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Les routes d’invasion du criocère du lis (Lilioceris lilii) en Amérique du Nord

Dieni, Alessandro 11 1900 (has links)
Le criocère du lis, Lilioceris lilii (Coleoptera : Chrysomelidae), un ravageur de lis et de fritillaires d’origine eurasienne, a été observé pour la première fois en Amérique du Nord en 1943 sur l’Ile de Montréal au Canada. Après y avoir été confiné pendant environ 25 années, ce coléoptère a par la suite progressé rapidement sur le territoire nord-américain. Actuellement, on l’observe dans huit provinces canadiennes et huit états américains. Cette étude a investigué les routes d’invasion utilisées par le criocère du lis au Canada et aux États- Unis avec l’aide de marqueurs génétiques AFLP. Pour ce faire, 516 individus parmi 34 sites en Amérique du Nord et en Europe ont été échantillonnés et analysés. Le premier objectif était de déterminer, en analysant la structure génétique des populations nord-américains, s’il y avait eu une ou plusieurs introductions en provenance d’Europe. Le deuxième objectif était d’identifier l’origine de la ou des populations introduites en Amérique du Nord. Finalement, le troisième objectif consistait à proposer un scénario d’invasion de L. lilii en Amérique du Nord basé sur les données de première mention et de structure génétique des populations échantillonnées. Les résultats démontrent une signature génétique distincte entre les criocères du lis du Canada et ceux des États-Unis, suggérant ainsi deux sources d’introductions indépendantes en Amérique du Nord, soit une première introduction à Montréal, Québec, dans les années 1940 et une seconde aux États-Unis au début des années 1990 à Cambridge, Massachusetts. De plus, les deux populations nord-américaines semblent provenir de différentes régions du nord de l’Europe, ce qui est conséquent avec le scénario suggérant deux sources d’introductions indépendantes. Chacune des populations aurait par la suite progressé respectivement dans leur pays d’introduction selon une dispersion de type stratifiée. En effet, la progression continue de L. lilii dans certaines régions suggère une dispersion naturelle de l’espèce sur le territoire nord-américain, alors que la progression rapide sur de longues distances semble être causée par le transport anthropique de lis contaminés. / The lily leaf beetle, Lilioceris lilii (Coleoptera : Chrysomelidae), a Eurasian pest of lilies and fritillaries, was first observed in North America in 1943 on the Island of Montréal, Canada. After being confined to Montréal for approximately 25 years, the beetle quickly progressed in North America, and is currently present in eight Canadian provinces and eight American states. During this study, we have investigated the routes of invasion followed by L. lilii in North America, using AFLP markers. We sampled and analysed 516 individuals from 34 sites across North America and Europe. Our first objective was to characterize the genetic structure of North American L. lilii populations to determine if they originated from a single or form multiple introductions from Europe. The second objective was to identify the geographical origin of the invasive population(s). Finally, the third objective was to trace back the geographical routes of invasion of L. lilii in North America, using information from both the dates of first observations and the genetic structure of sampled populations. Our results showed clear genetic difference between individuals from Canada and the USA, suggesting at least two different sources of introductions of L. lilii in North America. A first episode of introduction took place in Montréal, Canada in the 1940’s while a second introduction occurred in Cambridge, Massachusetts, around 1990. Also, both North American populations seem to originate from different populations in northern Europe, which support the hypothesis of two distinct sources of introduction. Each population next progressed in its respective country following a stratified dispersal. Indeed, continuous progression of the beetle in some regions of North America suggests a pattern of natural dispersion, while human-mediated carrying of infected lilies seemed to be responsible for the long-range movement of the beetle.
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Télédétection et épidémiologie en zone urbaine : de l'extraction de bâtiments à partir d'images satellite à très haute résolution à l'estimation de taux d'incidence / Remote sensing and epidemiology in urban zone : from extraction of buildings from very high resolution satellite images to the estimation of incidence rates

Upegui Cardona, Erika 08 October 2012 (has links)
En épidémiologie, une connaissance précise des populations à risque constitue un pré requis aucalcul d'indicateurs de l’état de santé d’une communauté (taux d'incidence). Néanmoins, les effectifsde population peuvent être indisponibles, ou peu fiables, ou insuffisamment détaillés pour un usageépidémiologique.L'objectif principal de ce travail est d'obtenir des taux d'incidence en l'absence de donnéesdémographiques, à une échelle spatiale infra-communale. Les objectifs secondaires sont d'estimerles populations humaines par l'intermédiaire de données satellitaires à très haute résolution spatiale(THRS), d'évaluer l'apport de ces données THRS par rapport aux données à haute résolution spatiale(Landsat) dans un même cadre urbain (Besançon), et de mettre au point une méthodologie simple etrobuste, pour garantir son exportabilité à d'autres zones.Nous proposons une approche en trois étapes, fondée sur la corrélation existant entre la densité depopulation et la morphologie urbaine. La première étape consiste à extraire des bâtiments à partirdes données télédétection THRS. Ces bâtiments sont utilisés dans la deuxième étape pour modéliserla population. A leur tour, ces populations servent de dénominateur, lors de la dernière étape, pourcalculer des taux d’incidence (cancers). Des données de référence sont utilisées à chaque étape pourévaluer les performances de notre méthodologie.Les résultats obtenus soulignent le potentiel de la télédétection pour mesurer l'état de santé d'unecommunauté (sous la forme de taux bruts d’incidence) à une échelle géographique fine. Ces tauxd'incidence estimés peuvent alors constituer des éléments de décision pour mieux adapter l'offre desoins aux besoin de santé, même en l'absence de données démographiques / In epidemiology, a precise knowledge of populations at risk is a prerequisite for calculating state ofhealth indicators of a community (incidence rates). The population data, however, may beunavailable, unreliable, or insufficiently detailed for epidemiological use.The main objective of this research is to estimate incidence rates, in cases of absence of demographicdata, at an infra-communal scale. The secondary objectives are to estimate the human populationthrough satellite data at very high spatial resolution (VHSR), to assess the contribution of this data(VHSR) compared with high spatial resolution data (Landsat) in a same urban framework (Besançon),and to develop a simple and robust methodology to ensure its exportability to other areas.We proposed a three-step approach based on the correlation between population density and urbanmorphology. The first step is to extract buildings from VHSR imagery data. These buildings are thenused in the second step to model the population data. Finally, this population data is used as thedenominator to calculate incidence rates (cancers). Reference data are used at each step to assessthe performance of our methodology.The results obtained highlight the potential of remote sensing to measure the state of health of acommunity (in the form of crude incidence rates) at a fine geographical scale. These estimatedincidence rates can be utilized as elements of decision to adapt better customized healthcare withrespect to the health needs of a given community, even in the absence of demographic data

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