Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1068.pdf: 1558374 bytes, checksum: 9f494970208ef891e83b858667c6094d (MD5) Previous issue date: 2006-05-10 / Universidade Federal de Sao Carlos / The Roseate Spoonbill (Platalea ajaja, Aves: Threskiornithidae) is a wading bird species which breeds in wetland colonies from the southern United States (US) to the pampas of Argentina. Brazilian colonies are abundant in the Pantanal region, Rio Grande do Sul marshes and in the north region of this country. Adults undergo two annual molt periods which partially overlap with the reproductive cycle. The species has been described as socially monogamous based on field observations of only one couple. We sampled five Pantanal and one Rio Grande do Sul breeding colonies, applying nestling blood and feather sampling and a new non-invasive methodology, the collection of adult molted feathers. Four species-specific and one heterologous microsatellite markers were used to characterize the genetic variability distribution and levels of genetic structure within and between the colonies; to estimate levels of genetic relatedness between nestlings found at the same nest to infer about breeding behavior in the wild; and to estimate and compare the distribution of genetic variability and values of genetic relatedness between male and female adults to infer about patterns of natal dispersal. Mean observed heterozigosity (0,575) was comparable to the reported for a wild-caught population maintained in a US zoo. Results are discussed supposing reduced losses of genetic variability in the US population after the population decline undergone by it, or by a rapid recovery of this population after the bottleneck. Another possibility was hypothesized considering that Brazilian Pantanal population may be declining. No evidences were found of genetic structuring nor differentiation between the colonies (global FST = -0.002, P: 0,59), thus suggesting the existence of high levels of recent or past gene flow between them. Unexpected low relatedness values with significant probability (LOD) values were observed for some dyads found at the same nests. We suggest that extra-pair copulation and/or brood parasitism, already observed in captivity birds, can be occurring in Roseate Spoonbill natural populations, but this fact may be further explored. Comparative analyses showed that genetic variability distribution and relatedness values did not differ significantly between male and female adult samples. The interpretation of these results indicates that both sexes of Roseate Spoonbill apparently present similar patterns of natal dispersal. / O colhereiro (Platalea ajaja, Aves: Threskiornithidae) é uma ave aquática de porte médio, pernas longas e cor rosada que nidifica em colônias reprodutivas em áreas alagadas desde a porção meridional dos Estados Unidos da América (EUA) até as pampas da Argentina. As colônias brasileiras dessa espécie são abundantes no Pantanal, na região dos banhados do Rio Grande do Sul e no norte do país. Os adultos passam por duas mudas ao longo do ano que se sobrepõem, em parte, ao ciclo reprodutivo. A espécie foi descrita como socialmente monogâmica segundo observações de campo de um único casal. Neste trabalho, foram amostradas cinco colônias reprodutivas pantaneiras e uma colônia no Rio Grande do Sul, aplicaram-se estratégias convencionais e uma abordagem não-invasiva de coleta de penas de adultos. Quatro locos de microssatélites espécie-específicos e um heterólogo foram usados para: 1) caracterizar a distribuição da variabilidade genética e os níveis de estruturação genética dentro e entre as colônias; 2) estimar os níveis de parentesco genético entre ninhegos amostrados nos mesmos ninhos com o objetivo de inferir sobre o comportamento reprodutivo dos adultos na natureza e 3) estimar e comparar a distribuição da variabilidade genética e os níveis de parentesco genético entre machos e fêmeas adultos para inferir sobre padrões de dispersão natal na espécie. A heterozigosidade media observada (0,575) foi comparável à reportada para uma população de indivíduos capturados na natureza e mantidos em cativeiro num zoológico dos EUA. Os resultados são discutidos supondo pouca perda de variabilidade na população norte-americana após a redução no tamanho populacional por ela sofrido, ou uma rápida recuperação da mesma. Outra hipótese é levantada, considerando que as populações do Pantanal poderiam estar em declínio. Não foram encontradas evidências de estruturação genética nem diferenciação entre as colônias (FST global = -0.002, P: 0,59), o qual sugere a existência de altos níveis de fluxo gênico atual ou passado entre elas. Valores baixos, mas significativos, de parentesco genético foram observados para alguns pares encontrados nos mesmos ninhos. Sugere-se que a copula extra-par e/ou parasitismo de ninho, já observados em indivíduos em cativeiro, podem ocorrer em populações naturais, mas esses fatos devem ser mais profundamente investigados. A análises comparativas demonstraram que a distribuição da variabilidade genética e os valores de parentesco não diferiram entre machos e fêmeas. A interpretação desses resultados indica que ambos os sexos apresentariam padrões semelhantes de dispersão natal.