Cette thèse porte sur l'étude de l’efficacité d’une Aire Marine Protégée (AMP) comme outil de restauration des ressources marines et de gestion des stocks halieutiques en zone tropicale ouest africaine. L’étude concerne trois AMP. Il s’agit de l’AMP de Bamboung située en zone estuarienne (sous influence marine), à l'intérieur d'un delta et fermée à l’exploitation halieutique depuis 2004. La deuxième AMP est celle des îles d’Urok créée en 2005 et située dans la réserve de biosphère de l’archipel des Bijagos dans la partie littorale de la Guinée-Bissau. Elle est divisée en trois zones et la pêche y est autorisée avec une pression de pêche de plus en plus forte de la zone centrale vers la zone périphérique. La troisième AMP est le Parc National du Banc d’Arguin situé le long de la côte mauritanienne. Il a été créé en 1976 et les activités de pêche y sont pratiquées de façon réglementée. Beaucoup d’AMP ont été évaluées à travers le monde et les résultats obtenus sont dans la majeure partie des cas positifs. Dans les milieux tropicaux, les variabilités interannuelles et intra-annuelles des paramètres environnementaux influent sur l’organisation spatio-temporelle des peuplements de poissons. Par conséquent, la mise en place d’AMP dans une zone tropicale a suscité des interrogations quant à leur efficacité en rapport avec l’influence des paramètres de l’environnement. Selon l’AMP étudiée, une approche spatiale ou temporelle sera utilisée pour répondre aux questions posées. Les méthodes d’analyse utilisées sont de type comparatif. L’analyse des données biologiques est précédée par celle des paramètres physico-chimiques qui a mis en évidence des variabilités saisonnières dans chaque AMP. Ce résultat justifie le choix d’analyser les données biologiques par saison afin de minimiser au mieux l’influence des variations environnementales. En ce qui concerne l’AMP de Bamboung, les résultats de l’analyse suivant une approche globale ont clairement montré son rôle positif dans la restauration des ressources marines. L’approche saisonnière a mis en évidence ce rôle de restauration mais en saison froide et non en saison chaude et humide. En 9 années de protection, l'AMP de Bamboung a contribué au retour de gros poissons dans le bolon de Bamboung. Son rôle dans l’enrichissement de la zone proximale à travers le phénomène de «Spillover» n’a pas pu être mis en évidence. Une tendance à la baisse des indicateurs biologiques en fonction de la distance à l'AMP a été observée surtout en saison chaude et en saison humide. De même l’analyse des indicateurs liés à la reproduction ne montre pas que l’AMP de Bamboung améliore la reproduction des poissons. Concernant, l’AMP des îles d’Urok et le Parc National du Banc d’Arguin, les analyses n’ont pas donné de résultats clairs quant à leur rôle dans l’amélioration des rendements de pêche et de la reproduction des poissons. Cependant, pour l’AMP des îles d’Urok, les tendances observées semble montrer une forte concentration de biomasse dans la zone centrale, un rôle d’équilibre joué par la zone intermédiaire et un rôle de pourvoyeur de biomasse de poisson de la zone périphérique. Pour le PNBA, le secteur intérieur semble contribuer à l’enrichissement du secteur extérieur par un transfert de biomasse. La faible quantité de données récoltées dans les AMP pourrait être à l’origine des résultats négatifs. Ainsi, l’idée d'effectuer des suivis biologiques à court terme et d'analyser les indicateurs liés à la reproduction au niveau population ont été envisagés pour les trois AMP afin de trouver des résultats clairs quant à leur rôle dans la gestion des stocks halieutiques. / This thesis focuses on the study of the effectiveness of Marine Protected Areas (MPAs) as restoration tools of marine resources and fish stocks management in tropical West Africa. The study involves three MPAs. The first one is the Bamboung MPA, a marine reserve located in estuarine areas (with marine influence), closed to fishing since 2004. The second is the Urok Islands MPA established in 2005 and located in the biosphere Reserve of Bijagos archipelago in the coastal part of Guinea-Bissau. It is divided into three areas and fishing is allowed there with a fishing pressure becoming stronger from the central area to peripheral area. The third MPA is the Banc d‟Arguin National Marine Park located along the coast of Mauritania. It was created in 1976 and fishing activities are restricted. Many AMP were evaluated worldwide and the results are in the main part positive. In tropical zones, the variability of environmental parameters affects the spatial and temporal organization of fish assemblage. Therefore, the MPA establishment in a tropical zone has raised questions about their effectiveness inrelation to the influence of environmental parameters. According to the AMP, spatial or temporal approach will be used to answer questions. Comparison analysis will be used. The analysis of biological data comes after those of the physicochemical parameters that show strong seasonal variability in each MPA. This result justifies the choice of seasonal analysis of biological data in order to minimize the influence of environmental variations.Regarding the Bamboung MPA, the results of global approach clearly confirm that it is an effective tool for restoring marine resources. The seasonal approach shows this role in cold season, but not in hot and wet seasons. In 9 years of protection, the Bamboung MPA contributed to attract big fish in the Bamboung bolon. The spillover effect in Bamboung MPA is not clearly demonstrated according to our results. A downward trend of biological indicators according to the distance to the MPA has been observed especially in hot season and wet season. Similarly, the analysis of indicators related to reproduction does not show that the Bamboung MPA improve fish reproduction. Regarding Urok Islands MPA and Banc d’Arguin National marine Park, the results do not confirm that these AMP are fish stock management tools (improved yields of fishing activities and fish reproduction). However, for Urok islands MPA the observed trends suggest a biomass concentration in the central area, an equilibrium role played by the intermediate area and a role of fish biomass provider of the peripheral area. For Banc d’Arguin National Marine Parc, the inside area seems to contribute to the enrichment of the external area by transferring fish biomass. Non-specific results could be explained by the small data collected in the MPAs. So the idea to conduct a short-term biological monitoring and to analyze reproduction indicators in population level has been considered for the three MPA to find clear results on their role in the management of fish stocks.