Chez les oiseaux et mammifères domestiques, la sélection sur des critères de croissance et de conversion alimentaire s’est accompagnée d’effets négatifs sur les performances de reproduction des deux sexes. Les travaux rapportés ici, réalisés sur deux souches commerciales de dindes (souches lourde et medium), constituaient une approche afin de mieux comprendre les effets d’alimentations libérales ou retreintes sur les performances de ponte durant la période de reproduction. Dans une première étude, nous avons pu démontrer qu’une restriction alimentaire au cours de la période d’élevage a eu un effet bénéfique sur la qualité globale des œufs. Au cours d’une seconde étude, nous avons comparé l’effet de régimes alimentaires différant soit par leur niveau énergétique soit par leur niveau protéique. Alors que les taux de ponte ont été améliorés par des aliments riches en énergie, un effet génétique fort a été mis en évidence concernant la réponse de femelles soumises à différents taux protéiques. Enfin, bien que la couvaison et son apparition aient déjà été clairement décrites dans des études préalables, nous avons observé des différences dans la rythmicité de son expression entre les deux souches, suggérant une dérive génétique de ce comportement sous l’action de la sélection. / In domesticated birds and mammals, selection for growth and feed conversion has been accompanied by adverse effects on reproductive performances in both sexes. The present studies, performed with two meat-type of turkey breeds (heavy or medium types), were an attempt to better assess the effects of liberal or moderately restricted feed regimes on laying performances over the reproductive season. In a first series of experiment, we could demonstrate that feed restriction during the growing period has a favourable effect on the overall ‘egg quality’ (incubable eggs). In a second study, we compared the global effects of feed regimes differing either for their total energy content or for their total protein levels. Laying rates were improved in females fed with regimes adjusted with high energy while a marked effect of the genetic origin was noted in females subjected to variable levels of proteins. While the occurrence of broodiness was also carefully noted in pre-cited studies, differences in the rhythmicity of this behaviour were observed between the two strains, suggesting genetic derivations of this trait caused by selection.

Les infrastructures virtuelles de cloud sont de plus en plus exploitées pour relever les défis de calcul intensif en sciences comme dans l'industrie. Elles fournissent des ressources de calcul, de communication et de stockage à la demande pour satisfaire les besoins des applications à grande échelle. Pour s'adapter à la diversité de ces infrastructures, de nouveaux outils et modèles sont nécessaires. L'estimation de la quantité de ressources consommées par chaque application est un problème particulièrement difficile, tant pour les utilisateurs qui visent à minimiser leurs coûts que pour les fournisseurs d'infrastructure qui visent à contrôler l'allocation des ressources. Même si une quantité quasi illimitée de ressources peut être allouée, un compromis doit être trouvé entre (i) le coût de l'infrastructure allouée, (ii) la performance attendue et (iii) la performance optimale atteignable qui dépend du niveau de parallélisme inhérent à l'application. Partant du cas d'utilisation de l'analyse d'images médicales, un domaine scientifique représentatif d'un grand nombre d'applications à grande échelle, cette thèse propose un modèle de coût à grain fin qui s'appuie sur l'expertise extraite de l'application formalisée comme un flot. Quatre stratégies d'allocation des ressources basées sur ce modèle de coût sont introduites. En tenant compte à la fois des ressources de calcul et de communication, ces stratégies permettent aux utilisateurs de déterminer la quantité de ressources de calcul et de bande passante à réserver afin de composer leur environnement d'exécution. De plus, l'optimisation du transfert de données et la faible fiabilité des systèmes à grande échelle, qui sont des problèmes bien connus ayant un impact sur la performance de l'application et donc sur le coût d'utilisation des infrastructures, sont également prises en considération. Les expériences exposées dans cette thèse ont été effectuées sur la plateforme Aladdin/Grid'5000, en utilisant l'intergiciel HIPerNet. Ce gestionnaire de plateforme virtuelle permet la virtualisation de ressources de calcul et de communication. Une application réelle d'analyse d'images médicales a été utilisée pour toutes les validations expérimentales. Les résultats expérimentaux montrent la validité de l'approche en termes de contrôle du coût de l'infrastructure et de la performance des applications. Nos contributions facilitent à la fois l'exploitation des infrastructures de cloud, offrant une meilleure qualité de services aux utilisateurs, et la planification de la mise à disposition des ressources virtualisées.

