados como una potencial fuente alternativa al aceite de pescado, estos microorganismos oleaginosos han sido aislados de diversos ambientes a nivel mundial encontrándose principalmente asociados a material vegetal en descomposición. Así, en este estudio se logró aislar cepas de thraustochitridos provenientes de todos los puntos muestreados en los manglares de Tumbes donde la caracterización bioquímica con acriflavina y rojo de nilo confirmaron su ocurrencia y los resultados de caracterización molecular permitieron determinar aislados pertenecientes a los géneros Aurantiochytrium (basónimo: Shizochytrium), Parietichytrium, Botryochytrium e Ulkenia sensu stricto. Asimismo se propone el posible descubrimiento de dos nuevas especies con potenciales biotecnológicos en base a información proporcionada de las características observadas en cultivo, de los análisis filogenéticos y de trabajos previos relacionadas a las cepas Aurantiochytrium sp. 15A-14a (Genbank Accesion N° AB811008) y Schizochytrium sp. S8 (Genbank Accesion N° DQ836630), los cuales dieron el mayor hit con los aislados 75, 507, 510, 512, 523, 526, 527 y C1, respectivamente. Finalmente, el presente estudio brindó los primeros reportes de la presencia de estos thraustochitridos en nuestro país.

Nuestro país adoptó la acuicultura para generar empleo, crecimiento económico y seguridad alimentaria para las poblaciones locales. Lamentablemente, la promoción estatal no consideró todos los elementos adecuados que eviten la afectación a la fragilidad de los ecosistemas de manglar. Por estas razones, estaría incrementando la vulnerabilidad de los ecosistemas de manglar. Esta tesis se propone como objetivo principal evaluar si se afecta o no el ecosistema de manglar del Santuario Nacional Los Manglares de Tumbes (SNLMT) al no contar con límites máximos permisibles en la industria langostinera y proponer una medida de control ambiental. La metodología utilizada ha sido la triangulación de información, realizándose un muestreo de fitoplancton cuantitativo en 11 puntos, ubicados en la frontera de los centros de producción acuícola y el área natural protegida SNLMT, entrevistas a funcionarios de los sectores involucrados y revisión de línea base (fitoplancton) de Estudios de Impactos Ambientales de las empresas langostineras. Los resultados del muestreo señalan la presencia de Skeletonema costatum en los puntos de muestreo F-02, F-04, F-06, F-09 y F-11, evidencia eventos de floraciones algales, agotamiento del fosforo en el medio y la potencial afectación al ecosistema de manglar; los niveles de población fitoplanctónica son hasta 26.8 veces más en el efluente que la del afluente; las entrevistas fueron sometidas a las pruebas de chi-cuadrado de Pearson, teniendo una significación asintótica de 0.004 a 0.038 y que la industria langostinera no afecta a la cantidad del recurso hídrico, pero si en la calidad, desde esa perspectiva es consuntiva. Esto concluye en la afirmación que la falta de LMP en los vertimientos de langostinos estaría afectando al cuerpo receptor, siendo los esteros que conforman el SNLMT, y con ello, vulnerando la fragilidad del ecosistema de manglar. / Our country adopted aquaculture to generate employment, economic growth and food security for local populations. Unfortunately, the state promotion did not consider all the appropriate elements that avoid affecting the fragility of mangrove ecosystems. For these reasons, it would be increasing the vulnerability of mangrove ecosystems. The main objective of this thesis is to evaluate whether or not the mangrove ecosystem of the Santuario Nacional Los Manglares de Tumbes (SNLMT) is affected by not having maximum permissible limits in the shrimp industry and to propose an environmental control measure. The methodology used has been the triangulation of information, carrying out a quantitative phytoplankton sampling at 11 points, located on the border of the aquaculture production centers and the SNLMT protected natural area, interviews with officials from the sectors involved and baseline review (phytoplankton) of Environmental Impact Studies of the shrimp companies. The sampling results indicate the presence of Skeletonema costatum at the sampling points F-02, F-04, F-06, F-09 and F-11, evidence of algae bloom events, phosphorus depletion in the environment and the potential affectation to the mangrove ecosystem; phytoplankton population levels are up to 26.8 times higher in the effluent than in the influent; the interviews were subjected to Pearson's chi-square tests, having an asymptotic significance of 0.004 to 0.038 and that the shrimp industry does not affect the quantity of the water resource, but does affect the quality, from this perspective it is consumptive. This concludes in the affirmation that the lack of LMP in shrimp discharges would be affecting the receiving body, being the estuaries that make up the SNLMT, and with it, violating the fragility of the mangrove ecosystem.