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Classification of glomerular pathological findings using deep learning and nephrologist-AI collective intelligence approach / 深層学習および腎臓内科医と人工知能との集合知アプローチを用いた糸球体病理所見の分類

Uchino, Eiichiro 24 September 2021 (has links)
京都大学 / 新制・論文博士 / 博士(医学) / 乙第13440号 / 論医博第2239号 / 新制||医||1054(附属図書館) / 京都大学大学院医学研究科医学専攻 / (主査)教授 黒田 知宏, 教授 松田 道行, 教授 長船 健二 / 学位規則第4条第2項該当 / Doctor of Medical Science / Kyoto University / DFAM
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Optimizing glomerular IgG and Nephrin localization using immunogold electron microscopy in minimal change disease

Ghafwari, Jamail 31 January 2023 (has links)
Immunolocalization of proteins within the cell is a significant and powerful tool that improves understanding of cellular functions and processes, such as molecule secretion during immune responses. Immunogold electron microscopy (IEM) is an immunohistochemistry technique that uses gold-conjugated antibodies and electron microscopy (EM) to identify and localize antigens at the ultrastructural level. Here, we are trying to develop and optimize an IEM staining protocol that targets glomerular proteins of interest in Minimal Change Disease (MCD), and eliminates background staining, and preserves tissue morphology. Using this optimized protocol, we hope to learn more about the relationship between IgG and Nephrin in MCD. Kidney biopsies diagnosed with MCD, Membranous Nephropathy (MN), and Thin Basement Membrane Disease (TBMD) and previously embedded in paraffin blocks were retrieved from the tissue archive of the Renal Pathology Laboratory at Boston Medical Center. MN and TBMD were selected as positive controls for IgG and Nephrin staining protocols, respectively. Co-staining of IgG and Nephrin was performed after the protocols for each target were optimized. During protocol development, it was observed that section quality is significantly affected by the angle and sharpness of the knife, and the thickness of the section. Moreover, section quality highly impacted gold particle localization. Ultimately, co-staining of IgG and Nephrin was successful in MCD cases. However, further improvements are needed to optimize IgG and Nephrin staining, and in turn, our understanding of MCD.
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Investigating the role of ketone body metabolism in diabetic kidney disease

Mechchate, Hamza 12 1900 (has links)
Ces dernières années, la compréhension de la relation entre l'alimentation et la santé métabolique, en particulier dans le contexte du diabète de type 2 (T2D), est devenue de plus en plus importante. Les régimes riches en graisses (HFD) sont connus pour exacerber les conditions diabétiques, menant à des complications telles que l'obésité, un métabolisme déséquilibré, des problèmes cardiovasculaires et un dysfonctionnement rénal. À l'inverse, les régimes cétogènes (KD) et la supplémentation en cétones (KP), connus pour augmenter le taux de corps cétoniques dans le sang, ont attiré l'attention pour leur potentiel dans la gestion du poids, l'amélioration du contrôle de la glycémie et l'atténuation des complications associées au diabète de type 2. L'étude a pour but d'évaluer l'efficacité du KD et de KP dans la gestion de la pathogenèse du T2D et la réduction de la progression de la maladie rénale diabétique dans un modèle de souris, en se concentrant sur les changements dans les indicateurs métaboliques et de santé rénale. Cette étude a examiné les effets de diverses interventions diététiques (HFD, KD, KP) sur une série de paramètres de santé rénale dans un modèle murin de T2D. Sur une période de 15 semaines, le T2D a été induit chez les souris, suivi d'une exposition de six semaines à différents régimes. La recherche s'est concentrée sur l'évaluation des changements dans le poids corporel, la prise alimentaire, la glycémie et les niveaux de cétone, la tolérance à l'insuline et au glucose, et les fonctions cardiovasculaires et rénales. L'évaluation des fonctions rénales comprenait le rapport albumine/créatinine, l'azote uréique du sang (BUN), les niveaux de cystatine C et l'histopathologie. En outre, l'étude a examiné l'impact de ces régimes sur l'accumulation de lipides dans les tissus rénaux et les niveaux de triglycérides plasmatiques, afin de comprendre les implications métaboliques plus larges des choix alimentaires dans la gestion du T2D. Les résultats ont indiqué que les souris suivant un régime KD présentaient des améliorations significatives dans plusieurs paramètres par rapport à celles suivant un régime HFD. Cela incluait une réduction du poids corporel, une meilleure maîtrise glycémique, une sensibilité accrue à l'insuline et une meilleure santé cardiovasculaire et rénale. En revanche, la supplémentation en KP n'a pas montré d'effet aussi prononcé dans plusieurs aspects, y compris l'amélioration du contrôle glycémique et de la fonction rénale. Intéressant, bien que le régime KD ait été efficace pour réduire les niveaux de triglycérides plasmatiques, il a paradoxalement conduit à une augmentation de l'accumulation de lipides dans les tissus rénaux. En conclusion, l'étude souligne l'efficacité du régime cétogène dans la gestion du poids, l'amélioration des marqueurs métaboliques et la réduction des complications liées au diabète dans un modèle de souris de T2D. Elle met également en évidence la complexité des réponses métaboliques aux interventions diététiques, en particulier en ce qui concerne la santé rénale et le métabolisme des lipides. Les résultats suggèrent que, bien que le régime KD puisse offrir de nombreux avantages pour la santé dans le contexte du diabète, il pourrait également induire des adaptations métaboliques spécifiques à certains organes. / In recent years, understanding the relationship between diet and metabolic health, particularly in the context of type 2 diabetes (T2D), has become increasingly important. High-fat diets (HFD) are known to exacerbate diabetic conditions, leading to complications such as obesity, dysregulated metabolism, cardiovascular issues, and renal dysfunction. Conversely, ketogenic diets (KD) and ketone supplementation (KP) known to elevate ketone bodies in the blood, have been gaining attention for their potential in managing weight, improving glycemic control, and mitigating complications associated with T2D. The study aims to evaluate the effectiveness of KD and KP in managing T2D pathogenesis and reducing the progression of diabetic kidney disease in a mouse model, focusing on changes in metabolic and renal health indicators. This study investigated the effects of various dietary interventions (HFD, KD, KP) on a range of kidney health parameters in a mouse model of T2D. Over 15 weeks, T2D was induced in mice, followed by a six-week exposure to different diets. The research focused on evaluating changes in body weight, food intake, blood glucose and ketone levels, insulin and glucose tolerance, and cardiovascular and renal function. Renal assessment included albumin-to-creatinine ratio, Blood urea nitrogen (BUN), Cystatin C levels, and histopathology. Additionally, the study examined the impact of these diets on lipid accumulation in renal tissues and plasma triglyceride levels, aiming to understand the broader metabolic implications of dietary choices in T2D management. Results indicated that mice on a KD exhibited significant improvements in several parameters compared to those on an HFD. These included reductions in body weight, enhanced glycemic control, improved insulin sensitivity, and better cardiovascular and renal health. In contrast, the KP supplementation group did not show as pronounced an effect in several aspects, including glycemic control and renal function improvement. Interestingly, while KD was effective in reducing plasma triglyceride levels, it paradoxically led to increased lipid accumulation in renal tissues. In conclusion, the study underscores the effectiveness of a ketogenic diet in managing weight, improving metabolic markers, and mitigating diabetes-related complications in a mouse model of T2D. It also highlights the complexity of metabolic responses to dietary interventions, especially concerning renal health and lipid metabolism. The results suggest that, while the KD diet may offer many health benefits in the context of diabetes, it may also induce organ-specific metabolic adaptations.

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