Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-01-25T15:47:23Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-01-25T15:47:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-25T15:47:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2016-12-07 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Turtles are freshwater turtles belonging to the Pleurodira suborder, are included in the family Chelidae that at present is represented by 56 species. The genus Phrynops endemic to South America has four nominal species: Phrynops geoffroanus, P. hilarii, P. tuberosus and P. williamsi, the first species has the largest geographical distribution among all representatives of the family Chelidae. It is distributed from the south of Venezuela to the north of Argentina. Considering its wide geographical distribution, several authors have indicated the possible existence of a complex of species that will be divided into distinct entities. The only reappraisal of the genus Phrynops occurred in the early 2000s. Between 2010 and 2015, 223 specimens from all regions of Brazil, north, north-east, central-west, southeast and south were collected covering much of their geographic distribution currently known. The samples were collected using a variety of collecting methods such as "hoop traps" traps, trammel nets, hooks, and sanders. Morphometric and molecular data (mitochondrial genes, nuclear - genomic data) have been important tools to help delineate distinct evolutionary lineages and their respective geographical distribution boundaries. Using mtDNA sequencing of the 16S, Cytochrome b and Cytochrome oxidase I genes with the aim of studying and revealing the genetic diversity patterns of P. geoffroanus to test the existence of cryptic diversity. Through genetic analysis using concatenated data of the mitochondrial genes it was possible to observe the distinction of four lineages. Morphological data also helped to distinguish clusters formed by the morphometric forms of the specimens studied. We suggest the existence of cryptic diversity in P. geoffroanus that may possibly be fractionated in other taxonomic entities. / Os cágados são quelônios de água doce pertencentes a subordem Pleurodira, estão incluídos na família Chelidae que atualmente está representada por 56 espécies. O gênero Phrynops endêmico da América do Sul possui quatro espécies nominais: Phrynops geoffroanus, P. hilarii, P. tuberosus e P. williamsi, a primeira espécie apresenta a maior distribuição geográfica entre todos os representantes da família Chelidae. Distribuindo-se desde o sul da Venezuela ao norte da Argentina. Considerando sua ampla distribuição geográfica diversos autores tem indicado a possível existência de um complexo de espécies que será fracionado em entidades distintas. A única reavaliação do gênero Phrynops ocorreu no início dos anos 2000. Entre os anos de 2010 e 2015 foi coletado 223 espécimes provenientes de todas as regiões do Brasil, norte, nordeste, centro-oeste, sudeste e sul abrangendo grande parte de sua distribuição geográfica atualmente conhecida. As coletas foram realizadas utilizando diversos métodos de coleta como armadilhas do tipo covo “hoop traps”, malhadeiras “trammel nets”, anzóis (esperas) e malhadeiras. Dados morfométricos e moleculares (genes mitocondriais, nucleares – dados genômicos) tem sido ferramentas importantes para auxiliar na delimitação de linhagens evolutivas distintas e os seus respectivos limites de distribuição geográfica. Utilizando sequenciamento do mtDNA dos genes 16S, Citocromo b e Citocromo oxidase I com o intuito de estudar e revelar os padrões de diversidade genética de P. geoffroanus para testar a existência de diversidade críptica. Através de análises genética utilizando dados concatenados dos genes mitocondriais foi possível observar a distinção de cinco linhagens. Dados morfológicos também auxiliaram na distinção de agrupamentos formados pelas formas morfométricas dos espécimes estudados. Sugerimos a existência de diversidade críptica em P. geoffroanus que possivelmente venha ser fracionado em outras entidades taxonômicas.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-08-25T13:36:33Z No. of bitstreams: 2 Tese_Camila_Fagundes_BADPI_INPA.pdf: 4530397 bytes, checksum: a7e7bdedfb0ee6c9dc2382cc56bdb3f4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-25T13:36:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Camila_Fagundes_BADPI_INPA.pdf: 4530397 bytes, checksum: a7e7bdedfb0ee6c9dc2382cc56bdb3f4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-06-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study aimed to evaluate some threats to freshwater turtles in Brazilian Amazon in order to propose strategies and priority areas to their conservation. In the first chapter, we used chelonian distribution data to generate species distribution model (SDM) that predict suitable areas for the occurrence of the group and to evaluate if turtles are protected by the current reserve networks (Gap Analysis). We identified only one gap species, Mesoclemmys nasuta. Other chelonian species had at least a portion of their distribution range included in protected areas. Considering Integral protected Areas (IPA), only Rhinoclemmys punctularia and Kinosternon scorpioides are protected. The insertion of Sustainable Use Areas (SUA) and Indigenous Territories Areas (ITA) was crucial to consider protected most of turtles. Chelonians may be overharvested in non-integral protected areas due their importance as a food resource. It is necessary to restructure the protected areas in Amazon in order to contemplate river catchment sites. In the second chapter we evaluated the exposition of the freshwater turtles to deforestation. We also identified priority areas to the group conservation based on the habitat requirements of the species, deforestation and the network of protected areas. The priority areas to freshwater chelonian conservation are located in