Orientador: Maria Márcia Pereira Sartori / Banca: Edivaldo Aparecido Amaral da Silva / Banca: Renato Fernandes Cantão / Banca: João Nakagawa / Resumo: Dentre as características mais estudadas na indústria de sementes e bancos de germoplasma, destaca-se o potencial fisiológico, tendo em vista que sementes de maior qualidade fisiológica permitem obter uma rápida e uniforme emergência das plântulas, e consequentemente o estabelecimento do estande. O objetivo dessa pesquisa foi avaliar a germinação de sementes de milho (Zea mays L.) e soja (Glycine max (L.) Merrill) por meio de modelos não lineares e lineares generalizados. Foram utilizadas as cultivares de milho: AS 1633 PRO3, 2B587 RR, 2A401PW, AL Bandeirante e BRS 4103, e de soja as cultivares: DS59716 IPRO, CD2737 RR, CD251 RR, CD2820 IPRO e CD2857 RR, ambas da safra 2016/17. Avaliou-se a germinação de 20 sementes com quatro repetições por cultivar por meio do teste de emissão da raiz primária (protrusão). A contagem das sementes germinadas foi efetuada em intervalos regulares de 6, 12 e 24 horas até 204 horas, adotando-se como critério de germinação a protrusão da raiz primária ≥ 2 mm. Os dados foram dispostos na forma de porcentagem acumulada ao longo do tempo e pela proporção de sementes viáveis em cada intervalo de tempo testado dado por uma sequência de ensaios de Bernoulli. Os dados de porcentagem acumulada ao longo do tempo foram modelados pelas curvas não lineares de Gompertz e função de Hill de quatro parâmetros e os dados de proporção foram avaliados por modelos lineares generalizados testando as funções ligação: Probit, Logit e Complemento Log Log. As cultivares ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Among the most studied characteristics in the seed industry and germplasm banks, the physiological potential stands out, since seeds of higher physiological quality allow a quick and uniform emergence of the seedlings, and consequently the establishment of the stand. The objective of this research was to evaluate the germination of corn (Zea mays L.) and soybean (Glycine max (L.) Merrill) seeds using nonlinear models and generalized linear. The used cultivars of corn were: AS 1633 PRO3, 2B587 RR, 2A401PW, AL Bandeirante and BRS 4103, and the soybean cultivars were: DS59716 IPRO, CD2737 RR, CD251 RR, CD2820 IPRO and CD2857 RR, both of the 2016/17 crop. The germination of 20 seeds with four replicates per cultivar was evaluated by the primary root emission test (protrusion). The germinated seeds were counted at regular intervals of 6, 12 and 24 hours up to 204 hours, with protrusion of the primary root ≥ 2 mm being the germination criterion. The data were plotted as a percentage accumulated over time and by the proportion of viable seeds at each interval of time tested given by a sequence of Bernoulli assays. The data of percentage accumulated over time were modeled by the non-linear Gompertz curves and Hill function with four parameters and the proportion data were evaluated by generalized linear models testing the linking functions: Probit, Logit and Complement Log Log.The corn cultivars with the highest germination speed were: AL Bandeirante and BRS 4103. For soybean the bes... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: A idade ao primeiro parto (IPP) e a produtividade acumulada (PAC) são características utilizadas para avaliar o desempenho reprodutivo dos bovinos de corte. Com o objetivo de estudar a variação fenotípica destas características e as associações genéticas existentes com outras de interesse econômico, dados de animais do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN - Nelore Brasil) foram utilizados para estimar, pelo método de máxima verossimilhança restrita, parâmetros genéticos e tendências genéticas de IPP e PAC. Análises bi-característica foram efetuadas entre IPP e PAC e entre estas e peso corporal das fêmeas corrigido para 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, e perímetro escrotal dos machos corrigidos para 365 (PE365), 450 (PE450), 550 (PE550) e 730 (PE730) dias de idade. As tendências genéticas de PAC e IPP foram favoráveis indicando que os critérios de seleção adotados nestas fazendas estão favorecendo estas características. As médias de herdabilidades estimadas para IPP e PAC foram de 0,03 e 0,19, respectivamente. A seleção baseada no P365 ou P450 visando melhorar a IPP seria mais eficiente do que a seleção direta para esta característica. A seleção com base na PAC poderá favorecer as fêmeas com maiores P365, P450 e menores IPP. Nestes rebanhos, o perímetro escrotal não está associado geneticamente a IPP e ao índice PAC. / Abstract: Age at First Calving (AFC) and Accumulated Productivity (ACP) are traits used to evaluate the reproductive performance of the beef cattle. The knowledge of the existing genetic relationships between these traits and those that respond to the selection can aid the selective process. Data of a Brazilian Nelore cattle breeding program were used to estimate via REML the genetic, phenotypic and