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Investigating intra and inter-subject performance with deep learning for gait on irregular surfaces

Lam, Guillaume 04 1900 (has links)
La médecine personnalisée promet des soins adaptés à chaque patient. Cependant, l’ap- prentissage automatique appliqué à cette fin nécessite beaucoup d’améliorations. L’évalua- tion des modèles est une étape cruciale qui nécessite du travail pour amener à un niveau acceptable pour son utilisation avec des participants. Actuellement, les performances sur les ensembles de données biomédicales sont évaluées à l’aide d’un découpage intra-sujet ou inter-sujet. Le premier se concentre sur l’évaluation des participants présents à la fois dans les ensembles d’entraînement et de test. Ce dernier sépare les participants pour chaque ensemble. Ces termes sont respectivement synonymes de fractionnement aléatoire et par sujet. Deux méthodes principales se présentent comme des solutions pour obtenir des performances de franctionnement aléatoires lors d’entraînement de méthodes par sujet, calibration et sans ca- libration. Alors que la calibration se concentre sur l’entraînement d’un petit sous-ensemble de participant non vues, les méthodes sans calibration visent à modifier l’architecture du modèle ou les traitements préliminaire pour contourner la nécessité du sous-ensemble. Ce mémoire étudiera la calibration non paramétrique pour ses propriétés d’indépendance de la modalité. L’article présenté détaillera cette enquête pour combler l’écart de performance sur un ensemble de données d’essais de marche sur des surfaces irrégulières. Nous détermi- nons que quelques cycles (1-2) de marche sont suffisants pour calibrer les modèles pour des performances adéquates (F1 : +90%). Avec accès à des essais de cycle de marche supplémen- taires (+10), le modèle a atteint à peu près les mêmes performances qu’un modèle formé à l’aide d’une approche de fractionnement aléatoire (F1 : 95-100%). Suivant les objectifs de la médecine personnalisée, des voies de recherche supplémentaires sont décrites, telles qu’une méthode alternative de distribution de modèles qui s’adapte aux étapes de recherche tout en réduisant les coûts de calcul pour les développeurs de modèles. Nous constatons que l’étalonnage est une méthode valable pour surmonter l’écart de performance. Les ré- sultats correspondent aux découvertes précédentes utilisant l’étalonnage pour obtenir des performances robustes. / Personalized medicine promises care tailored to each patient; however, machine learning applied to this end needs much improvement. Evaluation of models is a crucial step which necessitates attention when utilized with participants. Currently, performance on biomedical datasets is evaluated using either intra-subject or inter-subject splitting. The former focuses on the evaluation of participants present in both training and testing sets. The latter separates participants for each set. These terms are synonymous with random-wise and subject-wise splitting, respectively. Two main methods present themselves as solutions to achieving random-wise performance while training on a subject-wise dataset split, calibration and calibration-free methods. While calibration focuses on training a small subset of unseen data trials, calibration-free methods aim to alter model architecture or pre-processing steps to bypass the necessity of training data points. This thesis investigates non-parametric calibration for its modality-agnostic properties. The article presented details this investigation at bridging the performance gap on a dataset of gait trials on irregular surfaces. We determine few (1-2) gait cycles are sufficient to calibrate models for adequate performance (F1:+90%). With access to additional gait cycle trials, the model achieved nearly the same performance as a model trained using a random-split approach (F1:95-100%). Following the goals of personalized medicine, additional research paths are outlined, such as an alternative model distribution method which fits with research steps while reducing computational costs for model developers. We find that calibration is a valid method to overcome the performance gap. The presented results correspond with previous findings by using calibration to achieve robust performance.

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