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Estudos moleculares populacionais com o complexo específico Encholirium spectabile Mart. ex Schult. f. em ‘inselbergs’ do Nordeste BrasileiroOLIVEIRA, Rodrigo César Gonçalves de 27 February 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-02-27 / A família Bromeliaceae é uma das mais diversificadas no território brasileiro e conta com cerca de 1.200 espécies das quais 1.024 são endêmicas. Esses vegetais apresentam muitas associações ecológicas não observáveis em outros grupos de plantas, como a ocorrência de tanques na base de suas rosetas e a polinização primariamente por beija-flores ou morcegos. Encholirium spectabile Mart. Ex Schult. f. é uma bromélia que apresenta uma correlação direta com afloramentos rochosos do Nordeste Brasileiro. Esta espécie possui uma grande plasticidade morfológica regional, sendo tratada como um complexo específico, fato que resultou na descrição incorreta de outros binômios relacionados, como E. pernambucanum L.B.Sm. & Read e E. hoehneanum L.B. Sm. Plantas estritamente rupícolas são tratadas como modelos para estudos de irradiação adaptativa, bem como para correlações entre a vegetação e mudanças climáticas ocorrentes no passado. Vários marcadores moleculares têm sido aplicados nesse sentido, entre eles marcadores do tipo Fingerprinting de DNA, incluindo marcadores DAF (DNA Amplification Fingerprinting, Impressão Genômica do DNA Amplificado) e ISSR (Inter Simple sequence Repeat; Repetição Entre Sequências Simples). Indivíduos de nove populações de E. spectabile foram coletados, sendo distribuídos de norte a sul do Nordeste brasileiro, com populações nos estados da Paraíba, Pernambuco, Bahia e Sergipe. Nesse estudo 99 loci polimórficos foram gerados. A amostragem apresentou heterozigosidade total de 0,3417, semelhante à reportada para outras espécies de Encholirium como E. subsecundum Mez. Dois grupos genéticos foram encontrados a partir de uma análise Bayesiana de agrupamentos (k=2) distribuídos regionalmente, resultado também evidenciado pelo agrupamento gerado pelo método de Neighbor-joining. A análise da estrutura genética mostrou que existem diferenças significativas entre as populações (Fst = 0,3781), porém pouca correlação entre distância genética e distância geográfica foi observada (r = 0,3578, p >= 0,033), não sendo assim considerada. O compartilhamento de diversidade verificado pelo teste de AMOVA mostrou que a maior parte da diversidade está presente dentro das populações, o que é esperado para vegetais com reprodução clonal. A irradiação da espécie deve ter ocorrido do sul para norte, com dispersão em um modelo de ilhas. Este estudo concluiu que apesar da grande variação morfológica existente nesse complexo específico, E. spectabile compreende uma única espécie, onde cada morfotipo deve ser considerado como uma unidade para conservação in situ.
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Análise da diversidade genética entre genótipos de Mamona (Ricinus communis Euphorbiaceae) através de Fingerprinting de DNA com marcadores AFLP e ISSRSelmo de Vasconcelos Júnior, Santelmo 31 January 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / A mamoneira (Ricinus communis L.) é uma das oleaginosas cultivadas mais
importantes em todo o planeta, e no Brasil, uma das principais aplicações para o
óleo de rícino é a produção de biodiesel. Apesar da grande importância da cultura
para o Nordeste brasileiro, pouco é conhecido a respeito da diversidade genética de
genótipos adaptados às condições ambientais encontradas na região. Com o intuito
de prover informações acerca dos níveis de diversidade genética de acessos de
mamona provenientes da Embrapa Algodão, perfis de fingerprinting de DNA foram
descritos utilizando marcadores AFLP e ISSR. A partir da amplificação de 749
marcas no total (496 de AFLP e 253 de ISSR), foi observado o total de 53,4% de
bandas polimórficas (44,4% para o AFLP e 71,1% para o ISSR). O AFLP apresentou
a média mais alta de fragmentos amplificados por combinação de primers (33,1) em
comparação com os primers únicos de ISSR (16,9). As médias obtidas para os
índices PIC e MI foram mais altas para os primers de ISSR. No entanto, a média
mais alta de RP foi observada para as combinações de primers de AFLP. Uma forte
correlação positiva foi observada entre os parâmetros calculados, indicando a
validade dos índices para a escolha de marcadores AFLP e ISSR informativos. Os
valores de dissimilaridade genética entre os acessos variaram de 0,104 a 0,312
(AFLP), de 0,156 a 0,454 (ISSR) e de 0,143 a 0,339 (AFLP+ISSR). Em relação à
análise fenética, os 27 genótipos analisados dividiram-se em cinco grupos principais,
os quais, no entanto, não apresentaram indícios de estruturação (Fst = 0,108), com
maior variação dentro dos grupos (89,2%) sendo muito superior em relação à
variação entre grupos (10,8%). Apesar dos indícios de baixa diversidade genética e
ausência de estruturação entre os acessos, a associação de marcas específicas a
determinados genótipos de mamona revelam o potencial da aplicação das
metodologias de fingerprinting de DNA para acessar a variabilidade existente na
espécie. Adicionalmente, a descrição de primers capazes de gerar várias marcas
polimórficas capazes de diferenciar genótipos fornece subsídios para o melhor
direcionamento de cruzamentos entre acessos com características de interesse
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