Résumé Les entéropneustes, avec les Pterobranchia et les Planktospaeroidea, constituent le petit phylum deutérostomien d’Hemichordata, qui est généralement considéré comme une première ramification de la lignée en direction des Chordata. On s’attend à ce que le groupe détienne des indices sur l'évolution de la notocorde des chordés, du tube neural, des arcs branchiaux et de la glande thyroïde (Sato et al., 2008 ; Cameron et al., 2000). Je présente ici une étude taxonomique détaillée de nouvelles espèces de certaines familles et des études détaillées de leurs embryons et de leur structure musculaire. Dans le premier chapitre, j'ai fourni un contexte général sur les Enteropneusta (habitudes de vie, évolution, biogéographie et fossiles) et un diagnostic des familles d'Enteropneusta. Dans le chapitre deux, j'ai décrit une nouvelle espèce de la famille des entéropneustes Ptychoderidae d'Amérique du Nord en utilisant des méthodes histologiques traditionnelles, Balanoglossus sonorensis nov. sp., originaire du golfe de Californie, cette espèce se distingue de toutes les autres espèces du genre par la présence d'un long sillon médidorsal très profond sur la proboscis, du tissu conjonctif massif au centre du coelome et de la formation rapide et complète de les plaques radiales de la trompe. Le mésentère ventral du collier et l'emplacement des pores gonadiques du tronc sont uniques à cette espèce. Le chapitre trois a fourni une description formelle de Balanoglossus occidentalis, de Puget Sound, Washington, basée sur un manuscrit de W. E. Ritter. Les caractéristiques uniques de cette espèce comprennent. Le péricarde ne s'est pas formé en deux cornes et un glomérule qui s'étendaient largement sur la surface du péricarde et s'étendaient largement sur les parties latérales et ventrales de la stomocordé. Le cordon nerveux du collier a une seule cavité et la partie digestive du tronc était plus petite que la partie branchiale. Dans le chapitre quatre, j’ai quantifié l'efficacité de la micro-tomodensitométrie (CT-scan) dans 4 la taxonomie des entéropneustes. J’ai trouvé que le CT-scan est une alternative potentielle à l'histologie pour des spécimens uniques ou rares, mais il constitue plutôt un complément à l'histologie qui rend la taxonomie plus accessible et compréhensible pour les non-spécialistes. Au chapitre cinq, j'ai décrit l'espèce Schizocardium karankawa sp. nov (famille des Spengelidae) de la Laguna Madre, Texas, comprenant une phylogénie moléculaire, des détails sur sa fécondation et son développement avec un accent particulier sur son développement musculaire à travers la larve de tornaria et jusqu'au stade juvénile du ver. Au chapitre six, j'ai créé une collection virtuelle des entéropneustes d'Amérique du Nord basée sur des spécimens holotypes collectés par Cameron et empruntés au Musée national d'histoire naturelle (Smithsonian). Ces données comprennent des numérisations numériques haute résolution de chaque lame histologique comprenant les holotypes, les détails de la collection, notamment le nom du collectionneur, l'emplacement, les dates et la coloration fixatrice et histologique. La collection virtuelle est disponible sur Canadensys https://www.canadensys.net/, un membre actif du Global Biodiversity Information Facility (GBIF). Ce chapitre est important, car la numérisation de la collection d’entéropneustes apportera de nombreux avantages, notamment la création d'une documentation constante des collections, le suivi des changements dans la répartition des espèces au fil du temps et l’accès à une grande diversité de morphologies pour comprendre les variations intraspécifiques et interspécifiques. Dans le chapitre sept, j'ai fourni une conclusion générale, la motivation de mon travail, un résumé du travail de taxonomie effectué dans le laboratoire Cameron et la stratégie de tomodensitométrie. Enfin, j'ai fourni un bref aperçu de mes perspectives d'avenir concernant mon désir d’étendre ce travail par l'étude de la taxonomie des entéropneustes nord-africains. / Abstract The Enteropneusta (acorn worms), with the Pterobranchia, and the Planktospaeroidea constitute the small deuterostome phyla Hemichordata, which is generally regarded as an early offshoot of the line to the Chordata. The group is expected to hold clues about the evolution of the chordate notochord, neural tube, gill bars, and thyroid gland (Sato et al., 2008; Cameron et al., 2000). Here, I present a detailed taxonomic study of new species of some families and some detailed studies of their embryos and muscular structure. In the first chapter, I provided a general background of Enteropneusta (life habits, evolution, biogeography, and fossils) and a diagnosis of Enteropneusta families. In chapter two, I described one new species of the family Ptychoderidae acorn worm from North America using traditional histological methods, Balanoglossus sonorensis nov. sp., from the Gulf of California. This species is different from all the other Balanoglossus species by the presence of a deep, long middorsal groove on the proboscis, the massive connective tissue in the center of the coelom in conjunction with the formation of the proboscis radial muscle plates. The collar ventral mesentery and the location of the trunk gonadal pores are unique to this species. Chapter three provided a formal description of Balanoglossus occidentalis from Puget Sound, Washington, based on a manuscript by W.E. Ritter. Unique characteristics of this species include the following: The glomerulus spreads widely across the pericardium's surface and extends down over the stomochord's lateral and ventral portions. The collar nerve cord has a single cavity, and the digestive portion of the trunk is smaller than the branchial portion. In chapter four, we quantified the efficacy of micro-computed tomography (CT scans) in acorn worm taxonomy. We found that CT scans are a potential alternative to histology for 7 unique or rare specimens, but they are more of a complement to histology that makes taxonomy more accessible and understandable for non-specialists. In chapter five, I described the species Schizocardium karankawa sp. nov (family Spengelidae) from Laguna Madre, Texas, including a molecular phylogeny, details of its fertilization and development with particular emphasis on its muscle development through the tornaria larva and into juvenile worm stage. In chapter six, I created a virtual collection of acorn worms from North America based on holotype specimens collected by Cameron and borrowed from the National Museum of Natural History (Smithsonian). These data include high-resolution digital scans of every histological slide that comprises the holotypes and the collection details, including the collector’s name, location, dates, and fixative and histological stain. The virtual collection is available on Canadensys https://www.canadensys.net/ an active member of the Global Biodiversity Information Facility (GBIF). This chapter is significant because digitizing the acorn worm collection will bring many benefits, including the creation of a constant document of collections, tracking changes in species distributions over time, and providing a wide diversity of morphologies to understand intraspecific and interspecific variation. In chapter seven, I provided a general conclusion, the motivation of this thesis research, a summary of the taxonomic work from the Cameron lab, and the CT scan strategy. Finally, I provided a brief overview of my desire to continue this work by expanding on the knowledge of North African acorn worms.