environmental parameters as well as the genetic trends of AFC and ACP. Bi-trait analyses were performed between AFC and ACP and between these traits and the heifers’ body weight adjusted to 365 (W365) and 450 (W450) days of age, and the males’ scrotal circumference adjusted to 365 (P365), 450 (P450), 550 (P550) and 730 (P730) days of age. The genetic trends of the AFC and ACP were favorable, indicating genetic gains of -0.011 days per year for AFC and 0.1655 kg of weaned calves per year for ACP. The means of estimated heritabilities for AFC and ACP were 0.03 and 0.19, respectively. The indirect selection for AFC by W365 and W450 is more efficient than the direct selection. The estimated genetic correlations indicated that the heavier heifers at these ages were the ones that produced more kilograms of weaned calves per year and had earlier AFC. In these herds, the males’ scrotal circumference was not genetically associated with AFC and ACP. / Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientadora: Cláudia Cristina Paro de Paz / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Raysildo Barbosa Lôbo / Mestre

Orientador: Luzia Aparecida Trinca / Banca: Francisco Marcelo Monteiro / Banca: Rogerio Antonio de Oliveira / Resumo: Encontrar delineamentos experimentais eficientes para modelos não-lineares, amplamente utilizados em farmacocinética, exige integração numérica sobre o espaço dos parâmetros e otimização numérica sobre o espaço do delineamento, duas tarefas computacionalmente muito exigentes. O esforço computacional aumenta á medida que o número de parâmetros do modelo aumenta. Assim, há uma necessidade de métodos rápidos e precisos para a resolução do problema. O objetivo desta pesquisa é aplicar e explorar a performance das regras básicas de quadratura múltipla BF e B_F e de um algoritmo adaptativo para a aproximação de integrais múltiplas implementados em cubature (código C por Steven G. Johnson e R por Balasubramanian Narasimhan, 2009) do R (R Development Core Team, 2012). Os delineamentos D- ótimos encontrados utilizando esta abordagem para dois modelos não-lineares em farmacocinética, decaimento exponencial (um parâmetro) e monocompartimental (três parâmetros), no contexto de efeitos fixos e efeitos mistos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Finding efficient experimental designs for nonlinear models widely used in pharmacokinetics requires numerical integration over the parameter's space and numerical optimization over the design's space, two computationally demanding tasks. Computational effort increases as the number of parameters in the model increases. Thus, there is a need for fast and accurate methods to solve the problem. The purpose of this research is to apply and explore the performance of the basic rules BF and B F and of an adaptive algorithm for approximating multiple integrals implemented in cubature (C code by Steven G. Johnson and R by Balasubramanian Narasimhan, 2009) in R (R Development Core Team, 2012). The obtained D-optimum designs using this approach for two pharmacokinetic nonlinear models, exponential decay (one parameter) and mono-compartmental (three parameters), in the context of fixed and mixed effects were compared with designs of experiments found byButton (1979), Atkinson et al. (2007), Gotwalt et al. (2009), in case of... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-07Bitstream added on 2014-08-13T18:00:39Z : No. of bitstreams: 1 000756908.pdf: 521999 bytes, checksum: c92d8043980849d8b21f239dd04dac21 (MD5) / Em análise de modelo de crescimento com o objetivo de representar o desenvolvimento de organismos vivos por um período maior que sua fase inicial, utiliza-se, frequentemente, modelos não lineares. O objetivo deste trabalho foi ajustar o modelo não-linear de Gompertz utilizando o software SAS através de três estruturas diferentes: 1) modelo de efeitos fixos; 2) modelo autorregressivo de primeira ordem e 3) modelo de efeito misto a um conjunto de dados de crescimento em peso de ratos da linhagem Rattus norvegicus e para um conjunto de dados de crescimento em peso de vacas de três raças: Flamengas, Guernsey-Gir e Holandesas, para verificar o melhor modelo para os conjuntos de dados obtidos. Para tal, optou-se por seis critérios estatísticos como avaliadores de ajuste. Os critérios foram: Quadrado médio do resíduo, critério de informação de Akaike (AIC), critério de informação Bayesiano (BIC), erro de predição médio (EPM), resíduos nos pontos iniciais, chamadores 0, usado para avaliar o ajuste nas primeiras observações e um índice sendo um valor considerado como avaliador no final do ajuste (calculado pela razão entre os 20% dos maiores valores estimados e a assíntota estimada). Além destes, foram feitos testes de Durbin-Watson e Breusch-Pagan para verificar a independência dos resíduos e a heteroscedasticidade, respectivamente. Os resultados mostram que, em muitas repetiçõees, onde havia a necessidade de correção da autocorrelação e heterocedasticidade, o modelo autorregessivo