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Estudo de processos para modelagem, avaliação, alteração e seleção de estruturas de proteínasSouza Teixeira, Erico January 2005 (has links)
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Previous issue date: 2005 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O projeto consiste no estudo de diversos sistemas aplicados no processo de
construção de modelos de estruturas terciárias de proteínas, considerando etapas de
modelagem e avaliação da estrutura, assim como mecanismos para a modificação
visando a melhora das conformações desenvolvidas.
Ao longo desse estudo foi também desenvolvido um conjunto de interfaces que
permite a comunicação entre os diversos tipos de programas utilizados nas etapas
citadas acima. Além disso, um método para a alteração e melhora de pequenas regiões
de um modelo da proteína foi implementado e adicionado no fluxo do processo de
modelagem.
Por fim, o algoritmo de construção de novas conformações foi avaliado em
estruturas originadas da modelagem por homologia, criadas pela ferramenta
MODELLER, sempre apresentado uma melhora nas regiões modificadas, enquanto elas
apresentassem uma distância superior a 1,7 Å da estrutura nativa
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