Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-06-09T17:40:00Z No. of bitstreams: 1 2015_DeboraIsauradeMacedo.pdf: 820282 bytes, checksum: 2a208e926ccdb5e81810e88d0242c17c (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-06-10T20:55:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_DeboraIsauradeMacedo.pdf: 820282 bytes, checksum: 2a208e926ccdb5e81810e88d0242c17c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-10T20:55:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_DeboraIsauradeMacedo.pdf: 820282 bytes, checksum: 2a208e926ccdb5e81810e88d0242c17c (MD5) / O Cerrado é uma região em constante alteração antrópica para fins agropecuários e de urbanização. A fauna desse bioma deve sofrer impactos com essas alterações. Neste estudo avalio a resposta das assembleias de morcegos à urbanização e uso da terra para agricultura na cidade de Brasília, e verifico se a dieta destes organismos reflete as características das matrizes adjacentes aos fragmentos estudados. Para tanto, amostrei fragmentos de cerrado sensu stricto inseridos em matriz rural e urbana, e comparei a assembleia de morcegos em termos de diversidade e composição de espécies presente em cada uma delas. Foram analisados isótopos estáveis de carbono e nitrogênio dos pelos dos morcegos para verificar se a dieta refletia a distribuição das assembleias. Foi feito um test t para comparar as diversidades dos dois tipos de ambiente e uma NMDS, seguida de um ANOSIM, para testar se havia diferença na composição de espécies. Foram capturados 310 morcegos pertencentes a três famílias e 18 espécies. Phyllostomidae foi a família com maior riqueza e Artibeus lituratus e Glossophaga soricina as espécies mais abundantes. Quatro espécies foram exclusivas da matriz rural e duas da matriz urbana. Houve diferença significativa na diversidade (t: 2.5649, df: 279.86, p: 0.010843) das assembleias de morcegos dos dois ambientes e a composição de espécies (R=0,2579; p<0,014) foi diferente. Não foi verificada diferença significativa na composição isotópica de C e N na dieta dos morcegos das diferentes guildas alimentares entre as duas matrizes. A primeira hipótese de que existe diferença nas assembleias de morcegos entre os dois tipo de matrizes foi corroborada, o que sugere que o tipo de uso da terra é um fator importante a ser levado em consideração nos estudos de assembleia de morcegos. Porém a dieta destes animais não seguiu o mesmo padrão, o que refuta a segunda hipótese. Este fato é um indicativo de que os morcegos estão se alimentando de forma similar nos dois tipos de ambiente. _______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Cerrado is a constantly changing region. Anthropogenic changes for agricultural purposes and urbanization are the main forces affecting the biome. These changes will probably impact its fauna. In this study, I evaluate the response of bats assemblages to urbanization and land use for agriculture in Brasília, and check whether the diet of these organizations reflects the characteristics of adjacent matrices to study fragments. For that, I compared the assemblages of bats located in fragments of cerrado sensu stricto inserted in rural and urban matrices. Assemblages were evaluated in terms of diversity and composition of species present in each fragment. To verify if the diet of bat assemblages reflected their distribution, I analyzed stable carbon and nitrogen isotopes from bat’s fur. To compare the diversity between both kinds of environment, I conducted a T test and a NMDS, then an ANOSIM to test for differences in species composition. I captured 310 bats belonging to three families and 18 species. Phyllostomidae was the family with greater richness, and Artibeus lituratus and Glossophaga soricina, the most abundant species. Four species were unique to rural matrix and two unique to urban matrix. There were significant differences in diversity (t: 2.5649, df: 279.86, p: 0.010843) of bat assemblies between both kinds of environments and species composition (R = 0.2579, p <0.014) was also different. There was no significant difference in isotopic composition of C and N in the diet of bats of different feeding guilds between the two matrices. The first hypothesis that there is difference in the bats' assemblages between both kinds of matrices was corroborated, which suggests that the type of land use is an important factor to be taken into account in bats assemblage studies. However, the diet of these animals did not follow the same pattern, which refutes the latter hypothesis. This fact indicates that bats are feeding similarly in both types of environment.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia, 2016. / Texto liberado parcialmente pelo autor. Conteúdo restrito: Capítulos 1 e 2. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-12-19T12:22:39Z No. of bitstreams: 1 2016_PaulaGalvãoTeixeira_Parcial.pdf: 339424 bytes, checksum: aa707ae64fc171a2b3f268c17a6d9fc8 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-01-27T17:21:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_PaulaGalvãoTeixeira_Parcial.pdf: 339424 bytes, checksum: aa707ae64fc171a2b3f268c17a6d9fc8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-27T17:21:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_PaulaGalvãoTeixeira_Parcial.pdf: 339424 bytes, checksum: aa707ae64fc171a2b3f268c17a6d9fc8 (MD5) / Os morcegos são reconhecidos como hospedeiros de uma grande variedade de vírus. No entanto, a relação entre a presença dos vírus e o hábito de vida dos morcegos quase não é explorada. O presente trabalho teve como objetivo entender um pouco melhor esta relação. Para tanto foi realizado um levantamento bibliográfico, apresentado no primeiro capítulo, sobre em quais morcegos já foram identificados vírus e quais são esses vírus, em um panorama global. Foi possível constatar que existe um maior número de estudos nos continentes do Velho Mundo e que a maioria dos trabalhos sobre vírus em morcegos nas Américas e no Brasil é sobre o vírus da raiva. Vírus pertencentes a 16 famílias já haviam sido identificados em morcegos no continente americano, sendo que destas famílias, apenas oito haviam sido identificadas no Brasil. Foi possível constatar que a família de morcegos Phyllostomidae é a que possui mais dados sobre vírus tanto no Brasil como nas Américas, seguida da família Molossidae, no Brasil. Sabendo que a ordem Chiroptera possui uma das dietas mais diversificadas entre todos os mamíferos, elaborei um estudo no capítulo 2 a fim de verificar a hipótese de que o hábito alimentar de quatro espécies de morcegos exerce influencia sobre a sua diversidade viral, bem como a hipótese de que quanto mais especializada a dieta dos morcegos, menor será a diversidade de vírus presentes em seus intestinos. Para tanto foram capturados 15 indivíduos de cada uma das seguintes espécies: Artibeus lituratus (Phyllostomidae) - frugívoro, Glossophaga soricina (Phyllostomidae) - nectarívoro, Desmodus rotundus (Phyllostomidae) – hematófago e, Nyctinomops laticaudatus (Molossidae) – insetívoro, em pontos aleatórios do Distrito Federal, no domínio Cerrado do Planalto Central, nos anos de 2014 e 2015. Os animais foram eutanasiados e tiveram seus intestinos armazenados a -80 ˚C para posterior análise. As amostras passaram por um processo de enriquecimento viral e os ácidos nucleicos foram extraídos utilizando-se o Kit de extração Zymo ZR Virus DNA/RNA. O DNA foi a seguir amplificado com polimerase phi29 e sequenciado usando o Kit de preparação Nextera DNA Library na plataforma Illumina MiSeq. As sequencias obtidas (reads) foram processadas e montadas usando CLC Genomics Workbench v.6.0.3. Os contigs resultantes foram comparados com o banco de dados Viral RefSeq, utilizando o programa BLASTX. A hipótese de que a diversidade viral varia de acordo com o hábito alimentar dos morcegos foi confirmad, porém a hipótese de que quanto mais especializada a dieta, dos morcegos, menor a diversidade viral encontrada no intestino, foi refutada. A espécie N. laticaudatus apresentou a maior diversidade viral, provavelmente porque os vírus encontrados no intestino dos espécimes, derivam da maior diversidade de insetos predados. As espécies G. soricina e A. lituratus apresentaram a mesma diversidade, o que pode ser explicado pelo fato de as duas espécies eventualmente utilizarem como alimentos plantas e esporadicamente insetos. D. rotundus foi a espécie com a menor diversidade viral, devido a dieta ser bastante restrita, apenas sangue. Porém, nesta espécie foi encontrado o vírus da Anemia Infecciosa das Galinhas – CAV, aqui encontrado pela primeira vez em D. rotundus, indicando que a espécie está predando além de mamíferos, aves. No todo 54 novos vírus foram detectados nas quatro espécies de morcegos, reforçando que pouco se conhece sobre os vírus presentes em morcegos. / Bats have been identified as a reservoir host of many viruses. However, the relationship between the presence of virus and bats trophic guild has been underexplored. The present study aimed to know this relationship better. To do this, I did a literature compilation in Chapter 1, showing which bats have already been identified as hosts of viruses and which viruses are these at a global scale. I found that most studies have been made in the Old World countries and that most of the studies on viruses in bats in the Americas and Brazil are about rabies virus. Viruses belonging to 16 families have already been identified in bats on the American continent, but only eight of these have been