Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-05-14T13:56:49Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leciane Karita de Oliveira - 2009.pdf: 1349505 bytes, checksum: a58f21b0ca785ff9609cecb95a16791d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-05-14T13:59:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leciane Karita de Oliveira - 2009.pdf: 1349505 bytes, checksum: a58f21b0ca785ff9609cecb95a16791d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-14T13:59:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leciane Karita de Oliveira - 2009.pdf: 1349505 bytes, checksum: a58f21b0ca785ff9609cecb95a16791d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2009-06-22 / The synthesis of starch involves the interaction a complex cascade of genes. Alterations in these genes can change the final composition of starch and alter the quality of the rice grain after cooking. The quality of grain is influenced by the physico-chemical properties of starch. Through the associative mapping is possible to identify genes related to a quantitative trait and, therefore, using molecular markers of this gene as tools for assisted selection in breeding programs using access genebanks.This work had as objective identify and validate the association between amylose content (TA) and gelatinization temperature (TG) with molecular markers microsatellites and SNP of genes involved in starch metabolic route.Were used 242 accessions of rice core collection of Embrapa Arroz e Feijão, separated according to cropping system upland and lowland.The accessions were also classified for TA, based on the analysis conducted in 2004 and 2005, and TG analysis in 2007. The genetic analyzes were conducted using 36 molecular markers, 7 are those described in the literature, three microsatellite (SSR), 1 Sequence Tagged Sites (STS), 2 cleaved amplified polymorphic Sequence (CAPS) and the set of pairs of F7-F22-R1-R21 primers. The other markers were developed for this work in the Biotechnology laboratory of the Embrapa Arroz e Feijão, 6 markers are based on SSR and 26 SNP.For SSR markers were identified 70 alleles, with an average of 8.75 alleles per locus. The genetic diversity (He) was higher for access to lowland (0.72) compared to accesses with upland, that had a mean of 0.55. Found SNP/Indel 10 markers when the mini core collection was sequenced. The nucleotide diversity was low, with an average of 0.0054. CA-2 marker gene which expresses the enzyme glucose-6-phosphate isomerase, showed the greatest number of polymorphisms, with 9 SNP/Indel. Based on the genetic similarity dendrogram constructed with data from the SSR loci,was found genetic difference in the cropping system and the TA. Nine markers were significantly associated (p <0.05) with one of the characteristics. These six markers were associated with TA. The marker W2R, the waxy gene, was the one that best explained the variation of TA (82%). Eight markers were associated with TG. The F7-F22-R1-R21 together best explained the variation (66%).The factorial correspondence analysis has shown that the set of SSR loci literature together coms developed for this work are efficient in allocating access between TA classes. This work allowed the identification of not random associations between loci and starch characteristics of economic interest. Validating markers described in the literature and new markers, opening new prospects for the use of these markers in the early selection for TA and TG in rice. / A síntese do amido envolve vários genes que interagem em cascata. Mutações nestes genes interferem na composição final de amido e consequentemente na composição e qualidade do grão de arroz,pelo fato da composição físico-química do amido ter grande influência nas propriedades do grão. Por meio do mapeamento associativo é possível identificargenes relacionados às características quantitativas e, com isso,utilizar marcadores moleculares destes genes como ferramenta para seleção assistida em programas de melhoramento, que utilizam como base bancos de germoplasma. Este trabalho teve como principal objetivo identificar e validar a associaçăo entre o teor de amilose (TA) e temperatura de gelatinização (TG) com marcadores moleculares microssatélites e SNP de genes envolvidos na rota metabólica do amido. No desenvolvimento do trabalho foram utilizados 242 acessos da coleçăo nuclear de arroz da Embrapa Arroz e Feijão, que estão classificados de acordo com sistema de cultivo sequeiro e irrigado. Os acessos também foram classificados quanto ao TA, de acordo com análise realizada em 2004 e 2005, e à TG,avaliada neste trabalho. Foi construída uma mini coleção com 24 acessos contrastando quanto ao sistema de cultivo e ao TA. Como resultado, foi observado que a maior parte dos 242 acessos possuem TG intermediária, entre 69ºC e 73ºC. Para a análise genética foram utilizados36 marcadores moleculares, destes7estão descritos na literatura, sendo três microssatélite (SSR), 1Sequence Tagged Sites (STS),2Cleaved Amplified Polymorphic Sequence (CAPS) e o conjunto de pares de primers F7-F22-R1-R21.Os outros marcadores foram desenvolvidospara este trabalho no laboratório de biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, sendoque 6 marcadores sãobaseados em SSR e 26 em SNP. Para o conjunto de marcadores SSR foram identificados 70 alelos, com média de 8,75 alelos por loco.A diversidade genética (He)foi maior para os acessos com sistema de cultivo irrigado (0,72) quando comparado aos acessos com sistema de cultivo