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Prevalência da mutação germinativa TP53 p.R337H na região metropolitana de Campinas e cidades circunvizinhas / Prevalence of germline TP53 p.R337H mutation at metropolitan area of Campinas and surrounding cities

Caminha, Isabel Pereira, 1983- 27 August 2018 (has links)
Orientador: José Andrés Yunes / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T10:43:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caminha_IsabelPereira_D.pdf: 4630571 bytes, checksum: d16d4c6474c6966dc1040d1c4185c4a5 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: A mutação germinativa p.R337H do gene TP53 está associada à alta incidência de tumores do córtex da adrenal (TCA) em regiões Sul e Sudeste do Brasil, onde as evidências indicam a ocorrência de efeito fundador. A alta frequência de relatos desta mutação no Sul do Brasil nos encorajou a desenvolver um método adequado para a detecção de mutações em larga escala, com o objetivo de determinar a incidência da p.R337H em uma população de São Paulo, o Estado mais populoso do Brasil. Um novo método foi desenvolvido a fim de detectar a mutação p.R337H em amostras armazenadas em papel filtro, utilizando PCR em tempo real. Amostras de DNA genômico de 34.344 recém-nascidos de uma região específica do Estado de São Paulo foram selecionadas para detectar a frequência desta mutação germinativa. PCR Alelo-específico e Nested-PCR foram utilizados para verificar a presença do haplótipo fundador brasileiro em recém-nascidos portadores da mutação. Entre as 34.344 amostras triadas, 75 foram identificadas como portadores da mutação p.R337H. Esta frequência (0,21%) é semelhante à encontrada na região Sul do Brasil. O haplótipo fundador brasileiro foi identificado em todos os pacientes em que a amostra foi adequada para esta análise. A distribuição da mutação mostrou-se heterogênea, sendo mais abundante em cidades da fronteira com o sul do Estado de Minas Gerais. Nossos dados indicam que a frequência encontrada na população analisada está próxima à encontrada em outras regiões do Brasil. Além disso, a presença do haplótipo fundador em todas as portadoras corrobora a hipótese de efeito fundador. Desenvolveu-se tecnologia adequada para triagem em larga escala, utilizando amostras coletadas em papel filtro. A identificação de portadores ao nascimento pode aumentar as chances de diagnóstico precoce, melhorando o prognóstico destes pacientes e alertando os membros da família sobre um aumento da susceptibilidade para outros tipos de câncer. Entretanto, estudos posteriores são necessários, por exemplo, para avaliar a ocorrência de câncer de adulto em portadores da mutação, bem como o impacto psicológico de um programa de triagem na população saudável e na grande maioria dos portadores, os quais não desenvolverão a doença / Abstract: The germline p.R337H mutation of TP53 gene is associated with high incidence of adrenocortical tumors (ACT) in South and Southeastern regions of Brazil, where evidence indicates the occurrence of founder effect. The high frequency of this mutation in Southern Brazil encouraged us to develop a suitable method for mutation detection on a large scale, aiming to determine the frequency of p.R337H in a population of the most populous state in Brazil, São Paulo. A novel method was developed in order to detect p.R337H mutation in samples collected on Guthrie card, using real time PCR. Genomic DNA samples from 34.344 newborns from a specific region of São Paulo State were screened for this germline mutation. Alelle-Specific-PCR and Nested-PCR Assays were used to verify the presence of the Brazilian founder p.R337H haplotype in newborn mutation carriers. Among the 34.344 screened samples, we found 75 carriers of the TP53 p.R337H mutation. This frequency (0,21%) is close to that found in Brazil Southern region. We identified the haplotype A3 in all patients in whom the sample was suitable for analysis. The distribution of the mutation was shown to be heterogeneous, being more abundant in cities bordering the south of Minas Gerais. Our data indicate that the frequency found in a population of the State of São Paulo is close to that found in other regions of Brazil. Furthermore, the presence of the founder haplotype in all carriers, support the hypothesis of founder effect. We developed an appropriate technology for large-scale screening, using samples collected on filter paper. The identification of patients at birth may increase the chances of early diagnosis, improving the prognosis of these patients and alerting family members about an increased susceptibility to other cancers. However, further studies are required, for example, to assess the occurrence of cancer in adult patients with the mutation as well as the psychological impact of a screening program in the healthy population and in most carriers, who do not develop the disease / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Doutora em Genética e Biologia Molecular
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Espectro tumoral e alterações moleculares associadas à tumorigênese em portadores da mutação TP53 R337H / Tumor spectrum and molecular changes associated to tumorigenesis in carriers of TP53 R337H mutation