northern Amazon and they do not encompass high deforestation areas. However, higher vulnerability of turtle richness to deforestation is located in central-northeastern Amazon, where the deforestation is currently progressing. Phrynops geoffroanus, Kinosternon scorpioides and Rhinoclemmys punctularia had higher percentage of their SDMs lost due to deforestation. Protected areas included large amount of sites required by chelonian conservation but they are not located in areas with higher turtle richness. Our results highlight the regions more important to invest in conservation of freshwater turtles in Brazilian Amazon. In the third chapter, we analized if the Ecological Niche Model (ENM) of a large distributed species, Podocnemis expansa, are transferable to other parts of its geographical range. All TSS values were low, indicating that the models cannot be transferred from one Amazon area to another. On the other hand, AUC showed excellent and good values, no matter the dataset and predictor selection. The predicted area in number of pixels showed strong relationship with the TSS and AUC values using both predictor selections. Our study demonstrates the importance of capture relevant drivers of change in the requirements of the species in each region. Given the lack of transferability, the sum of the suitable areas predicted to both regions of the dataset which produced the more accurate model may be used to represent species distribution. In the fourth chapter, we determined sex ratio of P. unifilis hatchlings based on the dependency of the embryo growth rate from a time series of incubation temperatures of natural nests in central Amazonia. Our study is the first one to show that temperature influences the embryo developmental rate and sex determination in a different way. Daily mean nest temperature was related to distance to vegetation, air temperature and area. Daily thermal variance is related to daily mean nest temperature and both are responsible to sex determination. The sand beach shows high feminization pattern, but the flooding site is still an important source of male production and it seems to be crucial to the maintenance of the population viability. / Este estudo teve como objetivo avaliar ameaças relacionadas a tartarugas de água doce na Amazônia brasileira, a fim de propor estratégias e áreas prioritárias para a sua conservação. No primeiro capítulo, foram utilizados dados de distribuição de quelônios para prever áreas ambientalmente adequadas para a ocorrência do grupo (modelos de distribuição de espécies - SDM) e avaliar se as tartarugas são protegidas pela rede de reservas atuais (Gap Analysis). Identificamos apenas uma espécie-lacuna, Mesoclemmys nasuta. Outras espécies de quelônios tiveram pelo menos uma parte de sua área de distribuição incluída em áreas protegidas. Considerando Áreas de Proteção Integral (IPA), apenas Rhinoclemmys punctularia e Kinosternon scorpioides estão protegidas. A inserção de Áreas de Uso Sustentável (SUA) e Áreas de Territórios Indígenas (ITA) foram cruciais para considerar protegida a maioria das espécies. Quelônios podem ser sobreexplorados em áreas que não são protegidas integralmente. É necessário reestruturar as áreas protegidas na Amazônia, a fim de contemplar locais de captação dos rios. No segundo capítulo foi avaliada a exposição das tartarugas de água doce ao desmatamento. Nós também identificamos áreas prioritárias para a conservação do grupo com base nas exigências do habitat das espécies, o desmatamento e a rede de áreas protegidas atuais. As áreas prioritárias para conservação estão localizadas no norte do Amazonas e elas não abrangem áreas de grande desmatamento. No entanto, o maoir número de espécies afetadadas pelo desmatamento está no centro-nordeste da Amazônia, onde o desmatamento está progredindo. Phrynops geoffroanus, Kinosternon scorpioides e Rhinoclemmys punctularia apresentaram maior porcentagem de SDMs perdidos devido ao desmatamento. As reservas incluíram grande quantidade de área exigida na conservação de quelônios, mas elas não estão localizadas em áreas de maior riqueza. Nossos resultados destacam as regiões mais importantes para investir na conservação das tartarugas de água doce na Amazônia brasileira. No terceiro capítulo, nós analisamos se os Modelos de Nicho Ecológico (ENM) de uma espécie amplamente distribuída, Podocnemis expansa, são transferíveis para outras partes de seu range geográfico. Todos os valores de TSS foram baixos, indicando que os modelos não podem ser transferidos de uma área da Amazônia para outra. Por outro lado, a AUC apresentaram excelentes e bons valores, não importa o conjunto de dados e a seleção de preditores. A área predita para a ocorrência da espécie em número de pixels mostrou forte relação com os valores de AUC e TSS. Nosso estudo demonstra a importância de capturar mudanças relevantes nas necessidades da espécie em cada região. Devido à falta de transferência, a soma das áreas adequadas prevista para ambas as regiões do conjunto de dados que produziram modelos mais acurados podem ser utilizados para representar a distribuição das espécies. No quarto capítulo, determinamos a razão sexual de filhotes de P. unifilis baseado na dependência da taxa de crescimento do embrião a partir de uma série histórica de temperaturas de incubação de ninhos naturais na Amazônia central. O nosso estudo é a primeiro a mostrar que a temperatura influencia a taxa de desenvolvimento do embrião e a determinação do sexo de um modo diferente. Temperatura média diária do ninho foi relacionada com a distância dele até a vegetação, temperatura do ar e da área. Variação termal diária está relacionada com a temperatura diária do ninho e ambas são responsáveis pela determinação do sexo. A praia de areia mostra alto padrão de feminização, mas a praia de Várzea ainda é um importante local de produção do sexo masculino e parece ser crucial para a manutenção da viabilidade populacional.

Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-10-20T18:26:20Z No. of bitstreams: 1 PaulaSantiago.pdf: 844129 bytes, checksum: 5b509223cd3020daff0d62412d2fcae6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-20T18:26:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PaulaSantiago.pdf: 844129 bytes, checksum: 5b509223cd3020daff0d62412d2fcae6 (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão / Knowledge of the diet and histology of language is potentially important for clarify the alimentary composition, the arrangement and the cellular morphology, facilitating the understanding of animal biology. In this way, this research aims to to analyze Mesoclemmys' diet, food strategy and morphohistology tuberculata. The collections were carried out on the Island of São Cosme in the Little Lençóis Maranhenses, municipality of Paulino Neves. For capture of the animals was used traps of the type "Fyke nets", active search, trawl and covo. The contents were collected by means of stomach lavage in the period from April 2014 to May. The stomach contents were observed under a microscope stereoscopic; the prey were identified and classified into categories and the volumes. The importance of the different items was quantified through the Food Importance (IIA). Similarity in the diet between the sexes was evaluated through Simplified Morisita index and the food strategy through the Costello Diagram. For morphological analysis of the tongue, samples of the tongue of four species of the species Mesoclemmys tuberculata that were euthanized, these were fixed in 10% formalin and included in paraffin by standard histological technique. The species Mesoclemmys tuberculata has a diet based on animal and benthic items with dominance of Nymph of Odonata (Fo% -49%, Vo% - 45,8%, IIA-0,69) and Mollusk (I% -38% and Vo% -18.5%, IIA -0.21), niche overlap between males and females females, there are no dietary differences between classes of sizes and presents diet specialist with high inter-phenotype component. Histology confirmed the diet data found. The tongue of Mesoclemmys tuberculata histologically is a tongue small with non-keratinized cubic stratified epithelial tissue with few papillae, typical of aquatic carnivorous animals that feed through suction. / O conhecimento da dieta e da histologia da língua é potencialmente importante para esclarecer a composição alimentar, o arranjo e a morfologia celular, facilitando o entendimento da biologia do animal. Desta forma, esta pesquisa tem como objetivo analisar a dieta, estratégia alimentar e morfohistologia da língua de Mesoclemmys tuberculata. As coletas foram realizadas na Ilha de São Cosme nos Pequenos Lençóis Maranhenses, município de Paulino Neves. Para captura dos animais utilizou-se armadilhas do tipo “Fyke nets”, busca ativa, rede de arrasto e covo. Os conteúdos estomacais foram coletados por meio de lavagem estomacal no período de abril de 2014 a maio de 2015. Os conteúdos estomacais foram observados sob microscópio estereoscópico; as presas foram identificadas e classificados em categorias e aferidos os volumes. A importância dos diferentes itens foi quantificado por meio do Índice de Importância Alimentar(IIA). Similaridade na dieta entre os sexos foi avaliada através do índice de Morisita simplificado e a estratégia alimentar através do Diagrama de Costello. Para análise da morfohistológica da língua foram utilizadas amostras da língua de quatro quelônios da espécie Mesoclemmys tuberculata que foram eutanasiadas, estas foram fixados em formol 10% e incluídos em parafina por técnica histológica padrão. A espécie Mesoclemmys tuberculata tem uma dieta baseada em itens de origem animal e bentônicos com dominância de Ninfa de Odonata (Fo%-49%;Vo%- 45,8%;IIA-0,69) e Molusco Gastrópode (Fo%-38% e Vo%- 18,5%; IIA-0,21), sobreposição de nicho entre machos e fêmeas, não há diferenças de dieta entre classes de tamanhos e apresenta dieta especialista com alto componente inter-fenótipo. A histologia confirmou os dados de dieta encontrados. A língua da Mesoclemmys tuberculata histologicamente é uma língua pequena com tecido epitelial estratificado cúbico não queratinizado com poucas papilas, típica de animais aquáticos carnívoros que se alimentam através de sucção.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-06T12:21:29Z No. of bitstreams: 1 LAIS_MACIEL_DEFINITIVA.pdf: 1974765 bytes, checksum: 23075ca75fe8a25e90c1bb20010c28e8 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-26T18:18:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 LAIS_MACIEL_DEFINITIVA.pdf: 1974765 bytes, checksum: 23075ca75fe8a25e90c1bb20010c28e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-26T18:18:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LAIS_MACIEL_DEFINITIVA.pdf: 1974765 bytes, checksum: 23075ca75fe8a25e90c1bb20010c28e8 (MD5) / Os custos de uma vida aquática são susceptíveis a um fortemente influenciado da capacidade de controlar a flutuabilidade de um animal. O casco dos quelônios os torna negativamente flutuante, e por isso, a tendência destes animais compensarem a flutuabilidade através de alterações de volumes ar contido nos pulmões. A alteração do volume pulmonar é essencial ao controle da flutuabilidade, visto que volume corporal é relativamente fixo determinado por limitações da carapaça rígida. Foram estudados parâmetros respiratórios em duas espécies a T. s. elegans e P. unifilis. Mensuramos a freqüência respiratória (ƒR), freqüência dos episódios (fE), volume corrente (V T ), duração de expiração (T EXP ), duração da inspiração (T INSP ), duração de uma ventilação (T VENT ), ou seja o somatório de T EXP e T INSP , a duração do total dos movimentos respiratórios durante todo o experimento (T TOT ), a duração do período não ventilatório (T PNV ) e o consumo de oxigênio por respiração (V b O 2 ). A partir destas medições, foram calculados o consumo de oxigênio ( O 2 ), volume de oxigênio consumido por episódio ventilatório ( O 2EPS ), a taxa de ventilação total ( E ) e o volume de ar movimentado através do sistema respiratório necessário para extrair 1 ml de O 2 consumido pelo animal ( E / O 2 ). Foi observado que o tamanho de indivíduos da espécie T. s. elegans exerce um efeito significativo nos parâmetros respiratórios e que houve diferenças significativas entre as duas espécies estudadas. As manipulações na flutuabilidade não exerceram variação nos parâmetros respiratórios dos grupos T. s. elegans adulto, T. s. elegans juvenil e P. unifilis. / Salvador

