Thesis (M.S.)--Worcester Polytechnic Institute. / Keywords: crystal growth; monolayer; polymorph. Includes bibliographical references (leaves 106-120).

Thesis (Ph.D.) -- University of Rhode Island, 2007 / Typescript. Includes bibliographical references (leaves 95-101).

Thesis (M.S.)--University of Wisconsin--Madison. / Typescript. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references (leaves 37-40).

Thesis (Ph.D.) -- University of Rhode Island, 2008. / Typescript. Includes bibliographical references (leaves 125-134).

University of Oregon theses, Dept. of Biology, Ph.D., 1968. A print copy of this title is available from University of Oregon's Oregon Institute of Marine Biology library and at the Science library, under the call number: QL 430.4 .G5

Orientador: Carmen Silvia Passos Lima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-10T01:04:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_EricaFurquimSoledadeNeves_M.pdf: 1247474 bytes, checksum: fb164930ca8036640d7d8a9b9f56bca8 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: As glutationa S-transferases (GSTs) são enzimas detoxificantes que atuam no mecanismo de proteção contra a carcinogênese. Os genes GSTM1 e o GSTT1 são polimórficos em humanos e estão deletados de forma homozigótica em 40-50% e 15-25% dos indivíduos de diferentes populações étnicas, respectivamente. Os polimorfismos T6235C e A4889G do gene CYP1A1 estão também associados ao metabolismo de carcinógenos e as formas variantes CC e GG são identificadas em 5-20% e 5% dos indivíduos de diferentes populações étnicas. O objetivo deste estudo é avaliar se os polimorfismos destes genes influenciam o risco de ocorrência do carcinoma epidermóide (CEC) de cabeça e pescoço ou se estão associados com os aspectos clínicos dos pacientes com a doença. Para tanto, foram avaliados 142 pacientes com CEC de cabeça e pescoço e 142 controles. A genotipagem foi realizada por meio da reação em cadeia da polimerase (multiplex-PCR) e PCR e digestão enzimática, respectivamente. O significado estatístico das diferenças entre grupos foi calculado por meio do teste da probabilidade exata de Fisher. As determinações dos riscos de ocorrência do CEC, foram obtidas por meio das razões das chances (ORs) considerando um intervalo de confiança de 95% (IC 95%). Não foram observadas diferenças entre as freqüências da deleção homozigótica dos genes GSTM1 (40,8% versus 46,5%; P= 0,16) e GSTT1 (25,3% versus 20,4%; P= 0,94) em pacientes e controles. Entretanto a freqüência da deleção homozigótica do gene GSTM1 em pacientes com tumor dos estádios I a III foi menor do que a observada em pacientes com tumores do estádio IV (20,4% versus 51,8%; P= 0,002). A freqüência da deleção homozigótica do gene GSTM1 em pacientes com os estádios I a III do tumor foi também menor do que a observada em controles (20,4% versus 46,5%; P= 0,0008). As freqüências combinadas dos genótipos TC + CC do polimorfismo T6235C do gene CYP1A1 foram similares em pacientes e controles (36,6% versus 33,8%; P= 0,85). Em contraste, a freqüência combinada dos genótipos TC + CC em pacientes com tumor de laringe foi menor do que a observada em pacientes com tumores de outras localizações (21,6% versus 41,9%; P= 0,03). Já as freqüências combinadas dos genótipos AG + GG do polimorfismo A4889G do gene CYP1A1 foram similares em pacientes e controles (33,8% versus 28,2%; P= 0,71) e em pacientes estratificados por aspectos clínicos, anátomo-patológicos e biológicos do tumor. Os resultados deste estudo, em seu conjunto, sugerem que a presença dos genes GSTM1 parecem proteger indivíduos da ocorrência do CEC mais localizado de cabeça e pescoço, enquanto que a deleção homozigótica do gene GSTM1 parece atuar na agressividade do tumor em nossos casos. Os genótipos variantes TC + CC do polimorfismo T6235C do gene CYP1A1 parecem proteger indivíduos de nossa região do câncer de laringe. Já os genótipos do polimorfismo A4889G do gene CYP1A1 parecem não influenciar o risco de corrência da doença ou de suas manifstações clínicas, bem como as carcterísticas anátomo-patológicas e biológicas do tumor em nossos casos / Abstract: The glutathione S-transferases (GSTs) are metabolic enzymes involved in carcinogenic detoxification. GSTM1 and GSTT1 polymorphic genes are deleted in humans and null genotypes frequencies are different in several ethnic groups; 40-50% and 15-25% of different population, respectively. Genetic CYP1A1 polymorphisms T6235C and A4889G are also associated to carcinogenic metabolism and variant genotypes CC and GG are identified in 5-20% and 5% of individuals at several ethnic groups. It¿s unclear if these genetic polymorphisms influence head and neck epidermoide carcinoma (CEC) risk, or its association with patients stratified by clinical features. Therefore, 142 patients diagnosed with head and neck cancer and 142 control subjects were evaluated. Genotyping was performed by using polymerase chain reaction (multiplex-PCR) and PCR and subsequent restriction enzyme digestion, respectively. The different statistical significances between groups, was calculated by using the Fisher exact test or Chi ² test. Crude odds ratios (ORs) were calculated and are given with the 95% confidence intervals (IC). There were no difference frequencies statistically significant of GSTM1 null genotype (40,8% versus 46,5%; P= 0,16) neither GSTT1 null genotype (25,3% versus 20,4%; P= 0,94) between patients and controls. However, the homozygous deletion of the GSTM1 gene in patients with tumors of stages I to III was lower than that seem in patients with advanced (stage IV) tumors (20,4% versus 51,8%; P= 0,002). The homozygous deletion of the GSTM1 gene was also less common in stage I to III patients than in controls (20,4% versus 46,5%; P= 0,0008). The frequencies of the combined variant genotypes TC + CC of the CYP1A1 T6235C polymorphism were similar in patients and controls (36,6% versus 33,8%; P= 0,85). In contrast, the combined genotype TC + CC in patients with tumor of larynx was lower than that observed in patients with other tumors (21,6% versus 41,9%; P= 0,03). The frequencies of the combined variant genotypes AG + GG of the CYP1A1 A4889G polymorphism were similar in patients and controls (33,8% versus 28,2%; P= 0,71) and in patients stratified by clinical features, and anatomo-pathological and biological aspects of the tumor. In sumary, the results of this study sugest that the presence of the GSTM1 genes seems to protect individuals against localized tumors, while the homozygous deletion of the GSTM1 gene seems to be associated to the agressiveness of the tumor; the variant genotypes TC + CC of the CYP1A1 T6235C polymorphism seem to protect individuals against larynx cancer; and the genotypes of the CYP1A1 A4889G polymorphism seem do not influence the risk for head and neck tumor, as well as the clinical features of the disease, and anatomo-pathological and biological aspects of the tumor in our cases / Mestrado / Patologia / Mestre em Estomatopatologia

