L’intestin des mammifères est colonisé par une dense communauté microbienne avec lequel il a établi, au cours d’une longue co-évolution, des relations mutualistes. Ces relations, bien qu’essentiellement basées sur des avantages métaboliques permettent également la maturation complète du système immunitaire, dont le développement est initié in utero par un programme génétique. Chez la souris, seule la SFB a été décrite comme présentant un fort pouvoir immunostimulant permettant la coordination d’un large panel de réponses immunes, notamment IgA et Th17 dont le site d’induction préférentiel serait les plaques de Peyer. La première partie de ma thèse a contribué à la finalisation de travaux consacrés à l’étude des caractéristiques des réponses IgA et Th17 induites par SFB. Nous avons ainsi mis en évidence la capacité de la SFB à stimuler la maturation post-natale de follicules lymphoïdes isolés et de tissus lymphoïdes tertiaires qui se substitueraient aux plaques de Peyer en tant que sites inducteurs des réponses IgA et Th17 stimulées par SFB. Cependant, ce microbiote constitue aussi une source antigénique importante pouvant représenter une menace pour l’intégrité de l’hôte. Notamment, la SFB peut provoquer une inflammation chronique délétère en périphérie de l’intestin, chez des souris prédisposées génétiquement. Cela suggère l’existence de mécanismes capables de réguler la colonisation par la SFB, afin d’éviter tout phénomènes compromettant l’intégrité physiologique de l’hôte. À l’aide de souris immunodéficientes axéniques ou seulement colonisées par SFB, nous avons pu mettre en évidence un rôle de la voie de signalisation des TLR dans le contrôle de la colonisation par SFB. Cependant, ni les peptides anti-microbiens, ni les IgA ne semblent impliqué dans le contrôle de la colonisation par SFB. / The mammalian intestine is heavily colonized by a huge microbial community. During a long coevolution process, the host has evolved mutualistic relationships with its microbiota. Thes relationships, mainly based on metabolstic advantages, also allow the full maturation of the host immune system, which development is initiated in utero by a genetic program. In mice, only SFB has been yet described to display strong immunostimulant properties allowing the coordination of a large panel of immune responses, more specifically IgA and Th17 responses, which preferential induction sites might be the Peyer's patches. The first part of my thesis contributed to complete a work dedicated to the characterization of the IgA et Th17 responses induced by SFB. We have underscored SFB capacity to stimulate the post-natal maturation of isolated lymphoid follicles and also tertiary lymphoid tissues that would substitute to Peyer's patches as inductors sites of both IgA and Th17 responses induced by SFB. However, this microbiote also constitutes a potential antigenic threat for the host integrity. Notably, the SFB could provoke chronic deleterious inflammation in peripheric compartment in genetically predisposed individuals. It suggests the establishment of highly regulated mechanisms regulating SFB colonization, to avoid compromising events for the host homeostasis. In a second part of my thesis, with the help of immunodeficient axenic mice, we have shown a role of TLR signaling pathways in the control of SFB colonization. However, antimicrobial peptides, IgA, IL-17 or IL-22 seem to be involved int eh control of SFB colonization.

Les adénovirus humains (HAdVs) provoquent généralement une infection bénigne chez l'hôte sain. En revanche, chez les patients immunodéprimés et immunocompétents, ils peuvent causer des infections sévères à létales. Les vecteurs HAdVs sont couramment utilisés dans les domaines de la thérapie génique et de la vaccination. L'immunité pré-existante de l’hôte protège généralement contre les infections de type sauvage mais peut entraîner des effets indésirables lors du relargage des virus tel que l’induction de processus inflammatoire locale ou général. Après l'infection, l'inflammation va principalement entraîner le recrutement de cellules dendritiques (DCs), de monocytes et de neutrophiles. Les DCs ont la capacité unique de présenter l'antigène et d’activer les cellules T, qui, par la suite, aideront les cellules B à produire des anticorps. En plus de leurs activités phagocytaires, des peptides antimicrobiens dérivés des neutrophiles (AMPs) jouent un rôle central dans l'immunité innée. Les AMPs peuvent neutraliser les microbes infectieux et / ou activer différents types de cellules immunitaires. Dans ce contexte, nous avons étudié l'interaction ex vivo entre le facteur hôte (anticorps anti-HADV et AMPs) contre les HAdVs dans les DCs ainsi que le rôle des DCs activés indirectement (indir-DCs) lors de la réponse immunitaire. Nous avons caractérisé le profil des cytokines et des chimiokines sécrétées par les DCs stimulées par différents HAdVs, AMPs et les combinaisons qui en découlent. Enfin, nous avons constaté que l’opsonisation d’HAdV5 par les IgG accroît la capacité de capture antigénique des MoDCs (cellules dendritiques dérivées de monocytes) et induit la mort cellulaire par pyroptose. Je me suis donc concentrée sur les caractéristiques et la fonction des indir-DCs dans l’immunité contre les HAdVs. Afin de mieux comprendre les propriétés et les phénotypes des indir-DCs et DCs activés directement (dir-DCs), nous avons caractérisé leurs profils de maturation, les facteurs influençant cette maturation, et leur capacité fonctionnelle de recruter les leucocytes. Ainsi nous avons pu mettre en évidence que les dir-DCs empêchent le recrutement leucocytaire tandis que les indir-DCs favorisent la migration des monocytes. L’ensemble de ces données contribue à comprendre comment l'immunité pré-existante contre les HAdVs peut impacter l’efficacité des traitements contre les maladies HAdVs ainsi que la conception de vaccins. / Human adenoviruses (HAdV) generally cause mild infection in healthy host, but in immunocompromised and immunocompetent patients, they cause severe on lethal infections. HAdV vector are also commonly used for gene transfer and vaccination. We know that pre-existing immunity can protect from wild type infection and cause adverse effects during vector delivery including local and system inflammation. Following HAdV infection on vector use, inflammation leads to the recruitment of dendritic cells (DCs), monocyte and neutrophils. DCs have the unique ability to present antigens and activate T cells, that subsequently aid B cells to produce antibodies. In addition to their phagocytic activities, neutrophil-derived antimicrobial peptides (AMPs) play a central role in innate immunity. AMPs can kill invading microbes and/or activate various cell types. Here I studied the ex vivo interaction between host factor (anti-HAdV antibodies and AMPs) to HAdV in DCs and the role of indirect-activated DC (indir-DCs) in immune response. I characterized the profile of cytokines and chemokines of DC stimulated with different HAdV, AMPs and their combination. We recently found that IgG-oposonization of HAdV5 increase the update by MoDCs (monoctyes-derived dendritic cells) and induced pyroptotic cell death. I therefore focused on the characteristic and function of indir-DCs in anti-HAdV immunity. To better understand the properties and phenotypes of indir-DCs and direct-activated DCs (dir-DCs), we characterize their maturation profile, the factors influencing their maturation, and the functional ability to recruit leukocyte. We found that dir-DC prevent leucocyte recruitment while indir-DC increases monocyte migration. These data contribute to understand how the pre-existing immunity to HAdV impacts treatment for HAdV diseases and vaccine design.