identified in Brazil. The bat family Phyllostomidae is the one with most data about viruses, followed by the Molossidae family, in Brazil. Knowing that the Chiroptera order has one of the most diversified diets of all mammals, I proposed a study, presented in Chapter 2, to verify the hypothesis that viral diversity is guided by the feeding habits of four bat species and the hypothesis that the more specialized the diet of the bats, the lower the viral diversity presente in their intestines. I captured 15 individuals of each of the following species: Artibeus lituratus (Phyllostomidae) - frugivorous, Glossophaga soricina (Phyllostomidae) - nectarivorous, Desmodus rotundus (Phyllostomidae) – sanguivorous e, Nyctinomops laticaudatus (Molossidae) – insectivorous, during the years of 2014 and 2015, in the Brazilian Cerrado (a savanna-like vegetation) areas in the Federal District. The captured bats were euthanized, and their intestines were stored at -80 ˚C until processing. After viral enrichment, nucleic acids were extracted using the Zymo ZR Virus DNA/RNA Extraction kit. The resulting DNA was amplified with a phi29 polymerase and sequenced using Nextera DNA Library Preparation Kit and Illumina MiSeq platform. The paired-ends readings (881,946) were quality-filtered, re-assembled using CLC Genomics Workbench v.6.0.3, and the resulting contigs were compared to the Viral RefSeq database using BLASTX. The hypothesis that viral diversity varies according to the eating habits of the bats was confirmed, but the hypothesis that the more specialized the diet of the bats, the lower the viral diversity present in their intestines, was disproved. N. laticaudatus species had the highest viral diversity, probably because the viruses found in the intestines of specimens reflect the diversity of insects predated by them. The species G. soricina and A. lituratus showed the same viral diversity, which can be explained by the fact that this two species feed on plants and sporadically in insects. D. rotundus was the species with the lowest viral diversity due to its restricted blood feeding habits. However, Chicken Anemia Virus – CAV was reported for the first time in D. rotundus, indicating that D. rotundus bats are preying on avian hosts, despite preying on mammals too. Finally, altogether, 54 new viruses have been detected in the four bat species on this study, stressing that little is known about viruses in bats.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2007. / Submitted by Natália Cristina Ramos dos Santos (nataliaguilera3@hotmail.com) on 2009-10-09T17:28:33Z No. of bitstreams: 1 Luiz Augustinho Menezes da Silva.pdf: 4954027 bytes, checksum: f48415367ea457e20ce364f8601ebdb2 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2011-01-04T18:54:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Luiz Augustinho Menezes da Silva.pdf: 4954027 bytes, checksum: f48415367ea457e20ce364f8601ebdb2 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-01-04T18:54:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Augustinho Menezes da Silva.pdf: 4954027 bytes, checksum: f48415367ea457e20ce364f8601ebdb2 (MD5) Previous issue date: 2007-06 / A fauna de morcegos brasileiros é composta de 166 espécies e destas, 76 ocorrem na caatinga. Apesar da elevada diversidade de morcegos na Caatinga, ainda são escassos os trabalhos desenvolvidos com este grupo no Bioma. Há extensas lacunas de conhecimento nas áreas de distribuição da Caatinga, com regiões sem nenhum tipo de estudo referente aos morcegos. A Caatinga é um bioma tipicamente brasileiro e cobre uma área de cerca de 98 mil Km2. A sua fitofisionomia é bem heterogênea, possuindo uma vegetação típica de zonas áridas como também enclaves de florestas mésicas, conhecidos como brejos de altitude, que se formam nas cotas superiores a 1000m de altitude. O presente trabalho teve como objetivo estudar a composição de fauna, dieta e reprodução das espécies de morcegos ocorrentes em uma área de caatinga propriamente dita e uma de brejo de altitude no nordeste do Brasil. As áreas localizam-se no agreste de Pernambuco, eqüidistante cerca de 9km, no município de Brejo da Madre de Deus. Os animais foram coletados mensalmente entre fevereiro de 2005 e janeiro de 2006, durante seis noites consecutivas, totalizando 5040 horas.rede em cada área amostrada. Foram registradas 21 espécies e 587 capturas na caatinga e 20 espécies e 819 capturas no brejo de altitude. A diversidade (H’ = 2,39) e equitabilidade (0,78) foram maiores na caatinga em relação ao brejo de altitude (H’ = 1,97) e equitabilidade de (0,64). Na caatinga quatro espécies foram consideradas abundantes, seis intermediárias e 11 raras, enquanto no brejo registraram-se duas abundantes, seis intermediárias e 12 raras. Na