Made available in DSpace on 2014-06-12T16:01:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo7277_1.pdf: 2393933 bytes, checksum: b6c89eeb380fb4db0e2e71e2f83d4098 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O projeto consiste no estudo de diversos sistemas aplicados no processo de construção de modelos de estruturas terciárias de proteínas, considerando etapas de modelagem e avaliação da estrutura, assim como mecanismos para a modificação visando a melhora das conformações desenvolvidas. Ao longo desse estudo foi também desenvolvido um conjunto de interfaces que permite a comunicação entre os diversos tipos de programas utilizados nas etapas citadas acima. Além disso, um método para a alteração e melhora de pequenas regiões de um modelo da proteína foi implementado e adicionado no fluxo do processo de modelagem. Por fim, o algoritmo de construção de novas conformações foi avaliado em estruturas originadas da modelagem por homologia, criadas pela ferramenta MODELLER, sempre apresentado uma melhora nas regiões modificadas, enquanto elas apresentassem uma distância superior a 1,7 Å da estrutura nativa

Orientador : Artibano Micali / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-07-15T04:22:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paques_Antonio_D.pdf: 1956934 bytes, checksum: 656fff1da55c4550bd6d2ce3775d3699 (MD5) Previous issue date: 1977 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed / Doutorado / Doutor em Matemática

Orientador: Joney Antonio Daccach / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-07-17T12:32:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carreira_MariaGoretedaSilva_M.pdf: 691726 bytes, checksum: 2d89131ba60bd3f0d6a05470675e1392 (MD5) Previous issue date: 1986 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed / Mestrado / Mestre em Matemática

SOUSA, Roger Oliveira. Sobre a regularidade de Castelnuovo-Mumford de arranjos de subespaços lineares no espaço projetivo n-dimensional. 2015. 38 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Programa de Pós-Graduação em Matemática, Fortaleza-Ce, 2015 / Submitted by Erivan Almeida (eneiro@bol.com.br) on 2015-07-01T17:17:32Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_rosousa.pdf: 755944 bytes, checksum: 59645cfdb8d6a085c5e913456f09285e (MD5) / Approved for entry into archive by Rocilda Sales(rocilda@ufc.br) on 2015-07-02T11:10:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_rosousa.pdf: 755944 bytes, checksum: 59645cfdb8d6a085c5e913456f09285e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-02T11:10:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_rosousa.pdf: 755944 bytes, checksum: 59645cfdb8d6a085c5e913456f09285e (MD5) Previous issue date: 2015 / The objetive of this work is study the behavior of the Castelnuovo-Mumford regularity in arrangements of linear subspaces in projetive spaces, for this, we use Jessica Sidman and Harm Derksen article of title "A sharp bound for the Castelnuovo-Mumford regularity of subspace arrengements". At first, we give some preliminary notions and present auxiliary results. In a second moment, we define the main objects of this work proof the main results and give a example which show that the bound is sharp. / O objetivo deste trabalho é estudar o comportamento da regularidade de Castelnuovo- Mumford em arranjos de subespaços lineares no espaço projetivo, para isto, nos norteamos pelo artigo de título "Uma limitação sharp para a regularidade de Castelnuovo-Mumford de arranjos de subespaços" dos autores Harm Derksen e Jessica Sidman. Em um primeiro momento, daremos algumas noções preliminares e apresentaremos resultados auxiliares. Num segundo momento, definiremos os principais objetos deste trabalho, demonstraremos os resultados principais e daremos um exemplo que mostra que a limitação encontrada é a melhor possível.

