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Caracterização fenotípica e genotípica de cepas de Chromobacterium violaceum isolados no estado do Ceará

Mendes, Rafael de Carvalho January 2010 (has links)
Rafael de Carvalho Mendes. Caracterização fenotípica e genotípica de cepas de Chromobacterium violaceum isolados no estado do Ceará. 2010. 70 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2010. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2013-07-03T11:57:09Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_rcmendes.pdf: 1224623 bytes, checksum: 438c4c190ac6696c329b50b2b619965a (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes(erikaleitefernandes@gmail.com) on 2013-07-04T11:48:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_rcmendes.pdf: 1224623 bytes, checksum: 438c4c190ac6696c329b50b2b619965a (MD5) / Made available in DSpace on 2013-07-04T11:48:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_rcmendes.pdf: 1224623 bytes, checksum: 438c4c190ac6696c329b50b2b619965a (MD5) Previous issue date: 2010 / Chromobacterium violaceum é classificada como uma β-proteobactéria, saprófita, comumente encontrada em solo de regiões de clima tropical e subtropical, produz vários metabólitos de grande interesse biotecnológico, dentre eles, a violaceína. Este trabalho consiste numa caracterização fenotípica e genotípica de cinco cepas de Chromobacterium violaceum isolados nos Municípios de Tejussuóca e Banabuiú, ambas, no Estado do Ceará. A caracterização genotípica consistiu de sequenciamento da região rDNA 16S e análises RFLP do gene recA. Para a caracterização fenotípica, foram realizados testes bioquímicos e susceptibilidade a antibióticos, a óleos essenciais de Lippia alba, bem como seus constituintes majoritários. Com o sequenciamento, as cepas isoladas no estado do Ceará são espécies de Chromobacterium violaceum. Por ser um gene conservado, o recA é utilizado como marcador molecular, fornecendo mais informações na especificidade dos genoma bacterianos. Pela a análise por RFLP, as cepas 1425, 1323, 2221 e a ATCC 12472 apresentaram três fragmentos digeridos pela enzima, enquanto que as cepas 1221 e 1222 apresentaram dois fragmentos, indicando sequências nucleotídicas diferentes para este gene conservado. As cincos cepas apresentaram características fenotípicas iguais a Chromobacterium violaceum ATCC 12472, todas demonstraram ser resistentes a uma grande variedade de antibióticos β-lactâmicos e mais susceptíveis as fluorquinolonas. Este é o primeiro trabalho na literatura científica que trata da ação antimicrobiana dos óleos essenciais da Lippia alba sobre a Chromobacterium violaceum, e pelos resultados obtidos, os óleos essenciais exerceram ação bactericida sobre todas as cepas, sugerindo ser uma possível alternativa de tratamento nos casos de doença provocada pela Chromobacterium violaceum, que na maioria dos casos é confundida pela classe médica com a melioidose provocada pela Burkholderia pseudomallei.
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Classificação morfológica, genotipagem e avaliação da patogenicidade de isolados clínicos e ambientais de Acanthamoeba em Vitória e região metropolitana (ES).

POSSAMAI, C. O. 28 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_5885_.pdf: 3244352 bytes, checksum: e5fafdb73fe28c45324cf21dd7acb640 (MD5) Previous issue date: 2012-08-28 / O gênero Acanthamoeba compreende protozoários anfizóicos que estão presentes nos mais diversos ambientes, podendo causar no homem doenças graves, como a ceratite amebiana e a encefalite amebiana granulomatosa. A sua patogenicidade não é inteiramente conhecida, assim como os fatores que determinam a infecção. Para isso, marcadores vêm sendo investigados na tentativa de mensurar a virulência de linhagens dessa ameba. Com o objetivo de esclarecer alguns aspectos biológicos e moleculares de Acanthamoeba, isolados clínicos e ambientais foram obtidos e caracterizados por análise morfológica, molecular e testes de patogenicidade. Foram coletadas amostras de raspado de córnea de pacientes com suspeita de ceratite amebiana e amostras ambientais provenientes de poeira, solo, piscina, água tratada, água do mar e água de inundação, em Vitória e região metropolitana (ES). Todas as amostras foram cultivadas em meio ágar soja. Além da cultura, as amostras de raspado de córnea também foram coletadas em salina de Page e submetidas a uma reação de semi-nested PCR. Culturas positivas para Acanthamoeba, identificadas com base na morfologia dos cistos e trofozoítos, foram selecionadas, clonadas e classificadas nos grupos morfológicos I, II ou III. Para a confirmação do gênero Acanthamoeba dos clones foi realizada PCR com iniciadores gênero-específicos do gene 18S rDNA. A genotipagem dos isolados foi realizada a partir do sequenciamento parcial deste mesmo gene e o potencial patogênico dos isolados clonados foi avaliado por meio de testes de termotolerância e de osmotolerância. Foram coletadas em ágar 90 amostras ambientais, 16 de raspado de córnea e 9 de lentes de contato (LC). Destas, 37 (32 ambientais, 4 clínicas e 1 de LC) foram positivas para Acanthamoeba, sendo obtidos 28 clones (24 ambientais, 3 clínicos e 1 de LC). Desses, 26 apresentaram características morfológicas do grupo II, um do grupo I (solo) e um não foi classificado de acordo com os parâmetros morfológicas de classificação. A PCR confirmou a identificação genérica de todos os isolados obtidos, sendo que os clínicos, o de LC e a maioria dos ambientais sequenciados foram classificados como pertencentes ao genótipo T4. Dentre os isolados ambientais, dois foram agrupados no genótipo T11 (piscina) e um no T1 (poeira). A partir dos testes de termotolerância e de osmotolerância, todos os isolados clonados, clínicos e ambientais, foram considerados potencialmente patogênicos, pois, embora o crescimento à concentração de 1M de manitol não tenha sido observado em todos os isolados, todos cresceram a 37°C. Os resultados deste estudo pioneiro no Espírito Santo confirmam a predominância do grupo morfológico II e do genótipo T4 em isolados clínicos e ambientais de Acanthamoeba e relata no Brasil o isolamento de Acanthamoeba pertencente ao genótipo T1. Este trabalho demonstra também a presença de isolados potencialmente patogênicos no ambiente, inclusive em amostras de água do mar e de água de inundação, o que pode representar um fator de risco para o desenvolvimento de infecções causadas por Acanthamoeba. Além disso, a metodologia utilizada neste estudo poderá ser utilizada para um diagnóstico mais rápido, sensível e específico de ceratite por Acanthamoeba. PALAVRAS CHAVES: Acanthamoeba, isolamento, genotipagem, termotolerância, osmotolerância.