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-28T18:40:02Z No. of bitstreams: 2 Tese_Jaime Leon de la Ossa Velásquez.pdf: 2167337 bytes, checksum: dfeeb0edff3b3e1a6c5ab6d9ec573743 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-28T18:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Jaime Leon de la Ossa Velásquez.pdf: 2167337 bytes, checksum: dfeeb0edff3b3e1a6c5ab6d9ec573743 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2007-09-18 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The present thesis analyses and discusses aspects related to ecology and conservation of Peltocephalus dumerilianus (Testudines Podocnemididae), within a geographic area that includes a representative zone of the Muncipality of Barcelos, Amazonas, Brazil. The localities of biological and ecological information collected includes two tributaries of the medium Rio Negro: Itú and Cuimicurí rivers; Human use of the species was studied in the communities of São Louis, Baturité, Daracuá and Tomar. The nutritional components of the diet during a annual cycle were analyzed, from the digestive tract contents of individuals captured for consumption by the people inhabitanting the study area. This species was found to be an opportunistic omnivore. Data are also presented on the female reproductive cycle: annual ovarian cycle, egg laying in nature, induced ovoposition, and laboratory incubation reaffirming sex thermo-dependence in this species. Morphometric and mark and recapture data of the turtles captured during a two year continuous study was used to study the population dynamics in the research area. Habitat use was determined by a one year continuous telemetry study. Socioeconomic use was analyzed and discussed, the surveys show a cultural tendency associated with the consumption of turtles in the study area. All data combined indicate the population declination of turtles of greater historic preference; consequently the increasing hunting and commercialization of P. dumerilianus (bigheaded river turtle) is a dynamic process that demonstrates the related natural stock exhaustion taking place today. / A presente tese analisa e discute aspectos relacionados à ecologia e à conservação de Peltocephalus dumerilianus (Testudines, Podocnemididae), circunscrita à demarcação de uma área representativa do Município de Barcelos, Amazonas, Brasil. Os locais de coleta da informação biológica foram dois tributários do médio rio Negro: rio Itu e rio Cumicurí. Estudaram-se os aspectos de utilização nas comunidades de São Louis, Baturité, Daracúa y Tomar. Analisam-se os componentes da dieta alimentar durante um ciclo anual, tendo como base os conteúdos de tratos digestivos de exemplares capturados, na área de estudo, pelos ribeirinhos para seu consumo. Determina-se o caráter onívoro e oportunista da espécie. Apresenta-se também informação biológica dos aspectos reprodutivos, fundamentando-se a pesquisa no ciclo ovárico anual, desova em meio natural, desova induzida e incubação no laboratório. Assim, reafirma-se a sexotermodependência da espécie. Apresentam-se os dados morfométricos das capturas experimentais conduzidas durante dois anos contínuos e, mediante o método de captura/recaptura estabelecem-se aspectos importantes de dinâmica populacional para as duas áreas específicas de trabalho. Determina-se, igualmente aplicando-se telemetria, durante um ano contínuo, o uso de habitat por sexo. No aspecto socioeconômico, estabelece-se uma tendência cultural associada ao consumo de quelônios na área de trabalho; os dados obtidos indicam o declínio populacional das espécies de quelônios de maior preferência histórica; igualmente permitem evidenciar a constante caça e crescente comercialização de Peltocephalus dumerilianus (cabeçudo) e um processo de captura para subsistência que esgota os estoques naturais existentes, que envolve a troca das espécies preferidas por outras em função do declínio populacional.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-09-22T20:25:43Z No. of bitstreams: 2 TCC final Paulo Henrique 2015.pdf: 4296531 bytes, checksum: d58167ba8ae317bf5dbdf72813cb168b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-22T20:25:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TCC final Paulo Henrique 2015.pdf: 4296531 bytes, checksum: d58167ba8ae317bf5dbdf72813cb168b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-09-30 / In Brazil, the institutional incentives are focused on the intensive management of wild animals (captive intensive farming); there are a few extensive management initiatives in natural environments. The fresh water Podocnemididae turtles are resources of great importance for the Amazon households. The turtle conservation programs in sustainable use protected areas increased in the Amazonas since the 1990s and 2000s. The participatory local management assumes that the administrative decentralization of conservation actions is an alternative for recovering of the threatened stocks. The Uatumã chelonian program (PQU) operates in the Uatumã Sustainable Development Reserve (RDSU) for sixteen years in the reproductive monitoring of turtles in partnership with riverine villages (communities) and external institutions, along the Uatumã river, in the municipalities of São Sebastião do Uatumã, Itapiranga and Presidente Figueiredo. This research was a comparative study case between six PQU partners communities with different degree of participation to foster the monitoring of turtles reproduction trying to determine the set of institutional incentives that may encourage voluntary participation by users of the resource "turtles" in conservation and management actions and under what conditions these initiatives may turn out to be successful. The results suggest that successful participation in the management initiatives was higher in communities that implemented restrictive practices on resource usage with formal and informal collective agreements, supported by material