Th. 3e cycle--Hydrol.--Paris 5, 1984. N°: 76.

Thèse de 3e cycle : Sciences biologiques fondamentales et appliquées, psychologie : Metz : 1985. / Bibliogr. : p.123-125.

La stratification thermique d'un lac, caractérisée par la présence d'une thermocline, est un déterminant important dans la distribution verticale de la communauté planctonique. L'objectif de la présente étude est de déterminer l'effet de l'abaissement de la thermocline sur les communautés de zooplanctons et de phytoplanctons. Pour ce faire, une simulation de ce phénomène a été réalisée dans un bassin (de trois au Lac Croche, Québec, Canada) en utilisant un instrument mélangeant la colonne d'eau. Diverses variables furent échantillonnées en profils verticaux au point le plus profond de chacun des bassins durant deux étés: une année témoin (2007) et une année d'expérimentation (2008). Ces variables sont relatives à la physico-chimie de l'eau ainsi qu'aux caractéristiques de la communauté planctonique. Le bassin expérimental fut mélangé dès le printemps 2008. Les mesures prises durant l'expérimentation sont comparées aux mesures de l'année témoin et aux mesures des deux autres bassins. Un des bassins étant un témoin et l'autre un témoin uniquement au niveau de la turbulence car sa thermocline s'est aussi abaissée suite à l'expérimentation. Les résultats obtenus démontrent que le mélange a entraîné un abaissement de la thermocline, de 5 m en août 2007 à 8 m en août 2008 dans le bassin expérimental et de 5 m à 6,5 m dans le bassin intermédiaire. Cette variation a engendré une modification de la distribution verticale du plancton. De plus, l'abaissement a avantagé les algues vertes, les algues brunes ainsi que les cryptophytes. Le mélange accru a avantagé les algues vertes ainsi que certains zooplanctons, les rotifères et les copépodes cyclopoïdes. Seules les cyanobactéries ont présenté une réponse négative à la hausse de la turbulence. L'abaissement de la thermocline est une conséquence envisagée des changements climatiques, des feux de forêt ainsi que des coupes forestières. Les résultats obtenus dans ce projet pourraient ainsi aider à prédire les variations futures des populations planctoniques et guider les stratégies de conservation des écosystèmes aquatiques. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Phytoplancton, Profondeur de mélange, Thermocline, Turbulence, Zooplancton.

Th. 3e cycle--Biol. de la reprod. et du dév.--Lille 1, 1980. N°: 849.

Ce projet de recherche cible l’étude et l’amélioration de la précision de la classification d’images de phytoplancton et la diminution du temps de traitement moyen requis par image. Deux solutions de classification sont proposées pour atteindre ces objectifs. La première solution vise à effectuer la classification d’images en passant par les phases de prétraitement, de discrimination et de classification, et la deuxième solution utilise uniquement les phases de prétraitement et de classification. En résumé, la phase de prétraitement manipule une image en vue de caractériser l’élément principal (le phytoplancton), la phase de discrimination utilise les arbres décisionnels à intervalles pour éliminer les catégories ayant peu ou pas de similitude avec l’image traitée et finalement, la phase de classification se sert de machines à vecteurs de support (SVM) pour prédire une catégorie d’appartenance à chaque image traitée. À la base, il y a un appareil de capture automatisée d’images qui transmet celles-ci à un classificateur. Selon la vitesse de classification, une portion ou l’ensemble des images générées seront classifiés. Donc, plus le nombre d’échantillons à classifier est grand, meilleure est l’approximation de la population de chaque groupe de phytoplanctons, à un temps donné. Le but étant d’obtenir une analyse qualitative, quantitative et temporelle plus précise de ce micro-organisme. Pour permettre la classification de ce type d’image, un logiciel nommé Biotaxis a été développé. Celui-ci offre à l’utilisateur l’option de choisir parmis les deux solutions de classification proposées ci-haut. Toutes deux débutent par l’entraînement d’un groupe de classification, qui est composé de plusieurs catégories d’image, suivi par des tests de classification, qui sont effectués sur ce groupe pour vérifier la précision de la classification des catégories d’image qui le compose. Pour entraîner et tester le classificateur du logiciel Biotaxis, deux ensembles d’images ont été employés. L’un d’eux sert uniquement à l’entrainement de groupes de classification et le second à tester ces derniers. Les résultats obtenus dans ce projet de recherche ont permis de confirmer la validité des deux solutions proposées. Il fut possible d’atteindre une précision de la classification moyenne de 87 % et plus avec des groupes de classification de 13 catégories et moins. De plus, un temps de traitement moyen inférieur à 200 ms par image a été réalisé à partir de ces mêmes groupes de classification. Le logiciel Biotaxis est proposé comme une nouvelle solution pour classifier rapidement des images de phytoplancton.