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ANÁLISE DE TRANSMISSÃO E DA DINÂMICA DE MODIFICAÇÃO DE GENÓTIPOS DE Mycobacterium tuberculosis NA REGIÃO METROPOLITANA DE VITÓRIA ES EM UM INTERVALO DE 10 ANOS

NOBREGA, R. L. P. 25 February 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:35:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8567_Tese de doutorado Renata Nóbrega.pdf: 3031933 bytes, checksum: 14ff2b6175baee37b4eaad172d5cbb11 (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / Introdução: Técnicas de tipagem molecular têm colaborado para o entendimento da dinâmica de transmissão da tuberculose (TB). Apesar de inúmeros trabalhos terem sido publicados a esse respeito, poucos estudos, no entanto, foram realizados levando-se em consideração a dinâmica de modificação dos perfis genotípicos de M. tuberculosis (Mtb) em um intervalo de tempo longo. Objetivos: Caracterizar os genótipos e identificar os fatores de risco associados com transmissão recente e tamanho de cluster de Mtb na Região Metropolitana de Vitória ES (RMV) e analisar a dinâmica de modificação dos genótipos de Mtb na Região Metropolitana de Vitória ES em intervalo de 10 anos. Métodos: Este estudo foi constituído de duas partes. Primeira parte: Estudo transversal de casos novos de TB diagnosticados na RMV, entre 2000 e 2010 para identificar fatores de risco associados à transmissão recente da TB e o tamanho do cluster de Mtb. A genotipagem dos isolados de Mtb foi realizada com base nos métodos de RFLP IS 6110, Spoligotyping e na análise de deleção RDRio. Foram realizados Modelos de regressão hierárquica polinomial para identificar os fatores associados com o tamanho do cluster. Segunda Parte: Estudo observacional para analisar a dinâmica de modificação dos genótipos de Mtb na RMV em intervalo de 10 anos (com cortes transversais nos períodos de 2000 2001 e 2011) com base nas técnicas de RFLP IS 6110 e MIRU- VNTR 24 loci tendo como fonte de dados registros laboratoriais e o SINAN. Resultados: Primeira Parte: Dentre os 959 isolados de Mtb, 461 (48%) casos pertenciam a um cluster. Nossos modelos de regressão polinomial mostraram que os isolados de Mtb pertencentes a família LAM e ao genótipo RDRio foram mais prováveis de estarem em clusters com 6-9 isolados (OR = 1,17, 95% IC 1,08 1,26; OR=1,25, 95% IC 1,14- 1,37; respectivamente) em relação aos outros grupos. Os pacientes com ≥10 isolados foram mais prováveis de pertencerem a família LAM e a família de RFLP ES14 (OR = 1,14, 95% IC 1,06 1,23; OR= 7,03, 95% IC 4,00 12,34, respectivamente). Segunda Parte: No período de 2000-2001, dentre os 329 isolados, 109 (33,2%) foram agrupados em 38 clusters enquanto, em 2011, dentre os 485 isolados de Mtb, 176 (36,2%) foram distribuídos em 39 clusters. Não houve diferença estatisticamente significativa entre os períodos analisados em relação a formação de um cluster (p=0,35). A análise dos padrões gerados pelo RFLP IS 6110 identificou 8 clusters, ao quais estão mais envolvidos com transmissão recente na RMV. A correlação entre as duas técnicas de genotipagem mostrou em 2000-2001 uma concordância de 42,1%, e 42,5% em 2011. Conclusão: Esses resultados confirmam que a família LAM e o genótipo RDRio são mais encontrados em clusters com 6-9 isolados, e que a família de RFLP ES14 é o genótipo mais prevalente na RMV, sugerindo que a proporção de casos de TB em uma cidade pode ser causada por um pequeno número de genótipos circulantes dentro de uma região e que fatores relacionados ao patógeno devem ser melhor estudados para melhoria no controle da doença. Palavras-chave: Mycobacterium tuberculosis, técnicas de genotipagem, epidemiologia molecular, dinâmica de modificação do Mtb.
