Resumo não disponível

Foi desenvolvido um modelo bioeconômico para calcular valores econômicos para caracteres dos objetivos de seleção em sistemas de produção de ciclo completo e propor índices de seleção econômicos com base nos critérios de seleção utilizado no programa de melhoramento da raça Aberdeen Angus no estado do Rio Grande do Sul. As informações de parâmetros biológicos e econômicos utilizados nos cálculos são provenientes das propriedades, de outros estudos e do programa de melhoramento da raça - PROMEBO. Foram usadas planilhas Excel para o desenvolvimento do modelo. Os valores econômicos foram estimados para os objetivos de seleção de sistemas de produção de ciclo completo, sendo estes o número de bezerros desmamados (NBD) e peso ao abate (PA). Para avaliar o impacto das mudanças no desempenho dos caracteres sobre o lucro total do sistema de produção, os valores iniciais dos caracteres foram aumentados em 1%. Os caracteres são expressos em reais por unidade de mudança no caráter e foram calculados na base vaca/ano. Os valores econômicos para NBD e PA foram respectivamente R$ 6,65 e R$ 1,43. A partir das matrizes de (co)variância genética entre os objetivos e os critérios de seleção foram calculados ponderadores econômicos para os critérios de seleção utilizados no PROMEBO, estes são os seguintes: peso (P) a desmama (D) e ao sobreano (S), conformação (C), precocidade (G) e musculatura (M) a desmama e ao sobreano e perímetro escrotal (PE). Os ponderadores econômicos para PD, CD, GD e MS foram positivos e variarem de 2,61 a 0,62 reais. Para PS, CS, GS, MS e PE os ponderadores variaram de 1,40 a 0,004 reais. O índice de seleção a desmama alocaria 44,77% de ênfase para PD, 14,24% para CD, 30,36% para GD e 10,63% para MD. O índice de sobreano daria ênfase de 77,61% para PS, 4,99% para CS, 11,09% para GS, 6,10% para MD e 0,22% para PE. O caráter que mais impactou economicamente o sistema de produção de ciclo completo usando pastagem foi o reprodutivo, NBD, já o PA teve importância econômica positiva no sistema de produção, indicando que a seleção para esses caracteres aumentará a lucratividade do sistema. Os ponderadores econômicos para os caracteres ponderais e escores visuais de C, P e M e PE foram positivos indicando que esses caracteres podem ser usados na seleção dos animais que irão contribuir para incrementar a lucratividade do sistema de produção. / We developed a bio-economic model to estimate economic values for traits of breeding goals in production systems and propose full cycle economic selection indexes based on the criteria selection used in the breeding program Aberdeen Angus breed in the state of Rio Grande do Sul. Biological and economics information parameters used in the calculations are derived from the properties of other studies and the breeding program of the breed - PROMEBO. Excel spreadsheets were used for model development. Economic values were estimated for the purposes of selection of complete cycle systems production, the number of weaned calves (NCW) and slaughter weight (SW). In order to assess the impact of changes in the performance of the characters on the overall profitability of the production system, the initial values of the characters were increased by 1%. The characters are expressed in Real(R$) per unit change in character, and were based on cow / year. The economic values for NCW and SW were respectively R$ 6,65 and R$ 1,43. From the matrix of (co)variance components, between the objectives and the criteria of selection, we have calculated economic weights for selection criteria used in PROMEBO as the following: weight (W) weaning (W) and yearling (Y), conformation (C), precocity (P) and muscle (M) and weaning and yearling scrotal circumference (SC). The economic weights for WW, CW, PW and MW were positive and ranged from 2,61 to 0,62 reais. PY, CY, GY, MY and SC the weight ranged from 1,40 to 0,004 reais. The weaning selection index allocates 44.77% of emphasis for PW, 14.24% for CW, 30.36% to 10.63% for GW and MW. The index for yearling give emphasis 77.61% for PY, 4.99% for CY, 11.09% for GY, 6.10% to 0.22% for MY and SC. The character that most impacted economically production system complete cycle using grazing was the reproductive NCW. The SW had positive economic importance in the production system, indicating that selection for these characters increase the profitability of the system. The economic weights for traits and visual scores by weight for C, P and M and SC were positive, indicating that these characters can be used in the selection of animals that will contribute to increase the profitability of the production system.

Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e fenotípicos para 21 características lineares de tipo bem como a pontuação final e as características de produção de leite (PL), gordura (PG) e proteína (PP) em rebanhos de bovinos leiteiros da raça holandesa no Brasil. Os 18,5 mil registros utilizados neste estudo foram coletados por técnicos da Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa entre os anos 1994 e 2004. As estimativas dos componentes de (co)variância e dos parâmetros genéticos e fenotípicos das características foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivações por meio de modelos animal multicaráter. O processamento das análises com 22 características avaliadas simultaneamente foi realizado no Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho, São Paulo, através do ambiente operacional SGI Altix – 1350. As estimativas de herdabilidade para as características lineares de tipo variaram de 0,09 e 0,39 e para as PL, PG e PP variaram entre 0,17 e 0,24 indicando haver variabilidade genética aditiva suficiente para que ganhos genéticos moderados possam ser obtidos por seleção. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada, entretanto, as correlações genéticas variaram entre -0,44 e 0,85. As estimativas de correlações genéticas entre as características lineares de tipo com as características produtivas (PL, PG e PP) foram em geral de baixa magnitude. O antagonismo genético indesejável entre algumas características de tipo e produtivas deverá ser levado em consideração no momento da seleção, uma vez que a seleção para características produtivas pode levar à deteriorização de algumas características conformacionais. Quando o objetivo de seleção for melhorar as características lineares de tipo, a pontuação final poderá ser utilizada como critério de seleção por estar correlacionada geneticamente e de forma moderada com a maioria das características Entretanto, ao selecionar as vacas de maior pontuação final não se deve esperar aumento significativo no volume de PL, PG e PP, sendo a utilização de índices de seleção uma ferramenta indicada para o processo de seleção genética dos animais. / The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for 21 linear type traits over the final score and milk yield traits (MY), fat (FY) and protein (PP) in herds of Holstein dairy cattle in Brazil. The 18,500 records used in this study were collected by staff of the Brazilian Association of Cattle Breeders of Holstein between 1994 and 2004. Estimates of (co)variance and genetic and phenotypic parameters were determined by the method of maximum likelihood derivative-free restricted through multiple trait animal models. The analyses were processed in Sao Paulo through the operating environment SGI Altix - 1350 provided by the National Center for High Performance. The heritability estimates between linear type traits ranged between 0.09 and 0.39 and between PL, PG and PP between 0.17 and 0.24 indicating there sufficient genetic variability to obtain moderate genetic gains by selection. The phenotypic correlations between linear type traits were generally positive and of moderate magnitude, however, genetic correlations varied widely between -0.44 and 0.85 indicating that some could be excluded from the classification linear system currently adopted by the ABCBRH. Estimates of genetic correlations between linear type traits and yield traits (PL, PG and PP) were generally of low magnitude. The genetic antagonism between some type traits and yield should be taken into account at the time of selection, since, in many Brazilian herd, less productive cows are discarded. When the goal is to improve the selection of linear type traits the final score can be used as a selection tool to be genetically and correlated moderately with the most features, however, when the selection criterion is not the final score expect significant improvements in the characteristics of PL, PG and PP, with the use of selection indices indicated a tool for the process of genetic selection of animals.

Resumo não disponível

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O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e fenotípicos para 21 características lineares de tipo bem como a pontuação final e as características de produção de leite (PL), gordura (PG) e proteína (PP) em rebanhos de bovinos leiteiros da raça holandesa no Brasil. Os 18,5 mil registros utilizados neste estudo foram coletados por técnicos da Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa entre os anos 1994 e 2004. As estimativas dos componentes de (co)variância e dos parâmetros genéticos e fenotípicos das características foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivações por meio de modelos animal multicaráter. O processamento das análises com 22 características avaliadas simultaneamente foi realizado no Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho, São Paulo, através do ambiente operacional SGI Altix – 1350. As estimativas de herdabilidade para as características lineares de tipo variaram de 0,09 e 0,39 e para as PL, PG e PP variaram entre 0,17 e 0,24 indicando haver variabilidade genética aditiva suficiente para que ganhos genéticos moderados possam ser obtidos por seleção. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada, entretanto, as correlações genéticas variaram entre -0,44 e 0,85. As estimativas de correlações genéticas entre as características lineares de tipo com as características produtivas (PL, PG e PP) foram em geral de baixa magnitude. O antagonismo genético indesejável entre algumas características de tipo e produtivas deverá ser levado em consideração no momento da seleção, uma vez que a seleção para características produtivas pode levar à deteriorização de algumas características conformacionais. Quando o objetivo de seleção for melhorar as características lineares de tipo, a pontuação final poderá ser utilizada como critério de seleção por estar correlacionada geneticamente e de forma moderada com a maioria das características Entretanto, ao selecionar as vacas de maior pontuação final não se deve esperar aumento significativo no volume de PL, PG e PP, sendo a utilização de índices de seleção uma ferramenta indicada para o processo de seleção genética dos animais. / The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for 21 linear type traits over the final score and milk yield traits (MY), fat (FY) and protein (PP) in herds of Holstein dairy cattle in Brazil. The 18,500 records used in this study were collected by staff of the Brazilian Association of Cattle Breeders of Holstein between 1994 and 2004. Estimates of (co)variance and genetic and phenotypic parameters were determined by the method of maximum likelihood derivative-free restricted through multiple trait animal models. The analyses were processed in Sao Paulo through the operating environment SGI Altix - 1350 provided by the National Center for High Performance. The heritability estimates between linear type traits ranged between 0.09 and 0.39 and between PL, PG and PP between 0.17 and 0.24 indicating there sufficient genetic variability to obtain moderate genetic gains by selection. The phenotypic correlations between linear type traits were generally positive and of moderate magnitude, however, genetic correlations varied widely between -0.44 and 0.85 indicating that some could be excluded from the classification linear system currently adopted by the ABCBRH. Estimates of genetic correlations between linear type traits and yield traits (PL, PG and PP) were generally of low magnitude. The genetic antagonism between some type traits and yield should be taken into account at the time of selection, since, in many Brazilian herd, less productive cows are discarded. When the goal is to improve the selection of linear type traits the final score can be used as a selection tool to be genetically and correlated moderately with the most features, however, when the selection criterion is not the final score expect significant improvements in the characteristics of PL, PG and PP, with the use of selection indices indicated a tool for the process of genetic selection of animals.

