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Ευφυής διαχείριση ιατρικών δεδομένωνΣκαλκίδης, Ηλίας 28 September 2010 (has links)
Το πεδίο έρευνας της παρούσας διδακτορικής διατριβής είναι η ευφυής διαχείριση ιατρικών δεδομένων και πιο συγκεκριμένα ιατρικό βίντεο που επιτυγχάνεται κυρίως με την ενσωμάτωση κλινικών δεδομένων με τη χρήση ψηφιακής υδατογραφίας στο ιατρικό βίντεο. Η ψηφιακή υδατογραφία είναι το ερευνητικό πεδίο που ασχολείται με τη διαδικασία ενσωμάτωσης κρυφών πληροφοριών σε ένα σήμα. Η συγκεκριμένη ερευνητική εργασία επικεντρώνεται σε ένα μη ορατό και εύρωστο υδατογραφικό σχήμα για ιατρικό βίντεο. Μια συχνή απαίτηση για τα υδατογραφικά σχήματα είναι η ικανότητα τυφλής αποκωδικοποίησης, η αποκωδικοποίηση δηλαδή χωρίς το αρχικό σήμα. Στην ερευνητική εργασία σχεδιάστηκε και υλοποιήθηκε ένα υδατογραφικό σχήμα που σκοπό έχει τη χρήση του από ιατρικούς οργανισμούς για την προστασία των ιατρικών δεδομένων που παρέχουν τα ιατρικά βίντεο καθώς και την ευφυή διαχείριση των κλινικά χρήσιμων δεδομένων για διαγνωστικούς και εκπαιδευτικούς σκοπούς. Πιο συγκεκριμένα το σύστημα εφαρμόζει τρισδιάστατο μετασχηματισμό κυματιδίων σε ιατρικά βίντεο και ενσωματώνει πολλαπλά υδατογραφήματα, με διαφορετικές ανάγκες σε απαιτήσεις για ακεραιότητα και αδιορατότητα, χωρίς ωστόσο να αλλοιώνει τη διαγνωστική αξία των ιατρικών εξετάσεων. Καθώς η χρησιμότητα της εφαρμογής υδατογραφικών σχημάτων στις ιατρικές εικόνες είναι διεθνώς αναγνωρισμένη, ενώ αντίθετα δεν έχει γίνει μέχρι στιγμής καμία προσέγγιση για ιατρικά βίντεο, η παρούσα ερευνητική εργασία αποτελεί μια καινοτόμα προσέγγιση στην εισαγωγή υδατογραφίας και στα ιατρικά βίντεο, η οποία παράλληλα διαχειρίζεται ευφυώς τις κλινικές διαγνώσεις που προκύπτουν από αυτά. / The research field of this Ph.D thesis is the intelligent management of medical data, and more specifically medical video which is achieved based on the embedding of clinical data through the use of digital watermarking, on the medical video. Digital watermarking is the research field that uses a process to embed hidden information into a signal. The Ph.D thesis focuses on a non visible and robust watermarking scheme for medical videos. A common requirement of watermarking schemes is the ability to blindly decode a message without the use of the original signal. On the current work, a watermarking scheme was designed and implemented aiming to be used by medical organizations to protect medical data and to intelligent manage clinical useful data for diagnostic and educational purposes. In particular the system performs a three dimensional discrete wavelet transform into medical videos and embeds multiple watermarks with different requirements for integrity and imperceptibility without degradation of the diagnostic value of the medical examinations. The use of watermarking schemes on medical images is well established by the international literature. The use of a watermarking scheme for medical videos has not been achieved until today. The present scientific works proposes an innovative approach for medical video watermarking, that intelligently manages at the same time clinical diagnosis from the examinations.