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Genotipagem por sequenciamento para identificação de SNPs e associação com características agronômicas em Coffea canephora

MOTTA, L. B. 23 February 2016 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:36:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7170_Ludymila Brandão Motta.pdf: 7486868 bytes, checksum: a0e1e33cf1278b9f7fc7367d7bccdaa3 (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / A genotipagem por sequenciamento (GBS) é capaz de identificar e genotipar milhares de polimorfismos do tipo SNPs de forma simultânea. Objetiva-se contribuir para o melhoramento genético do cafeeiro Conilon através da caracterização da ocorrência de SNPs no genoma de Coffea canephora e de associações destes com características de interesse agronômico. Os145 indivíduos de duas famílias de irmãos completos (clones 109x120/120x109 e 76x48) do programa de melhoramento do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (Incaper)foram fenotipados e os DNAs foram multiplexados em sequenciador Ilumina na Universidade de Cornell. Detectaram-se 91.105 SNPs antes de aplicar os parâmetros de filtragem, sendo que após os filtros houve redução de 64%. Ampla distribuição dos SNPs foi encontrada, sendo que foram detectados em média 1330 SNPs gênicos e 2955 intergênicos, por pseudocromossomo. Verificou-se que o padrão de distribuição dos SNPs nas regiões do genoma difere. A menor ocorrência de SNPs detectada em regiões gênicas é esperada como consequência da pressão de seleção, que limita as alterações de aminoácidos nas sequências proteicas. Os estudos de associação permitiram encontrar 18 SNPs associados a características fenotípicas de Coffea canephora (S2_9329731, S2_4579518, S2_41329025, S2_17821870, S2_20934616, S3_23227842, S4_22978689, S5_10964474, S6_9949547, S7_13991105, S7_13991086, S7_13991077, S9_4618814, S9_18527411, S10_24840747, S11_30063996, S11_23828233). Localizam-se em regiões intergênicas 33% dos SNPs, sendo que os demais se distribuem em região de íntrons, éxons e 3UTR. Os SNPs em região codificadora são responsáveis por alterações não sinônimas em 82% das ocorrências. Os resultados encontrados são importantes para a cafeicultura e podem contribuir para a seleção assistida por marcadores. Palavras-chave: cafeeiro, sequenciamento, SNP, genotipagem, estudos de associação.
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Avaliação das interações entre a suplementação antioxidante com o óleo de pequi (caryocar brasiliense camb.) e os polimorfismos nos genes da α-actinina-3 (ACTN-3), eritropoetina (EPO) e seu receptor (EPOR) nos resultados do hemograma, marcadores bioquímicos e peroxidação lipídica, em corredores de rua

Ribeiro, Ieler Ferreira January 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-04-30T14:41:02Z No. of bitstreams: 1 2013_IelerFerreiraRibeiro.pdf: 1216592 bytes, checksum: d00140db9fb6953ef58299c495cacd72 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-05-02T13:04:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_IelerFerreiraRibeiro.pdf: 1216592 bytes, checksum: d00140db9fb6953ef58299c495cacd72 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-02T13:04:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_IelerFerreiraRibeiro.pdf: 1216592 bytes, checksum: d00140db9fb6953ef58299c495cacd72 (MD5) / O exercício físico, por aumentar o consumo de oxigênio, pode produzir um desequilíbrio entre a geração de espécies reativas de oxigênio (ERO) e a capacidade de defesa antioxidante do organismo, levando ao estresse oxidativo. Esta sobrecarga oxidativa pode acarretar dano celular e graves lesões musculares com consequente processo inflamatório. Neste contexto, muitos atletas consomem suplementos antioxidantes para evitar os danos oxidativos, a inflamação e o consequente comprometimento do desempenho. O pequi (Caryocar brasiliense Camb.), um fruto típico do cerrado brasileiro, contém diversos componentes antioxidantes, importantes para reduzir ERO produzidas durante a atividade física. Visto que nutrientes presentes na alimentação podem interagir com o genoma humano para influenciar a saúde e a doença, e variabilidade genética também pode influenciar a resposta à dieta, estudos que avaliem esta interação podem contribuir para futuras intervenções dietéticas baseadas no conhecimento do requerimento nutricional, do estado nutricional e do genótipo. Alguns polimorfismos já foram descritos na literatura como agentes interferentes do desempenho atlético em determinadas categorias de esportes. Entre eles, várias variantes sob a forma de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) já foram identificadas, incluindo os SNPs R577X no gene da α-actinina-3 (ACTN-3), T→ G na região promotora do gene da eritropoetina (EPO) e G6002A no receptor de eritropoetina (EPOR). O gene da ACTN-3 codifica a proteína α-actinina-3, componente altamente conservado da maquinaria contrátil das fibras rápidas da musculatura esquelética, e é expresso apenas em miofibras tipo II, que são fibras glicolíticas do músculo esquelético. O polimorfismo da ACTN-3 resulta na substituição de uma arginina (R) por um códon prematuro de parada (X) na posição 577 e cria uma proteína não funcional. A eritropoetina (EPO) é o principal hormônio endógeno regulador da eritropoiese, que permite a sobrevivência, proliferação, diferenciação das células progenitoras e, consequentemente, aumento da oxigenação dos tecidos. Assim, polimorfismos no gene da EPO ou de seu receptor (EPOR) podem afetar o desempenho atlético, por influenciarem a expressão de EPO. O objetivo deste trabalho foi investigar a influência dos SNPs rs1815739 no gene da ACTN-3, rs1617640 na região promotora do gene da EPO, e rs121918116 no gene da EPOR na peroxidação lipídica (Teste Tbars), hemograma completo e dosagens bioquímicas de creatina quinase (CK), aspartato aminotransferase (AST), alanina aminotransferase (ALT) e proteína Creativa (PCR e PCR-us), em uma amostra de corredores de rua do Distrito Federal (N=123), antes e depois da suplementação com 400mg de óleo de pequi em cápsulas ingeridas diariamente por 14 dias consecutivos. As amostras de sangue foram coletadas imediatamente após cada uma das corridas para realizar os testes. O DNA foi obtido por extração da fração leucocitária, e a genotipagem foi realizada por PCR seguida por corte com enzimas