La maîtrise de la QoS dans 802.11e EDCA (Enhanced Distributed Coordination Function) ne peut être assurée que par un mécanisme de contrôle d'admission qui empêche le réseau d'atteindre un état de saturation critique et par la même garantit les besoins de QoS des applications voix/vidéo.<br />Ce mécanisme de contrôle d'admission a besoin pour sa prise de décision de prédire les métriques de performances si un nouveau flux est admis. Dans le but de rendre les décisions efficaces, nous choisissons d'utiliser une méthode de prédiction basée sur un modèle analytique. Ce dernier doit remplir deux conditions : 1) fournir une bonne précision de prédiction et 2) avoir une complexité numérique faible et un temps de réponse limité. Vu que la majorité des modèles analytiques de la littérature ne satisfont pas à ces deux conditions, nous développons un nouveau modèle analytique pour EDCA qui est capable de prédire le débit et le délai d'accès des différentes Access Category (AC) d'EDCA.<br />Ainsi, après la modélisation analytique du temps de transmission des ACs en prenant en compte le paramètre de différentiation TXOPLimit, nous développons un modèle analytique pour EDCA sous la forme d'une chaîne de Markov à quatre dimensions. Celui-ci est développé d'abord dans les conditions de saturation puis étendu aux conditions générales de trafic.<br />Pour finir, nous proposons un algorithme de contrôle d'admission à implémenter au sein du point d'accès et qui utilise le modèle analytique proposé. Nous proposons un abaque de solution d'optimisation des paramètres d'accès d'EDCA. Le but étant d'améliorer les performances du mécanisme de contrôle d'admission par l'utilisation optimale des ressources du réseau.

Les trois principales ressources du calcul sont le temps, l'espace et l'énergie, les minimiser constitue un des défis les plus importants de la recherche de la performance des processeurs.Dans cette thèse, nous nous intéressons à un quatrième facteur qui est l'information. L'information a un impact direct sur ces trois facteurs, et nous montrons comment elle contribue ainsi à l'optimisation des performances. Landauer a montré que c’est la destruction - logique - d’information qui coûte de l’énergie, ceci est un résultat fondamental de la thermodynamique en physique. Sous cette hypothèse, un calcul ne consommant pas d’énergie est donc un calcul qui ne détruit pas d’information. On peut toujours retrouver les valeurs d’origine et intermédiaires à tout moment du calcul, le calcul est réversible. L'information peut être portée non seulement par une donnée mais aussi par le processus et les données d’entrée qui la génèrent. Quand un calcul est réversible, on peut aussi retrouver une information au moyen de données déjà calculées et du calcul inverse. Donc, le calcul réversible améliore la localité de l'information. La thèse développe ces idées dans deux directions. Dans la première partie, partant d'un calcul, donné sous forme de DAG (graphe dirigé acyclique), nous définissons la notion de « garbage » comme étant la taille mémoire – le nombre de registres - supplémentaire nécessaire pour rendre ce calcul réversible. Nous proposons un allocateur réversible de registres, et nous montrons empiriquement que le garbage est au maximum la moitié du nombre de noeuds du graphe.La deuxième partie consiste à appliquer cette approche au compromis entre le recalcul (direct ou inverse) et le stockage dans le contexte des supercalculateurs que sont les récents coprocesseurs vectoriels et parallèles, cartes graphiques (GPU, Graphics Processing Unit), processeur Cell d’IBM, etc., où le fossé entre temps d’accès à la mémoire et temps de calcul ne fait que s'aggraver. Nous montons comment le recalcul en général, et le recalcul inverse en particulier, permettent de minimiser la demande en registres et par suite la pression sur la mémoire. Cette démarche conduit également à augmenter significativement le parallélisme d’instructions (Cell BE), et le parallélisme de threads sur un multicore avec mémoire et/ou banc de registres partagés (GPU), dans lequel le nombre de threads dépend de manière importante du nombre de registres utilisés par un thread. Ainsi, l’ajout d’instructions du fait du calcul inverse pour la rematérialisation de certaines variables est largement compensé par le gain en parallélisme. Nos expérimentations sur le code de Lattice QCD porté sur un GPU Nvidia montrent un gain de performances atteignant 11%. / The main resources for computation are time, space and energy. Reducing them is the main challenge in the field of processor performance.In this thesis, we are interested in a fourth factor which is information. Information has an important and direct impact on these three resources. We show how it contributes to performance optimization. Landauer has suggested that independently on the hardware where computation is run information erasure generates dissipated energy. This is a fundamental result of thermodynamics in physics. Therefore, under this hypothesis, only reversible computations where no information is ever lost, are likely to be thermodynamically adiabatic and do not dissipate power. Reversibility means that data can always be retrieved from any point of the program. Information may be carried not only by the data but also by the process and input data that generate it. When a computation is reversible, information can also be retrieved from other already computed data and reverse computation. Hence reversible computing improves information locality.This thesis develops these ideas in two directions. In the first part, we address the issue of making a computation DAG (directed acyclic graph) reversible in terms of spatial complexity. We define energetic garbage as the additional number of registers needed for the reversible computation with respect to the original computation. We propose a reversible register allocator and we show empirically that the garbage size is never more than 50% of the DAG size. In the second part, we apply this approach to the trade-off between recomputing (direct or reverse) and storage in the context of supercomputers such as the recent vector and parallel coprocessors, graphical processing units (GPUs), IBM Cell processor, etc., where the gap between processor cycle time and memory access time is increasing. We show that recomputing in general and reverse computing in particular helps reduce register requirements and memory pressure. This approach of reverse rematerialization also contributes to the increase of instruction-level parallelism (Cell) and thread-level parallelism in multicore processors with shared register/memory file (GPU). On the latter architecture, the number of registers required by the kernel limits the number of running threads and affects performance. Reverse rematerialization generates additional instructions but their cost can be hidden by the parallelism gain. Experiments on the highly memory demanding Lattice QCD simulation code on Nvidia GPU show a performance gain up to 11%.