and monetary incentives received from external institutions and aware of the need to protect their common use territories (lakes and beaches). Those actions ensure the exclusive use of those resources by their households, those that received such benefit by adhering to the PQU proposal compared to other ones. For the other hand, communities from where turtles resource were less abundant and breeding sites were rarer, were most dependent from these resources and less participative. / No Brasil, os incentivos institucionais estão voltados para ao manejo intensivo de espécies da fauna (criação intensiva em cativeiro), são raras as iniciativas de manejo extensivo em ambientes naturais. Os quelônios Podocnemididae são um recurso de grande importância para as famílias da Amazônia. As atividades de programas de conservação de quelônios em Unidades de Conservação de Uso Sustentável no Estado do Amazonas foram intensificadas a partir das décadas de 1990 e 2000. O manejo local participativo pressupõe a descentralização administrativa das ações de conservação e surgiu como uma alternativa para recuperar os estoques ameaçados. O programa Quelônio do Uatumã (PQU) atua na Reserva de Desenvolvimento Sustentável Uatumã (RDSU) há dezesseis anos no monitoramento reprodutivo dos quelônios em parceria com comunidades ribeirinhas e instituições externas no Rio Uatumã, nos municípios de São Sebastião do Uatumã, Itapiranga e Presidente Figueiredo. Este estudo foi um estudo de caso sobre o PQU entre seis localidades onde o PQU atuou com diferente grau de participação das comunidades para a promoção do monitoramento reprodutivo dos quelônios para tentar determinar qual o conjunto de incentivos institucionais que favoreceu a participação voluntária de usuários do recurso “quelônios” em ações de conservação e manejo extensivo e em que condições estas iniciativas puderam ser bem sucedidas. Os resultados obtidos sugerem que o sucesso da participação nas iniciativas de manejo, medido pelas comunidades com maior grau de engajamento nas ações de conservação e manejo, foi daquelas que implementam práticas restritivas do uso do recurso, incluindo acordos coletivos formais e informais apoiados por incentivos materiais e monetários recebidos de instituições externas e, sensibilizadas pela necessidade de protegerem seus territórios (lagos e praias) de uso comum. Estas ações asseguraram o uso exclusivo dos recursos para as famílias destas localidades, que foram mais beneficiadas por aderirem às propostas do PQU em relação às outras localidades. Por outro lado, as comunidades em que os recursos “quelônios” foram menos abundantes e os sítios reprodutivos mais raros em seus territórios, foram mais dependentes destes recursos e menos participativas.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-04T19:09:17Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Fernanda Freda Pereira.pdf: 1466064 bytes, checksum: 17d5801bfa02aff54729767620ca3a32 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-04T19:09:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Fernanda Freda Pereira.pdf: 1466064 bytes, checksum: 17d5801bfa02aff54729767620ca3a32 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-03-20 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Podocnemis sextuberculata genus belongs to the family Podocnemididae is considered “Vulnerable” according to the International Union for Conservation of Nature - IUCN, largely due to the human harvest of their eggs and adults. Several studies reported the occurrence of multiple clutches of the turtles from the Podocnemis genus, including P. sextuberculata. However, direct observation (capture-mark-recapture) were not mad. Most studies report multiple clutches indirectly, through the analysis of gonads. Multiple clutches in turtles are considered important for the survival of the offspring. A polyandrous mating system and multiple paternity in turtles contributes to genetic heterozygosity in offspring and promotes greater genetic variability in the population. This study aims to analyze directly the nesting behavior and the occurrence of multiple clutches during a breeding season of P. sextuberculata as well as their ecological and genetic effects on the offspring. The study area is located in the Trombetas Biological Reserve, in the municipality of Oriximiná, Pará, Brazil. The nests were identified on the Farias Beach (1º15'S), from October to November 2013. During the nesting season, the beach was monitored from 1900h to 0700h for 60 nights. Females were captured, measured and blood samples collected after nesting. Radio transmitters were attached their carapaces to monitor their movements and potential nesting in nearby areas. The nests were marked. After the eclosion of the eggs, we collected data on reproductive characteristics. We also took a blood sample from the hatchling femoral vein. We used six primers from the studied species, five primers from P. unifilis and a primer from P. expansa to perform the PCR analysis (the Polymerase Chain Reaction) and genotyping. There were no reports of a second clutch for any of the females monitored in this study. Female size (track width) was significantly smaller (ANOVA; df = 2.15 F = 4.22, p < 0.05; Tukey: p <0.05) at the beginning of the breeding season (mean = 110mm ± 8.4) than in the middle of the breeding season (mean = 148mm ± 19). There were no significant differences between the hatching success (ANOVA; df = 2.35; F = 0.85; p = 0.44) and clutch size (ANOVA; df = 2.31; F = 0.29; p = 0.75) for the different periods of the breeding season (beginning, middle and end). Mean incubation time was 55 days (50 - 73). The hatchling remained in the nest after hatching for a mean of 6 days (2-14). We observed a strong synchronization between the descent and the ascent of the river water level with the nesting 11 and hatching period, respectively. We analyzed all hatchlings from 23 nests, and confirmed multiple paternity in 100% of the sample. There was a mean of six fathers per nest. There were no significant difference between the number of parents and the period of the nesting season (Kruskal-Wallis; df = 2, H = 2.193, p = 0.33). There were also no significant differences between the