de restrição. Os dados estatísticos para as frequências alélicas e genotípicas foram gerados pelo programa Genepopweb®, e os demais dados pelo programa Statistical Package for the Social Sciences (SPSS). Os resultados demonstraram que todos os genótipos estudados encontraram-se em equilíbrio de Hardy- Weinberg (EHW). Apesar dos muitos parâmetros analisados apresentarem diferença significativa entre os sexos, faixas etárias e distâncias percorridas, nenhuma correlação entre esses parâmetros e os polimorfismos analisados foi encontrada. O polimorfismo da EPO influenciou os resultados do eritrograma e do plaquetograma, sugerindo uma vantagem aeróbica para o genótipo TG, e uma desvantagem para o genótipo GG sobre possíveis eventos de complicações microvasculares, enquanto não foi encontrada associação do polimorfismo da ACTN-3 com o desempenho de resistência. Ambos os polimorfismos influenciaram as respostas dos corredores ao óleo de pequi, onde respostas significativas foram observadas para o genótipo selvagem da EPO (TT) nos valores de eritrócitos (p=0,000), hematócrito (HCT, p=0,001), hemoglobina corpuscular média (HCM, p=0,000) e concentração hemoglobínica corpuscular média (CHCM, p=0,001); e para os genótipos TT e TG (p=0,000 para ambos) nos valores da amplitude ou variação da distribuição do tamanho dos eritrócitos (RDW). Diferenças significativas também foram observadas no plaquetograma só para os genótipos TT e TG. O polimorfismo da ACTN-3 influenciou principalmente os valores de AST e CK, onde os heterozigotos RX tiveram uma redução significativa nos valores de AST (p=0,037), e os homozigotos XX, nos valores de CK (p=0,010) após a suplementação o óleo de pequi. Esses resultados de resposta diferenciada de cada polimorfismo à suplementação com cápsulas de pequi demonstram a importância dos efeitos da nutrigenômica no desempenho do atleta. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Physical exercise, by increasing oxygen consumption, can produce an imbalance between the generation of reactive oxygen species (ROS) and antioxidant defense capacity of the organism, leading to oxidative stress. This oxidative overload can cause cell damage and severe muscle damage with consequent inflammation. In this context, many athletes consume antioxidant supplements to prevent oxidative damage, inflammation and consequent impairment of performance. Pequi (Caryocar brasiliense Camb.), a typical fruit of the Brazilian Cerrado, contains several antioxidant components that are important to reduce ROS produced during physical activity. Since nutrients present in food can interact with the human genome to influence health and disease, and genetic variability may also influence the response to diet, studies evaluating this interaction may contribute to future dietary interventions based on knowledge of nutritional requirement, nutritional status and genotype. Some polymorphisms have been described in the literature as agents interfering in athletic performance in certain categories of sports. Among them, several variants in the form of single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been identified, including the SNPs R577X in the α-actinin-3 gene (ACTN-3), T→G in the promoter region of the erythropoietin (EPO) gene, and G6002A in the erythropoietin receptor (EPOR). The ACTN-3 gene encodes protein α-actinin-3, a highly conserved component of the contractile machinery of the fast skeletal muscle fibers, and is expressed only in type II myofibers, which are glycolytic fibers of skeletal muscle. The ACTN-3 polymorphism results in substitution of an arginine (R) by a premature stop codon (X) at position 577 and creates a non-functional protein. Erythropoietin (EPO) is the main endogenous hormone regulator of erythropoiesis, which allows the survival, proliferation, and differentiation of progenitor cells and, hence, increased oxygenation of the tissues. Thus, polymorphisms in the EPO gene or in its receptor can affect athletic performance by influencing the expression of EPO. The aim of this study was to investigate the influence of the SNPs rs1815739 in the ACTN-3 gene, rs1617640 in the promoter region of the EPO gene, and rs121918116 EPOR gene in the lipid peroxidation (TBARS assay), taking a complete hemogram and biochemical dosages of creatine kinase (CK), aspartate aminotransferase (AST), alanine aminotransferase (ALT) and C-reactive protein (CRP and hs-CRP), in a sample of street runners from the Federal District (N=123), before and after supplementation of 400mg of pequi oil capsules taken daily for 14 consecutive days. Blood samples were taken immediately after racing to perform the tests. DNA was obtained by extraction of leukocyte fraction, and genotyping was performed by PCR followed by cut with restriction enzymes. Statistical data for the allele and genotype frequencies were generated by the program Genepopweb®, and other data by the program Statistical Package for the Social Sciences (SPSS). Results showed that all genotypes were found in Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE). Although many examined parameters showed significant differences between sexes, age group and distance covered, no correlation between these parameters and the analyzed polymorphisms was found. EPO polymorphism influenced results of erythrogram and plateletgram, suggesting an aerobic advantage for TG genotype and a disadvantage for GG genotype concerning possible microvascular complication events, while no association was found for ACTN-3 polymorphism with endurance performance. Both polymorphisms influenced runner’s response to pequi oil, where the significant responses were observed for EPO wild type genotype (TT) in the red blood cells, hematocrit, mean corpuscular hemoglobin and mean corpuscular hemoglobin concentration values; and for TT and TG genotypes in the red cell distribution width values. Significant differences were also observed in the plateletgram only for TT and TG genotypes. ACTN-3 mainly influenced AST and CK values, where heterozygous RX had significant decrease in AST values (p=0.037), and homozygous XX in CK values (p=0.010) after pequi oil supplementation. These results of differential response of each polymorphism to the supplementation with pequi capsules demonstrate the importance of the effects of nutrigenomics on athletic performance.