Conte, Ana Luiza Ongaro Seidinger, 1985- 20 August 2018 (has links)
Orientador: José Andrés Yunes / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T16:36:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Conte_AnaLuizaOngaroSeidinger_D.pdf: 7461860 bytes, checksum: a44751dc1556a30853dcde70f024aed9 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O gene supressor de tumor TP53 é um dos mais bem caracterizados genes cujo papel na etiologia é conhecido tanto em tumores hereditários como esporádicos. Mutações germinativas neste gene normalmente estão associadas à Síndrome de Li-Fraumeni, uma síndrome de predisposição ao câncer cujos portadores apresentam alto risco de desenvolvimento de uma variedade de tumores ao longo da vida. Uma mutação específica deste gene é altamente prevalente na população brasileira, chegando a estar presente em 0.3% da população saudável. Esta mutação, a R337H, não foi descrita como uma mutação associada a um amplo espectro tumoral e, sim, como uma mutação tecido-específica associada somente ao desenvolvimento do tumor do córtex da adrenal (TCA). Entretanto, algumas evidências indicavam que ela poderia contribuir para a etiologia de outros tumores, além do TCA. A R337H foi encontrada em 06 famílias com Síndrome de Li- Fraumeni like e em 2.4% de pacientes diagnosticadas com câncer de mama. Com o objetivo de obter maiores evidências sobre a contribuição da R337H na etiologia de outros tumores além do TCA, investigamos a prevalência desta mutação em 493 pacientes diagnosticados com diferentes tumores pediátricos. Além disto, buscamos investigar alterações cromossômicas que poderiam estar associadas ao processo de tumorigênese em portadores desta mutação. Os resultados mostraram que além do TCA e câncer de mama, a R337H está fortemente associada ao carcinoma de plexo coroide (69%) e ao osteossarcoma (7%) na faixa etária pediátrica. Em nossa instituição, foi observado um aumento da incidência relativa do carcinoma de plexo coroide em relação ao papiloma de plexo coroide. Uma deleção do gene TP53 em células do sangue periférico sob a forma de um mosaico foi identificada nos pacientes portadores da R337H que desenvolveram o TCA. Os dados mostraram que se trata de uma deleção intersticial do cromossomo 17, a qual especula-se ter ocorrido durante o período embrionário. Os resultados sobre a prevalência desta mutação em diferentes tumores pediátricos poderão contribuir para um adequado aconselhamento genético das famílias em que a R337H está presente. Adicionalmente, o mosaicismo encontrado nos portadores da R337H que desenvolveram o TCA nos permitiu formular uma hipótese sobre a tumorigênese adrenocortical associada à R337H e talvez possa também contribuir para a futura compreensão do comportamento oncogênico desta mutação / Abstract: The tumor suppressor gene TP53 is a well characterized gene whose role in the etiology of hereditary and sporadic cancer is well established. Germline mutations in this gene are usually associated with the Li-Fraumeni Syndrome (LFS), a cancer predisposition syndrome in which individuals are at a high risk to develop a wide spectrum of tumors during their lives. A specific mutation of TP53 gene is highly prevalent among the Brazilian population, reaching 0.3% of healthy individuals. This mutation, R337H, was not described as a mutation associated to a wide spectrum of tumors but as a tissue-specific mutation, predisposing individuals only to adrenocortical tumors (ACT). However, some evidences have indicated that it could contribute to the etiology of other tumors besides ACT. The R337H was found in six families diagnosed with LFS-like and also in 2.4% of patients diagnosed with breast cancer. In order to obtain more evidence regarding the role of R337H in the etiology of tumors besides ACT, we have investigated the prevalence of this mutation among 493 pediatric patients diagnosed with cancer. Moreover, we have looked for chromosomal changes potentially involved in tumorigenic process among R337H carriers. Our results demonstrated that, besides ACT and breast cancer, the R337H mutation is strongly associated to choroid plexus carcinoma (69%) and osteosarcoma (7%) in the pediatric age. At our institution it was observed a raise in the relative incidence of choroid plexus carcinoma to choroid plexus papilloma. It was identified a mosaic of cells presenting TP53 deletion in peripheral blood of R337H carriers who developed ACT. Our data showed that is an interstitial deletion affecting the short arm of chromosome 17 that may have occurred during the embryonic life. The results regarding the R337H prevalence among different pediatric tumors may potentially contribute to a more accurate genetic counseling of families bearing this mutation. Additionally, the TP53 deletion found in R337H carriers who developed ACT prompted us to formulate a hypothesis on the adrenocortical tumorigenesis associated to this mutation. Finally, our findings may be useful to better understand the oncogenic behavior of this mutation / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

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