Orientador: Carmen Silvia Passos Lima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-16T03:51:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Scherr_MarcelaCustodio_M.pdf: 1746928 bytes, checksum: 1590f1bcf4c880aa0dbd063756c2c777 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A habilidade de metabolizar xenobióticos é variável em humanos e em cães e está relacionada a genótipos distintos de genes polimórficos. Os portadores do genótipo CYP1A2 1117TT foram classificados como metabolizadores lentos de fármacos. Ainda, os alelos variantes T e C dos polimorfismos CYP1A2 C1117T e GSTA3 I71L foram descritos como menos eficazes na ativação e inativação de carcinógenos do que os selvagens, respectivamente. Assim, humanos e cães podem apresentar diferentes respostas a medicamentos e estar sob riscos distintos de ocorrência de tumores. As frequências dos genótipos dos polimorfismos CYP1A2 C1117T e GSTA3 I71L em cães de diferentes raças e sem raça definida (SRD) não foram ainda descritas. O objetivo deste estudo foi o de identificar as frequências dos genótipos em 105 cães da raça boxer, 84 cães da raça rottweiler, 110 cães da raça pastor alemão e 99 animais SRD, para verificar se ocorre distribuição distinta de genótipos em animais de diferentes grupos. O genótipos foram identificados por amplificação das regiões gênicas de interesse, em amostras de sangue periférico, por meio da reação em cadeia da polimerase seguida por sequenciamento ou digestão enzimática dos fragmentos amplificados. A frequência do genótipo homozigoto selvagem CC do polimorfismo CYP1A2 C1117T foi maior em cães de raça (96,4% versus 87,9%, P= 0,002) e boxers (98,0% versus 87,9%, P= 0,005) do que em cães SRD. Frequências genotípicas similares foram observadas em cães estratificados por aspectos clínicos. Apenas o genótipo variante CC do polimorfismo GSTA3 I71L foi identificado em nossos cães. Nossos resultados sugerem que cães de raça metabilizam fármacos e ativam carcinógenos de forma mais eficaz do que cães SRD e podem obter maior benefício medicamentoso e estar sob risco maior de tumores. Já o metabolismo de xenobióticos pela enzima GSTA3 parece similar em cães de diferentes raças e não influenciar diferentemente a resposta a medicamentos e o risco de tumores nesses animais / Abstract: The ability to metabolize xenobiotics is variable among humans and dogs, and is related to the distinct genotypes of polymorphic genes. Carriers of the CYP1A2 1117TT genotype were classified as poor metabolizers of drugs. In addition, the varying T and C alleles of CYP1A2 C1117T e GSTA3 I71L polymorphisms were described as less efficient in the activation and inactivation of carcinogens than the wild alleles, respectively. Thus, humans and dogs seem to obtain distinct benefits under drug treatments and also to be under different risks of tumours. The frequencies of genotypes of the refered genes in dogs of different breeds and mixed breed are yet not described. The objective of this study was to identify the frequencies of the genotypes in 105 boxers, 84 rottweilers, 110 german shepherds and 99 mixed breed dogs with the purpose of to verify if a distinct distribution of genotypes occurs in animals of different groups.The genotypes were evaluated by amplifying the area of interest of the genes, in peripheral blood samples, using a polymerase chain reaction followed by a sequencing or enzymatic digestion of the amplified fragments. The frequency of the homozygous wild CC genotype of the CYP1A2 C1117 polymorphism was higher in dogs of pure breed (96,4% versus 87,9%, P= 0.002) and boxers (98.0% versus 87,9%, P= 0.005) than in mixed breed dogs. Similar frequencies of the genotypes were seem in dogs stratified by clinical features. Just the CC varying genotype of the GSTA3 I71L polymorphism was identified in all dogs. The results of this study suggest that pure breed dogs might be more efficient in metabolizing drugs and in activating carcinogens than mixed breed dogs, and therefore, may obtain larger therapeutic benefits under treatment for diseases and may be under higher risk for tumors. In contrast, the metabolim of xenobiotics by the GSTA3 enzyme seems to be similar among dogs of different breeds and not to influence on a different way the drug metabolism or tumour risk in these animals / Mestrado / Biologia Estrutural, Celular, Molecular e do Desenvolvimento / Mestre em Fisiopatologia Médica