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Epidemiologia molecular do Papilomavírus humano em mulheres atendidas no Sistema Único de Saúde no município de Olinda-PE

EKERT, Marek Henryque Ferreira 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:54:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6487_1.pdf: 7697187 bytes, checksum: 77c7654199970aa3ac51293a3871d243 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Os Papilomavírus humano (HPV) são responsáveis por causar lesões epiteliais, podendo evoluir a diversos tipos de carcinomas. Segundo a Organização Mundial de Saúde, a infecção pelo HPV é o principal fator de risco para o câncer cervical sendo detectado em aproximadamente 99% dos casos. O HPV 16, assim como o HPV 18, são os genótipos virais mais prevalentes em carcinomas cervicais invasivos no mundo. O teste molecular é mais eficiente em exames preventivos, ratificando sua utilização para a triagem do HPV e, desta forma, favorecendo a prevenção das lesões causadas pelo vírus. A presente dissertação teve como objetivo identificar os genótipos prevalentes do HPV em amostras cervicais consideradas normais e com alterações. O estudo de corte transversal foi realizado com 241 mulheres de 18 a 60 anos, atendidas numa Unidade de Saúde da Família do município de Olinda - PE. As amostras de DNA foram extraídas de células de raspado do colo uterino utilizando kit comercial. A infecção pelo HPV foi investigada através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizando os primers consensus MY09/11 e GP5+/6+. Alterações celulares foram visualizadas pelo exame citopatológico (Papanicolaou). O PapilloCheck HPV-screen DNA-chip foi utilizado para genotipar os HPV presentes nas amostras biológicas. Através do exame citopatológico observou-se que apenas 2,90% das pacientes apresentaram alterações celulares características da infecção pelo HPV, enquanto que o diagnóstico molecular permitiu detectar a presença do DNA viral em 23,23% das pacientes. Os dois pares de primers testados tiveram eficiências similares, sendo o MY09/11 com 15,35% e, o GP5+/6+ com 17,01%, entretanto o percentual de concordância entre ambos foi de apenas 39,28%. Neste estudo, o HPV6 (16,94%) e os HPV16 e HPV11, cada um com 10,16%, foram os genótipos virais mais prevalentes, em conjunto respondendo por quase 30% dos casos. O percentual de amostras com múltipla infecção foi de 22,03% sendo o HPV52 o genótipo mais prevalente (8,47%). Neste estudo o HPV 18 não figurou como sendo um dos genótipos mais prevalentes. A alta prevalência dos genótipos HPV6, 16 e 11 contribui para a discussão sobre estratégias de implantação de uma vacina contra o HPV, melhorando assim, a qualidade da assistência à saúde, além de reduzir os gastos públicos com tratamentos. Contudo, estudos incluindo uma maior amostragem em diferentes áreas do município se faz necessário para obter uma visualização mais detalhada da prevalência genotípica do HPV na região
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Epidemologia e Caracterização Genética da Resistência aos Beta-lactâmicos em Enterobactérias Não Susceptíveis aos Carbapenêmicos

BORGHI, M. 20 February 2017 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10835_Dissertação_Mirla Borghi.pdf: 2176338 bytes, checksum: 93f6c18aa70f06dc59c508a80f22245c (MD5) Previous issue date: 2017-02-20 / A resistência cada vez mais ampla aos antimicrobianos beta-lactâmicos em espécies da família Enterobacteriaceae tem se tornado um grave problema de saúde pública. Do ponto de vista epidemiológico, a produção de carbapenemases merece destaque devido ao seu grande potencial de disseminação mundial. O presente estudo teve como objetivo determinar o perfil de resistência aos antimicrobianos, detectar genes de resistência aos beta-lactâmicos e analisar o polimorfismo genético das amostras de enterobactérias não susceptíveis aos carbapenêmicos isoladas de diversos materiais clínicos obtidos de pacientes atendidos em hospitais da Grande Vitória. ParaParaPara avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste difusão em ágar edifusão em ágar e difusão em ágar e difusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar e difusão em ágar e o teste teste teste teste de de de gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concentração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima inibitória inibitória inibitória inibitória. P araara detecdetecdetecdetecdetecção ção dos ge s genes de resistêncianes de resistêncianes de resistência nes de resistêncianes de resistência nes de resistência nes de resistêncianes de resistêncianes de resistência aos beta-lactâmicos foi realizadafoi realizadafoi realizada foi realizada foi realizadafoi realizadafoi realizadafoi realizada a técnic técnic técnic a de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pol a de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o polimorfismo genético foi imorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foi imorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foi imorfismo genético foiimorfismo genético foi imorfismo genético foi analisado analisado analisado analisado analisado analisado analisado analisado pelaspelaspelaspelaspelas técnica técnicatécnicatécnica s de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e MLSTMLSTMLSTMLST. As As espéciesespécies espéciesespécies incluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudo incluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudo incluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudo incluídas no estudoincluídas no estudo foram foram : Klebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniae (n=47), (n=47), (n=47), (n=47), (n=47), Serratia marcescensSerratia marcescensSerratia marcescens Serratia marcescensSerratia marcescens Serratia marcescensSerratia marcescensSerratia marcescensSerratia marcescens Serratia marcescensSerratia marcescens (n=14), (n=14), (n=14), (n=14), Enterobacter cloacaeEnterobacter cloacaeEnterobacter