relative size of females (Correlation of Spearman; rho = -0.10; p = 0.76) and the hatching success (Correlation of Spearman; rho = 0.04; p = 0.85) compared with the number of males fathering the clutch. However, clutch size was significantly related to the number of father found (Correlation of Spearman; rho = 0.47; p < 0.05). / Podocnemis sextuberculata, da família Podocnemididae, é listada como espécie vulnerável (União Internacional para a Conservação da Natureza – IUCN), em grande parte devido ao consumo de seus ovos e adultos pela população humana. A ocorrência de posturas múltiplas de quelônios do gênero Podocnemis, inclusive de P.sextuberculata está documentada. Entretanto, as verificações diretas (captura-marcação-recaptura) referentes a este fato são raras, sendo na maioria das vezes relatadas de forma indireta, como a partir da análise das gônadas das fêmeas. A desova múltipla em quelônios é importante para a sobrevivência da prole. O sistema de acasalamento poliândrico e paternidade múltipla em tartarugas também consistem em uma importante estratégia de sobrevivência para a população, pois contribui para o aumento da heterozigosidade genética nas proles e promove maior variabilidade genética na população. O presente trabalho teve como objetivo analisar, diretamente, o comportamento de nidificação e a ocorrência de desovas múltiplas durante uma estação de desova de P.sextuberculata e seus efeitos ecológicos e genéticos na prole. A área deste estudo localiza-se na Reserva Biológica do Rio Trombetas, no município de Oriximiná, Pará, Brasil. Os ninhos foram amostrados na praia do Farias (1º15’S e 56º50’O), entre outubro e novembro de 2013. Durante a estação de nidificação, a praia foi monitorada das 19h às 7h do dia seguinte, durante aproximadamente 60 noites. Após a desova 10 fêmeas foram capturadas, medidas e amostras de sangue foram coletadas. Rádios transmissores foram colocados na porção superior das carapaças para observação dos próximos locais de desovas. Os ninhos foram marcados e, após o nascimento dos filhotes, dados referentes aos aspectos reprodutivos e uma amostra de sangue da veia femoral foram coletados. Utilizou-se seis locos heterólogos à espécie, cinco locos de P. unifilis e um loco de P. expansa para realização das análises de PCR (Reação em cadeia da Polimerase) e genotipagem. Não houve registro de uma segunda desova para nenhuma das fêmeas monitoradas. O tamanho das fêmeas (largura do rastro) foi significativamente menor (ANOVA; d.f. = 2,15; F=4,22, p < 0,05; Tukey: p < 0,05) no início da estação de desova (média=110mm ±8,4) quando comparada ao meio da estação de desova (média = 148mm ± 19). Não houve diferenças significativas entre o sucesso de eclosão (ANOVA; d.f. = 2,35; F = 0,85; p = 0,44) e o tamanho da ninhada (ANOVA; d.f. = 2,31; F = 0,29; p = 0,75) com relação aos diferentes períodos da estação de desova (início, meio e fim). O período de incubação dos ovos de P.sextuberculata foi em média 55 dias (50 – 73). O período de tempo em que os filhotes permaneceram nos ninhos após a eclosão foi, em média, 6 dias (2-14). Observamos uma forte sincronia entre a descida e a subida do nível das águas do rio com o período de desovas e nascimento dos filhotes, respectivamente. Analisamos todos os filhotes de 23 ninhos de P.sextuberculata, dos quais foram verificados 100% de paternidade múltipla. Em média foram encontrados seis pais por ninho. Não houve diferença significativa entre o número de pais encontrados e o período da estação de desova (Kruskal-Wallis; d.f. = 2; H = 2,193; p = 0,33). Não houve diferenças significativas entre o tamanho das fêmeas (Correlação de Spearman; rho = -0,10; p = 0,76) e o sucesso de eclosão (Correlação de Spearman; rho = 0,04; p = 0,85) em relação ao número de pais encontrados nos ninhos. Contudo, o tamanho da ninhada apresentou significativamente correlação positiva com o número de pais encontrados (Correlação de Spearman; rho = 0,47; p < 0,05).

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-22T20:16:32Z No. of bitstreams: 2 Tese_Jackson Pantoja Lima.pdf: 1894708 bytes, checksum: 9e706c1c34aaa4a572735a19034c0593 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-22T20:16:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Jackson Pantoja Lima.pdf: 1894708 bytes, checksum: 9e706c1c34aaa4a572735a19034c0593 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-01-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Turtles are resources historically exploited by human populations in Amazonian ecosystems. Naturalists report that Indians large numbers of animals in ponds in the villages for address consumption during the high water period. Turtle nesting beaches, known locally as "tabuleiro de bicho-de-casco", are distributed along of the Purus River. Abufari Beach (5 ° 22'12 "S and 63 ° 01'06" W), is located in the Abufari Biological Reserve (RBA), in the municipality of Tapauá. This beach is one of the few remaining of from this abundant period for the turtles in the Purus River. RBA belongs to the indirect use-category of Conservation Units and has as its goal the research and conservation of fauna and flora. This study evaluated the consumption of turtles, traditional ecological knowledge of fishermen on turtle ecology, population structure and density of turtles in the Biological Reserve. We estimated a consumption of more than 20,000 turtles of three species of Podocnemis (P.expansa, P. unifilis and P. sextuberculata) in 2007 in the urban area, and one trade of than $ 400,000 between 2006 and 2007. Based on the popular knowledge were produce maps of distribution of fishing area, hunting and harvest of forest wood and non-timber and as areas of occurrence and movement patterns of turtles in the floodplain of the Purus River. The maps and oral history showed that most of the 16 major nesting areas of P. expansa among Abufari (RBA) and Sacado Santa Luzia (Sustainable Development Reserve Piagaçu Purus -RDSPP) have been extinct, leaving only the Abufari and Tauamirim Beach ́s. Through experimental fisheries on sites indicated on the maps we captured 3,377 turtles ( 2,390 captured with bag net in the channels Abufari and Chapéu stream) and 987 turtles with seine nets on "boiador" of the