Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:39:52Z : No. of bitstreams: 1 henriques_jm_me_botib.pdf: 1169724 bytes, checksum: 897f2a369c2b125057309094236f0fc6 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O rio Ribeira de Iguape e os rios litorâneos drenam uma importante faixa de terras da região leste de São Paulo e sua ictiofauna de água doce tem algumas semelhanças e muitas diferenças em relação às drenagens continentais. Os levantamentos ictiofaunísticos realizados nesses rios, como nas outras grandes bacias hidrográficas brasileiras, são ainda incompletos. Além disso, não existe consenso acerca do status taxonâmico de muitas espécies listadas nesses levantamentos. As estimativas disponíveis sugerem que existam cerca de 100 espécies de água doce na bacia do Ribeira de Iguape e 50 nos rios litorâneos. Estudos recentes têm proposto o uso do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (Cox 1) como um sistema global de identificação para as plantas e animais. Essas sequências têm sido interpretadas como um código de barras (barcode), com as espécies sendo delimitadas por uma sequência particular ou por um conjunto de sequências muito similares. Foram obtidas e analisadas 400 sequências do gene Citocromo Oxidase subunidade I (Cox1) de 68 espécies para a bacia do Ribeira de Iguape e 315 sequências de 58 espécies pertencentes aos rios costeiros do estado de São Paulo. A distância K2P média encontrada entre indivíduos dentro das espécies do Ribeira de Iguape foi de 0,41 %, e 6,32% entre espécies dentro de um mesmo gênero, similar ao encontrado nos rios costeiros onde a distância K2P foi de 0,77% dentro de espécies, em comparação à 6,16% entre espécies dentro de um mesmo gênero. Todas as espécies puderam ser diferenciadas por sua sequência Cox1, embora alguns indivíduos isolados de espécies distintas apresentaram haplótipos característicos de uma espécie do mesmo gênero. O presente estudo evidenciou que as espécies de peixes analisadas puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode, e pode ser usada para aplicações / The Ribeira Iguape river and coastal rivers drain a large range of land east of São Paulo and its freshwater fishes has some similarities and many differences frem the continental drainage. Surveys conducted ichthyofauna in these rivers, as in other large river basins in Brazil, is still incomplete. Moreover, there is no consensus on the taxonomic status of many species Iisted in these surveys. Available estimates suggest that there are about 100 freshwater fishes species in the Ribeira Iguape basin and 50 in coastal rivers. Recent studies have proposed the use of mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit I (Cox 1) as a global system of identification for plants and animais. These sequences have been interpreted as a barcodes, with species being bounded by a particular sequence or a set of very similar sequences. Were obtained and analyzed 400 sequences of the gene cytochreme oxidase subunit I (Cox1) from 68 species of Ribeira de Iguape basin and 315 sequences of 58 species of coastal rivers from Sao Paulo state. The average K2P distance between individuais within species of Ribeira Iguape basin was 0.41 % and 6.32% between species within a genus, similar to that found in coastal rivers where the K2P distance was 0.77% within species, compared to 6.16% between species within the same genus. Ali species were differentiated by their sequence Cox1, although some isolated individuais of different species had haplotypes of species of the same gender. The present study showed that fish species analyzed could be identified efficiently using barcode, and can be used for subsequent applications in ecology and systematics

Resumo: O rio Ribeira de Iguape e os rios litorâneos drenam uma importante faixa de terras da região leste de São Paulo e sua ictiofauna de água doce tem algumas semelhanças e muitas diferenças em relação às drenagens continentais. Os levantamentos ictiofaunísticos realizados nesses rios, como nas outras grandes bacias hidrográficas brasileiras, são ainda incompletos. Além disso, não existe consenso acerca do status taxonâmico de muitas espécies listadas nesses levantamentos. As estimativas disponíveis sugerem que existam cerca de 100 espécies de água doce na bacia do Ribeira de Iguape e 50 nos rios litorâneos. Estudos recentes têm proposto o uso do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (Cox 1) como um sistema global de identificação para as plantas e animais. Essas sequências têm sido interpretadas como um código de barras (barcode), com as espécies sendo delimitadas por uma sequência particular ou por um conjunto de sequências muito similares. Foram obtidas e analisadas 400 sequências do gene Citocromo Oxidase subunidade I (Cox1) de 68 espécies para a bacia do Ribeira de Iguape e 315 sequências de 58 espécies pertencentes aos rios costeiros do estado de São Paulo. A distância K2P média encontrada entre indivíduos dentro das espécies do Ribeira de Iguape foi de 0,41 %, e 6,32% entre espécies dentro de um mesmo gênero, similar ao encontrado nos rios costeiros onde a distância K2P foi de 0,77% dentro de espécies, em comparação à 6,16% entre espécies dentro de um mesmo gênero. Todas as espécies puderam ser diferenciadas por sua sequência Cox1, embora alguns indivíduos isolados de espécies distintas apresentaram haplótipos característicos de uma espécie do mesmo gênero. O presente estudo evidenciou que as espécies de peixes analisadas puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode, e pode ser usada para aplicações / Abstract: The Ribeira Iguape river and coastal rivers drain a large range of land east of São Paulo and its freshwater fishes has some similarities and many differences frem the continental drainage. Surveys conducted ichthyofauna in these rivers, as in other large river basins in Brazil, is still incomplete. Moreover, there is no consensus on the taxonomic status of many species Iisted in these surveys. Available estimates suggest that there are about 100 freshwater fishes species in the Ribeira Iguape basin and 50 in coastal rivers. Recent studies have proposed the use of mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit I (Cox 1) as a global system of identification for plants and animais. These sequences have been interpreted as a barcodes, with species being bounded by a particular sequence or a set of very similar sequences. Were obtained and analyzed 400 sequences of the gene cytochreme oxidase subunit I (Cox1) from 68 species of Ribeira de Iguape basin and 315 sequences of 58 species of coastal rivers from Sao Paulo state. The average K2P distance between individuais within species of Ribeira Iguape basin was 0.41 % and 6.32% between species within a genus, similar to that found in coastal rivers where the K2P distance was 0.77% within species, compared to 6.16% between species within the same genus. Ali species were differentiated by their sequence Cox1, although some isolated individuais of different species had haplotypes of species of the same gender. The present study showed that fish species analyzed could be identified efficiently using barcode, and can be used for subsequent applications in ecology and systematics / Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Oswaldo Takeshi Oyakawa / Banca: Cristina Yumi Miyaki / Banca: Anderson Luís Alves / Banca: Fábio Porto-Foresti / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Mestre