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Recuperação de vídeos médicos baseada em conteúdo utilizando extratores de características visuais e sonoras / Content-based medical video retrieval using visual and sound feature extractorsGonçalves, Vagner Mendonça 12 December 2016 (has links)
A evolução dos dispositivos de armazenamento e das redes de computadores permitiram que os vídeos digitais assumissem um importante papel no desenvolvimento de sistemas de informação multimídia. Com a finalidade de aproveitar todo o potencial dos vídeos digitais no desenvolvimento desses sistemas, técnicas automatizadas eficientes para análise, interpretação e recuperação são necessárias. A recuperação de vídeos baseada em conteúdo (CBVR, do inglês content-based video retrieval) permite o processamento e a análise do conteúdo de vídeos digitais visando à extração de informações relevantes que viabilizem indexação e recuperação. Trabalhos científicos têm proposto a aplicação de CBVR em bases de vídeos médicos a fim de proporcionar diferentes contribuições como diagnóstico auxiliado por computador, suporte à tomada de decisão e disponibilização de bases de vídeos para utilização em treinamento e educação médica. Em geral, características visuais são as principais informações utilizadas no contexto de CBVR aplicada em vídeos médicos. No entanto, muitos diagnósticos são realizados por meio da análise dos sons produzidos em diferentes estruturas e órgãos do corpo humano. Um exemplo é o diagnóstico cardíaco que, além de exames de imagem como ecocardiografia e ressonância magnética, também pode empregar a análise dos sons provenientes do coração por meio da auscultação. O objetivo deste trabalho consistiu em aplicar e avaliar extratores de características de som em conjunto com extratores de características visuais para viabilizar CBVR e, então, inferir se a abordagem resultou em ganhos com relação ao desempenho de recuperação quando comparada à utilização apenas das características visuais. Vídeos médicos constituíram nosso principal interesse, porém o trabalho considerou também vídeos não relacionados à área médica para a validação da abordagem. Justifica-se o objetivo, pois a análise do som, visando a obter descritores relevantes para melhorar os resultados de recuperação, ainda é pouco explorada na literatura científica. Essa afirmação foi evidenciada com a condução de uma revisão sistemática sobre o tema. Dois conjuntos de experimentos foram conduzidos visando a validar a abordagem de CBVR mencionada. O primeiro conjunto de experimentos foi aplicado sobre uma base de vídeos sintetizados para validação da abordagem. Já o segundo, foi aplicado em uma base de vídeos construídos utilizando-se imagens provenientes de exames de ressonância magnética em conjunto com sons provenientes de auscultação do coração. Os resultados foram analisados utilizando-se as métricas de revocação e precisão, bem como o gráfico que as relaciona. Demonstrou-se que a abordagem é promissora por meio da melhora significativa dos resultados de recuperação nos diferentes cenários de combinação entre características visuais e sonoras experimentados / Advance of storage devices and computer networks has contributed to digital videos assume an important role in the development of multimedia information systems. In order to take advantage of the full potential of digital videos in the development of these systems, it is necessary the development of efficient techniques for automated data analysis, interpretation and retrieval. Content-based video retrieval (CBVR) allows processing and analysis of content in digital videos to extract relevant information and enable indexing and retrieval. Scientific studies have proposed the application of CBVR in medical video databases in order to provide different contributions like computer-aided diagnosis, decision-making support or availability of video databases for use in medical training and education. In general, visual characteristics are the main information used in the context of CBVR applied in medical videos. However, many diagnoses are performed by analysing the sounds produced in different structures and organs of the human body. An example is the cardiac diagnosis which, in addition to images generated by echocardiography and magnetic resonance imaging, for example, may also employ the analysis of sounds from the heart by means of auscultation. The objective of this work was evaluating combination between audio signal and visual features to enable CBVR and investigating how much this approach can improve retrieval results comparing to using only visual features. Medical videos are the main data of interest in this work, but video segments not related to the medical field were also used to validate the approach. The objectives of this work are justifiable because audio signal analysis, in order to get relevant descriptors to improve retrieval results, is still little explored in the scientific literature. This statement was evidenced by results of a systematic review. Two experiment sets were conducted to validate the CBVR approach described. The first experiment set was applied to a synthetic images database specially built to validate the approach, while the second experiment was applied to a database composed of digital videos created from magnetic resonance imaging and heart sounds from auscultation. Results were analyzed using the recall and precision metrics, as well as the graph which relates these metrics. Results showed that this approach is promising due the significantly improvement obtained in retrieval results to different scenarios of combination between visual and audio signal features
