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Medição interativa por imagens de colônias de isolados do Corynespora cassiicola em placas de petri / Interactive measurement by images of isolated of Corynespora cassiicola colonies in petri dishesKai, Priscila Marques 11 July 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-07-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The use of chemicals as a form of prevention, protection and control to combat diseases that
affect plants, is a feasible solution involving control measures, that over the years, with the
improvement of these products, raise the effectiveness of such chemicals. However, due to the
emergence of microorganisms resistant to these products, new tests need to be performed in
the laboratory, requiring the effort of the specialist in phytopathology and to investigate these
microorganisms, with research of genetic analysis, resistance to chemical products, among
others. One of the methods used includes laboratory tests, periodically verifying the growth of
the fungal colony with measurements using a ruler or caliper. However, this method, although
it is most commonly used, is also imprecise, since measurements of the same plaque by
different professionals may result in different measurements. Due to this, the development of
a method that assists professionals in phytopathology, for measurement of fungal colony growth
in Petri dishes, provides other means of measurement besides the traditional use of visual
analysis by ruler or pachymeter. For this, processes were developed involving region
segmentation, unnecessary information removal and colony size calculation by color analysis.
The study was developed using images containing Petri dishes with growing fungus colonies,
comparing the manual method performed by the specialist in Phytopathology and the performed
by digital image processing. It was possible to verify the application and potential of the method
developed for creating mobile applications. Therefore, this work presents a method for
measuring fungal colony on Petri dishes from isolates of the fungus Corynespora cassiicola,
using techniques involving processing from images captured by mobile device, with the purpose
of assisting the professional, providing other means besides a manual process. / O uso de produtos químicos como forma de prevenção, proteção e controle para o combate a
doenças que afetam plantas, é uma solução factível envolvendo medidas de controle, que ao
passar dos anos, com o melhoramento desses produtos, elevam a efetividade de tais químicos.
No entanto, devido ao surgimento de microrganismos resistentes a esses produtos, novos testes
precisam ser realizados em laboratório, exigindo esforço do especialista em fitopatologia a fim
de investigar estes microrganismos, com pesquisas a partir da análise genética, resistência a
produtos químicos, dentre outros. Um dos métodos utilizados engloba testes laboratoriais,
verificando periodicamente o crescimento da colônia de fungos com medições com uso de régua
ou paquímetro. Entretanto, este método, apesar de ser o mais comumente utilizado, é também
impreciso, pois medições de uma mesma placa por profissionais diferentes podem resultar emmedidas distintas. Devido a isto, o desenvolvimento de um método que auxilie profissionais em
fitopatologia, para medição do crescimento da colônia de fungos em placas de Petri, fornece
outros meios de medição além do uso tradicional de análise visual por régua ou paquímetro.
Para isto, foram desenvolvidos processos de manipulação de imagens, envolvendo segmentação
de regiões, remoções de informações desnecessárias e o cálculo do tamanho da colônia por
análise de cores. O estudo foi desenvolvido com uso de imagens contendo placas de Petri com
colônias de fungo em crescimento, realizando comparações entre o método manual realizado
pelo especialista em Fitopatologia e o realizado pelo processamento digital de imagens. Foi
possível verificar a aplicação e potencial do método desenvolvido para criação de aplicações
para dispositivos móveis. Portanto, este trabalho apresenta um método para medição da colônia
de fungos em placas de Petri, de isolados do fungo Corynespora cassiicola, utilizando técnicas
envolvendo processamento a partir de imagens captadas por dispositivo móvel, com objetivo
de auxiliar o profissional, disponibilizando outros meios além do processo manual.
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