de primeira ordem foi o melhor ajuste. Já em relação ao ajuste único, nos casos em que a autocorrelação foi significativa, o modelo autorregressivo foi o melhor segundo os critérios e, quando a autocorrelação foi não significativa, o modelo de efeitos fixos foi o melhor modelo / In growth model analyzing to represent the development of organisms for a larger period than its initial phase, it nonlinear models are often used . The aim of this work was to adjust the nonlinear Gompertz model using the software SAS by three different structures: 1) fixed effects model, 2) first-order autoregressive model and 3) mixed-effects model to a data of growth of female and male rats Rattus norvegicus and to a data of growth of three breeds cow to verify the best model for the data obtained. To attach the objective, six criteria was chosen as evaluators of statistical adjustment. The criteria were: residual mean square, Akaike information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), mean prediction error (EPM), residues in starting points, called res 0, used to assess the fit in the first observations and an index value being considered as an evaluator at the end of adjustment (calculated as the ratio between 20% of the largest estimated values and estimated asymptote). In addition, Durbin-Watson and Breusch-Pagan tests were performed to verify the independence of waste and heteroscedasticity, respectively. The results show that in many repetitions, where was need a correction of autocorrelation and heteroscedasticity, the first order autoregressive model was the best fit. In relation to the single adjustment, where the autocorrelation was significant, the autoregressive model was the best, according to the criteria utilized, and when the autocorrelation was not significant, the fixed effects model was the best model

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-16Bitstream added on 2014-06-13T19:19:23Z : No. of bitstreams: 1 000750099.pdf: 1001744 bytes, checksum: 9dd55fe10e48e8a981d10f0b406b4ba3 (MD5) / O objetivo foi descrever o crescimento em peso vivo, do fígado, do corpo adiposo, a deposição dos nutrientes corporais e das coxas, do consumo da dieta, e avaliar a eficiência proteica da dieta para rãs-touro na fase de engorda, criadas no sistema anfigranja através do ajuste de dois modelos não lineares o de Gompertz e o Logísitco. As estimativas para os parâmetros do modelo de Gompertz não apresentaram coerência com os resultados observados, diferente para os do modelo Logístico, o qual também apresentou os melhores ajustes para descrever as variáveis estudadas. As deposições máximas dos nutrientes ocorreram dentro do período experimental; sendo a de cinzas primeira e a do extrato etéreo mais tardio. A partir da relação entre deposição de proteína na carcaça e consumo de proteína da ração foi encontrada uma baixa eficiência proteica de 36,76%. O melhor modelo para descrever o consumo da dieta e a deposição dos nutrientes da rã-touro na engorda foi o Logístico. A composição centesimal média das pernas de rãs-touro durante a engorda foi de 79,29% de água, 15,83% de proteína, 1,74% de gordura e 2,99% de cinzas. As deposições máximas dos nutrientes ocorreram dentro do período experimental, sendo a de extrato etéreo a primeira e a de cinzas mais tardia. O melhor modelo para descrever a deposição dos nutrientes da rã-touro na fase de engorda foi o Logístico / The objective of this study was to describe growth rates of live body weight, liver and adipose body/tissue, as well as nutrient deposition on the body and legs and feed intake, in order to assess dietary protein efficiency for bullfrogs during the grow-out phase, raised under the “Amphifarm” system by adjusting two nonlinear models, Gompertz and Logistic. The parameters estimated for the Gompertz model were not consistent with the observed results; unlike the logistic model, which yielded the best fits to describe the variables. The maximum deposition of nutrients occurred within the trial period, with ash first and ether extract later. The low protein efficiency of 36.76% was given by the relationship between protein deposition on the carcass and dietary protein intake. The Logistic model best described the dietary intake of nutrients and nutrient deposition for bullfrogs during the grow-out phase. The average chemical composition of bullfrog legs was 79.29% water, 15.83% protein, 1.74% fat and 2.99% ash. The maximum deposition of nutrients was verified during the trial period; with ether extract first and ash later. The Logistic was the model that best described the deposition of nutrients of bullfrogs during the grow-out phase