sequeiro que tiveram média igual a 0,55. Foram encontrados SNP/Indel em 10 marcadores quando a minicoleção nuclear foi sequenciada.A diversidade nucleotídica foi baixa, com valor médio de 0,0054. O marcador CA-2, do gene que expressa a enzima Glucose-6-phosphate isomerase, apresentou o maior número de polimorfismos, com total de 9 SNP/Indel.Com base no dendrograma de similaridade genética, construído com os dados dos locos SSR, foi posssível diferenciar os acessos quanto ao sistema de cultivo e ao TA.Nove marcadores apresentaram associaçăo significativa (p <0,05) comuma das característicasavaliadas, sendo que seismarcadores foram associados com oTA. O marcador W2R, do gene waxy, foi o que mais explicou a variação de TA (82%). Para TG foiencontrada associação com 8 marcadores, sendo que o conjuntoF7-F22-R1-R21 explicou melhor a variação (66%). A análise fatorial de correspondęncia demostrou que o conjunto de locos SSRda literatura em conjunto coms desenvolvidos para este trabalho são eficientes em discriminar os acessos entre as classes deTA. Este trabalho possibilitou a identificaçãode associaçőes năo aleatórias entre locosecaracterísticas do amido de interesse econômico.Validando marcadores descritos na literatura e marcadores nunca testados,abrindo novas perspectivas quanto ao uso desses marcadores na seleçăo precoce para TA e TGem arroz.

O amendoim é a quarta oleaginosa mais cultivada no mundo. Sua importância está relacionada à diversidade de usos de seus grãos, sendo este rico em óleo, calorias, proteínas e vitaminas. Já é sabido que, com o uso da irrigação, pode-se duplicar seu rendimento. Porém, a técnica da irrigação deve buscar atingir a máxima produtividade com o menor consumo de água. O objetivo deste trabalho foi o de avaliar o efeito de diferentes lâminas de irrigação e épocas de colheita sobre o crescimento e a produção de grãos da cultivar de amendoim Runner IAC 886, em dois ciclos de cultivo. O experimento foi instalado sob um delineamento experimental em blocos aleatorizados, usando o esquema fatorial 4 x 2 x 2, uma vez que foi possível a realização da análise conjunta dos ciclos, para todas as variáveis resposta avaliadas. Os tratamentos foram compostos por quatro frações da lâmina de irrigação necessária para elevar a umidade do solo próximo da capacidade de campo (L1 = 50%, L2 = 75%, L3 = 100% e L4 = 125%), duas épocas de colheita (EC1 = 118 dias após a emergência, EC2 = 140 dias após a emergência), e dois ciclos de cultivo (C1 = cultivo entre 23 de janeiro a 24 de junho de 2015, C2 = cultivo entre 02 de setembro a 09 de janeiro de 2016). A unidade experimental foi constituída por uma caixa contendo 5 mudas de amendoim, espaçadas a 8 cm. O sistema de irrigação utilizado foi por gotejamento e o manejo foi realizado com base em dados de umidade do solo obtidos a partir de leituras de tensiômetros. As lâminas de irrigação influenciaram todas as variáveis de crescimento e de produção, encontrando-se na lâmina de 125% os maiores valores. O fator época de colheita teve efeito significativo sobre a massa seca da parte aérea e a produtividade de grãos, sendo que a época de colheita 2 teve os maiores valores de massa seca da parte aérea (70,05 g) e de produtividade de grãos (5.578,97 kg ha-1). O fator ciclo promoveu efeito em todas as variáveis de crescimento, produção e qualidade do grão, dos quais, no ciclo 1, se observou os maiores valores para as variáveis de produção e qualidade de grão, e no ciclo 2 se verificou os maiores valores para as variáveis de crescimento. / The peanut is the fourth oleaginous most cultivated in the world. Its importance is associated to the diversity of use of its kernels, which are rich in oil, calories, proteins and vitamins. It is already known that using irrigation is possible to double its yield. However, the technique of irrigation must reach the maximum productivity with the least water consumption. The objective of this work was to evaluate the effects of different irrigation dephts and harvest dates on growth and kernel production of the peanut cultivar Runner IAC 886 in two cultivation cycles. The experiment was conducted under randomized blocks experimental design, in factorial scheme 4 x 2 x 2, since it was possible to perform the joint analysis of cycles, for all characteristics evaluated. The treatments were consisting of four fractions of irrigation depths needed to raise the humidity from the soil to field capacity (L1 = 50%, L2 = 75%, L3 = 100% e L4 = 125%), two harvest dates (EC1 = 118 days after emergence, EC2 = 140 days after emergence), and two cultivation cycles (C1= from January 23 to June 24, 2015; C2= from September 02, 2015 to January 09, 2016). The experimental unit was constituted by a box containing 5 peanut seedlings, spaced by 8 cm. The irrigation system used was dripping and the irrigation management was carried out based on tensiometer readings. The irrigation dephts have influenced all variables of growth and production, being that in the irrigation depht of 125% the highest values were found. The factor harvest date had significant effect on shoots dry weight and kernels productivity of peanut, in which the harvest date 2 showed the highest values of shoot dry weight (70.05 g) and peanut productivity (5,578.97 kg ha-1). The factor cycle affected all variables of growth, yield and kernel quality, which in the cycle 1 was observed the highest values for the variables of production and kernel quality, and in the cycle 2 the highest values for the variables of growth.