caatinga a espécie mais abundante foi Artibeus planirostris (n = 139, 23,67%) e no brejo Artibeus fimbriatus (n = 322, 39,3%). Em ambas as áreas ocorreu o domínio dos Phyllostomidae. Pode-se destacar a presença de Pygoderma bilabiatum, Artibeus fimbriatus, Lasiurus egregius e Myotis ruber ainda não registrados na literatura científica para áreas de caatinga propriamente dita e de Lasiurus ega como a primeira ocorrência em áreas de brejo de altitude. Além disso, estas espécies são pouco amostradas na região Nordeste. As espécies de morcegos catalogadas podem ser divididas em insetívoras (n = 9), frugívoras (n = 7), nectarivoras (n = 3), hematófagas e onívoras (n = 2) e carnívoras e piscívoras (n = 1), em relação a abundância os frugívoros se destacaram (n= 1044), seguido pelos nectarívoros (n = 174), insetívoros (n = 100), hematófagos (n = 58), onívoros (n = 25) e carnívoros (n = 3). Dos cinqüenta itens consumidos pelos morcegos, 38 ocorreram em amostras da caatinga e 35 nas do brejo de altitude, entre frutos (n = 31), pólen/néctar (n = 16), pequenos vertebrados (n = 1), peixe (n = 1) e insetos diversos. Vinte e dois itens foram comuns às duas áreas, enquanto 15 ocorreram apenas na caatinga e 13 no brejo de altitude. Na matriz de nicho 17 células foram ocupadas pelas 25 espécies de morcegos. Houve sobreposição entre os frugívoros de dossel de grande porte (Artibeus planirostris / Artibeus fimbriatus) e para os frugívoros de sub-bosque (Carollia perspicillata / Pygoderma bilabiatum / Sturnira lilium. Na categoria nectarívora houve sobreposição entre as espécies Glossophaga soricina / Lonchophylla mordax, na de hematófagos (Desmodus rotundus / Diphylla ecaudata) e em meio aos insetívoros de clareiras (Myotis nigricans / Myotis ruber / Rhogeessa io), as demais células foram preenchidas por representantes isolados. Os maiores valores de sobreposição de nicho alimentar foram obtidos no brejo de altitude e os menores na caatinga, indicando haver uma maior competição pelos recursos alimentares no brejo. Com relação ao número de itens alimentares consumidos Glossophaga soricina se destacou, apresentando a maior riqueza nas duas áreas estudadas, 18 itens na caatinga e 20 no brejo de altitude. Seguida por Lonchophylla mordax (n = 16) e Carollia perspicillata (n = 14) que se sobressaíram na caatinga, esta ultima também em destaque para o brejo de altitude (n = 15), seguida por Artibeus fimbriatus (n=12). Entre os animais capturados, 658 eram machos e 748 fêmeas em uma razão sexual de 0,88 machos/fêmeas. No brejo de altitude foram capturados 384 machos e 435 fêmeas e na caatinga 274 machos e 313 fêmeas apresentando como razão sexual respectivamente 0,88 machos/fêmeas e 0,87 machos/fêmeas. A razão sexual da maior parte das espécies seguiu o padrão de aproximadamente 1:1, entretanto com uma tendência maior a captura de fêmeas. Vinte espécies foram capturadas em atividade reprodutiva, 15 ocorreram na caatinga e 14 no brejo de altitude. Das 754 fêmeas capturadas 383 estavam em atividade reprodutiva, entre elas 222 grávidas, 139 lactantes e 22 grávidas e lactantes concomitantemente. Não ocorreram diferenças acentuadas para os períodos reprodutivos entre as populações de morcegos nas duas áreas estudadas. Proporcionalmente ao número de fêmeas capturadas em atividade reprodutiva ocorreu um maior número de coletas de fêmeas grávidas na estação seca e de lactantes na chuvosa. Com relação à estrutura etária constatou-se a presença de indivíduos jovens na estação chuvosa, o que pode indicar um período de recrutamento dos filhotes que começaram a voar. O estro pós-parto ocorreu em cinco espécies, Artibeus fimbriatus (n = 9), Artibeus lituratus (n = 6), Artibeus planirostris (n = 5), Carollia perspicillata (n = 1) e Glossophaga soricina (n=1) sendo evidenciado pela captura de fêmeas grávidas e lactantes concomitantemente. Uma fêmea de Platyrrhinus lineatus foi capturada grávida em abril e recapturada em dezembro, novamente grávida. Tais registros evidenciam uma poliestria. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The fauna of Brazilian bats is composed of 166 species and 76 occur in the caatinga. In spite of the high diversity of bats in the caatinga, there are still scarce the studies with this group in this biome. Extensive gaps of knowledge related to its distribution in the caatinga with some areas without any information referring the bats. Caatinga is a typical Brazilian biome covering around 98.000 km2. Its physiognomy is quite heterogeneous with vegetation typical of arid zones and enclaves of mesic forest, known as brejo de altitude, which are composed upper than 1000m of altitude. This study aimed to identify the composition of fauna, diet and reproduction of the species of bats from one typical