Orientador: Lídia Raquel de Carvalho / Banca: Jose Silvio Govone / Banca: Silvio Sandoval Zocchi / Resumo: Em análise de modelo de crescimento com o objetivo de representar o desenvolvimento de organismos vivos por um período maior que sua fase inicial, utiliza-se, frequentemente, modelos não lineares. O objetivo deste trabalho foi ajustar o modelo não-linear de Gompertz utilizando o software SAS através de três estruturas diferentes: 1) modelo de efeitos fixos; 2) modelo autorregressivo de primeira ordem e 3) modelo de efeito misto a um conjunto de dados de crescimento em peso de ratos da linhagem Rattus norvegicus e para um conjunto de dados de crescimento em peso de vacas de três raças: Flamengas, Guernsey-Gir e Holandesas, para verificar o melhor modelo para os conjuntos de dados obtidos. Para tal, optou-se por seis critérios estatísticos como avaliadores de ajuste. Os critérios foram: Quadrado médio do resíduo, critério de informação de Akaike (AIC), critério de informação Bayesiano (BIC), erro de predição médio (EPM), resíduos nos pontos iniciais, chamadores 0, usado para avaliar o ajuste nas primeiras observações e um índice sendo um valor considerado como avaliador no final do ajuste (calculado pela razão entre os 20% dos maiores valores estimados e a assíntota estimada). Além destes, foram feitos testes de Durbin-Watson e Breusch-Pagan para verificar a independência dos resíduos e a heteroscedasticidade, respectivamente. Os resultados mostram que, em muitas repetiçõees, onde havia a necessidade de correção da autocorrelação e heterocedasticidade, o modelo autorregessivo de primeira ordem foi o melhor ajuste. Já em relação ao ajuste único, nos casos em que a autocorrelação foi significativa, o modelo autorregressivo foi o melhor segundo os critérios e, quando a autocorrelação foi não significativa, o modelo de efeitos fixos foi o melhor modelo / Abstract: In growth model analyzing to represent the development of organisms for a larger period than its initial phase, it nonlinear models are often used . The aim of this work was to adjust the nonlinear Gompertz model using the software SAS by three different structures: 1) fixed effects model, 2) first-order autoregressive model and 3) mixed-effects model to a data of growth of female and male rats Rattus norvegicus and to a data of growth of three breeds cow to verify the best model for the data obtained. To attach the objective, six criteria was chosen as evaluators of statistical adjustment. The criteria were: residual mean square, Akaike information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), mean prediction error (EPM), residues in starting points, called res 0, used to assess the fit in the first observations and an index value being considered as an evaluator at the end of adjustment (calculated as the ratio between 20% of the largest estimated values and estimated asymptote). In addition, Durbin-Watson and Breusch-Pagan tests were performed to verify the independence of waste and heteroscedasticity, respectively. The results show that in many repetitions, where was need a correction of autocorrelation and heteroscedasticity, the first order autoregressive model was the best fit. In relation to the single adjustment, where the autocorrelation was significant, the autoregressive model was the best, according to the criteria utilized, and when the autocorrelation was not significant, the fixed effects model was the best model / Mestre

Orientador: Maria Cristina Batoni Abdalla / Doutor

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-03. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:29Z : No. of bitstreams: 1 000854378.pdf: 6674616 bytes, checksum: d5106f3df91d25255a99661658612b89 (MD5) / O uso de técnicas não lineares (sistemas complexos, geometria fractal e física quântica), com enfoques mais amparados pelos princípios do caos, é uma tendência crescente no estudo das ciências naturais, e estão sendo progressivamente apresentadas como opções válidas às suas correspondentes medidas em sistemas lineares (estruturas simples, geometria euclidiana e física clássica newtoniana), com seus enfoques mais cartesianos. Neste sentido, a neurobiologia e a acupuntura podem ajudar a lançar alguma luz nesta busca. Para se avaliar o alcance do uso de técnicas não lineares - mais especificamente a dimensão fractal - foi realizado estudo piloto experimental em humanos para avaliar a sensibilidade do eletroencefalograma na identificação de alterações provocadas por pontos auriculares de acupuntura, conforme critérios clínicos, neurofisiológicos e de geometria fractal. Pacientes de ambos os sexos, tendo cefaléia como queixa comum, mas não exclusiva, foram submetidos a exames eletroencefalográficos, antes e após a estimulação de pontos de acupuntura auricular, ou após ciclos de tratamento ambulatorial por acupuntura auricular e sistêmica. As dimensões fractais pelo 'método da contagem de caixas', foram obtidas com o auxílio do sofware ImageJ, a partir de imagens tratadas dos traçados digitalizados do eletroencefalograma, e os resultados apresentados como estudos de caso. Mediante análise das variações das dimensões fractais efetuada por estudo descritivo e quantitativo, foram observados os comportamentos evolutivos da condição clínica ou sintomática do paciente, e sua relação com os conceitos de desenvolvimento caótico dos sistemas complexos dinâmicos