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Diversidade microbiana em substratos descartados durante as fases do processo de produ??o de mudas clonais de eucalipto

Santos, Luana Martins dos January 2016 (has links)
Data de aprova??o ausente. / Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-06-08T22:19:37Z No. of bitstreams: 2 luana_martins_santos.pdf: 1170564 bytes, checksum: 215e11cc17c654f8760cc6085cca3464 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-06-22T15:18:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 luana_martins_santos.pdf: 1170564 bytes, checksum: 215e11cc17c654f8760cc6085cca3464 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-22T15:18:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 luana_martins_santos.pdf: 1170564 bytes, checksum: 215e11cc17c654f8760cc6085cca3464 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A produ??o de muda ? uma etapa primordial e decisiva para a implanta??o de uma floresta. No entanto, devido a diversos fatores de ordem t?cnica, as perdas no setor de produ??o s?o bastante relevantes. Dentre estes fatores est? o descarte do substrato, que quando feito de forma err?nea favorece a prolifera??o de micro-organismos fitopatog?nicos em viveiro. Isso pode desencadear em perdas significativas e ainda se tornar um passivo ambiental. Raramente o substrato ? reutilizado nos viveiros comerciais, uma vez que presume-se que as caracter?sticas f?sica, qu?mica e biol?gicas formam perdidas durante a produ??o das mudas. Contudo, h? poucos estudos sobre micro-organismos em substratos. A import?ncia deste estudo fundamenta-se na escassez de pesquisa sobre essa problem?tica que afeta o setor de produ??o de mudas, bem como buscar alternativas sustent?veis que pressup?e a demanda de uso desse insumo. A aplica??o de t?cnicas moleculares vem sendo empregadas para detectar e identificar os micro-organismos em diversos ambientes. Neste contexto, o objetivo deste estudo foi detectar a diversidade microbiol?gica em amostras de substratos descartados pela t?cnica de PCR-RFLP. Foram coletados dez amostras de substratos em diferentes viveiros no estado de Minas Gerais em diferentes fases de produ??o e estado de tecnifica??o. O DNA gen?mico total foi extra?do e amplificado pela t?cnica de PCR com oligonucleot?deos espec?ficos para fungos, bact?ria e archaea. Os produtos amplificados foram submetidos ? clivagem com enzimas de restri??o HaeIII, BamHI, TaqI e HindIII, para detec??o de poss?veis polimorfismos entre as amostras por meio da t?cnica de PCR-RFLP. Foi poss?vel verificar diferen?as entre as amostras de substratos, tanto em rela??o ao tamanho da regi?o do DNA amplificada, bem como em rela??o ? presen?a de s?tios de restri??o. Com base no ?ndice de similaridade, detectou-se uma maior varia??o da diversidade dentro da amostra em diferentes fases do que nas amostras entre os diferentes viveiros. Portanto, estes resultados podem ser relevantes para o conhecimento da diversidade microbiol?gica em substrato. Por?m mais estudos se fazem necess?rios para maior compreens?o destes micro-organismos e sua fun??o no substrato. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / The production of changes is a crucial and decisive step for the implementation of a forest. However, due to several technical factors, losses in the production sector are quite relevant. Among these factors is the disposal of substrate, which when done wrongly favors the proliferation of phytopathogenic microorganisms in nursery. This can trigger significant losses and still become a environmental liabilities. Rarely the substrate is reused in commercial nurseries, since it is assumed that the physical, chemical and biological characteristics were lost during the production of seedlings. However, there are few studies on microorganisms on substrates. The importance of this study is based on the scarcity of research on this issue that affects the production of seedlings, as well as seek sustainable alternatives that assumes the use of this raw material demand. The application of molecular techniques have been employed to detect and identify microorganisms in various environments. In this context, the objective of this study was to detect microbiological diversity in substrate samples dropped by PCR-RFLP technique. Ten samples were collected of substrates in different nurseries in the State of Minas Gerais in different stages of production and State of modern farms. Total genomic DNA was extracted and amplified by the PCR technique with specific oligonucleotides to fungi, bacteria and archaea. The amplified products were submitted to cleavage with HaeIII restriction enzymes, BamHI, HindIII, and TaqI for detection of possible polymorphisms between the samples by PCR-RFLP technique. It was possible to check differences between samples of substrates, both in relation to the size of the amplified DNA region as well as in relation to the presence of restriction sites. Based on the index of similarity, if a greater variation of diversity within the sample at different stages than in samples between different nurseries. Therefore, these results may be relevant to the knowledge of microbiological diversity in substrate. However more studies are needed to better understanding of these microorganisms and their role in the substrate.
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Caracterização morfológica e molecular de oídio em Hevea brasiliensis /

Pieroni, Lisandro de Proença January 2020 (has links)
Orientador: Edson Luiz Furtado / Resumo: A seringueira (Hevea brasiliensis) é a terceira cultura florestal mais plantada no Brasil, e o estado de São Paulo é responsável por mais de 60% da produção de látex do país. É uma espécie nativa da região amazônica que possui hábito caducifólio, e durante o período de reenfolha é suscetível ao ataque de fitopatógenos foliares, que prejudicam e até limitam seu estabelecimento em determinadas regiões. Dentre os principais patógenos foliares da seringueira, destacam-se os fungos causadores de oídios, microrganismos biotróficos que infectam tecidos jovens, e podem causar desfolha, principalmente em condições de viveiro e jardim clonal. O agente causal do oídio da seringueira é descrito como Erysiphe quercicola, porém, devido a insuficientes descrições taxonômicas, morfológicas e moleculares desta doença, seu agente causal permanece em discussão, além da fase sexual deste patógeno carecer de qualquer registro neste hospedeiro. Portanto, o objetivo deste trabalho é caracterizar o oídio da seringueira, utilizando caracterizações morfológicas, análises moleculares e testes de patogenicidade. No período de julho a dezembro de 2019, foram coletadas amostras foliares de seringueira em diferentes estágios fenológicos infectadas com oídio na região de Botucatu, São Paulo. Para a caracterização morfológica, foram registradas e mensuradas características das hifas, conídios e conidióforos, que correspondem à fase assexuada do fungo. A caracterização molecular foi realizada através de análi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Rubber tree (Hevea brasiliensis) is the third most planted forest crop in Brazil, and the state of São Paulo is responsible for more than 60% of the country's latex production. It is a species native to the Amazon region that has a deciduous habit, and during the re-leafing period it is susceptible to the attack of leaf phytopathogens, which harm and even limit its establishment in certain regions. Among the main leaf pathogens of the rubber tree, there are the fungi that cause powdery mildew, biotrophic microorganisms that infect young tissues, and can cause defoliation, especially in nursery and clonal garden conditions. The causal agent of rubber mildew is described as Erysiphe quercicola, however, due to insufficient taxonomic, morphological and molecular descriptions of this disease, its causal agent remains under discussion, in addition to the sexual phase of this pathogen lacking any record in this host. Therefore, the objective of this work is to characterize powdery mildew mildew, using morphological characterizations, molecular analyzes and pathogenicity tests. From July to December 2019, leaf samples of rubber trees were collected at different phenological stages infected with powdery mildew in the Botucatu region, São Paulo. For morphological characterization, characteristics of hyphae, conidia and conidiophores, which correspond to the asexual phase of the fungus, were recorded and measured. Molecular characterization was performed through phylogenetic analyzes o... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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