Les études récentes ont montré qu'il y aurait une forte influence de la matière organique dissoute (MOD) sur la dynamique des écosystèmes aquatiques. En particulier, certaines catégories de MOD ont des propriétés antialgues, susceptibles de réduire la biomasse des espèces de cyanobactéries. Nous avons testé les effets de différentes catégories de matières organiques dissoutes, ainsi que leurs interactions avec la lumière et les nutriments, sur la composition des communautés de phytoplancton lors d'incubations in situ (7 jours). La composition initiale en phytoplancton et les caractéristiques de la matière organique dissoute ont été des facteurs déterminants pour les modifications de la structure des communautés de phytoplancton, lors des incubations. Les résultats de notre étude montrent que la croissance du phytoplancton était fortement dépendante de la disponibilité en nutriments dans la baie Missisquoi en 2007, et que les concentrés d'extrait d'orge et de matière organique naturelle peuvent inhiber la croissance du phytoplancton, particulièrement des espèces de cyanobactéries. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Matière organique dissoute (MOD), Cyanobactérie, Phytoplancton, Incubations, Lac Champlain.

Thèse de doctorat : Sciences de l'Environnement Marin : Aix Marseille 2 : 2002. / Thèse : 2002AIX22010. Bibliogr.: f.199-208.

Mémoire (M. Sc. A.)-- Université du Québec à Chicoutimi, 1984. / Bibliographie: f. 77-81. Document électronique également accessible en format PDF. CaQCU

Th. doct.--Hydrologie et hydrogéol. quant.--Paris--Éc. natl. supér. mines, 1995. / Bibliogr. p. 267-281. Résumé en français et en anglais.

La mixotrophie (la combinaison de la phototrophie et de l’hétérotrophie chez un même organisme) est une stratégie nutritive très courante chez les protistes planctoniques et son importance pour le fonctionnement des écosystèmes aquatiques a récemment été mise en évidence. La plupart des modèles biogéochimiques décrivant les écosystèmes aquatiques sont cependant encore basés sur le paradigme traditionnel d’une séparation stricte entre les protistes phototrophes (le phytoplancton) et les protistes hétérotrophes (le nano/microzooplancton).Dans la première partie, la thèse de doctorat propose deux modèles mathématiques mécanistiques permettant de décrire l’ensemble des stratégies nutritives déployées par les protistes planctoniques et pouvant être implémentés dans les modèles biogéochimiques. Le premier modèle décrit la capacité des protistes phototrophes à utiliser le phosphore organique dissous (DOP) lorsqu’ils sont limités en phosphate. Le second modèle décrit la mixotrophie stricte (phototrophie + phagotrophie) et permet de représenter les grands types de mixotrophies observés dans les milieux aquatiques: la mixotrophie constitutive et la mixotrophie non-constitutive.Dans la seconde partie du travail, les modèles mécanistiques sont implémentés dans le modèle MIRO (Lancelot et al. 2005) décrivant l’écosystème planctonique de la Baie Sud de la Mer du Nord, avec l’objectif d’étudier le rôle de la mixotrophie sur le fonctionnement d’un écosystème côtier eutrophisé.Les résultats montrent que lorsque les apports en nutriments par les rivières (Seine et Escaut) sont élevés et enrichis en N par rapport au P, le DOP devient une source importante en P pour les protistes phototrophes (surtout pour les colonies de l’espèce nuisible Phaeocystis) ;ne pas en tenir compte mènerait à une sous-estimation de la production primaire (jusqu’à 32%), de la sédimentation (jusqu’à 20%), de la reminéralisation en ammonium (jusqu’à 13%), des émissions de diméthylsulfure (DMS ;jusqu’à 97%), et de la capacité de l’écosystème à absorber le CO2 atmosphérique (avec, certaines années, un changement du rôle de l’écosystème, passant de source à puits de CO2). La production secondaire n’est, par contre, pas affectée par le DOP. Les mixotrophies constitutive et non-constitutive ont en général peu d’impact sur la production primaire, la production secondaire, la sédimentation, et la reminéralisation dans l’écosystème étudié. L’effet de la mixotrophie non-constitutive dépend cependant de la lumière disponible ;les printemps/été caractérisés par des intensités lumineuses élevées, la mixotrophie non-constitutive induit une augmentation de tous les processus étudiés, en particulier la production secondaire (jusqu’à 23%). / Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique / info:eu-repo/semantics/nonPublished