e adaptativos / The use of nonlinear techniques (complex systems, fractal geometry and quantum physics), with approaches more related with the principles of chaos theory, is a growing tendency in the study of the natural sciences, and are being progressively presented as valid options to their correspondent measures in linear systems (simple structures, Euclidean geometry and newtonian classical physics), with their more Cartesian approaches. In this sense, neurobiology and acupuncture may help to shed some light upon this search. Aiming to evaluate the reach of the use of nonlinear techniques - more specifically the fractal dimension - a pilot experimental essay was taken in human beings in order to evaluate the sensibility of eletroencefalography in the identification of alterations resulting from the stimulation of auricular acupuncture points, according to clinical, neurophysiologic and fractal geometry criteria. Both male and female patients, having headache as a common but not exclusive complaint, were subject to eletroencefalographic examinations, before and after the stimulation of auricular acupuncture points, or after cycles of both auricular and systemic acupuncture follow up in an outpatient basis. The fractal dimensions calculated by the 'box counting method' were obtained with the aid of ImageJ software, using digitalized images from the eletroencefalographic examinations, and the results are presented as case reports. By analysing the variations in the fractal dimensions both by descriptive and quantitative approaches, observations were made on the evolutive behaviours either from the clinical or from the symptomatic condition of the patient, and their relationship with the concepts of chaotic development of the complex dynamic adaptative systems

Made available in DSpace on 2016-01-13T13:27:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1988. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-13T13:31:36Z : No. of bitstreams: 1 000036077.pdf: 4483670 bytes, checksum: 03892faf78b15a06dda178fbff397aad (MD5)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-12-20Bitstream added on 2014-06-13T18:54:05Z : No. of bitstreams: 1 grossi_da_me_jabo.pdf: 379246 bytes, checksum: 621b0adcdace905a3bdad7c39ee9ad99 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A idade ao primeiro parto (IPP) e a produtividade acumulada (PAC) são características utilizadas para avaliar o desempenho reprodutivo dos bovinos de corte. Com o objetivo de estudar a variação fenotípica destas características e as associações genéticas existentes com outras de interesse econômico, dados de animais do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN - Nelore Brasil) foram utilizados para estimar, pelo método de máxima verossimilhança restrita, parâmetros genéticos e tendências genéticas de IPP e PAC. Análises bi-característica foram efetuadas entre IPP e PAC e entre estas e peso corporal das fêmeas corrigido para 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, e perímetro escrotal dos machos corrigidos para 365 (PE365), 450 (PE450), 550 (PE550) e 730 (PE730) dias de idade. As tendências genéticas de PAC e IPP foram favoráveis indicando que os critérios de seleção adotados nestas fazendas estão favorecendo estas características. As médias de herdabilidades estimadas para IPP e PAC foram de 0,03 e 0,19, respectivamente. A seleção baseada no P365 ou P450 visando melhorar a IPP seria mais eficiente do que a seleção direta para esta característica. A seleção com base na PAC poderá favorecer as fêmeas com maiores P365, P450 e menores IPP. Nestes rebanhos, o perímetro escrotal não está associado geneticamente a IPP e ao índice PAC. / Age at First Calving (AFC) and Accumulated Productivity (ACP) are traits used to evaluate the reproductive performance of the beef cattle. The knowledge of the existing genetic relationships between these traits and those that respond to the selection can aid the selective process. Data of a Brazilian Nelore cattle breeding program were used to estimate via REML the genetic, phenotypic and environmental parameters as well as the genetic trends of AFC and ACP. Bi-trait analyses were performed between AFC and ACP and between these traits and the heifers body weight adjusted to 365 (W365) and 450 (W450) days of age, and the males scrotal circumference adjusted to 365 (P365), 450 (P450), 550 (P550) and 730 (P730) days of age. The genetic trends of the AFC and ACP were favorable, indicating genetic gains of -0.011 days per year for AFC and 0.1655 kg of weaned calves per year for ACP. The means of estimated heritabilities for AFC and ACP were 0.03 and 0.19, respectively. The indirect selection for AFC by W365 and W450 is more efficient than the direct selection. The estimated genetic correlations indicated that the heavier heifers at these ages were the ones that produced more kilograms of weaned calves per year and had earlier AFC. In these herds, the males scrotal circumference was not genetically associated with AFC and ACP.