Les enjeux du développement durable, le réchauffement climatique, la pollution dans les grandes villes, la congestion et les nuisances sonores, l'augmentation des prix de carburants, sont parmi des nombreux facteurs qui incitent les pays développés à l'innovation dans les transports publics. Dans ce contexte, l'introduction des systèmes de vélos en libre-service, au cours de ces dernières années, est une des solutions adoptées par de nombreuses grandes villes. Malgré leur succès fulgurant dans le monde entier, il existe peu d'études fondamentales sur ce type transport urbain. Pourtant, leur exploitation et leur management par des opérateurs soulèvent de nombreuses questions notamment d'ordre opérationnel. Dans ce contexte, cette thèse s'adresse aux problèmes d'ordonnancement et de rééquilibrage des stations de vélos en libre-service. Ce sont des problèmes cruciaux pour la qualité de service et la viabilité économique de tels systèmes. Le rééquilibrage consiste à redistribuer le nombre de vélos entre les différentes stations afin de satisfaire au mieux les demandes des usagers. Cette régulation se fait souvent par le biais de véhicules spécifiques qui font des tournées autour des différentes stations. Ainsi, deux problèmes d'optimisation difficiles se posent : la recherche de la meilleure tournée du véhicule de régulation (ordonnancement de la tournée) et la détermination des nombres de véhicules à utiliser (rééquilibrage des stations). Dans cette optique, les travaux de cette thèse constituent une contribution à la modélisation et à l'optimisation de performances des systèmes de vélos en libre-service en vue de leur rééquilibrage et leur ordonnancement. Plusieurs méthodes d'optimisation et ont été développées et testées. De telles méthodes incorporent différentes approches de simulation ou d'optimisation comme les réseaux de Petri, les algorithmes génétiques, les algorithmes gloutons, les algorithmes de recherche par voisinage, la méthode arborescente de branch-and-bound, l'élaboration des bornes supérieures et inférieures, etc. Différentes facettes du problème ont été étudiées : le cas statique, le cas dynamique, l'ordonnancement et le rééquilibrage avec un seul (ou multiple) véhicule(s). Afin de montrer la pertinence de nos approches, la thèse comporte également plusieurs applications réelles et expérimentations / In our days, developed countries have to face many public transport problems, including traffic congestion, air pollution, global oil prices and global warming. In this context, Public Bike sharing systems are one of the solutions that have been recently implemented in many big cities around the world. Despite their apparent success, the exploitation and management of such transportation systems imply crucial operational challenges that confronting the operators while few scientific works are available to support such complex dynamical systems. In this context, this thesis addresses the scheduling and balancing in public bicycle-sharing systems. These problems are the most crucial questions for their operational efficiency and economic viability. Bike sharing systems are balanced by distributing bicycles from one station to another. This procedure is generally ensured by using specific redistribution vehicles. Therefore, two hard optimization problems can be considered: finding a best tour for the redistribution vehicles (scheduling) and the determination of the numbers of bicycles to be assigned and of the vehicles to be used (balancing of the stations). In this context, this thesis constitutes a contribution to modelling and optimizing the bicycle sharing systems' performances in order to ensure a coherent scheduling and balancing strategies. Several optimization methods have been proposed and tested. Such methods incorporate different approaches of simulation or optimization like the Petri nets, the genetic algorithms, the greedy search algorithms, the local search algorithms, the arborescent branch-and-bound algorithms, the elaboration of upper and lower bounds, ... Different variants of the problem have been studied: the static mode, the dynamic mode, the scheduling and the balancing by using a single or multiple vehicle(s). In order to demonstrate the coherence and the suitability of our approaches, the thesis contains several real applications and experimentations