cloacae Enterobacter cloacae Enterobacter cloacaeEnterobacter cloacae Enterobacter cloacaeEnterobacter cloacaeEnterobacter cloacae Enterobacter cloacae Enterobacter cloacae (n=4 (n=4), Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae (n=1) e (n=1) e (n=1) e (n=1) e (n=1) e Citrobacter freundii Citrobacter freundii Citrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundii Citrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundii Citrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundii (n=1). (n=1). (n=1). (n=1). Essas amostras foram encaminhadas pelo Laboratório Central do Espírito Santo (LACEN) onde foram previamente analisadas e identificadas como resistentes a pelo menos um carbapenêmico. A maioria das amostras apresentou um perfil de multirresistência em relação aos 25 antimicrobianos analisados, destacando a resistência a polimixinas e tigeciclina. Todas as amostras apresentaram o gene blaKPC e a associação entre os genes de carbapenemases com genes de ESBL foi observada em todas as amostras. O perfil genético de resistência prevalente (34%) englobava os genes blaKPC, blaTEM, blaSHV, blaOXA-1 e blaCTX-Mgp1. Através da análiseAtravés da análise Através da análiseAtravés da análiseAtravés da análise Através da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análise Através da análise por PFGE, por PFGE, por PFGE, por PFGE, por PFGE, por PFGE, foi observada foi observada foi observadafoi observadafoi observada foi observada foi observadafoi observadafoi observada a prevalência de dois pulsotipos entre as amostras de K. pneumoniae: kpA (40,42%) e kpB (19,14%). Já o pulsotipo smA foi encontrado em 13 das 14 das amostras de S. marcescens. As quatro amostras de E. cloacae apresentaram pulsotipos distintos. Através da técnica de MLST, realizada em 14 amostras de K. pneumoniae, o ST437 e ST340 foram os mais encontrados. O ST437 foi identificado na maioria (6\7) das amostras do pulsotipo kpB e o ST340 em todas as amostras do pulsotipo kpA (3\3). O ST628, ST37 e ST394 foram identificados nos pulsotipos kpD, kpO e kpH, respectivamente. O ST628 e o ST394 foram descritos pela primeira vez no Brasil.
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Otimização da técnica de MIRU (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units) para o estudo epidemiológico de pacientes com tuberculose

Pandolfi, José Rodrigo Cláudio [UNESP] 29 May 2006 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-05-29Bitstream added on 2014-06-13T19:40:42Z : No. of bitstreams: 1 pandolfi_jrc_dr_araiq.pdf: 716701 bytes, checksum: 707d1bc6d263e145f12c4e53feeae657 (MD5) / O presente trabalho evidencia os esforços realizados na tentativa de se aperfeiçoar a técnica de MIRU (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units). Esta utiliza como marcadores, diferenças em fragmentos de DNA não codificadores específicos do Mycobacterium tuberculosis e vem sendo empregada para o estudo epidemiológico da tuberculose, pela facilidade de execução. A técnica de MIRU possibilita uma comparação entre linhagens de diferentes áreas geográficas e permite o rastreamento da movimentação de linhagens individuais. Na otimização os seguintes parâmetros foram determinados: 1. protocolos de purificação de DNA; 2. estratégias de amplificação pela PCR; 3. comparações entre um kit de PCR (PCR Master Mix - PROMEGA) e a utilização da PCR da maneira convencional; 4. testes de variadas condições de amplificação utilizando o kit e os reagentes convencionais de PCR; 5. determinação de protocolos de ciclagem para a amplificação dos fragmentos desejados; 6. teste de amplificação sem a prévia extração de DNA das amostras utilizadas. Após a padronização a metodologia foi utilizada na tipagem de 82 amostras de M. tuberculosis que se encontravam divididas em dois grupos, sendo o primeiro com 49 amostras, provenientes de pacientes do Serviço Especial de Saúde de Araraquara (SESA - USP, Araraquara) e o segundo, composto de 33 amostras de bactérias com perfil de resistência a pirazinamida e a outras drogas, provenientes de Maringá. Nesta etapa foram realizados: 7. PCR para a confirmação de gênero e espécie para M. tuberculosis nas 82 amostras analisadas. 8. Aplicação da técnica de MIRU e análise manual de todas as amostras provenientes de pacientes; 9. Emprego de ferramentas de bioinformática (programa PAST Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis) para a análise das amostras... / The present work shows efforts to improve the MIRU (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units) assay. This methodology, that has been exploited for fingerprinting the Mycobacterium tuberculosis in molecular epidemiological studies, allows for direct and reliable comparison of results between laboratories and the development of large-scale epidemiological studies. In the optimization of MIRU assay, some parameters were defined: DNA purification protocols and PCR strategies were compared, to select the most practical and economical among them. After the standartization, 82 M. tuberculosis strains, from two different groups were analised. The 49 bacteria strains from the first group were sensible and the 33 from the second one were resistant to pyrazinamide and another drugs as isoniazide and/or rifampicin. To stablish the allelic studies the samples were first confirmed as M. tuberculosis by PCR. Then the MIRU assay was applied and the genetic profile was determined. These results generated dendrograms, obtained by bioinformatic tools. This study showed that any kind of DNA purification and even the use of fresh bacterial culture directly into the PCR tube can be used. When the PCR strategies were compared the utilization of the PCR kit seemed to be more practical and to avoid some mistakes that can happens during the home-made PCR mixture preparation. Furthermore, it allows some dilutions higher than those recommended by the manufacturer. In the same way, the home-made mixture in amounts smaller than those suggested can be used. These experiments indicated that only two annealing temperatures can be used to the PCR with the twelve primer pairs, always in the same MgCl2 concentration, allowing the amplification of more samples at the same time. To generate dendrograms with the allelic data from clinical samples... (Complete abstract click electronic access below)