caatinga vegetation and other from brejo de altitude, both in the northeast of Brazil. The animals were collected monthly from February 2005 to January 2006, during six consecutive nights, totalizing 5040 hours using nets in each sampled areas. In the caatinga were registered 21 species and 587 captures and in the brejo de altitude were registered 20 species and 819 captures. The diversity and equitability (H’ = 2.39 and H’= 1.97; 0.78 and 0.64, respectively) were greater in caatinga than in brejo de altitude In the caatinga, four species were considered abundant, six intermediary and 11 rare; in the marsh were registered two abundant, six intermediary and 12 rare. In the caatinga, the most abundant specie was Artibeus planirostris (n = 139, 23.67%) and in the marsh was Artibeus fimbriatus (n = 322, 39.3%). In both areas occurred the dominance of Phyllostomidae. It can be detached the presence of Pygoderma bilabiatum, Artibeus fimbriatus, Lasiurus egregius and Myotis rubber not registered in the literature to areas of caatinga properly stated and the presence of Lasiurus ega as the first occurrence to brejo de altitude areas. Furthermore, these species are weakly sampled in the Northeast region. The bat species catalogued can be divided in insectivorous (n = 9), frugivorous (n = 7), nectarivorous (n = 3), haematophagous and omnivorous (n = 2) and carnivorous and piscivorous (n = 1). Considering the abundance, the frugivorous were detached (n = 1044), followed by the nectarivorous (n = 174), insectivorous (n = 100), haematophagous (n = 58), omnivorous (n = 25) and carnivorous (n = 3). From fifty items eaten by the bats, 38 occurred in the samples from the caatinga and 35 from the brejo de altitude, among fruits (n = 31), pollen/nectar (n = 16), small vertebrates (n = 1), fish (n = 1) and several insects. Twenty two items were common to the two areas, while 15 occurred only in the caatinga and 13 from the brejo de altitude. In the matrix of niche, 17 cells were occupied by 25 species of bats. There was superposition between frugivorous from the canopy of high tree (Artibeus planirostris / Artibeus fimbriatus) and the frugivorous from the sub-forest (Carollia perspicillata / Pygoderma bilabiatum / Sturnira lilium). In the category of nectarivorous there was superposition between the species Glossophaga soricina / Lonchophylla mordax; in the haematophagous (Desmodus rotundus / Diphylla ecaudata) and between insectivorous of gaps (Myotis nigricans / Myotis ruber / Rhogeessa io), the other cells were filled out by isolated representatives. The biggest values of superposition of food niche were obtained in the brejo de altitude and the lowest in the caatinga, indicating a bigger competition for food resources in the marsh. Regarding the number of food items consumed, Glossophaga soricina was detached, showing the greater value in two studied areas, 18 items in the caatinga and 20 in the brejo de altitude. Lonchophylla mordax (n = 16) and Carollia perspicillata (n = 14) were detached in the caatinga; the last specie is also detached to the brejo de altitude (n = 15), followed by Artibeus fimbriatus (n = 12). Among the captured animals, 658 and 748 were male and females, respectively, in a sexual ratio of 0.88 males/females. In the brejo de altitude, 384 males and 435 females were captured, and in the caatinga, 274 males and 313 females, with a sexual ratio of 0.88 and 0.87, respectively males/females. The sexual ratio from the major of species followed the standard of 1:1, approximately, with a tendency to capture more females. Twenty species were captured in a reproductive activity, 15 occurring in the caatinga and 14 in the brejo de altitude. From 74 females captured, 383 were reproductively actives, among them, 222 pregnant ones, 139 lactants and 22 both pregnants and lactants. There did not take place differences accented for the reproductive periods between the populations of bats in two studied areas. Proportionally to the number of females captured in reproductive activity there took place a bigger number of collections of pregnant females in the dry station and of sucking ones in the rainy one. Regarding the age structure it was noticed the presence of young individuals in the rainy station, which can indicate a period of recruitment of the cubs that began to fly. The oestrum powderschildbirth took place in five sorts, Artibeus fimbriatus (n = 9), Artibeus lituratus (n = 6), Artibeus planirostris (n = 5), Carollia perspicillata (n = 1) and Glossophaga soricina (n=1). This was noted by the capture of females that were simultaneously pregnant and lactating. A female of Platyrrhinus lineatus was captured pregnant in April and re-captured in December, again pregnant. Such registers show a polyestrous.