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:30:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4585_1.pdf: 466210 bytes, checksum: 682cdf28eb7c481b0fe71c749ae930e8 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Esta dissertação teve como principal preocupação compreender como a heterogeneidade discursiva aparece no discurso telejornalístico. Seu principal objetivo foi apontar as vozes antagônicas no discurso heterogêneo do Jornal Nacional(JN), da Rede Globo de televisão. Temos como referencial teórico-metodológico a Análise de Discurso, a partir de Authier-Revuz, utilizando ainda autores como Bakhtin, Bordieu, Berger, Fausto Neto, entre outros teóricos da Análise do Discurso, do jornalismo e da televisão. Sustentamos a hipótese de que os sentidos legitimantes e deslegitmadores a respeito dos Sem-Terra, resultante da heterogeneidade de vozes, é a base para se produzir efeitos de sentidos monofônicos sobre o MST. Se por um lado, esse discurso aponta para a legalização das ações dos Sem-Terra, na medida em que o JN divulga as estratégicas ocupações do MST e assume designações dos Sem-Terra, legitimando-os. Por outro, em sua maior parte, coloca os Sem-Terra na ilegalidade através de textos e imagens que correspondem à posição-sujeito do governo e dos latifundiários, classificando o Movimento como fora da lei e provocando reações deslegitimantes. Diante disso, observamos que a paráfrase e a polissemia são determinantes para o funcionamento da linguagem, na produção do discurso do JN e, por conseguinte, na construção de um único sentido, pois, apesar da polifonia do corpus, os efeitos de sentido são monofônicos. Para desenvolver esta pesquisa, acompanhamos e gravamos, de 1997 a 2002, matérias do JN sobre as ações do MST

Esta dissertação tem como objetivos um estudo detalhado do módulo canônico e do funtor dualizante para anéis de Cohen-Macaulay locais e as demonstrações dos teoremas de dualidade de Grothendieck. Iniciamos com o caso Artiniano e depois estendemos ao caso geral. Analisamos a unicidade do funtor dualizante através da interveniência do módulo canônico, uma peça chave da álgebra comutativa moderna. Focamos, em especial, nos chamados anéis de Gorenstein, caracterizados, entre os anéis de Cohen-Macaulay, como aqueles que são seu próprio módulo canônico. Explicitamos o funtor dualizante. Analisamos o comportamento do módulo canônico sob o processo de localização e completamento. Por fim, trabalhamos nas demonstrações dos teoremas de dualidade de Grothendieck. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT: The main purpose of this dissertation is a detailed study of canonical module and the dualizing functor for local Cohen-Macaulay rings and the proof of the duality theorems of Grothendieck. We start with the Artinian case and later we extend to the general case. Using the canonical module, an important subject of modern commutative algebra, we examine the unicity of dualizing functor. We give special attention in Gorenstein rings, those whom are Cohen-Macaulay rings and have free canonical module. After, we make explicit the dualizing functor and analyze the behavior of the canonical module under the localization and completion process. We conclude with the duality theorems of Grothendieck.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8716_1.pdf: 394933 bytes, checksum: 01ca084378f3790faafdbe0837235749 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Esta dissertação tem como objetivos um estudo detalhado do módulo canônico e do funtor dualizante para anéis de Cohen-Macaulay locais e as demonstrações dos teoremas de dualidade de Grothendieck. Iniciamos com o caso Artiniano e depois estendemos ao caso geral. Analisamos a unicidade do funtor dualizante através da interveniência do módulo canônico, uma peça chave da álgebra comutativa moderna. Focamos, em especial, nos chamados anéis de Gorenstein, caracterizados, entre os anéis de Cohen-Macaulay, como aqueles que são seu próprio módulo canônico. Explicitamos o funtor dualizante. Analisamos o comportamento do módulo canônico sob o processo de localização e completamento. Por fim, trabalhamos nas demonstrações dos teoremas de dualidade de Grothendieck