O amendoim é a quarta oleaginosa mais cultivada no mundo. Sua importância está relacionada à diversidade de usos de seus grãos, sendo este rico em óleo, calorias, proteínas e vitaminas. Já é sabido que, com o uso da irrigação, pode-se duplicar seu rendimento. Porém, a técnica da irrigação deve buscar atingir a máxima produtividade com o menor consumo de água. O objetivo deste trabalho foi o de avaliar o efeito de diferentes lâminas de irrigação e épocas de colheita sobre o crescimento e a produção de grãos da cultivar de amendoim Runner IAC 886, em dois ciclos de cultivo. O experimento foi instalado sob um delineamento experimental em blocos aleatorizados, usando o esquema fatorial 4 x 2 x 2, uma vez que foi possível a realização da análise conjunta dos ciclos, para todas as variáveis resposta avaliadas. Os tratamentos foram compostos por quatro frações da lâmina de irrigação necessária para elevar a umidade do solo próximo da capacidade de campo (L1 = 50%, L2 = 75%, L3 = 100% e L4 = 125%), duas épocas de colheita (EC1 = 118 dias após a emergência, EC2 = 140 dias após a emergência), e dois ciclos de cultivo (C1 = cultivo entre 23 de janeiro a 24 de junho de 2015, C2 = cultivo entre 02 de setembro a 09 de janeiro de 2016). A unidade experimental foi constituída por uma caixa contendo 5 mudas de amendoim, espaçadas a 8 cm. O sistema de irrigação utilizado foi por gotejamento e o manejo foi realizado com base em dados de umidade do solo obtidos a partir de leituras de tensiômetros. As lâminas de irrigação influenciaram todas as variáveis de crescimento e de produção, encontrando-se na lâmina de 125% os maiores valores. O fator época de colheita teve efeito significativo sobre a massa seca da parte aérea e a produtividade de grãos, sendo que a época de colheita 2 teve os maiores valores de massa seca da parte aérea (70,05 g) e de produtividade de grãos (5.578,97 kg ha-1). O fator ciclo promoveu efeito em todas as variáveis de crescimento, produção e qualidade do grão, dos quais, no ciclo 1, se observou os maiores valores para as variáveis de produção e qualidade de grão, e no ciclo 2 se verificou os maiores valores para as variáveis de crescimento. / The peanut is the fourth oleaginous most cultivated in the world. Its importance is associated to the diversity of use of its kernels, which are rich in oil, calories, proteins and vitamins. It is already known that using irrigation is possible to double its yield. However, the technique of irrigation must reach the maximum productivity with the least water consumption. The objective of this work was to evaluate the effects of different irrigation dephts and harvest dates on growth and kernel production of the peanut cultivar Runner IAC 886 in two cultivation cycles. The experiment was conducted under randomized blocks experimental design, in factorial scheme 4 x 2 x 2, since it was possible to perform the joint analysis of cycles, for all characteristics evaluated. The treatments were consisting of four fractions of irrigation depths needed to raise the humidity from the soil to field capacity (L1 = 50%, L2 = 75%, L3 = 100% e L4 = 125%), two harvest dates (EC1 = 118 days after emergence, EC2 = 140 days after emergence), and two cultivation cycles (C1= from January 23 to June 24, 2015; C2= from September 02, 2015 to January 09, 2016). The experimental unit was constituted by a box containing 5 peanut seedlings, spaced by 8 cm. The irrigation system used was dripping and the irrigation management was carried out based on tensiometer readings. The irrigation dephts have influenced all variables of growth and production, being that in the irrigation depht of 125% the highest values were found. The factor harvest date had significant effect on shoots dry weight and kernels productivity of peanut, in which the harvest date 2 showed the highest values of shoot dry weight (70.05 g) and peanut productivity (5,578.97 kg ha-1). The factor cycle affected all variables of growth, yield and kernel quality, which in the cycle 1 was observed the highest values for the variables of production and kernel quality, and in the cycle 2 the highest values for the variables of growth.