Foi desenvolvido um modelo bioeconômico para calcular valores econômicos para caracteres dos objetivos de seleção em sistemas de produção de ciclo completo e propor índices de seleção econômicos com base nos critérios de seleção utilizado no programa de melhoramento da raça Aberdeen Angus no estado do Rio Grande do Sul. As informações de parâmetros biológicos e econômicos utilizados nos cálculos são provenientes das propriedades, de outros estudos e do programa de melhoramento da raça - PROMEBO. Foram usadas planilhas Excel para o desenvolvimento do modelo. Os valores econômicos foram estimados para os objetivos de seleção de sistemas de produção de ciclo completo, sendo estes o número de bezerros desmamados (NBD) e peso ao abate (PA). Para avaliar o impacto das mudanças no desempenho dos caracteres sobre o lucro total do sistema de produção, os valores iniciais dos caracteres foram aumentados em 1%. Os caracteres são expressos em reais por unidade de mudança no caráter e foram calculados na base vaca/ano. Os valores econômicos para NBD e PA foram respectivamente R$ 6,65 e R$ 1,43. A partir das matrizes de (co)variância genética entre os objetivos e os critérios de seleção foram calculados ponderadores econômicos para os critérios de seleção utilizados no PROMEBO, estes são os seguintes: peso (P) a desmama (D) e ao sobreano (S), conformação (C), precocidade (G) e musculatura (M) a desmama e ao sobreano e perímetro escrotal (PE). Os ponderadores econômicos para PD, CD, GD e MS foram positivos e variarem de 2,61 a 0,62 reais. Para PS, CS, GS, MS e PE os ponderadores variaram de 1,40 a 0,004 reais. O índice de seleção a desmama alocaria 44,77% de ênfase para PD, 14,24% para CD, 30,36% para GD e 10,63% para MD. O índice de sobreano daria ênfase de 77,61% para PS, 4,99% para CS, 11,09% para GS, 6,10% para MD e 0,22% para PE. O caráter que mais impactou economicamente o sistema de produção de ciclo completo usando pastagem foi o reprodutivo, NBD, já o PA teve importância econômica positiva no sistema de produção, indicando que a seleção para esses caracteres aumentará a lucratividade do sistema. Os ponderadores econômicos para os caracteres ponderais e escores visuais de C, P e M e PE foram positivos indicando que esses caracteres podem ser usados na seleção dos animais que irão contribuir para incrementar a lucratividade do sistema de produção. / We developed a bio-economic model to estimate economic values for traits of breeding goals in production systems and propose full cycle economic selection indexes based on the criteria selection used in the breeding program Aberdeen Angus breed in the state of Rio Grande do Sul. Biological and economics information parameters used in the calculations are derived from the properties of other studies and the breeding program of the breed - PROMEBO. Excel spreadsheets were used for model development. Economic values were estimated for the purposes of selection of complete cycle systems production, the number of weaned calves (NCW) and slaughter weight (SW). In order to assess the impact of changes in the performance of the characters on the overall profitability of the production system, the initial values of the characters were increased by 1%. The characters are expressed in Real(R$) per unit change in character, and were based on cow / year. The economic values for NCW and SW were respectively R$ 6,65 and R$ 1,43. From the matrix of (co)variance components, between the objectives and the criteria of selection, we have calculated economic weights for selection criteria used in PROMEBO as the following: weight (W) weaning (W) and yearling (Y), conformation (C), precocity (P) and muscle (M) and weaning and yearling scrotal circumference (SC). The economic weights for WW, CW, PW and MW were positive and ranged from 2,61 to 0,62 reais. PY, CY, GY, MY and SC the weight ranged from 1,40 to 0,004 reais. The weaning selection index allocates 44.77% of emphasis for PW, 14.24% for CW, 30.36% to 10.63% for GW and MW. The index for yearling give emphasis 77.61% for PY, 4.99% for CY, 11.09% for GY, 6.10% to 0.22% for MY and SC. The character that most impacted economically production system complete cycle using grazing was the reproductive NCW. The SW had positive economic importance in the production system, indicating that selection for these characters increase the profitability of the system. The economic weights for traits and visual scores by weight for C, P and M and SC were positive, indicating that these characters can be used in the selection of animals that will contribute to increase the profitability of the production system.

Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.