Orientador: Marcio Antonio de Faria Rosa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-25T02:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mosna_RicardoAntonio_M.pdf: 1809081 bytes, checksum: 6281d9176777646e4f300c74e3343d3a (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Estudamos a teoria de Morse sob diferentes pontos de vista, culminando com uma introdução à cohomologia de Floer. Para isso, obtivemos as desigualdades de Morse através de varias estratégias distintas: (i) através do enfoque tradicional, em que a topologia da variedade é investigada em termos de pontos críticos e linhas de gradiente de funções; (ii) utilizando a teoria do índice de Conley; (iii) através do enfoque de Witten, segundo o qual o laplaciano da variedade é deformado por uma função e identificado com o hamiltoniano de um sistema mecânico-quântico supersimétrico e (iv) utilizando o enfoque de Floer, que formaliza o procedimento de Witten e o estende para variedades de dimensão infinita. Aqui ainda abordamos o caso em que a variedade é um espaço de conexões sobre uma 3-esfera homológica e a função é dada pelo funcional de Chern-Simons / Abstract: We have studied Morse theory from different viewpoints, culminating in an introduction to Floer cohomology. To do that, we have obtained Morse inequalities through distinct strategies: (i) by employing the standard approach, according to which the topology of the manifold is investigated in terms of critical points and gradient lines of functions, (ii) through the Conley index theory, {iii) through Witten's approach, where the Laplacian of the manifold is deformed by a function and identified with the Hamiltonian operator of a supersymmetrical quantum mechanical system, and (iv) through Floer's approach, which formalizes Witten's procedure and generalizes it to infinite dimensional manifolds. Here we also consider the case in which the manifold is a space of connections over a homology 3-sphere and the function is the Chern-Simons functional / Mestrado / Mestre em Matemática

Orientador : Janey Antonio Daccach / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-17T09:15:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andrade_MariaGoreteCarreira_D.pdf: 1942631 bytes, checksum: 8c1061ab1d583ea452b7d554b688c4bb (MD5) Previous issue date: 1992 / Resumo: Não informado. / Abstract: Not informed. / Doutorado / Doutor em Matemática

Made available in DSpace on 2016-04-07T13:21:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 nelson_filho_ioc_dout_2015.pdf: 18433990 bytes, checksum: 8dd6a2876cb547b6a2d7fe8493822e55 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A inferência de homologia entre organismos é uma atividade da genômica comparativa que possibilita compreender melhor a relação entre os mesmos e, por conseguinte, sua distância evolutiva. Especificamente, a identificação de genes ortólogos, ou seja, aqueles que têm sua origem em um ancestral comum, permite oferecer melhorias na anotação funcional de genes, uma vez que genes ortólogos tendem a ter sua função conservada. Com a crescente disponibilidade de genomas através de técnicas de NGS, a construção e atualização de bases de dados de ortólogos representam um desafio constante, pois demandam o estudo e identificação das relações entre os genes de tais organismos, em um volume de dados cada vez mais extenso e a um custo computacional cada vez mais elevado. Nesta tese propomos a solução para nuvem computacional elastic-OrthoSearch, um workflow científico de genômica comparativa inspirado no OrthoSearch, responsável pela inferência de homologia entre organismos com o uso de abordagem baseada em melhores hits recíprocos e perfis de Markov. Também propomos uma metodologia para criação de bases de ortólogos construída através do reuso do OrthoSearch. Esta metodologia mostrou-se capaz de alavancar a oferta de grupos ortólogos e assim auxiliar, por exemplo, na identificação de alvos de protozoários / Homology inference among organisms is a comparative genomics tasks which allows for a better understanding on how such organisms are related to each other and on their evolutionary distance. Specifically, the identification of orthologous genes – those who share a common ancestor – allows for functional gene annotation improvements, as orthologous genes tend to preserve their functions. The increasing amount of genomic data provided by the NGS techniques makes the orthologous databases’ building and update processes a challenging task. It requires the identification and study of the organisms’ genes relationships, in an extensive data volume and at an increasing computational cost. In this thesis we propose elastic-OrthoSearch, a cloud-enabled comparative genomics scientific workflow, derived from OrthoSearch. It aims at providing homology inference among organisms, in a reciprocal best hits and Markov profiles approach. We also propose an improved orthologous database creation methodology built on top of OrthoSearch. Such methodology has shown means to offer a broader orthologous groups dataset, which could in turn aid on Protozoa target identification.