Orientador: Ronei Jesus Poppi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-17T03:08:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_WericksonFortunatodeCarvalho_D.pdf: 5817007 bytes, checksum: 4581b99bb9fbcd5d186656109eb68573 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: O estudo do fenômeno de polimorfismo em fármacos é muito importante na indústria farmacêutica. Dessa forma, tem sido extensivamente investigado, devido ao seu impacto sobre a qualidade e eficácia das formulações farmacêuticas. Neste trabalho, três novas metodologias para o controle de qualidade de polimorfismo em fármacos foram propostas. O desenvolvimento, desses métodos, visa tomar as análises de controle de qualidade na indústria farmacêutica mais prática, rápida e sem a necessidade de consumo de reagentes com alto grau de toxicidade. Na primeira metodologia foi proposta a caracterização da composição polimórfica do fármaco Piroxicam em formulações farmacêuticas utilizando cartas de controle multivariadas baseada no cálculo do sinal analítico líquido e da espectroscopia na região do infravermelho próximo. Nesse caso, foi possível a identificação da presença das diferentes formas polimórficas nas formulações farmacêuticas. Em uma segunda metodologia, no qual também foi utilizado o fármaco Piroxicam, procurou-se realizar a quantificação e a distribuição de duas formas polimórficas através da espectroscopia de imagem na região do infravermelho próximo aliado ao método quimiométrico PLS. Os resultados mostraram que para ambos os modelos desenvolvidos os valores de RMSEP (%(m/m)) estão abaixo de 4%. Também foi possível obter a informação da distribuição espacial dos diferentes polimorfos nas formulações farmacêuticas. Na última metodologia utilizou-se da espectroscopia Raman e das cartas de controle multivariadas para identificação no fármaco Carbamazepina de adulteração em excipiente, transformação de formas polimórficas por humidade e detecção de diferentes formas polimórficas. Foi possível identificar a presença e a transformação dos diferentes polimórficos presentes, além da sua correta identificação / Abstract: The study of the polymorphism phenomenon in drugs is very important in the pharmaceutical industry. Thus, it has been extensively investigated because of its impact on the pharmaceutical formulations quality and effectiveness. In this work, three new methods for quality control of polymorphism in drugs were proposed. The development of these methods, aims to make the analysis of quality control in the pharmaceutical industry more practical, faster and without the need of reagent consumptions with a high degree of toxicity. In the first method it was proposed the characterization of Piroxican polymorphic composition in pharmaceutical formulations using multivariate control charts based on the calculation of the net analytical signal and the near infrared spectroscopy. In that case, it was possible to identify the presence of different polymorphic forms of the drug in the pharmaceutical formulations. In a second method, in which it was also used Piroxicam, there was an attempt to carry out the quantification and distribution of two polymorphic forms through the near-infrared imaging spectroscopy technique and PLS chemometric method. The results showed that for both models developed the RMSEP values (% (m / m)) are below 4%. It was also possible to distinguish the information from local and global distributions of different polymorphics in pharmaceutical formulations. In the last method it was used Raman spectroscopy and multivariate control charts to identify adulteration in excipients, polymorphic forms change by humidity and the detection of different polymorphic forms in the Carbamazepine drug / Doutorado / Quimica Analitica / Doutor em Ciências