Linda Vista at 2006 and 2007 years. We estimated 2,833 females of P. expansa, 3,648 P. sextuberculata and 235 P. unifilis using the Abufari Beach between August and November 2007. Total production for the three species on the Abufari beach was estimated at 353,688 hatchling turtles. Traditional knowledge was efficient for describing movement and factors that influence the movements of migration of turtles. Consolidation of this conservation policy would be important for including all users of the resources or those are affected by its management and the conservation of turtles, but it is necessary to change the rules of the Brazilian fauna. / Quelônios são recursos historicamente explorados por populações humanas nos ecossistemas aquáticos amazônicos. Naturalistas relatam que indígenas mantinham grande quantidade de animais em currais nas aldeias para suprir a falta de alimento no período de águas altas. Praias de desova de quelônios, conhecidas regionalmente como “tabuleiros de bicho-de-casco” estavam distribuídas ao longo de toda a extensão do rio Purus, um dos tributários do rio Amazonas. O tabuleiro de Abufari (5o22’12”S e 63o01’06”W), situado na Reserva Biológica de Abufari (RBA), município de Tapauá, é um dos remanescentes deste período áureo dos quelônios. RBA pertence à categoria de Unidades de Conservação de uso indireto e tem como finalidade a pesquisa e conservação da fauna e flora. O presente estudo avaliou o consumo de quelônios, o conhecimento tradicional ecológico dos pescadores sobre a ecologia de quelônios, a estrutura populacional e densidades de quelônios na Reserva Biológica. Foi estimado um consumo superior a 20 mil quelônios de três espécies de Podocnemis (P.expansa, P. unifilis e P. sextuberculata) no ano de 2007 na zona urbana, movimentado mais de R$ 400.000 entre 2006 e 2007. Com base no conhecimento popular produzimos mapas de distribuição de área de pesca, caça, exploração de recursos florestais madeireiros e não-madeireiros e áreas de ocorrências e padrões de movimentação de quelônios na várzea do rio Purus. Os mapeamentos e a história oral mostraram que a maioria das 16 grandes áreas de desova de P. expansa existentes entre Abufari (RBA) e Sacado de Santa Luzia (RDS-PP) foram dizimadas ou extintas, restando somente o tabuleiro de Abufari e Tauamirim. Por meio de pescarias experimentais em locais indicados nos mapeamentos foram capturados 3377 quelônios, sendo 2390 com rede capa-saco nos canais do igarapé do Chapéu e canal do rio Abufari e 987 quelônios com rede de cerco no “boiador” da Linda Vista entre 2006 e 2007. Foram estimados 2.833 fêmeas de P. expansa, 3648 de P. sextuberculata e 235 P. unifilis nidificando na praia do Abufari entre agosto e novembro de 2007. A produção total para as três espécies na praia do Abufari foi estimada em 353.688 filhotes de quelônios. O conhecimento tradicional se mostrou eficiente na descrição de áreas de movimentação e fatores que influenciam o processo de movimentação dos quelônios. Para o fortalecimento da política de conservação de fauna seria importante incluir todos os usuários do recurso ou que sejam afetados pelo seu manejo, na conservação de quelônios, mas para isso se faz necessário a alteração da legislação de fauna brasileira.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-05-22T20:28:45Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Jessica-dos-Anjos_DIGITAL_19-04-2017.pdf: 6077973 bytes, checksum: b6db96b68dfe31ed52855c7ae15c7bc5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T20:28:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Jessica-dos-Anjos_DIGITAL_19-04-2017.pdf: 6077973 bytes, checksum: b6db96b68dfe31ed52855c7ae15c7bc5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-04-07 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Associations between landscape factors and ecological processes such as dispersal, reproduction and survival of organisms can ultimately affect microevolutionary processes such as gene flow, drift and selection. Landscape Genetics emerged as a research field that combines population genetics, landscape ecology, and spatial analyses to explicitly quantify the effects of landscape composition, configuration, and matrix quality on microevolutionary processes. In fluvial systems, such as Amazon basin, the process of isolation by distance is often strong and can mask the importance of barriers, landscape resistance and local environmental factors on shaping genetic patterns. Therefore, in this dissertation I assessed the importance of local and connectivity variables in shaping the spatial genetic variation patterns of two Amazonian river turtle species with distinct dispersal abilities. My objectives were: 1) assess whether the high-dispersal species (Podocnemis sextuberculata) has less spatial genetic structure than the low-dispersal species (P. erythrocephala); 2) test whether connectivity factors are related to genetic differentiation for the low-dispersal (P. erythrocephala) species but not for the high-dispersal species (P. sextuberculata); and 3) test whether local factors are more strongly associated to intrapopulational genetic diversity for the low dispersal species (P. erythrocephala). With broad sampling throughout their distribution in Amazon basin, I estimated genetic diversity and differentiation for 14 localities totaling 273 samples of P. erythrocephala and for 20 localities totaling 336 samples of P. sextuberculata. I applied model selection on models associating genetic diversity to local variables representing hypothesis of climate and productivity, instability of inter-annual water levels, hunting pressure and downstream increase in genetic diversity. I used General Dissimilarity Modelling (GDM) to model the relationship of genetic differentiation with connectivity variables representing hypothesis of isolation by distance (IBD), isolation by resistance (IBR) and isolation by barrier (IBB). Differently from the expected, local variables were more important in explaining genetic diversity of the high-dispersal species (P. sextuberculata) than of P. erythrocephala, with best models including productivity, distance from downstream locality, density of human villages and historical climatic