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissMHS.pdf: 1182741 bytes, checksum: 57f363f6583bd0736e6fa0914d77fdfb (MD5) Previous issue date: 2005-12-02 / Roseate spoonbill (Platalea ajaja) is a neotropical bird with wide geographic distribution in intercontinental and coastal wetland habitats. Populations are morphologically indistinguishable, with no apparent differentiation from the southern United States to northern Argentina. In this study we aim to determine the genetic diversity and to delineate the Brazilian population structure of this specie, using genetic data of a 483 base-pair fragment of the first domain of the mitochondrial DNA control region. Samples of 50 individuals were collected from five breeding colonies in two important Brazilian wetland areas, the Pantanal (four colonies, n = 39) and the Banhado do Taim (one colony, n = 11). The levels of variability estimated using nucleotide (π) and haplotipic (H) diversities were higher in the Pantanal (π = 0.004 and H = 0.753) than in Taim (π = 0,0004 and H = 0,182). No significant levels of genetic differentiation among Pantanal colonies (Fst and AMOVA values are not significant) and between Pantanal and Taim colonies (Fst and AMOVA values are not significant) were found. The unimodal pattern of the mismatch distribution and the neutrality tests results (Tajima`s D = -1,942, Fu = -23,271 and R2 = 0,055) pointed a recent expansion in the Pantanal population. The time since the expansion was estimated to be 30242 years before present and the Ne was estimated as 14556 females. Our results were discuss considering that the present Pantanal population was originated from a geographically limited founder population. The Ne estimates indicates that the Pantanal population represents around 10-30% of Roseate Spoonbill continental population. / O colhereiro (Platalea ajaja) é uma ave aquática neotropical, com distribuição ampla por áreas costeiras e intracontinentais. As populações são morfologicamente indistinguíveis, sem diferenciação aparente entre as populações do sul dos Estados Unidos até o norte da Argentina. Esse estudo visou à determinação da variabilidade e estruturação genética de algumas colônias reprodutivas brasileiras dessa espécie. A análise foi baseada na variação de um fragmento de 483 pares de bases do primeiro domínio da região controladora do DNA mitocondrial. Foram coletadas 50 amostras provenientes de cinco colônias reprodutivas em duas importantes áreas úmidas do Brasil, o Pantanal (quatro colônias n = 39) e o Banhado do Taim (uma colônia, n = 11). O nível de variabilidade para a região do Pantanal foi estimado usando a diversidade genética (π) e a diversidade haplotípica (H) e foram mais altas (π = 0,004, H = 0,753) do que o encontrado para o Taim (π = 0,0004, H =0,182). Não foi encontrada diferenciação genética entre as colônias do Pantanal (Fst e AMOVA, valores não significativos) e entre o Pantanal e Taim (Fst e AMOVA, valores não significativos). A distribuição unimodal do histograma de freqüências relativas das diferenças pareadas e os testes de neutralidade (Tajima = -1,942, Fu = -23,271 e R2 = 0,055) sugerem uma expansão recente para as colônias da região do Pantanal. O tempo desde a expansão foi estimado em 30242 anos atrás e o Ne = 14556 fêmeas. Os resultados foram discutidos supondo que a população contemporânea de colhereiro no Pantanal é originária de uma população fundadora geograficamente mais limitada e a população atual da região representa cerca de 10 a 30% de toda a população do continente.