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Otimização da técnica de MIRU (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units) para o estudo epidemiológico de pacientes com tuberculose /

Pandolfi, José Rodrigo Cláudio. January 2006 (has links)
Resumo: O presente trabalho evidencia os esforços realizados na tentativa de se aperfeiçoar a técnica de MIRU ("Mycobacterial Interspersed Repetitive Units"). Esta utiliza como marcadores, diferenças em fragmentos de DNA não codificadores específicos do Mycobacterium tuberculosis e vem sendo empregada para o estudo epidemiológico da tuberculose, pela facilidade de execução. A técnica de MIRU possibilita uma comparação entre linhagens de diferentes áreas geográficas e permite o rastreamento da movimentação de linhagens individuais. Na otimização os seguintes parâmetros foram determinados: 1. protocolos de purificação de DNA; 2. estratégias de amplificação pela PCR; 3. comparações entre um "kit" de PCR ("PCR Master Mix" - PROMEGA) e a utilização da PCR da maneira convencional; 4. testes de variadas condições de amplificação utilizando o "kit" e os reagentes convencionais de PCR; 5. determinação de protocolos de ciclagem para a amplificação dos fragmentos desejados; 6. teste de amplificação sem a prévia extração de DNA das amostras utilizadas. Após a padronização a metodologia foi utilizada na tipagem de 82 amostras de M. tuberculosis que se encontravam divididas em dois grupos, sendo o primeiro com 49 amostras, provenientes de pacientes do Serviço Especial de Saúde de Araraquara (SESA - USP, Araraquara) e o segundo, composto de 33 amostras de bactérias com perfil de resistência a pirazinamida e a outras drogas, provenientes de Maringá. Nesta etapa foram realizados: 7. PCR para a confirmação de gênero e espécie para M. tuberculosis nas 82 amostras analisadas. 8. Aplicação da técnica de MIRU e análise manual de todas as amostras provenientes de pacientes; 9. Emprego de ferramentas de bioinformática (programa PAST "Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis") para a análise das amostras... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present work shows efforts to improve the MIRU (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units) assay. This methodology, that has been exploited for fingerprinting the Mycobacterium tuberculosis in molecular epidemiological studies, allows for direct and reliable comparison of results between laboratories and the development of large-scale epidemiological studies. In the optimization of MIRU assay, some parameters were defined: DNA purification protocols and PCR strategies were compared, to select the most practical and economical among them. After the standartization, 82 M. tuberculosis strains, from two different groups were analised. The 49 bacteria strains from the first group were sensible and the 33 from the second one were resistant to pyrazinamide and another drugs as isoniazide and/or rifampicin. To stablish the allelic studies the samples were first confirmed as M. tuberculosis by PCR. Then the MIRU assay was applied and the genetic profile was determined. These results generated dendrograms, obtained by bioinformatic tools. This study showed that any kind of DNA purification and even the use of fresh bacterial culture directly into the PCR tube can be used. When the PCR strategies were compared the utilization of the PCR kit seemed to be more practical and to avoid some mistakes that can happens during the "home-made" PCR mixture preparation. Furthermore, it allows some dilutions higher than those recommended by the manufacturer. In the same way, the "home-made" mixture in amounts smaller than those suggested can be used. These experiments indicated that only two annealing temperatures can be used to the PCR with the twelve primer pairs, always in the same MgCl2 concentration, allowing the amplification of more samples at the same time. To generate dendrograms with the allelic data from clinical samples... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Clarice Queico Fujimura Leite / Coorientador: Sandro Roberto Valentini / Banca: Mario Hiroyuki Hirata / Banca: Fernando Augusto Fiúza de Melo / Banca: Daisy Nakamura Sato / Banca: Rosilene Fressatti Cardoso / Doutor
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Comparações genotípicas e fenotípicas de diferentes isolados clínicos de colonização e candidemia por Candida albicans / Comparisons genotype and phenotype of different clinical isolates of settlement and by candida albicans candidemia

Santos, Fernanda Pahim [UNIFESP] 27 May 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-07-22T20:49:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-05-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-11T03:26:19Z : No. of bitstreams: 1 Publico-149.pdf: 1437447 bytes, checksum: cba255301df36690895e45efbaee7f29 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Introdução: Candida albicans faz parte da microbiota humana, entretanto pode causar infecção disseminada a depender das condições imunológicas do hospedeiro. Trata-se da espécie mais virulenta do gênero Candida, além de ser isolada com freqüência em infecções superficiais e sistêmicas. Alguns fatores de virulência são atualmente propostos para C. albicans, incluindo: adesão a células epiteliais e endoteliais do hospedeiro, a capacidade de secretar enzimas hidrolíticas, a transição de levedura à hifa e a capacidade de combate ao estresse oxidativo, gerado por células fagocitárias Objetivos: caracterizar atributos de virulência em diferentes isolados clínicos de C. albicans; analisar o relacionamento genético