suitability. Connectivity factors in general were not important in explaining genetic differentiation turnover for either species, but as expected, the GDM models explained a larger amount of deviance for the low-dispersal species, P. erythrocephala. Also, IBB and IBR models explained more genetic differentiation turnover than IBD, revealing the importance of including the environmental and landscape complexity when studying spatial genetic patterns. I showed that, although local variables are often overlooked in Landscape Genetics studies, they can influence intrapopulacional genetic diversity of aquatic species, even those with high dispersal ability. By applying a novel resistance-model framework in Riverscape Genetics and by using riverscape factors relevant in Amazonian context, I provide an approach to study the roles of local and connectivity variables in shaping genetic patterns of aquatic vertebrates in fluvial systems. / Associações entre fatores da paisagem e processos ecológicos como dispersão, reprodução e sobrevivência de organismos podem afetar processos microevolutivos como fluxo gênico, deriva e seleção. A Genética da Paisagem surgiu como um campo de pesquisa que combina genética populacional, ecologia de paisagens e análises espaciais para quantificar explicitamente os efeitos da qualidade da matriz, da composição e configuração da paisagem nos processos microevolutivos. Em sistemas fluviais, como a bacia Amazônica, o processo de isolamento por distância é normalmente forte e pode mascarar a importância de barreiras, resistência da paisagem e fatores ambientais locais em moldar padrões genéticos. Portanto, nesta dissertação eu avaliei a importância de variáveis locais e de conectividade em moldar os padrões espaciais de variação genética de dois quelônios aquáticos Amazônicos com diferentes capacidades dispersoras. Meus objetivos foram: 1) avaliar se a espécie com maior capacidade de dispersão (Podocnemis sextuberculata) possui menor estrutura genética especial que a espécie com baixa capacidade dispersora (P. erythrocephala); 2) testar se fatores de conectividade estão relacionados à diferenciação genética para a espécie de baixa capacidade dispersora (P. erythrocephala) mas não para a de alta capacidade dispersora (P. sextuberculata); e 3) testar se fatores locais estão mais fortemente associados à diversidade genética intrapopulacional da espécie de baixa capacidade de dispersão (P. erythrocephala). Com ampla amostragem pela distribuição geográfica das espécies na bacia Amazônica, eu estimei os parâmetros genéticos para P. erythrocephala em 14 localidades (273 amostras) e para P. sextuberculata em 20 localidades (336 amostras). Apliquei seleção de modelos em modelos associando a diversidade genética a variáveis locais representando hipóteses de clima e produtividade, instabilidade interanual de níveis da água dos rios, pressão de caça e aumento de diversidade genética a jusante dos rios. Usei General Dissimilarity Modelling (GDM) para modelar a relação entre diferenciação genética e variáveis de conectividade representando hipóteses de isolamento por distância (IBD), isolamento por resistência (IBR) e isolamento por barreira (IBB). Diferentemente do esperado, variáveis locais foram mais importantes em explicar a diversidade genética intrapopulacional da espécie com maior capacidade de dispersão (P. sextuberculata) que de P. erythrocephala, com melhores modelos incluindo produtividade, distância da localidade mais a jusante, densidade de vilas humanas e adequabilidade climática histórica. Fatores de conectividade em geral não foram importantes em explicar a diferenciação genética para nenhuma das espécies, entretanto, como esperando, os modelos GDM explicaram uma maior parte da variação para a espécie de menor capacidade dispersora, P. erythrocephala. Além disso, modelos de IBB e IBR explicaram mais diferenciação genética que IBD, revelando a importância em incluir a complexidade ambiental e da paisagem quando estudar padrões genéticos espaciais. Nessa dissertação mostro que, apesar de variáveis locais serem frequentemente desconsideradas em estudos de Genética da Paisagem, elas podem influenciar a diversidade genética intrapopulacional de espécies aquáticas, inclusive daquelas com alta capacidade dispersora. Ao usar um método inédito de modelos de resistência no contexto de Genética da Paisagem de Rios (Riverscape Genetics) e ao usar fatores da paisagem relevantes no contexto Amazônico, forneço uma abordagem para o estudo dos papéis de variáveis locais e de conectividade em moldar os padrões genético-espaciais de vertebrados aquáticos em sistemas fluviais. v

Orientador: Bruno Cesar Schimming / Resumo: O diagnóstico de diversas doenças em quelônios é um desafio para o clínico, pois a presença de casco e plastrão impedem um exame físico detalhado com ausculta e palpação. Exames de imagem como radiografia e tomografia computadorizada (TC) têm provado serem benéficos para se chegar ao diagnóstico, prognóstico e planos de tratamento em numerosas espécies animais. Assim, este estudo teve como objetivo identificar e descrever as estruturas constituintes do sistema respiratório em jabuti-piranga, por meio da tomografia computadorizada, radiografia digital e, dissecações e secções anatômicas. Para tanto, foram utilizados 12 exemplares de jabutis-pirangas (Chelonoidis carbonaria), adultos (machos e fêmeas), sendo 10 animais vivos e hígidos e, dois mortos. As estruturas que compõem o sistema respiratório nestes animais compreenderam a glote, a traqueia, os brônquios e os pulmões. Não se observou a presença da cartilagem epiglote. A TC permitiu observar a parte intrapulmonar dos brônquios, a qual foi acompanhada por grandes vasos sanguíneos. Os pulmões apresentaram parênquima com aspecto reticulado, sem lobações. Cada pulmão possuía uma pequena estrutura localizada junto aos polos cranial e caudal. Estas estruturas foram identificadas nos cortes tomográficos e reconstruções 3D. Sugere-se que estas dilatações poderiam ser estruturas não respiratórias, comparável aos sacos aéreos das aves. De todas as técnicas usadas, a TC mostrou-se mais eficaz para a identificação das estruturas anatô... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre