La presente investigación se enfoca en la subcuenca del Río Chiquito, una región donde aproximadamente el 27 % de su territorio se encuentra completamente urbanizado. El sistema hidrogeológico exhibe características distintivas, comprendiendo acuíferos fracturados, porosos y multicapa que operan como una única unidad. La zona de recarga, en parte protegida por su ubicación en la zona de amortiguamiento y núcleo del Parque Nacional La Tigra, se encuentra en los acuíferos fracturados del Grupo Padre Miguel, seguidos por los acuíferos multicapa de la Formación Río Chiquito. En la parte baja de la subcuenca se localiza la zona de descarga, con alto aprovechamiento de pozos por la mayor densidad de población, y donde el territorio se encuentra completamente urbanizado. El análisis hidroquímico de las aguas subterráneas (manantiales y pozos) muestra que en la parte alta de la cuenca las aguas presentan una facies bicarbonatada cálcica, mientras que en la parte baja son aguas selenitosas, es decir, con elevadas concentraciones de sulfato. Los recursos hídricos de esta unidad se encuentran en un estado crítico debido a la extracción exhaustiva de agua en los pozos, agravando la situación los materiales propios de la geología local y los procesos edáficos, que contribuyen al empeoramiento de la calidad del agua, con incremento en la presencia de metales pesados, como arsénico, cadmio, manganeso, zinc y estroncio, así como por las altas concentraciones de sulfatos, comprometiendo la salud humana de los usuarios de estos puntos de aprovechamiento. Se determinó la zonificación de los riesgos asociados a la salud humana, identificando la parte baja de la subcuenca como un área con alto riesgo debido a aguas selenitosas y a contaminantes metálicos, junto con elevadas tasas de contaminación microbiológica encontradas en más del 50 % de los pozos evaluados, dando como consecuencia un índice de calidad del agua que oscila entre pobre y marginal. Para abordar estos problemas, se propone fortalecer la Gestión Integrada de los Recursos Hídricos (GIRH) mediante la propuesta de ordenanzas municipales específicas para la explotación hídrica y la creación de un consejo de subcuenca, como la principal estructura de organización hídrica. La implementación de un canon municipal de agua se destaca como un mecanismo financiero primario para apoyar estas iniciativas. Este estudio cierra una brecha significativa en el conocimiento científico y provee información vital para el desarrollo sostenible de la subcuenca antes inexistente, que es crucial para los municipios del Distrito Central y Santa Lucía. Estos municipios están habitados por más de 300,000 personas que, dadas las limitaciones del servicio municipal en cuanto a continuidad y dotación, se sirven de los más de 300 pozos estimados en la subcuenca. En este contexto, se subraya la necesidad de que las autoridades municipales y nacionales enfoquen sus esfuerzos en la gestión sostenible de los recursos hídricos subterráneos en zonas urbanas y periurbanas, acorde con el desarrollo sostenible. La zona de recarga de la subcuenca asegura un cierto nivel de resiliencia hídrica, pero se encuentra amenazada por el avance de la frontera urbana y, en menor escala por la agricultura, por lo que es necesario aplicar medidas de protección y conservación para asegurar la sostenibilidad del aprovechamiento de los recursos hídricos.