intraespecífico e, determinar o perfil de susceptibilidade dos mesmos. Material e Métodos: Foram incluídos 51 isolados sequencialmente obtidos de 7 pacientes alocados em 3 grupos: a) 3 pacientes que foram apenas colonizados (17 isolados); b) 3 pacientes colonizados que evluíram com candidemia e alta hospitalar (27 isolados); e c) 1 paciente colonizado que evoluiu com candidemia e óbito (7 isolados). Foram determinados os seguintes fatores de virulência: taxas de crescimento máximas, atividade de proteinase específica, atividade de fosfolipase, aderência de células de C. albicans à células epiteliais bucais humanas (CEBH), ensaio de morfogênese,formação do biolfilme. Foram realizados teste de susceptibilidade a antifúngicos (TSA) pelo método de microdiluição em caldo, utilizando anfotericina B, fluconazol, itraconazol, 5-fluorocitosina, caspofungina e anidulafungina. Para avaliar a variabilidade genética empregou-se técnica de microssatélites utilizando o “primer” M13, com posterior montagem de dendrograma. Foi também empregada a genotipagem ABC. Resultados: Observou-se que todas as cepas apresentaram similar taxa de crescimento, à exceção de um isolado (657B). As amostras apresentaram capacidade de aderência a CEBH e formação de hifa variáveis, não havendo associação direta entre estes atributos e o desfecho clínico do paciente. Na avaliação de secreção de Saps, os isolados do paciente 7, pertencente ao grupo III (candidemia/óbito), apresentaram os maiores valores de secreção desta enzima entre os isolados avaliados, seguida das cepas do paciente 4 (candidemia/alta). A produção de fosfolipase em nosso estudo foi homogênea para todos os isolados testados à exceção dos isolados do paciente 4 (candidemia/alta), o qual apresentou diversas cepas com atividade de fosfolipase negativa. Os pacientes 4 (candidemia/alta), e 7 (candidemia/óbito), obtiveram as maiores taxas de formação de biofilme entre todos os isolados testados. Quanto ao TSA, não houve ocorrência de resistência entre os isolados, porém uma única cepa (170 A) apresentou-se SDD frente a 5-fluorocitosina. As técnica de microssatelite e genotipagem ABC evidenciam que aquelas cepas dos grupos II e III apresentam uma menor variabilidade genética do que aquelas oriundas de pacientes do grupo I (somente colonização). Conclusão: Foi possível verificar que além do “status” imunológico do paciente, os aspectos intrínsecos de cada cepa são importantes determinantes do sucesso de sua trajetória como patógeno. Adicionalmente, destacamos a importância de ferramentas moleculares na detecção de genótipos melhor adaptados ao organismo humano, possivelmente responsáveis pelos piores prognósticos clínicos em ambiente hospitalar. / Introduction: Candida albicans is part of the human microbiota, but it can cause disseminated infection depending on the host immunity status. It is the most virulent species of the genus Candida as well as is frequently isolated from superficial and systemic infections. Some putative virulence factors have been recently proposed for C. albicans, including: adhesion to host epithelial and endothelial cells, the ability to secrete hydrolytic enzymes, yeast-to-hypha transition and the capability to combat oxidative stress generated by phagocytic cells Objectives: to characterize virulence attributes of different C. albicans clinical isolates; to analyze intraspecific genetic relatedness and to determine antifungal susceptibility of clinical isolates collected from a specific clinical scenario. Material and Methods: We have investigated 51 isolates sequentially obtained from 7 patients divided into 3 different groups: a) 3 patients who were only colonized (17 isolates); b) 3 colonized patients who had candidemia and were discharged (27 isolates); and c) 1 colonized patient who died of candidemia (7 isolates). We have investigated the following virulence factors: maximum growth rates, proteinase and phospholipase activity, adherence to human buccal epithelial cells, morphogenesis and biofilm formation. We also performed antifungal susceptibility testing by using broth microdilution method with amphotericin B, fluconazole, itraconazole, 5-fluorocytosine, caspofungin and anidulafungin. To investigate genetic variability, we have used a microsatellite technique with primer M13, followed by dendrogram construction, in addition to A, B, C genotyping. Results: We have found that all the isolates except strain 657B presented similar growth rates. The strains exhibited variable ability to adhere to buccal epithelia and to for hyphae. Therefore, we could not establish a direct relationship between these virulence attributes and patients clinical outcome. Strains obtained from patient 7, belonging to group III (candidemia/death) had the highest levels of proteinase activity, seconded by the isolates collected from patient 4 (candidemia/discharge). Phospholipase activity was essentially the same for all the isolates investigated in the present study, except from some patient 4 strains (candidemia/discharge) which were phospholipase negative. Isolates from patients 4 (candidemia/discharge), and 7 (candidemia/death) showed the highest levels of biofilm formation. We could not detect resistance to antifungal drugs among the isolates. However, a unique strain was DDS to 5-fluorocytosine (170 A). Microsatelite and A, B, C typing demonstrated that isolates from groups II and III (candidemia) showed lower genetic variability than the strains belonging to group I (only colonized). Conclusion: It was possible to verify that besides host immunity, each isolate had particular aspects which could be important factors to guarantee their success as pathogens. In addition, we emphasize the importance of molecular tools to detect genotypes well adapted to the human organism, which are likely responsible for worse prognosis in the hospital environment. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações

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