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Recuperação de vídeos médicos baseada em conteúdo utilizando extratores de características visuais e sonoras / Content-based medical video retrieval using visual and sound feature extractorsVagner Mendonça Gonçalves 12 December 2016 (has links)
A evolução dos dispositivos de armazenamento e das redes de computadores permitiram que os vídeos digitais assumissem um importante papel no desenvolvimento de sistemas de informação multimídia. Com a finalidade de aproveitar todo o potencial dos vídeos digitais no desenvolvimento desses sistemas, técnicas automatizadas eficientes para análise, interpretação e recuperação são necessárias. A recuperação de vídeos baseada em conteúdo (CBVR, do inglês content-based video retrieval) permite o processamento e a análise do conteúdo de vídeos digitais visando à extração de informações relevantes que viabilizem indexação e recuperação. Trabalhos científicos têm proposto a aplicação de CBVR em bases de vídeos médicos a fim de proporcionar diferentes contribuições como diagnóstico auxiliado por computador, suporte à tomada de decisão e disponibilização de bases de vídeos para utilização em treinamento e educação médica. Em geral, características visuais são as principais informações utilizadas no contexto de CBVR aplicada em vídeos médicos. No entanto, muitos diagnósticos são realizados por meio da análise dos sons produzidos em diferentes estruturas e órgãos do corpo humano. Um exemplo é o diagnóstico cardíaco que, além de exames de imagem como ecocardiografia e ressonância magnética, também pode empregar a análise dos sons provenientes do coração por meio da auscultação. O objetivo deste trabalho consistiu em aplicar e avaliar extratores de características de som em conjunto com extratores de características visuais para viabilizar CBVR e, então, inferir se a abordagem resultou em ganhos com relação ao desempenho de recuperação quando comparada à utilização apenas das características visuais. Vídeos médicos constituíram nosso principal interesse, porém o trabalho considerou também vídeos não relacionados à área médica para a validação da abordagem. Justifica-se o objetivo, pois a análise do som, visando a obter descritores relevantes para melhorar os resultados de recuperação, ainda é pouco explorada na literatura científica. Essa afirmação foi evidenciada com a condução de uma revisão sistemática sobre o tema. Dois conjuntos de experimentos foram conduzidos visando a validar a abordagem de CBVR mencionada. O primeiro conjunto de experimentos foi aplicado sobre uma base de vídeos sintetizados para validação da abordagem. Já o segundo, foi aplicado em uma base de vídeos construídos utilizando-se imagens provenientes de exames de ressonância magnética em conjunto com sons provenientes de auscultação do coração. Os resultados foram analisados utilizando-se as métricas de revocação e precisão, bem como o gráfico que as relaciona. Demonstrou-se que a abordagem é promissora por meio da melhora significativa dos resultados de recuperação nos diferentes cenários de combinação entre características visuais e sonoras experimentados / Advance of storage devices and computer networks has contributed to digital videos assume an important role in the development of multimedia information systems. In order to take advantage of the full potential of digital videos in the development of these systems, it is necessary the development of efficient techniques for automated data analysis, interpretation and retrieval. Content-based video retrieval (CBVR) allows processing and analysis of content in digital videos to extract relevant information and enable indexing and retrieval. Scientific studies have proposed the application of CBVR in medical video databases in order to provide different contributions like computer-aided diagnosis, decision-making support or availability of video databases for use in medical training and education. In general, visual characteristics are the main information used in the context of CBVR applied in medical videos. However, many diagnoses are performed by analysing the sounds produced in different structures and organs of the human body. An example is the cardiac diagnosis which, in addition to images generated by echocardiography and magnetic resonance imaging, for example, may also employ the analysis of sounds from the heart by means of auscultation. The objective of this work was evaluating combination between audio signal and visual features to enable CBVR and investigating how much this approach can improve retrieval results comparing to using only visual features. Medical videos are the main data of interest in this work, but video segments not related to the medical field were also used to validate the approach. The objectives of this work are justifiable because audio signal analysis, in order to get relevant descriptors to improve retrieval results, is still little explored in the scientific literature. This statement was evidenced by results of a systematic review. Two experiment sets were conducted to validate the CBVR approach described. The first experiment set was applied to a synthetic images database specially built to validate the approach, while the second experiment was applied to a database composed of digital videos created from magnetic resonance imaging and heart sounds from auscultation. Results were analyzed using the recall and precision metrics, as well as the graph which relates these metrics. Results showed that this approach is promising due the significantly improvement obtained in retrieval results to different scenarios of combination between visual and audio signal features
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