La dengue, une des maladies les plus largement émergents actuellement, avec 390 millions d'infections chaque année (OMS), est causée par le virus de la dengue contre lequel il n’existe pas de traitements. La protéine NS5 a un rôle important dans le cycle de réplication. Cette protéine se compose d'une méthionine S-transférase d’adénosyl en N-terminal et une ARN polymérase dépendante de l'ARN (RdRp) en C-terminal. Cette NS5 RdRp peut catalyser non seulement la synthèse du brin négatif de l'ARN, utilisé comme matrice pour synthétiser l'ARN brin plus-supplémentaire, mais aussi pour la synthèse d'un ARN complémentaire à partir d'une matrice court e d'ARN sans amorce (de novo). Dans ce travail de thèse, nous présentons la production et le test de l'activité de la protéine NS5, ainsi que du domaine polymérase RdRp pour les quatre sérotypes du virus de la dengue en développant un nouveau test enzymatique, en utilisant comme un réactif fluorescent. L'utilisation de ce réactif fluorescent a également contribué à la détermination des conditions optimisées pour développer un essai de criblage de l'activité polymérase pour identifier des inhibiteurs contre le virus de la dengue. En outre, quatre flavonoïdes, Hinokiflavone, apigénine, la quercétine et Amentoflavone ont montré des valeurs d’IC50 équivalentes contre toutes les constructions NS5 et les domaines polymérase des quatre sérotypes. / Dengue fever, one of the most widely emerging diseases nowadays with 390 million infections each year (WHO), is caused by Dengue virus in which no official antiviral reagent or vaccine is available. The NS5 protein has an important role in the replication cycle. This protein consists of a S-adenosyl methionine transferase at N-terminal and a RNA dependent RNA polymerase (RdRp) at C-terminal. This NS5 RdRp can catalyse for not only synthesis of minus-strand RNA to be used as the template to synthesize additional plus-strand RNA but also synthesizing a complement RNA from a short RNA template without primer (de novo). In this research we present the production and activity test for NS5 protein and N-terminal extended sequence 266-900 from NS5 RdRp of all first four serotypes of Dengue virus and a construct of sequence 273-900 using a new enzymatic assay, using Picogreen as fluorescent reagent. Using this fluorescent reagent also helped determining the optimised conditions to develop a screening assay for inhibitors against dengue polymerase activity. In addition, four flavonoids, Hinokiflavone, Apigenin, Quercetin and Amentoflavone showed approximate IC50 values when testing on all NS5 and polymerase protein constructs of all four serotypes.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / DNA is a molecule susceptible to the attack of many toxic substances. So, studies on the toxic effects of chemical are very important. Tests that evaluate substances genomodifier (presenting action genoprotetora or genotoxic), how the Comet Assay, are often complex and laborious. Therefore an ultrasensitive and fast protocol no-cell is presented for the quantification DNA triggered by chemical compounds, called GEMO Assay (Genomodifier capacity assay). This assay includes a prooxidant standardized (H2O2, 3M) that is used to compare the effects on dsDNA damage of the compound-test that is evaluated with and without addition this prooxidant. The assay is performed in black 96-well plate and use Quant-iT PicoGreen® dsDNA Reagent and DNA from Calf Thymus. The vitamin C was used like compound-test in different concentrations (0.1, 0.3, 1, 3 and 10 μg/mL). For validation of GEMO Assay was used PBMCs (peripheral blood mononuclear cells) and HT29 (colon carcinoma cell line) exposed the same conditions that the proposed test and evaluated at different tests already well described in the literature: Alkaline Comet Assay, MTT, DCFH-DA and TBARS. The results showed high correlation with GEMO Assay, confirming the validation. Then the test developed in this work offers high sensitivity for detecting genomodifier substances without interference if biological systems. / Pelo fato do DNA ser uma molécula suscetível ao ataque muitas de substâncias, estudos sobre efeitos tóxicos ou fitoterapêuticos de compostos químicos são necessários. Muitos ensaios que analisam o efeito genomodificador de substâncias, às vezes, são relativamente complexos, como o Teste do Cometa. Entende-se por ação genomodificadora aquela em que a substância testada ou apresenta genoproteção ou genotoxicidade. Baseado na existência de ensaios in vitro que servem como triagem para avaliar a capacidade antioxidante de um dado composto, como o DPPH, o objetivo deste estudo foi desenvolver e validar um método in vitro da capacidade genomodificadora de compostos químicos e sintéticos. Assim, um ultrassensível e rápido protocolo que não utiliza sistemas biológicos foi desenvolvido para a quantificação do DNA dupla-fita (dsDNA) exposto a substâncias químicas, denominado de Teste GEMO (Teste de Capacidade Genomodificadora). Esse método foi concebido para placa preta de 96 poços, utilizando um corante altamente específico de dsDNA (PicoGreen®) e DNA purificado de timo de bezerro (dsDNA). O teste inclui um pró-oxidante de referência, peróxido de hidrogênio (H2O2 3M), que permite a análise comparativa dos dados obtidos, classificando a substância testada em vários níveis de genotoxicidade e ainda se a mesma apresenta potencial de genoproteção. Para o desenvolvimento do teste foi utilizado um antioxidante bem conhecido pelo seu papel genoprotetor e antitumoral, a vitamina C em diferentes concentrações (0.1, 0.3, 1, 3 e 10 μg/mL). Para a validação do Teste GEMO, foram utilizadas células mononucleares de sangue periférico (PBMCs) e células de adenocarcinoma colorretal (HT29), expostas as mesmas condições que o teste proposto e submetidas a diferentes testes já bem descritos na literatura: Teste do Cometa Alcalino, MTT, DCFH-DA e TBARS. Os resultados mostraram alta correlação com Teste GEMO, confirmando a validação. Portanto, o ensaio desenvolvido nesse trabalho oferece alta sensibilidade para detectar compostos genomodificadores, sem a interferência de sistemas biológicos.