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3280.pdf: 5102569 bytes, checksum: f511b08e43998ea79e0f9b0ac5ed969b (MD5) Previous issue date: 2010-08-06 / Universidade Federal de Sao Carlos / Population genetic parameters and genetic relatedness estimates were carried out for Roseate Spoonbill (Platalea ajaja), Wood Stork (Mycteria americana) and Great Egret (Ardea alba egretta) reproductive colonies in Amapa, Pantanal and Rio Grande do Sul (RS), Brazil. Microsatellite genotypes were used to investigate kinship patterns between nestlings sampled inside the same nests, using a variety of analytical approaches. Unrelated nestling-pairs were observed in Roseate Spoonbill nests (6.12% of analyzed nests) and in Wood Stork nests (11.34%); half-siblings were present in Roseate Spoonbill nests as well (1.36%). Only full-siblings were detected inside Great Egret nests. Conspecific brood parasitism (CBP) and extra-pair paternity were proposed to account for the presence of unrelated nestmates and half-siblings, respectively, in Roseate Spoonbill and Wood Stork nests. Those results suggest the occurrence of a mating system different than genetic monogamy in natural populations of those waterbirds. Genetic relatedness was also investigated for adults and offspring, as well as for supposed siblings in Roseate Spoonbill families kept in three zoological facilities in the U.S. Paternity and maternity allocation analyses through maximum-likelihood revealed that errors were present in zoo‟s studbooks in relation to the familial records. We also identified mating between related individuals that were not detected previously by zookeepers. Population genetic parameters were also estimated and demographic processes were assessed for Great Egret reproductive colonies in the Pantanal and Rio Grande do Su, Brazil. Bayesian clustering analyses, assignment tests, analysis of molecular variance, F-statistics estimates, allelic frequency distribution and the G-W index revealed that: i) Pantanal reproductive colonies are genetically differentiated from Rio Grande do Sul colonies; ii) an IBD-like pattern alone cannot explain that differentiation; and iii) genetic signal of a reduction of population size was present for two colonies in the Pantanal and one in Rio Grande do Sul. Results were discussed considering a metapopulation dynamic and also considering that populations from both Brazilian regions represent distinct units and deserve to be treated separately when planning and carrying out conservation and management programs that aim to preserve the species‟ genetic diversity. / Estudos de genética de populações e de parentesco genético foram desenvolvidos em colhereiro (Platalea ajaja), cabeça-seca (Mycteria americana) e garça-branca-grande (Ardea alba egretta), de colônias reprodutivas do Amapá, Pantanal e Rio Grande do Sul (RS), Brasil. Genótipos em locos de microssatélites foram utilizados para se investigar os padrões de relacionamento entre ninhegos amostrados dentro dos mesmos ninhos com diferentes metodologias de análise. Pares de ninhegos não-relacionados foram encontrados nos ninhos de colhereiro (6,12% dos pares analisados) e de cabeça-seca (11,34%); meio-irmãos foram observados nos ninhos de colhereiro (1,36%). Em garça branca grande foi detectada apenas a presença de irmãos-completos dentro dos ninhos. Parasitismo de ninho intraespecífico e paternidade extra-par podem explicar a presença de ninhegos não-relacionados e meio-irmãos nos ninhos de colhereiro e cabeça-seca, o que indica a presença de um sistema de acasalamento diferente da monogamia genética nas populações naturais dessas espécies. Relações de parentesco entre adultos e filhotes e entre supostos irmãos foram determinadas em famílias de colhereiro de três zoológicos dos EUA. Análises de atribuição de maternidade e paternidade por máxima verossimilhança revelaram erros nos registros dos zoológicos quanto às relações progenitor-progênie e identificaram acasalamentos entre indivíduos aparentados que não tinham sido registrados. Parâmetros genético-populacionais e processos demográficos foram investigados em populações de garça-branca-grande do Pantanal e do Rio Grande do Sul. Análises Bayesianas, testes de alocação de indivíduos, análises de variância molecular, estimativa de estatísticas F, exame da distribuição das freqüências alélicas e cálculo do índice de G-W permitiram identificar que: i) há diferenciação genética significativa entre colônias reprodutivas do Pantanal e do Rio Grande do Sul; ii) o padrão de isolamento pela distância não explica essa diferenciação; e iii) duas populações no Pantanal e uma população no RS apresentaram sinais genéticos de redução demográfica. Os resultados foram discutidos considerando que as populações de garça-branca-grande localizadas no Pantanal e no Rio Grande do Sul são unidades populacionais independentes e devem se tratar separadamente no planejamento e desenvolvimento de programas de manejo para a conservação da diversidade genética total da espécie.