Orientador: Mario Jose Abdalla Saad / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-06T11:08:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bellinazzi_VeraRegina_M.pdf: 1059560 bytes, checksum: bdf226ffce821be677b9c8439cc32fdd (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Apesar dos mecanismos da longevidade não serem totalmente conhecidos, sabe-se que mutações em genes que reduzem a sinalização intracelular de insulina/IGF-1 são capazes de aumentar a sobrevida de animais invertebrados e mamíferos Na mosca Drosophila Melanogaster, mutações no receptor de insulina (similar ao gene do receptor de insulina humano) e no gene chico (similar ao gene do IRS-1 humano) levam ao aumento da sobrevida do animal. Em roedores, estudos sobre restrição calórica e diversas mutações tem relacionado a via de sinalização insulina/IGF-1 com longevidade. Em humanos, a sensibilidade à insulina normalmente declina com o envelhecimento, porém existem evidências que idosos longevos apresentam ação da insulina preservada e nível de IGF-1 sérico reduzido, o que sugere que a resposta à insulina tem impacto na longevidade humana. Evidências recentes que reforçam esta teoria demonstram que polimorfismos de genes da via de sinalização de insulina/IGF-1( IGF-1R e PI3K), afetam o IGF-1 sérico e a longevidade humana, sugerindo que este mecanismo esteja conservado através da evolução das espécies. Baseada nestas evidências, nosso estudo investigou a prevalência do polimorfismo mais comum do IRS-1, a substituição de glicina por arginina no códon 972 (Gly972Arg), numa amostra da população longeva brasileira, e a sua associação com diversos fenótipos e com a longevidade. Foram incluídos no estudo 94 idosos, de ambos os sexos, com idades entre 80 e 100 anos. Como grupo controle foram incluídos 194 recém-nascidos da mesma região brasileira. A freqüência genotípica encontrada nos idosos foi: Gly/GIy 80,85%, Gly/Arg 19,15%, e Arg/Arg 0%. Não foi encontrada diferença estatística entre a prevalência do polimorfismo em longevos e em neonatos brasileiros. Também não houve associação deste polimorfismo com resistência à insulina, hipertensão, diabetes, ou com alterações no IMC, circunferência da cintura, e lípides nessa população. Nossos achados indicam que não há associação do polimorfismo Gly972Arg do IRS-1 com longevidade em humanos. E possível que esta falta de relação esteja relacionada ao seu efeito neutro tanto na sensibilidade à insulina quanto no nível de IGF-1. / Abstract: Although the underlying mechanisms of longevity are not fully understood, it is known that mutations in genes that decrease the insulin/IGF-1 signal response pathway are capable of extending life span in a variety of model systems from invertebrates to mammals. In Drosophila Melanogaster, mutations of either the insulin receptor gene (similar of human insulin receptor gene) or the Chico (similar of human IRS-1 gene) led to enhanced longevity. In humans, insulin sensitivity normally declines during aging. Although there are evidences that long-lived subjects have decreased plasma IGF-1 levels and preserved insulin action, thus indicating that insulin responsiveness impacts on human longevity. Recent findings also provide novel and intriguing indications for the involvement of insulin and IGF-1 in the control of aging and longevity in humans. In particular, it has been demonstrated that polymorphic variants of IGF-1 receptor (IGF-IR) and phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) genes affect IGF-1 plasma levels and human longevity, indicating that the impact of these genes on species longevity is an evolutionary conserved property. On the basis of the above-mentioned literature, we investigate the prevalence of a most common IRS-1 variant, a Gly --> Arg substitution at codon 972 (GIy972Arg) in a population-based sample of Brazilian elderly, its association with phenotypes and longevity. Ninety-four Brazilian subjects (men and women), from 80-100 yr. of age, volunteered for this study. As a control population we studied 194 newborn children from our University Hospital. Genotype frequencies were Gly/Gly 80,85%, Gly/Arg 19,15%, and Arg/Arg 0%, which are in Hardy-Weinberg equilibrium In addition, no significant differences among allele and genotype distribution were found between Brazilian elderly and Brazilian newborns Also, the Arg variant was not associated with insulin resistance, hypertension, diabetes, detrimental values for body mass index, waist circumference, and lipids in the Brazilian elderly. Our findings indicate that the IRS-1 Gly972Arg variant is not related with longevity. It is possible that the lack of this association might be related to its neutral effect on insulin sensitivity and on IGF-1 levels. / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica

Orientadores: Carmen Silvia Passos Lima, Claudio Saddy Rodrigues Coy / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-12T04:46:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Angelo_SandroNunes_M.pdf: 2804773 bytes, checksum: b88b1fbf49effea5eae1bf248bc95389 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A exposição das células do cólon e do reto a substâncias carcinogênicas está associada ao consumo de alimentos que constituam fonte de substratos, como aminas aromáticas e hidrocarbonetos aromáticos policiclícos. Enzimas como a mono-oxigenase do citocromo P450, codificada pelo gene CYP1A1 e a N-acetiltransferase, codificada pelo gene NAT1, estão relacionadas com o metabolismo dessas substâncias. Os polimorfismos T6235C e A4889G, do gene CYP1A1, e o haplótipo NAT1*10, do gene NAT1, foram associados ao risco do câncer colorretal (CC) em indivíduos do hemisfério norte. Não há descrições sobre as influências desses polimorfismos no risco do CC em nossa população, sendo este o objetivo do estudo. O DNA de 254 pacientes com adenocarcinoma colorretal esporádico (ACE) e 255 controles foi analisado por meio da reação em cadeia da polimerase e digestão enzimática. Foi avaliado também, o padrão dietético de pacientes e controles por meio do recordatório de freqüência alimentar. Houve risco maior de ocorrência do ACE em indivíduos com os genótipos variantes dos polimorfismos T6235C e A4889G do gene CYP1A1 e com consumo excessivo de carnes. A frequência do haplótipo NAT1*10 foi maior em pacientes do que em controles, havendo risco maior de ocorrência do ACE nesses indivíduos. Maior risco de ocorrência da doença foi também observado em indivíduos com os haplótipos NAT1*10 do gene NAT1 e consumo excessivo de carnes e escasso de verduras e frutas. Os resultados deste estudo sugerem que as vias herdadas do metabolismo de carcinógenos, CYP1A1 e NAT1, associadas ao padrão da dieta influenciam o risco de ocorrência do ACE em nosso meio. / Abstract: The exposure of the cells of the colon and rectum to carcinogenic substances is associated with the consumption of foods that are source of substrates, such as aromatic amines and polycyclic aromatic hydrocarbons. Enzymes such as cytochrome P450 monooxygenase, encoded by the CYP1A1 gene, and acetyltransferase, encoded by the NAT1 gene, are related to the metabolism of these substances. T6235C and A4889G polymorphisms, of the CYP1A1 gene, and NAT1*10 haplotype of the gene NAT1 were associated with incidence of colorectal cancer (CC). There are no descriptions about the influences of these polymorphisms on the risk for the CC in our population, which is the objective of the study. DNA from 254 sporadic colorectal adenocarcinoma (SCA) patients and 255 controls were analysed by polymerase chain reaction and restriction digestion. It was also assessed the dietary pattern pacients and controls through the recall of food frequency. There was a greater risk of the occurrence of SCA in individuals with the variant genotypes of the T6235C and A4889G polymorphisms, of the CYP1A1 gene, associated with high consumption of meat. The frequency of the NAT1*10 haplotype was greater in pacients than in controls, with increased risk of occurrence of SCA these individuals. Increased risk of occurrence of the disease was also observed in individuals with NAT1*10 haplotype of the gene NAT1 and excessive consumption of meat and little vegetables and fruits. The results of the study suggest that the pathaway inherited from the metabolism of carcinogens, CYP1A1 and NAT1, associated with the pattern of diet influences the risk of occurrence of SCA in our country. / Mestrado / Cirurgia / Mestre em Cirurgia